siddharthtumre/JNLPBA-Processed · Datasets at Hugging Face

id stringlengths 1 5	tokens list	ner_tags list
5801	[ "Initiation", "of", "DNA", "replication", "requires", "the", "function", "of", "MCM", "gene", "products", ",", "which", "participate", "in", "ensuring", "that", "DNA", "replication", "occurs", "only", "once", "in", "the", "cell", "cycle", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5802	[ "Expression", "of", "all", "mammalian", "genes", "of", "the", "MCM", "family", "is", "induced", "by", "growth", "stimulation", ",", "unlike", "yeast", ",", "and", "the", "mRNA", "levels", "peak", "at", "G1", "/", "S", "boundary", "." ]	[ "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5803	[ "In", "this", "study", ",", "we", "examined", "the", "transcriptional", "activities", "of", "isolated", "human", "MCM", "gene", "promoters", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O" ]
5804	[ "Human", "MCM5", "and", "MCM6", "promoters", "with", "mutation", "in", "the", "E2F", "sites", "failed", "in", "promoter", "regulation", "following", "serum", "stimulation", "and", "exogenous", "E2F", "expression", "." ]	[ "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O" ]
5805	[ "In", "addition", ",", "we", "identified", "a", "novel", "E2F", "-", "like", "sequence", "in", "human", "MCM6", "promoter", "which", "cooperates", "with", "the", "authentic", "E2F", "sites", "in", "E2F", "-", "dependent", "regulation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O" ]
5806	[ "Forced", "expression", "of", "E2F1", "could", "induce", "expression", "of", "all", "members", "of", "the", "endogenous", "MCM", "genes", "in", "rat", "embryonal", "fibroblast", "REF52", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5807	[ "Our", "results", "demonstrated", "that", "the", "growth", "-", "regulated", "expression", "of", "mammalian", "MCM5", "and", "MCM6", "genes", ",", "and", "presumably", "other", "MCM", "members", ",", "is", "primarily", "regulated", "by", "E2F", "through", "bin...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "O" ]
5808	[ "An", "essential", "role", "for", "NF", "-", "kappaB", "in", "human", "CD34", "(", "+", ")", "bone", "marrow", "cell", "survival", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5809	[ "The", "transcription", "factor", ",", "NF", "-", "kappaB", ",", "is", "important", "for", "T", "-", "cell", "activation", ",", "B", "-", "cell", "maturation", ",", "and", "human", "immunodeficiency", "virus", "transcription", "and", "plays", "a", "role", ...	[ "O", "B", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5810	[ "However", ",", "a", "role", "for", "NF", "-", "kappaB", "in", "human", "CD34", "(", "+", ")", "bone", "marrow", "cells", "has", "not", "been", "described", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5811	[ "We", "provide", "evidence", "here", "that", "virtually", "all", "human", "CD34", "(", "+", ")", "bone", "marrow", "cells", "express", "NF", "-", "kappaB", "that", "can", "be", "activated", "by", "exposure", "to", "phorbol", "12", "-", "myristate", "13", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "...
5812	[ "In", "addition", ",", "we", "demonstrate", "that", "NF", "-", "kappaB", "may", "be", "required", "for", "human", "CD34", "(", "+", ")", "bone", "marrow", "cell", "clonogenic", "function", "and", "survival", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5813	[ "These", "results", "offer", "insight", "into", "a", "new", "role", "for", "NF", "-", "kappaB", "in", "maintaining", "survival", "and", "function", "in", "hematopoietic", "stem", "and", "progenitor", "cells", "and", "suggest", "that", "proposed", "strategies", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
5814	[ "High", "molecular", "weight", "dextran", "sulfate", "increases", "the", "activity", "of", "NF", "-", "kappaB", "-", "regulated", "promoter", "in", "monocyte", "-", "derived", "macrophages", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5815	[ "It", "is", "known", "that", "sulfated", "polysaccharides", "can", "mimic", "the", "action", "of", "common", "T", "-", "cell", "mitogens", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O" ]
5816	[ "To", "investigate", "the", "molecular", "basis", "of", "the", "mitogenic", "effect", "of", "high", "molecular", "weight", "dextran", "sulfate", "(", "HMDS", ")", ",", "monocyte", "-", "derived", "macrophages", "were", "transfected", "with", "recombinant", "plas...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "...
