Datasets:
siddharthtumre
/
JNLPBA-Processed

Dataset card Data Studio Files
xet
 Community
id
stringlengths
1
5
tokens
list
ner_tags
list
7501
[ "When", "monocytes", "are", "stimulated", "with", "LPS", "(", "lipopolysaccharide", ")", "repeatedly", "then", "the", "initially", "high", "expression", "of", "the", "TNF", "(", "tumor", "necrosis", "factor", ")", "gene", "is", "only", "very", "low", ",", "i...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7502
[ "Tolerant", "cells", "still", "express", "the", "CD14", "receptor", "and", "they", "can", "still", "be", "activated", "to", "mobilize", "NF", "-", "kappa", "B", "into", "nucleus", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O" ]
7503
[ "Analysis", "of", "the", "binding", "proteins", "employing", "the", "-", "605", "motif", "of", "the", "human", "TNF", "promoter", "(", "GGGGCTGTCCC", ")", "revealed", "that", "in", "tolerant", "cells", "of", "the", "human", "monocytic", "cell", "line", "Mono...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]
7504
[ "We", "now", "show", "that", "a", "mutant", "motif", "that", "exchanges", "the", "terminal", "3", "'", "C", "for", "a", "G", "fails", "to", "bind", "the", "p50", "homodimer", "that", "is", "upregulated", "in", "LPS", "toler", "ant", "human", "Mono", "M...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7505
[ "The", "same", "is", "true", "for", "nuclear", "extracts", "taken", "from", "the", "murine", "P388D1", "macrophage", "cell", "line", "when", "tested", "with", "the", "-", "516", "motif", "of", "the", "murine", "TNF", "promoter", "(", "GGGGGCTTTCCC", ")", "...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O" ]
7506
[ "Here", "the", "wild", "type", "motif", "gives", "efficient", "binding", "of", "p50p50", "that", "again", "is", "upregulated", "in", "tolerant", "cells", "whereas", "a", "mutant", "with", "a", "3", "'", "G", "shows", "hardly", "any", "binding", "of", "p50p...
[ "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O" ]
7507
[ "Conversely", ",", "the", "murine", "kappa", "light", "chain", "enhancer", "motif", "(", "GGGGACTTTCCG", ")", "does", "not", "efficiently", "bind", "the", "nuclear", "p50p50", "from", "tolerant", "murine", "P388", "macrophages", "." ]
[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7508
[ "Binding", "is", ",", "however", ",", "readily", "detected", "when", "the", "3", "'", "G", "is", "replaced", "by", "a", "C", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7509
[ "These", "data", "show", "that", "the", "detection", "of", "upregulated", "p50", "homodimers", "in", "LPS", "tolerant", "cells", "is", "dependent", "on", "subtle", "differences", "in", "the", "sequence", "of", "the", "DNA", "binding", "motif", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]
7510
[ "Cyclosporin", "A", "(", "CsA", ")", "may", "achieve", "its", "immunosuppressive", "effects", "by", "inhibiting", "the", "calcium", "-", "and", "calmodulin", "-", "dependent", "phosphatase", "calcineurin", "which", "is", "required", "for", "activation", "of", "t...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "...
7511
[ "Among", "these", "target", "genes", "is", "the", "gene", "encoding", "interleukin", "-", "2", "(", "IL2", ")", ",", "a", "cytokine", "facilitating", "progression", "through", "the", "G1", "phase", "of", "the", "cell", "cycle", "." ]
[ "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7512
[ "However", ",", "IL2", "does", "not", "reverse", "CsA", "inhibition", ",", "suggesting", "that", "at", "least", "one", "other", "NFAT", "-", "sensitive", "gene", "may", "be", "involved", "." ]
[ "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O" ]
7513
[ "The", "human", "G0", "/", "G1", "switch", "gene", ",", "G0S2", ",", "has", "potential", "NFAT", "-", "binding", "sites", "in", "the", "5", "'", "flank", "and", "encodes", "a", "small", "basic", "potential", "phosphoprotein", "of", "unknown", "function", ...
