Datasets:
siddharthtumre
/
JNLPBA-Processed

Dataset card Data Studio Files
xet
 Community
id
stringlengths
1
5
tokens
list
ner_tags
list
7901
[ "Using", "protein", "-", "DNA", "interaction", "assays", "we", "show", "that", "the", "H4", "promoter", "contains", "two", "ATF", "/", "CREB", "recognition", "motifs", "which", "interact", "with", "CREB", ",", "ATF1", ",", "and", "ATF2", "but", "not", "wit...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]
7902
[ "Both", "ATF", "/", "CRE", "motifs", "overlap", "binding", "sequences", "for", "the", "multifunctional", "YY1", "transcription", "factor", ",", "which", "has", "previously", "been", "shown", "to", "be", "nuclear", "matrix", "associated", "." ]
[ "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7903
[ "Subnuclear", "fractionation", "reveals", "that", "there", "are", "two", "ATF1", "isoforms", "which", "appear", "to", "differ", "with", "respect", "to", "DNA", "binding", "activity", "and", "partition", "selectively", "between", "nuclear", "matrix", "and", "nonmat...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7904
[ "Is", "celiac", "disease", "due", "to", "molecular", "mimicry", "between", "gliadin", "peptide", "-", "HLA", "class", "II", "molecule", "-", "T", "cell", "interactions", "and", "those", "of", "some", "unidentified", "superantigen", "?" ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O" ]
7905
[ "This", "paper", "presents", "a", "new", "hypothesis", "for", "the", "etiology", "and", "pathogenesis", "of", "celiac", "disease", "(", "CD", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7906
[ "It", "is", "our", "contention", "that", "CD", "is", "triggered", "by", "the", "binding", "of", "one", "or", "more", "gliadin", "peptides", "to", "CD", "-", "associated", "HLA", "class", "II", "molecules", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O" ]
7907
[ "Furthermore", ",", "we", "propose", "that", "these", "putative", "CD", "peptides", "bind", "to", "oligosaccharide", "residues", "on", "HLA", "class", "II", "molecules", "distal", "to", "the", "peptide", "-", "binding", "groove", "invoking", "recognition", "and"...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7908
[ "The", "binding", "of", "these", "gamma", "delta", "T", "cells", "serves", "as", "a", "signal", "for", "abrogation", "of", "oral", "tolerance", "to", "ingested", "proteins", "setting", "in", "motion", "a", "series", "of", "immune", "responses", "directed", "...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7909
[ "CD", "patients", "are", "victimized", "by", "this", "self", "-", "distructed", "immune", "response", "because", "of", "inheritance", "of", "certain", "combinations", "of", "HLA", "-", "DQ", "and", "DR", "haplotypes", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7910
[ "Dimers", "encoded", "by", "HLA", "-", "DR", "haplotypes", "may", "be", "the", "primary", "restriction", "elements", "for", "lectin", "-", "like", ",", "gliadin", "peptides", "while", "the", "degree", "of", "immune", "suppression", "(", "or", "lack", "thereo...
[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O" ]
7911
[ "Finally", ",", "we", "speculate", "that", "molecular", "mimicry", "between", "one", "or", "more", "gliadin", "peptides", "and", "some", ",", "as", "yet", "unidentified", ",", "bacterial", "or", "viral", "superantigen", "plays", "a", "role", "in", "disease", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7912
[ "Epstein", "-", "Barr", "virus", "latent", "membrane", "protein", "-", "1", "triggers", "AP", "-", "1", "activity", "via", "the", "c", "-", "Jun", "N", "-", "terminal", "kinase", "cascade", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7913
[ "The", "Epstein", "-", "Barr", "virus", "latent", "membrane", "protein", "-", "1", "(", "LMP", "-", "1", ")", "is", "an", "integral", "membrane", "protein", "which", "transforms", "fibroblasts", "and", "is", "essential", "for", "EBV", "-", "mediated", "B",...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7914
[ "LMP", "-", "1", "has", "been", "shown", "to", "trigger", "cellular", "NF", "-", "kappa", "B", "activity", "which", ",", "however", ",", "can", "not", "fully", "explain", "the", "oncogenic", "potential", "of", "LMP", "-", "1", "." ]
[ "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]
7915
[ "Here", "we", "show", "that", "LMP", "-", "1", "induces", "the", "activity", "of", "the", "AP", "-", "1", "transcription", "factor", ",", "a", "dimer", "of", "Jun", "/", "Jun", "or", "Jun", "/", "Fos", "proteins", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O" ]
7916
[ "LMP", "-", "1", "effects", "on", "AP", "-", "1", "are", "mediated", "through", "activation", "of", "the", "c", "-", "Jun", "N", "-", "terminal", "kinase", "(", "JNK", ")", "cascade", ",", "but", "not", "the", "extracellular", "signal", "-", "regulated...