5817	[ "We", "observed", "that", "HMDS", ",", "similar", "to", "bacterial", "lipopolysaccharide", "(", "LPS", ")", ",", "increases", "the", "expression", "of", "CAT", "reporter", "gene", "suggesting", "increased", "activity", "of", "NF", "-", "kappaB", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]
5818	[ "The", "activation", "of", "NF", "-", "kappaB", "correlated", "with", "the", "increased", "expression", "of", "B7", ".", "1", "molecules", "." ]	[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]
5819	[ "It", "was", "postulated", "that", "this", "NF", "-", "kappaB", "-", "regulated", "promoter", "might", "play", "a", "role", "in", "the", "activation", "of", "the", "accessory", "cells", "as", "well", "as", "the", "rate", "of", "replication", "of", "HIV", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5820	[ "We", "demonstrate", "here", "that", "the", "expression", "of", "the", "lysosomal", "enzyme", "acid", "sphingomyelinase", "(", "ASM", ";", "E", ".", "C", ".", "3", ".", "1", ".", "4", ".", "12", ")", "is", "induced", "during", "this", "process", "and",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
5821	[ "Using", "Northern", "blotting", ",", "RNase", "protection", "assay", ",", "and", "nuclear", "run", "-", "on", "analyses", ",", "we", "show", "that", "the", "up", "-", "regulation", "of", "ASM", "expression", "is", "regulated", "mainly", "at", "the", "leve...	[ "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5822	[ "This", "cell", "-", "type", "specific", "induction", "by", "PMA", "treatment", "was", "further", "investigated", "with", "respect", "to", "transcriptional", "control", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5823	[ "A", "series", "of", "5", "'", "deletion", "derivatives", "of", "the", "upstream", "regulatory", "region", "were", "used", "in", "transient", "transfection", "assays", "to", "identify", "promoter", "elements", "required", "for", "basal", "and", "inducible", "gen...	[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5824	[ "Using", "electrophoretic", "mobility", "shift", "assays", "and", "supershift", "assays", "we", "demonstrate", "that", "this", "region", "is", "specifically", "bound", "by", "Sp1", "and", "AP", "-", "2", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "I", "I", "O" ]
5825	[ "These", "factors", "are", "present", "in", "nuclear", "extracts", "prepared", "from", "both", "induced", "and", "uninduced", "THP", "-", "1", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5826	[ "From", "these", "studies", ",", "we", "conclude", "that", "a", "concerted", "action", "of", "the", "transcription", "factors", "AP", "-", "2", "and", "Sp1", "is", "essential", "for", "the", "up", "-", "regulation", "of", "ASM", "expression", "during", "th...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5827	[ "LPS", "-", "Induced", "NF", "-", "kappaB", "activation", "and", "TNF", "-", "alpha", "release", "in", "human", "monocytes", "are", "protein", "tyrosine", "kinase", "dependent", "and", "protein", "kinase", "C", "independent", "." ]	[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O" ]
5828	[ "BACKGROUND", ":", "Tumor", "necrosis", "factor", "alpha", "(", "TNF", "-", "alpha", ")", "is", "an", "important", "mediator", "of", "septic", "shock", "." ]	[ "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5829	[ "Endotoxin", "(", "LPS", ")", "signal", "transduction", "in", "human", "monocytes", "leads", "to", "activation", "of", "nuclear", "factor", "-", "kappa", "B", "(", "NF", "-", "kappaB", ")", "and", "TNF", "-", "alpha", "release", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O" ]
5830	[ "Previous", "studies", "have", "implicated", "activation", "of", "both", "protein", "kinase", "C", "(", "PKC", ")", "and", "protein", "tyrosine", "kinases", "(", "PTK", ")", "in", "LPS", "-", "induced", "NF", "-", "kappaB", "activation", "and", "TNF", "-",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O" ]