[ "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O" ]
7514
[ "Using", "a", "sensitive", ",", "reverse", "transcription", "-", "polymerase", "chain", "reaction", "(", "RT", "-", "PCR", ")", "assay", ",", "G0S2", "mRNA", "levels", "were", "assayed", "in", "cultured", "blood", "mononuclear", "cells", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7515
[ "Freshly", "isolated", "cells", "contain", "high", "levels", "of", "G0S2", "mRNA", "which", "rapidly", "decline", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O" ]
7516
[ "This", "`", "`", "spontaneous", "stimulation", "'", "'", "is", "also", "noted", "with", "some", "other", "G0S", "genes", "and", "has", "been", "attributed", "to", "some", "aspect", "of", "the", "isolation", "procedure", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7517
[ "Both", "these", "responses", "are", "inhibited", "by", "CsA", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7518
[ "Our", "results", "suggest", "that", "G0S2", "expression", "is", "required", "to", "commit", "cells", "to", "enter", "the", "G1", "phase", "of", "the", "cell", "cycle", ",", "and", "that", ",", "while", "not", "excluding", "other", "possible", "targets", "...
[ "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7519
[ "G0S2", "may", "be", "of", "value", "as", "a", "reporter", "gene", "for", "analyzing", "the", "mechanism", "of", "action", "of", "CsA", "and", "its", "influence", "on", "the", "positive", "and", "negative", "selection", "of", "lymphocytes", "in", "response",...
[ "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7520
[ "c", "-", "Rel", "and", "p65", "subunits", "bind", "to", "an", "upstream", "NF", "-", "kappaB", "site", "in", "human", "granulocyte", "macrophage", "-", "colony", "stimulating", "factor", "promoter", "involved", "in", "phorbol", "ester", "response", "in", "5...
[ "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7521
[ "To", "further", "clarify", "the", "complex", "transcriptional", "regulation", "of", "the", "human", "GM", "-", "CSF", "gene", ",", "which", "was", "extensively", "investigated", "in", "activated", "T", "cells", ",", "we", "have", "studied", "the", "role", "...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
7522
[ "This", "sequence", ",", "named", "the", "A", "element", ",", "has", "an", "active", "role", "on", "GM", "-", "CSF", "transcription", "and", "is", "responsive", "to", "the", "tumor", "promoter", "PMA", "in", "transient", "transfection", "experiments", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7523
[ "We", "describe", "here", "a", "heterodimeric", "binding", "complex", "of", "NF", "-", "kappaB", "subunits", "(", "c", "-", "Rel", "and", "p65", ")", "which", "is", "identical", "to", "the", "one", "obtained", "using", "the", "HIV", "-", "LTR", "-", "k...
[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "...