[ "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O" ]
7917
[ "Consequently", ",", "LMP", "-", "1", "triggers", "the", "activity", "of", "the", "c", "-", "Jun", "N", "-", "terminal", "transactivation", "domain", "which", "is", "known", "to", "be", "activated", "upon", "JNK", "-", "mediated", "phosphorylation", "." ]
[ "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O" ]
7918
[ "Deletion", "analysis", "indicates", "that", "the", "55", "C", "-", "terminal", "amino", "acids", "of", "the", "LMP", "-", "1", "molecule", ",", "but", "not", "its", "TRAF", "interaction", "domain", ",", "are", "essential", "for", "AP", "-", "1", "activa...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O" ]
7919
[ "JNK", "-", "mediated", "transcriptional", "activation", "of", "AP", "-", "1", "is", "the", "direct", "output", "of", "LMP", "-", "1", "-", "triggered", "signaling", ",", "as", "shown", "by", "an", "inducible", "LMP", "-", "1", "mutant", "." ]
[ "B", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]
7920
[ "Using", "a", "tetracycline", "-", "regulated", "LMP", "-", "1", "allele", ",", "we", "demonstrate", "that", "JNK", "is", "also", "an", "effector", "of", "non", "-", "cytotoxic", "LMP", "-", "1", "signaling", "in", "B", "cells", ",", "the", "physiologica...
[ "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7921
[ "In", "summary", ",", "our", "data", "reveal", "a", "novel", "effector", "of", "LMP", "-", "1", ",", "the", "SEK", "/", "JNK", "/", "c", "-", "Jun", "/", "AP", "-", "1", "pathway", ",", "which", "contributes", "to", "our", "understanding", "of", "t...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]
7922
[ "1", ".", "In", "this", "study", "we", "hypothesized", "that", "in", "individuals", "with", "certain", "genetic", "makeup", ",", "MTBE", ",", "benzene", "or", "their", "metabolites", "act", "as", "adducts", "and", "may", "induce", "programmed", "cell", "deat...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7923
[ "2", ".", "Our", "study", "involved", "a", "group", "of", "60", "male", "and", "female", "subjects", "who", "were", "exposed", "to", "MTBE", "and", "benzene", "-", "contaminated", "water", "concentrations", "up", "to", "76", "PPB", "for", "MTBE", "and", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7924
[ "For", "comparison", ",", "we", "recruited", "a", "control", "group", "consisting", "of", "32", "healthy", "males", "and", "females", "with", "similar", "age", "distribution", "and", "without", "a", "history", "of", "exposure", "to", "MTBE", "or", "benzene", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7925
[ "3", ".", "Peripheral", "blood", "lymphocytes", "(", "PBL", ")", "of", "both", "groups", "were", "tested", "for", "the", "percentage", "of", "apoptotic", "cells", "and", "cell", "cycle", "progression", "using", "flow", "cytometry", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7926
[ "4", ".", "When", "apoptotic", "lymphocytes", "from", "exposed", "individuals", "were", "compared", "to", "apoptotic", "lymphocytes", "from", "the", "control", "group", ",", "statistically", "-", "significant", "differences", "between", "each", "mean", "group", "w...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
7927
[ "MTBE", "and", "benzene", "-", "induced", "apoptosis", "is", "attributed", "to", "a", "discrete", "block", "within", "the", "cell", "cycle", "progression", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7928
[ "5", ".", "One", "of", "the", "signaling", "molecules", "which", "mediates", "programmed", "cell", "death", "is", "nuclear", "factor", "Kappa", "-", "B", "(", "NF", "-", "kappa", "B", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O" ]
7929
[ "NF", "-", "kappa", "B", "was", "examined", "as", "one", "of", "the", "many", "molecular", "mechanisms", "for", "mediating", "cell", "death", "by", "MTBE", "and", "benzene", "." ]
[ "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7930
[ "Cloning", "of", "the", "cDNA", "encoding", "human", "SR", "-", "BP", "shows", "an", "open", "reading", "frame", "for", "a", "223", "-", "amino", "acid", "protein", ",", "which", "is", "homologous", "to", "the", "recently", "cloned", "sigma", "1", "recep...