5831	[ "We", "hypothesized", "that", "inhibition", "of", "either", "PKC", "or", "PTK", "would", "decrease", "LPS", "-", "induced", "NF", "-", "kappaB", "DNA", "binding", "and", "TNF", "-", "alpha", "release", "in", "human", "monocytes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5832	[ "MATERIALS", "AND", "METHODS", ":", "Human", "monocytes", "were", "stimulated", "with", "PMA", "(", "50", "ng", "/", "ml", ")", "alone", "or", "LPS", "(", "100", "ng", "/", "ml", ")", "with", "and", "without", "a", "nonspecific", "serine", "/", "threon...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
5833	[ "TNF", "-", "alpha", "release", "in", "culture", "supernatants", "was", "measured", "by", "an", "ELISA", "." ]	[ "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5834	[ "RESULTS", ":", "LPS", "increased", "NF", "-", "kappaB", "DNA", "binding", "and", "TNF", "-", "alpha", "release", "in", "human", "monocytes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5835	[ "Nonspecific", "protein", "kinase", "inhibition", "inhibited", "NF", "-", "kappaB", "activation", "and", "TNF", "-", "alpha", "release", ",", "while", "specific", "PKC", "inhibition", "with", "Bis", "had", "no", "effect", "on", "LPS", "-", "induced", "NF", "...	[ "O", "B", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O" ]
5836	[ "PTK", "inhibition", "with", "Gen", "attenuated", "both", "LPS", "-", "induced", "NF", "-", "kappaB", "DNA", "binding", "and", "TNF", "-", "alpha", "production", "in", "human", "monocytes", "." ]	[ "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5837	[ "CONCLUSIONS", ":", "These", "results", "suggest", "that", "LPS", "-", "induced", "NF", "-", "kappaB", "activation", "and", "TNF", "-", "alpha", "release", "in", "human", "monocytes", "are", "independent", "of", "PKC", "activity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O" ]
5838	[ "Copyright", "1999", "Academic", "Press", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O" ]
5839	[ "Amelioration", "of", "rat", "cerulein", "pancreatitis", "by", "guamerin", "-", "derived", "peptide", ",", "a", "novel", "elastase", "inhibitor", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O" ]
5840	[ "Increased", "activity", "of", "various", "proteases", "is", "observed", "in", "both", "human", "and", "experimental", "pancreatitis", ";", "however", ",", "the", "information", "on", "the", "effects", "of", "specific", "protease", "inhibitors", "on", "the", "di...	[ "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5841	[ "In", "this", "study", "we", "show", "that", "a", "novel", "elastase", "inhibitor", ",", "guamerin", "-", "derived", "synthetic", "peptide", "(", "GDSP", ")", ",", "improves", "the", "parameters", "of", "cerulein", "-", "induced", "acute", "pancreatitis", "i...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5842	[ "The", "effects", "of", "GDSP", "were", "also", "measured", "on", "superoxide", "formation", "by", "activated", "human", "neutrophils", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5843	[ "The", "effects", "of", "GDSP", "were", "compared", "with", "those", "of", "another", "elastase", "inhibitor", ",", "elastatinal", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5844	[ "GDSP", "significantly", "inhibited", "edema", "formation", ",", "neutrophil", "infiltration", ",", "acinar", "cell", "damage", ",", "and", "plasma", "lipase", "and", "amylase", "increases", "caused", "by", "cerulein", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5845	[ "GDSP", "also", "completely", "inhibited", "superoxide", "formation", "in", "the", "human", "neutrophils", "stimulated", "by", "N", "-", "formyl", "-", "methionine", "-", "leucine", "-", "phenyl", "-", "alanine", "(", "fMLP", ")", "or", "12", "-", "O", "-"...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5846	[ "These", "results", "demonstrate", "a", "beneficial", "effect", "of", "GDSP", ",", "a", "novel", "specific", "elastase", "inhibitor", ",", "on", "the", "development", "of", "rat", "cerulein", "pancreatitis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5847	[ "A", "novel", "lipopolysaccharide", "-", "induced", "transcription", "factor", "regulating", "tumor", "necrosis", "factor", "alpha", "gene", "expression", ":", "molecular", "cloning", ",", "sequencing", ",", "characterization", ",", "and", "chromosomal", "assignment",...	