7524
[ "Repression", "of", "human", "immunodeficiency", "virus", "type", "1", "through", "the", "novel", "cooperation", "of", "human", "factors", "YY1", "and", "LSF", "[", "published", "erratum", "appears", "in", "J", "Virol", "1998", "Feb", ";", "72", "(", "2", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "B", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7525
[ "A", "subpopulation", "of", "stably", "infected", "CD4", "+", "cells", "capable", "of", "producing", "virus", "upon", "stimulation", "has", "been", "identified", "in", "human", "immunodeficiency", "virus", "(", "HIV", ")", "-", "positive", "individuals", "(", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
7526
[ "Few", "host", "factors", "that", "directly", "limit", "HIV", "-", "1", "transcription", "and", "could", "support", "this", "state", "of", "nonproductive", "HIV", "-", "1", "infection", "have", "been", "described", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7527
[ "We", "report", "that", "both", "YY1", "and", "LSF", "participate", "in", "the", "formation", "of", "a", "complex", "that", "recognizes", "the", "initiation", "region", "of", "the", "HIV", "-", "1", "LTR", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]
7528
[ "Further", ",", "we", "have", "found", "that", "these", "factors", "cooperate", "in", "the", "repression", "of", "LTR", "expression", "and", "viral", "replication", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7529
[ "This", "cooperative", "function", "may", "account", "for", "the", "divergent", "effects", "of", "LSF", "previously", "observed", "in", "vitro", "and", "in", "vivo", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7530
[ "Thus", ",", "the", "cooperation", "of", "two", "general", "cellular", "transcription", "factors", "may", "allow", "for", "the", "selective", "downregulation", "of", "HIV", "transcription", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7531
[ "Through", "this", "mechanism", "of", "gene", "regulation", ",", "YY1", "and", "LSF", "could", "contribute", "to", "the", "establishment", "and", "maintenance", "of", "a", "population", "of", "cells", "stably", "but", "nonproductively", "infected", "with", "HIV"...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7532
[ "Analysis", "of", "interactions", "between", "huGATA", "-", "3", "transcription", "factor", "and", "three", "GATA", "regulatory", "elements", "of", "HIV", "-", "1", "long", "terminal", "repeat", ",", "by", "surface", "plasmon", "resonance", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7533
[ "For", "this", "purpose", ",", "human", "GATA", "-", "3", ",", "either", "recombinant", "or", "in", "nuclear", "extracts", ",", "and", "three", "natural", "GATA", "elements", "of", "the", "HIV", "-", "1", "long", "terminal", "repeat", "(", "sites", "1", ...
[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "...
7534
[ "Direct", "analysis", "of", "sensorgrams", ",", "with", "recombinant", "huGATA", "-", "3", ",", "allowed", "the", "comparison", "of", "association", "and", "dissociation", "profiles", "of", "the", "three", "DNA", "regions", "and", "their", "ranking", "according"...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7535
[ "Interactions", "between", "the", "canonical", "and", "unique", "GATA", "site", "3", "and", "nuclear", "extracts", "were", "also", "studied", "in", "real", "time", "and", "provided", "information", "on", "its", "association", "and", "dissociation", "rates", "for...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]
7536
[ "Finally", ",", "recovered", "protein", "was", "identified", "as", "genuine", "huGATA", "-", "3", "by", "SDS", "-", "PAGE", ",", "Western", "blotting", ",", "and", "bandshift", "assays", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7537
[ "Copyright", "1997", "Academic", "Press", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O" ]
7538
[ "Although", "retinoic", "acid", "(", "RA", ")", "has", "been", "known", "for", "many", "years", "to", "be", "a", "modulating", "agent", "that", "plays", "a", "role", "in", "generating", "both", "granulocytes", "and", "monocytes", ",", "the", "molecular", "...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7539