[ "O", "O", "O", "B", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]
7931
[ "Interestingly", ",", "the", "deduced", "amino", "acid", "sequence", "was", "found", "to", "be", "related", "to", "fungal", "C8", "-", "C7", "sterol", "isomerase", ",", "encoded", "by", "the", "ERG2", "gene", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O" ]
7932
[ "The", "ERG2", "gene", "product", "has", "been", "identified", "recently", "as", "the", "molecular", "target", "of", "SR", "31747A", "that", "mediates", "antiproliferative", "effects", "of", "the", "drug", "in", "yeast", "." ]
[ "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7933
[ "Subcellular", "localization", "analysis", "in", "various", "cells", ",", "using", "a", "specific", "monoclonal", "antibody", "raised", "against", "SR", "-", "BP", ",", "demonstrated", "that", "this", "protein", "was", "associated", "with", "the", "nuclear", "en...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7934
[ "When", "studying", "the", "binding", "of", "SR", "31747A", "on", "membranes", "from", "yeast", "expressing", "SR", "-", "BP", ",", "we", "found", "a", "pharmacological", "profile", "of", "sigma", "1", "receptors", ";", "binding", "was", "displaced", "by", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
7935
[ "Scatchard", "plot", "analysis", "revealed", "Kd", "values", "of", "7", ".", "1", "nM", "and", "0", ".", "15", "nM", "for", "(", "+", ")", "-", "pentazocine", "and", "SR", "31747A", ",", "respectively", ",", "indicating", "an", "affinity", "of", "SR", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
7936
[ "Additionally", ",", "we", "showed", "that", "pentazocine", ",", "a", "competitive", "inhibitor", "of", "SR", "31747A", "binding", ",", "also", "prevents", "the", "immunosuppressive", "effect", "of", "SR", "31747A", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7937
[ "Taken", "together", ",", "these", "findings", "strongly", "suggest", "that", "SR", "-", "BP", "represents", "the", "molecular", "target", "for", "SR", "31747A", "in", "mammalian", "tissues", ",", "which", "could", "be", "critical", "for", "T", "cell", "prol...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7938
[ "Phospholipase", "C", "gamma", "1", "overexpression", "and", "activation", "induced", "by", "interferon", "beta", "in", "human", "T", "lymphocytes", ":", "an", "ISGF3", "-", "independent", "response", "." ]
[ "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O" ]
7939
[ "Interferons", "exert", "their", "antiviral", ",", "antiproliferative", "and", "immunoregulatory", "activities", "by", "stimulating", "the", "expression", "of", "several", "genes", "." ]
[ "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7940
[ "Such", "genes", "disclose", "a", "common", "element", "within", "their", "promoters", ",", "defined", "Interferon", "Stimulated", "Response", "Element", "(", "ISRE", ")", ",", "which", "binds", "a", "nuclear", "factor", "(", "s", ")", "translocated", "from", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "O", "...
