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- biology
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pretty_name: SchemaBio Bundle
🧬 SchemaBio Bundle
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📖 概述
本数据集是一个全面、精心整理的一站式注释库,专为生物信息学和基因组变异分析设计(如 WES/WGS 流水线)。它将核心的变异效应预测器、临床数据库和基因组参考文件整合到统一的资源库中,大幅减少数据收集、格式对齐和预处理的时间。
🗂️ 包含数据与来源
本资源库包含以下类别的数据:
- 变异效应预测器与评分: AlphaMissense、EVOScore2、Pangolin。
- 临床与人群频率数据: gnomAD、CIViC、mskcc_hotspot。
- 基因组参考与区域: UCSC 注释文件(
cytoband、ncbiRefSeq.gtf)、Ensembl 参考文件(GRCh38/37 FASTA、vep_cache)、ManeSelectBed。
⚖️ 许可证与商业使用
好消息:本资源库包含的所有基础数据集目前均允许商业使用,前提是用户严格遵守各自的署名和相同方式共享要求。
由于本资源库作为聚合器,它不受单一许可证约束。您必须遵守各基础数据源的单独许可证。下表概述了每个组件的具体许可证:
📊 数据库许可证汇总
| 数据库 / 来源 | 版本 | 官方许可证 | 商业使用 | 再分发 | 关键要求与说明 |
|---|---|---|---|---|---|
| AlphaMissense | v3 | CC BY 4.0 | ✅ 允许 | ✅ 允许 | 必须署名 DeepMind Technologies Limited。 |
| EVOScore2 | 20260128 | MIT | ✅ 允许 | ✅ 允许 | 必须包含原始版权声明。 |
| Pangolin | v1 | CC BY 4.0 | ✅ 允许 | ✅ 允许 | 必须提供适当署名。 |
| ManeSelectBed | v49 | MIT | ✅ 允许 | ✅ 允许 | 必须包含原始版权声明。 |
| mskcc_hotspot | v2 | ODbL | ✅ 允许 | ✅ 允许 | 相同方式共享: 如果您修改/改编此数据库,衍生作品也必须采用 ODbL 许可证。 |
| CIViC | 20260301 | CC0 1.0 | ✅ 允许 | ✅ 允许 | 公共领域。无限制。 |
| gnomAD | v4.1 | 无限制 | ✅ 允许 | ✅ 允许 | Broad Institute 声明对使用无限制。 |
| UCSC Data | / | 公共领域 | ✅ 允许 | ✅ 允许 | 公共资助数据,可自由用于任何用途。 |
| Ensembl Data | release 115 | 无限制 | ✅ 允许 | ✅ 允许 | EMBL-EBI 对使用或再分发无限制。 |
免责声明:本组合数据集的创建者对原始源数据不主张任何所有权。用户需自行确保其下游使用符合原始数据提供者的条款。