[ "In", "particular", ",", "the", "part", "played", "by", "the", "retinoid", "X", "receptors", "(", "RXRs", ")", ",", "which", "are", "members", "of", "the", "steroid", "/", "thyroid", "hormone", "nuclear", "receptor", "family", ",", "has", "not", "been", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7540
[ "In", "this", "study", ",", "therefore", ",", "the", "human", "monoblastic", "leukemia", "cell", "line", "U937", "has", "been", "used", "as", "a", "model", "system", "to", "investigate", "the", "role", "of", "one", "of", "the", "RXRs", ",", "RXR", "-", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7541
[ "RXR", "-", "alpha", "mRNA", "was", "present", "in", "untreated", "U937", "cells", ",", "and", "levels", "increased", "after", "induction", "of", "differentiation", "with", "phorbol", "ester", "." ]
[ "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7542
[ "The", "same", "was", "found", "for", "RXR", "-", "beta", "mRNA", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]
7543
[ "Using", "plasmids", "containing", "sense", "or", "antisense", "RXR", "-", "alpha", "sequences", "under", "the", "control", "of", "an", "inducible", "promoter", ",", "we", "generated", "stably", "transfected", "cell", "lines", "which", "expressed", "either", "in...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O" ]
7544
[ "The", "sense", "cell", "lines", "(", "U", "alpha", "S", "and", "its", "clonal", "derivative", "alpha", "G2S", ")", "showed", "increased", "sensitivity", "to", "RA", ",", "while", "the", "antisense", "cell", "lines", "(", "U", "alpha", "A", "and", "its",...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
7545
[ "Both", "U", "alpha", "A", "and", "alpha", "B5A", "also", "failed", "to", "respond", "to", "another", "modulating", "agent", ",", "1", "alpha", ",", "25", "-", "dihydroxycholecalcif", "(", "DHCC", ")", ",", "but", "only", "U", "alpha", "S", "and", "not...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7546
[ "The", "combination", "of", "RA", "and", "DHCC", "together", "inhibited", "growth", "of", "both", "sense", "and", "antisense", "cell", "lines", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7547
[ "In", "addition", ",", "alpha", "G2S", "exhibited", "increased", "expression", "of", "CD11b", "and", "CD54", ",", "while", "alpha", "B5A", "cells", "showed", "increased", "expression", "of", "CD102", ",", "suggesting", "that", "RXR", "-", "alpha", "has", "a"...
[ "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O" ]
7548
[ "These", "results", "demonstrate", "that", "RXR", "-", "alpha", "has", "a", "role", "in", "mediating", "growth", "inhibition", "and", "cell", "adhesion", "during", "myelomonocytic", "differentiation", ",", "and", "suggest", "that", "different", "species", "of", ...
[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
7549
[ "Transcriptional", "activation", "of", "the", "vascular", "cell", "adhesion", "molecule", "-", "1", "gene", "in", "T", "lymphocytes", "expressing", "human", "T", "-", "cell", "leukemia", "virus", "type", "1", "Tax", "protein", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O" ]
7550
[ "Recruitment", "and", "extravasation", "of", "T", "cells", "through", "the", "blood", "-", "brain", "barrier", "are", "favored", "by", "adhesion", "molecule", "-", "mediated", "interactions", "of", "circulating", "T", "cells", "with", "endothelial", "cells", "."...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7551
[ "Since", "a", "common", "pathological", "finding", "in", "human", "T", "-", "cell", "leukemia", "virus", "type", "1", "(", "HTLV", "-", "1", ")", "-", "associated", "diseases", "is", "the", "infiltration", "of", "HTLV", "-", "1", "-", "infected", "T", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "...
7552
[ "Flow", "cytometry", "analysis", "indicated", "that", "these", "cells", "were", "expressing", "high", "levels", "of", "vascular", "cell", "adhesion", "molecule", "1", "(", "VCAM", "-", "1", "[", "CD106", "]", ")", ",", "a", "110", "-", "kDa", "member", "...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "...