7941
[ "In", "addition", ",", "the", "ability", "of", "this", "enzyme", "to", "hydrolyse", "PIP2", ",", "also", "in", "the", "presence", "of", "genistein", ",", "implies", "the", "possibility", "that", "this", "enzyme", "can", "exert", "its", "hydrolytic", "activit...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O" ]
7942
[ "Negative", "regulation", "by", "HLA", "-", "DO", "of", "MHC", "class", "II", "-", "restricted", "antigen", "processing", "." ]
[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7943
[ "HLA", "-", "DM", "is", "a", "major", "histocompatibility", "complex", "(", "MHC", ")", "class", "II", "-", "like", "molecule", "that", "facilitates", "antigen", "processing", "by", "catalyzing", "the", "exchange", "of", "invariant", "chain", "-", "derived", ...
[ "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O" ]
7944
[ "HLA", "-", "DO", "is", "a", "second", "class", "II", "-", "like", "molecule", "that", "physically", "associates", "with", "HLA", "-", "DM", "in", "B", "cells", "." ]
[ "B", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O" ]
7945
[ "HLA", "-", "DO", "was", "shown", "to", "block", "HLA", "-", "DM", "function", "." ]
[ "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O" ]
7946
[ "Purified", "HLA", "-", "DM", "-", "DO", "complexes", "could", "not", "promote", "peptide", "exchange", "in", "vitro", "." ]
[ "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7947
[ "Expression", "of", "HLA", "-", "DO", "in", "a", "class", "II", "+", "and", "DM", "+", ",", "DO", "-", "human", "T", "cell", "line", "caused", "the", "accumulation", "of", "class", "II", "-", "CLIP", "complexes", ",", "indicating", "that", "HLA", "-"...
[ "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "...
7948
[ "Vitamin", "D", "receptor", ":", "no", "evidence", "for", "allele", "-", "specific", "mRNA", "stability", "in", "cells", "which", "are", "heterozygous", "for", "the", "Taq", "I", "restriction", "enzyme", "polymorphism", "." ]
[ "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O" ]
7949
[ "Allelic", "variations", "of", "the", "vitamin", "D", "receptor", "(", "VDR", ")", "gene", "have", "been", "associated", "with", "the", "risk", "of", "developing", "prostate", "cancer", "in", "men", "and", "osteoporosis", "in", "postmenopausal", "women", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7950
[ "Three", "RFLPs", "(", "TaqI", ",", "ApaI", ",", "BsmI", ")", "define", "two", "common", "haplotypes", ":", "BAt", "and", "baT", "." ]
[ "O", "B", "O", "B", "O", "B", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7951
[ "None", "of", "these", "polymorphisms", "change", "the", "translated", "protein", "." ]
[ "O", "O", "O", "B", "O", "O", "B", "I", "O" ]
7952
[ "Since", "sequence", "variations", "in", "the", "3", "'", "UTR", "of", "VDR", "have", "been", "linked", "to", "the", "different", "haplotypes", ",", "investigators", "have", "proposed", "that", "the", "stability", "of", "VDR", "mRNA", "is", "influenced", "by...
[ "O", "B", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7953
[ "Indirect", "evidence", "suggested", "that", "allele", "T", "is", "less", "stable", "than", "allele", "t", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O" ]
7954
[ "In", "all", "three", "cases", ",", "we", "did", "not", "find", "a", "significant", "difference", "in", "stability", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7955
[ "These", "results", "indicate", "a", "variation", "in", "transcriptional", "regulation", "rather", "than", "mRNA", "stability", "between", "the", "alleles", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O" ]
7956
[ "We", "hypothesize", "that", "an", "unknown", "gene", "or", "genes", "in", "linkage", "with", "the", "polymorphisms", "is", "(", "are", ")", "responsible", "for", "the", "relationship", "between", "risk", "of", "prostate", "cancer", "and", "VDR", "polymorphism...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "B", "O" ]
7957
[ "Replication", "of", "human", "immunodeficiency", "virus", "-", "1", "in", "primary", "human", "T", "cells", "is", "dependent", "on", "the", "autocrine", "secretion", "of", "tumor", "necrosis", "factor", "through", "the", "control", "of", "nuclear", "factor", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O" ]
7958
[ "Tumor", "necrosis", "factor", "(", "TNF", ")", "-", "alpha", "controls", "T", "-", "cell", "activation", "and", "is", "a", "major", "inducer", "of", "human", "immunodeficiency", "virus", "(", "HIV", ")", "-", "1", "replication", "in", "chronically", "infe...