7553
[ "This", "adhesion", "molecule", "was", "also", "expressed", "by", "T", "cells", "obtained", "from", "one", "patient", "with", "HTLV", "-", "1", "-", "associated", "myelopathy", "/", "tropical", "spastic", "paraparesis", "but", "not", "by", "activated", "T", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7554
[ "Finally", ",", "gel", "mobility", "shift", "assays", "demonstrated", "the", "nuclear", "translocation", "of", "proteins", "specifically", "bound", "to", "these", "two", "NF", "-", "kappaB", "motifs", ",", "confirming", "that", "VCAM", "-", "1", "was", "induce...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O" ]
7555
[ "Collectively", ",", "these", "results", "therefore", "suggest", "that", "the", "exclusive", "Tax", "-", "induced", "expression", "of", "VCAM", "-", "1", "on", "T", "cells", "may", "represent", "a", "pivotal", "event", "in", "the", "progression", "of", "HTLV...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7556
[ "HIV", "-", "1", "Vpr", "suppresses", "immune", "activation", "and", "apoptosis", "through", "regulation", "of", "nuclear", "factor", "kappa", "B", "[", "see", "comments", "]" ]
[ "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O" ]
7557
[ "The", "HIV", "-", "1", "accessory", "gene", "product", "Vpr", "can", "influence", "viral", "pathogenesis", "by", "affecting", "viral", "replication", "as", "well", "as", "host", "cell", "transcription", "and", "proliferation", "." ]
[ "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7558
[ "However", ",", "we", "have", "also", "found", "that", "Vpr", "modulates", "T", "-", "cell", "receptor", "(", "TCR", ")", "-", "triggered", "apoptosis", "in", "a", "manner", "similar", "to", "that", "of", "glucocorticoids", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7559
[ "This", "regulation", "of", "apoptosis", "is", "linked", "to", "Vpr", "suppression", "of", "NF", "-", "kappa", "B", "activity", "via", "the", "induction", "of", "I", "kappa", "B", ",", "an", "inhibitor", "of", "NF", "-", "kappa", "B", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]
7560
[ "Further", ",", "Vpr", "suppresses", "expression", "of", "IL", "-", "2", ",", "IL", "-", "10", ",", "IL", "-", "12", ",", "TNF", "alpha", "and", "IL", "-", "4", ",", "all", "of", "which", "are", "NF", "-", "kappa", "B", "-", "dependent", "." ]
[ "O", "O", "B", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O" ]
7561
[ "The", "effects", "of", "Vpr", "could", "be", "reversed", "by", "RU486", "." ]
[ "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7562
[ "Tissue", "transglutaminase", "-", "dependent", "posttranslational", "modification", "of", "the", "retinoblastoma", "gene", "product", "in", "promonocytic", "cells", "undergoing", "apoptosis", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7563
[ "The", "retinoblastoma", "gene", "product", "(", "pRB", ")", "plays", "an", "important", "role", "in", "controlling", "both", "cell", "release", "from", "the", "G1", "phase", "and", "apoptosis", "." ]
[ "O", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7564
[ "We", "show", "here", "that", "in", "the", "early", "phases", "of", "apoptosis", ",", "pRB", "is", "posttranslationally", "modified", "by", "a", "tissue", "transglutaminase", "(", "tTG", ")", "-", "catalyzed", "reaction", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7565
[ "In", "keeping", "with", "this", "finding", ",", "we", "showed", "that", "apoptosis", "of", "U937", "cells", "is", "characterized", "by", "the", "rapid", "disappearance", "of", "the", "105", ",", "000", "-", "to", "110", ",", "000", "-", "molecular", "-"...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
7566
[ "The", "shift", "in", "pRB", "molecular", "weight", "was", "reproduced", "by", "adding", "exogenous", "purified", "tTG", "to", "extracts", "obtained", "from", "viable", "U937", "cells", "and", "was", "prevented", "by", "dansylcadaverine", ",", "a", "potent", "...
[ "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7567
[ "The", "effect", "of", "the", "pRB", "posttranslational", "modification", "during", "apoptosis", "was", "investigated", "by", "determining", "the", "E2F", "-", "1", "levels", "and", "by", "isolating", "and", "characterizing", "pRB", "-", "null", "clones", "from"...
[ "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7568
[ "Notably", ",", "the", "lack", "of", "pRB", "in", "these", "U937", "-", "derived", "clones", "renders", "these", "p53", "-", "null", "cells", "highly", "resistant", "to", "apoptosis", "induced", "by", "serum", "withdrawal", ",", "calphostin", "C", ",", "an...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7569
[ "Taken", "together", ",", "these", "data", "suggest", "that", "tTG", ",", "acting", "on", "the", "pRB", "protein", ",", "might", "play", "an", "important", "role", "in", "the", "cell", "progression", "through", "the", "death", "program", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7570
[ "STAT3", "is", "a", "serine", "kinase", "target", "in", "T", "lymphocytes", "." ]
[ "B", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O" ]
7571
[ "Interleukin", "2", "and", "T", "cell", "antigen", "receptor", "signals", "converge", "upon", "serine", "727", "." ]
[ "B", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7572
[ "We", "now", "show", "that", "IL", "-", "2", "regulation", "of", "STAT3", "proteins", "in", "T", "cells", "is", "a", "complex", "response", "involving", "activation", "of", "two", "forms", "of", "STAT3", ":", "90", "-", "kDa", "STAT3alpha", "and", "an", ...
[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O" ]
7573
[ "The", "phosphorylation", "of", "STAT", "proteins", "on", "serine", "residues", "is", "also", "required", "for", "competent", "STAT", "transcription", "." ]
[ "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O" ]
7574
[ "A", "critical", "serine", "phosphorylation", "site", "in", "STAT3alpha", "is", "at", "position", "727", "." ]
[ "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7575
[ "In", "this", "study", "we", "have", "produced", "an", "antisera", "specific", "for", "STAT3alpha", "proteins", "phosphorylated", "on", "serine", "727", "and", "used", "this", "to", "monitor", "the", "phosphorylation", "of", "this", "residue", "during", "T", "...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7576
[ "Our", "results", "show", "that", "phosphorylation", "of", "STAT3alpha", "on", "serine", "727", "is", "not", "constitutive", "in", "quiescent", "T", "cells", "but", "can", "be", "induced", "by", "the", "cytokine", "IL", "-", "2", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]
7577
[ "Interestingly", ",", "triggering", "of", "the", "T", "cell", "antigen", "receptor", "complex", "or", "activation", "of", "protein", "kinase", "C", "with", "phorbol", "esters", "also", "induces", "phosphorylation", "of", "serine", "727", "but", "without", "simul...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7578
[ "Hence", ",", "the", "present", "results", "show", "that", "STAT3", "serine", "phosphorylation", "can", "be", "regulated", "independently", "of", "the", "tyrosine", "phosphorylation", "of", "this", "molecule", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7579
[ "Previous", "studies", "have", "identified", "H", "-", "7", "-", "sensitive", "kinase", "pathways", "that", "regulate", "STAT3", "DNA", "binding", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O" ]
7580
[ "We", "show", "that", "H", "-", "7", "-", "sensitive", "pathways", "regulate", "STAT3", "DNA", "binding", "in", "T", "cells", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7581
[ "Nevertheless", ",", "we", "show", "that", "H", "-", "7", "-", "sensitive", "kinases", "do", "not", "regulate", "STAT3", "tyrosine", "phosphorylation", "or", "phosphorylation", "of", "serine", "727", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7582
[ "NF", "-", "kappa", "B", "/", "Rel", "family", "members", "regulating", "the", "ICAM", "-", "1", "promoter", "in", "monocytic", "THP", "-", "1", "cells", "." ]
[ "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7583
[ "A", "kappa", "B", "-", "site", "was", "identified", "in", "the", "promoter", "of", "the", "intercellular", "adhesion", "molecule", "-", "1", "(", "ICAM", "-", "1", ")", "gene", ",", "which", "is", "involved", "in", "regulation", "of", "ICAM", "-", "1"...
[ "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "...
7584
[ "We", "now", "report", "on", "the", "transcription", "factors", "which", "bind", "and", "transactivate", "this", "enhancer", "sequence", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O" ]
7585
[ "In", "vitro", ",", "the", "ICAM", "-", "1", "kappa", "B", "site", "appeared", "to", "bind", "RelA", "and", "c", "-", "Rel", "homodimers", "as", "well", "as", "heterodimers", "with", "NF", "-", "kappa", "B1", ",", "but", "weakly", "NF", "-", "kappa",...