[ "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7959
[ "Therefore", ",", "we", "have", "investigated", "its", "role", "in", "primary", "cultures", "of", "HIV", "-", "infected", "human", "T", "lymphocytes", "by", "using", "neutralizing", "anti", "-", "TNF", "-", "alpha", "antibodies", "or", "TNF", "-", "alpha", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O" ]
7960
[ "Primary", "resting", "T", "lymphocytes", "produced", "TNF", "-", "alpha", "and", "supported", "HIV", "replication", "after", "T", "-", "cell", "receptor", "activation", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7961
[ "Addition", "of", "neutralizing", "anti", "-", "TNF", "-", "alpha", "antibodies", "drastically", "reduced", "p24", "antigen", "release", "and", "prevented", "CD4", "+", "cell", "depletion", "associated", "with", "infection", "." ]
[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7962
[ "Anti", "-", "TNF", "-", "alpha", "also", "prevented", "nuclear", "factor", "-", "kappa", "B", "(", "NF", "-", "kappa", "B", ")", "activation", ",", "and", "a", "good", "correlation", "between", "this", "inhibition", "and", "inhibition", "of", "HIV", "re...
[ "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7963
[ "Moreover", ",", "supplementing", "the", "cultures", "with", "high", "doses", "of", "IL", "-", "2", "reverted", "anti", "-", "TNF", "-", "alpha", "inhibition", "of", "cell", "proliferation", "but", "did", "not", "affect", "the", "inhibition", "of", "HIV", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7964
[ "Hypoxia", "enhances", "induction", "of", "endothelial", "ICAM", "-", "1", ":", "role", "for", "metabolic", "acidosis", "and", "proteasomes", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O" ]
7965
[ "Coincident", "with", "many", "inflammatory", "diseases", "is", "tissue", "hypoxia", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7966
[ "Thus", "we", "hypothesized", "that", "combinations", "of", "hypoxia", "and", "inflammatory", "stimuli", "may", "differentially", "regulate", "expression", "of", "endothelial", "ICAM", "-", "1", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]
7967
[ "Human", "endothelial", "cells", "were", "exposed", "to", "hypoxia", "in", "the", "presence", "or", "absence", "of", "added", "lipopolysaccharide", "(", "LPS", ")", "and", "examined", "for", "expression", "of", "functional", "ICAM", "-", "1", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]
7968
[ "Although", "hypoxia", "alone", "did", "not", "induce", "ICAM", "-", "1", ",", "the", "combination", "of", "LPS", "and", "hypoxia", "enhanced", "(", "3", "+", "/", "-", "0", ".", "4", "-", "fold", "over", "normoxia", ")", "ICAM", "-", "1", "expressio...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O" ]
7969
[ "Combinations", "of", "hypoxia", "and", "LPS", "significantly", "increased", "lymphocyte", "binding", ",", "and", "such", "increases", "were", "inhibited", "by", "addition", "of", "anti", "-", "ICAM", "-", "1", "antibodies", "or", "antisense", "oligonucleotides", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O" ]
7970
[ "Hypoxic", "endothelia", "showed", "a", ">", "10", "-", "fold", "increase", "in", "sensitivity", "to", "inhibitors", "of", "proteasome", "activation", ",", "and", "combinations", "of", "hypoxia", "and", "LPS", "enhanced", "proteasome", "-", "dependent", "cytopla...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "...
7971
[ "Such", "proteasome", "activation", "correlated", "with", "hypoxia", "-", "evoked", "decreases", "in", "both", "extracellular", "and", "intracellular", "pH", "." ]
[ "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7972
[ "We", "conclude", "from", "these", "studies", "that", "endothelial", "hypoxia", "provides", "a", "novel", ",", "proteasome", "-", "dependent", "stimulus", "for", "ICAM", "-", "1", "induction", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O" ]
7973
[ "Differanisole", "A", ",", "a", "novel", "antitumor", "antibiotic", ",", "enhances", "growth", "inhibition", "and", "differentiation", "of", "human", "myeloid", "leukemia", "cells", "induced", "by", "9", "-", "cis", "retinoic", "acid", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7974
[ "Differanisole", "A", ",", "3", ",", "5", "-", "dichloro", "-", "2", "-", "hydroxy", "-", "4", "-", "methoxy", "-", "6", "-", "n", "-", "propylbenzoic", "acid", ",", "inhibited", "growth", "of", "human", "myeloid", "leukemia", "cells", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7975
[ "Differanisole", "A", "and", "9", "-", "cis", "retinoic", "acid", "(", "9cisRA", ")", "synergistically", "inhibited", "the", "growth", "and", "induced", "functional", "and", "morphologic", "differentiation", "of", "HL", "-", "60", "and", "NB4", "cells", ",", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
7976
[ "Similar", "results", "were", "obtained", "in", "primary", "culture", "of", "leukemia", "cells", "from", "a", "patient", "with", "acute", "promyelocytic", "leukemia", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7977
[ "The", "synergistic", "effect", "on", "growth", "inhibition", "and", "induction", "of", "differentiation", "required", "simultaneous", "treatment", "with", "differanisole", "A", "and", "9cisRA", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7978
[ "Differanisole", "A", "and", "an", "RXR", "-", "specific", "ligand", "(", "Ro47", "-", "5944", ")", "cooperatively", "inhibited", "the", "cell", "growth", ",", "while", "the", "combined", "effect", "of", "differanisole", "A", "and", "an", "RAR", "-", "spec...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7979
[ "Differanisole", "A", "in", "combination", "with", "9cisRA", "may", "have", "implications", "for", "therapy", "of", "acute", "promyelocytic", "leukemia", "patients", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7980
[ "The", "activation", "of", "the", "JAK2", "/", "STAT5", "pathway", "is", "commonly", "involved", "in", "signaling", "through", "the", "human", "IL", "-", "5", "receptor", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O" ]
7981
[ "The", "JAK", "(", "Janus", "kinase", ")", "family", "of", "protein", "tyrosine", "kinases", "and", "the", "STATs", "(", "signal", "transducers", "and", "activators", "of", "transcription", ")", "have", "been", "shown", "to", "be", "activated", "in", "respon...
[ "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "I", "O" ]
7982
[ "In", "this", "study", ",", "we", "evaluated", "the", "activation", "of", "JAK", "/", "STAT", "pathway", "upon", "human", "interleukin", "-", "5", "(", "hIL", "-", "5", ")", "stimulation", "of", "two", "different", "hIL", "-", "5", "-", "responsive", "...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "B", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
7983
[ "Immunoprecipitation", "and", "electrophoretic", "mobility", "shift", "analysis", "revealed", "that", "tyrosine", "phosphorylation", "of", "JAK2", "and", "activation", "of", "STAT5", "were", "induced", "upon", "stimulation", "with", "hIL", "-", "5", "in", "all", "...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7984
[ "Dysregulation", "of", "monocytic", "nuclear", "factor", "-", "kappa", "B", "by", "oxidized", "low", "-", "density", "lipoprotein", "." ]
[ "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]
7985
[ "The", "aim", "of", "the", "present", "study", "was", "to", "investigate", "the", "effects", "of", "oxidized", "LDL", "(", "oxLDL", ")", "on", "the", "NF", "-", "kappa", "B", "system", "in", "human", "THP", "-", "1", "monocytic", "cells", "as", "well",...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7986
[ "In", "contrast", ",", "long", "-", "term", "treatment", "with", "oxLDL", "prevented", "the", "lipopolysaccharide", "-", "induced", "depletion", "of", "I", "kappa", "B", "-", "alpha", ",", "accompanied", "by", "an", "inhibition", "of", "both", "NF", "-", "...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "...