[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O" ]
7586
[ "In", "monocytic", "THP", "-", "1", "cells", "TNF", "-", "alpha", "induced", "two", "nuclear", "complexes", "which", "in", "vitro", "bound", "to", "the", "ICAM", "-", "1", "kappa", "B", "site", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O" ]
7587
[ "Using", "antibodies", "in", "an", "electrophoretic", "mobility", "supershift", "assay", ",", "one", "of", "these", "complexes", "was", "shown", "to", "contain", "NF", "-", "kappa", "B1", "and", "RelA", ",", "and", "to", "bind", "with", "higher", "affinity",...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]
7588
[ "The", "second", "complex", "contained", "RelA", ",", "and", "exhibited", "higher", "affinity", "towards", "the", "ICAM", "-", "1", "kappa", "B", "than", "to", "the", "HIV", "kappa", "B", "site", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]
7589
[ "The", "glucocorticoid", "receptor", "was", "shown", "to", "repress", "activity", "of", "both", "the", "RelA", "homodimer", "and", "the", "NF", "-", "kappa", "B1", "/", "RelA", "heterodimer", "." ]
[ "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O" ]
7590
[ "We", "argue", "that", "in", "vivo", "RelA", "homodimers", "are", "likely", "to", "play", "a", "dominant", "role", "in", "TNF", "-", "alpha", "-", "induced", "ICAM", "-", "1", "transcription", "in", "monocytic", "cells", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7591
[ "The", "human", "autosomal", "recessive", "disease", ",", "xeroderma", "pigmentosum", "(", "XP", ")", ",", "can", "result", "from", "mutations", "in", "any", "one", "of", "seven", "genes", ",", "designated", "XPA", "through", "XPG", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "O" ]
7592
[ "Of", "these", ",", "the", "XPB", "and", "XPD", "genes", "encode", "proteins", "that", "are", "subunits", "of", "a", "general", "transcription", "factor", ",", "TFIIH", ",", "involved", "in", "both", "nucleotide", "excision", "repair", "(", "NER", ")", "an...
[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]
7593
[ "In", "humans", ",", "mutation", "of", "the", "XPB", "or", "XPD", "gene", "impairs", "NER", ",", "resulting", "in", "hyper", "-", "sensitivity", "to", "sunlight", "and", "greatly", "increased", "skin", "tumor", "formation", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7594
[ "However", ",", "no", "transcription", "deficiency", "has", "been", "demonstrated", "in", "either", "XP", "-", "B", "or", "XP", "-", "D", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7595
[ "Although", "the", "growth", "rate", "was", "normal", ",", "the", "XP", "-", "B", "and", "XP", "-", "D", "cells", "contained", "reduced", "amounts", "of", "TFIIH", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O" ]
7596
[ "Extracts", "prepared", "from", "XP", "-", "B", "and", "XP", "-", "D", "lymphoblastoid", "cells", "exhibited", "similar", "transcription", "activity", "from", "the", "adenovirus", "major", "late", "promoter", "when", "compared", "to", "that", "in", "extracts", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7597
[ "Thus", ",", "we", "conclude", "that", "the", "XP", "-", "B", "and", "XP", "-", "D", "lymphoblastoid", "cells", "do", "not", "have", "impaired", "RNA", "transcription", "activity", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
7598
[ "We", "consider", "the", "possible", "consequences", "of", "the", "reduced", "cellular", "content", "of", "TFIIH", "for", "the", "clinical", "symptoms", "in", "XP", "-", "B", "or", "XP", "-", "D", "patients", ",", "and", "discuss", "a", "'", "conditional",...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
7599
[ "A", "novel", "form", "of", "the", "myeloid", "-", "specific", "zinc", "finger", "protein", "(", "MZF", "-", "2", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O" ]
7600
[ "BACKGROUND", ":", "Myeloid", "cell", "development", "is", "controlled", "by", "tissue", "-", "specific", "transcription", "factors", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O" ]