7987
[ "Suppression", "of", "nuclear", "factor", "kappa", "B", "and", "CD18", "-", "mediated", "leukocyte", "adhesion", "to", "the", "corneal", "endothelium", "by", "dexamethasone", "." ]
[ "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7988
[ "METHODS", ":", "Cultured", "bovine", "corneal", "endothelium", "was", "stimulated", "for", "6", "hours", "by", "40", "micron", "/", "ml", "tumor", "necrosis", "factor", "alpha", "(", "TNFalpha", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "O", "O" ]
7989
[ "Dexamethasone", "was", "added", "1", "hour", "before", "TNFalpha", "stimulation", "in", "the", "dexamethasone", "group", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7990
[ "After", "stimulation", ",", "neutrophils", "separated", "from", "a", "healthy", "human", "volunteer", "were", "added", "with", "or", "without", "anti", "-", "CD18", "antibody", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]
7991
[ "The", "culture", "plate", "was", "settled", "for", "15", "minutes", "at", "37", "degrees", "C", ",", "and", "then", "neutrophils", "were", "activated", "by", "N", "-", "formyl", "-", "methionyl", "-", "leucyl", "-", "phenylalanine", "for", "5", "minutes",...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7992
[ "The", "intracellular", "localization", "of", "NFkappaB", "after", "TNFalpha", "simulation", "was", "determined", "by", "confocal", "immunocytochemistry", "using", "an", "anti", "-", "p65", "antibody", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]
7993
[ "This", "increased", "adhesion", "was", "suppressed", "by", "the", "addition", "of", "anti", "-", "CD18", "antibody", "(", "157", ".", "6", "+", "/", "-", "25", ".", "1", "cells", "/", "mm2", ",", "n", "=", "8", ",", "P", "<", "0", ".", "01", "...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
7994
[ "Immunocytochemistry", "60", "minutes", "after", "stimulation", "revealed", "that", "NFkappaB", "was", "located", "in", "the", "cytoplasm", "in", "unstimulated", "cells", ";", "however", ",", "the", "addition", "of", "TNFalpha", "caused", "NFkappaB", "to", "transl...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7995
[ "Pretreatment", "with", "dexamethasone", "tapered", "NFkappaB", "translocation", "into", "the", "nucleus", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7996
[ "CONCLUSIONS", ":", "Leukocyte", "adhesion", "to", "the", "corneal", "endothelium", "was", "shown", "to", "be", "mediated", "by", "CD18", "expressed", "on", "activated", "leukocytes", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7997
[ "Pretreatment", "of", "the", "endothelium", "with", "dexamethasone", "inhibited", "leukocyte", "adhesion", ";", "this", "may", "be", "due", "in", "part", "to", "the", "suppression", "of", "NFkappaB", "entry", "into", "the", "nucleus", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7998
[ "Molecular", "characterization", "and", "pattern", "of", "tissue", "expression", "of", "the", "gene", "for", "neutrophil", "gelatinase", "-", "associated", "lipocalin", "from", "humans", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O" ]
7999
[ "Neutrophil", "gelatinase", "-", "associated", "lipocalin", "(", "NGAL", ")", "is", "a", "25", "-", "kDa", "lipocalin", "first", "identified", "as", "a", "protein", "stored", "in", "specific", "granules", "of", "the", "human", "neutrophil", "." ]
[ "B", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
8000
[ "The", "protein", "is", "believed", "to", "bind", "small", "lipophilic", "substances", "such", "as", "bacterial", "derived", "formylpeptides", "and", "lipopolysaccharides", "(", "LPS", ")", "and", "might", "function", "as", "a", "modulator", "of", "inflammation", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]