[ "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5848	[ "Lipopolysaccharide", "(", "LPS", ")", "is", "a", "potent", "stimulator", "of", "monocytes", "and", "macrophages", ",", "causing", "secretion", "of", "tumor", "necrosis", "factor", "alpha", "(", "TNF", "-", "alpha", ")", "and", "other", "inflammatory", "mediat...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5849	[ "Given", "the", "deleterious", "effects", "to", "the", "host", "of", "TNF", "-", "alpha", ",", "it", "has", "been", "postulated", "that", "TNF", "-", "alpha", "gene", "expression", "must", "be", "tightly", "regulated", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5850	[ "We", "have", "used", "this", "DNA", "fragment", "to", "isolate", "and", "purify", "a", "60", "-", "kDa", "protein", "binding", "to", "this", "fragment", "and", "obtained", "its", "amino", "-", "terminal", "sequence", ",", "which", "was", "used", "to", "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5851	[ "A", "novel", "cDNA", "clone", "(", "1", ".", "8", "kb", ")", "was", "isolated", "and", "fully", "sequenced", "." ]	[ "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5852	[ "Characterization", "of", "this", "cDNA", "clone", "revealed", "that", "its", "induction", "was", "dependent", "on", "LPS", "activation", "of", "THP", "-", "1", "cells", ";", "hence", ",", "the", "name", "LPS", "-", "induced", "TNF", "-", "alpha", "factor"...	[ "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "O", "O" ]
5853	[ "Finally", ",", "chromosomal", "localization", "using", "fluorescence", "in", "situ", "hybridization", "revealed", "that", "LITAF", "mapped", "to", "chromosome", "16p12", "-", "16p13", ".", "3", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O" ]
5854	[ "Together", ",", "these", "findings", "suggest", "that", "LITAF", "plays", "an", "important", "role", "in", "the", "activation", "of", "the", "human", "TNF", "-", "alpha", "gene", "and", "proposes", "a", "new", "mechanism", "to", "control", "TNF", "-", "al...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O" ]
5855	[ "The", "immunogenetic", "basis", "of", "severe", "infections", "caused", "by", "bacille", "Calmette", "-", "Guerin", "vaccine", "and", "environmental", "mycobacteria", "in", "humans", "remains", "largely", "unknown", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5856	[ "We", "describe", "18", "patients", "from", "several", "generations", "of", "12", "unrelated", "families", "who", "were", "heterozygous", "for", "1", "to", "5", "overlapping", "IFNGR1", "frameshift", "small", "deletions", "and", "a", "wild", "-", "type", "IFNG...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O" ]
5857	[ "There", "were", "12", "independent", "mutation", "events", "at", "a", "single", "mutation", "site", ",", "defining", "a", "small", "deletion", "hotspot", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]
5858	[ "Neighbouring", "sequence", "analysis", "favours", "a", "small", "deletion", "model", "of", "slipped", "mispairing", "events", "during", "replication", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5859	[ "The", "mutant", "alleles", "encode", "cell", "-", "surface", "IFNgamma", "receptors", "that", "lack", "the", "intra", "-", "cytoplasmic", "domain", ",", "which", ",", "through", "a", "combination", "of", "impaired", "recycling", ",", "abrogated", "signalling", ...	[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5860	[ "We", "thus", "report", "a", "hotspot", "for", "human", "IFNGR1", "small", "deletions", "that", "confer", "dominant", "susceptibility", "to", "infections", "caused", "by", "poorly", "virulent", "mycobacteria", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5861	[ "Pterin", "carbinolamine", "dehydratase", "/", "dimerization", "cofactor", "of", "HNF1", "(", "PCD", "/", "DCoH", ")", "is", "a", "dual", "-", "function", "protein", "." ]	[ "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]
5862	[ "In", "the", "cytoplasm", "it", "acts", "as", "a", "dehydratase", "in", "the", "regeneration", "of", "tetrahydrobiopterin", ",", "the", "cofactor", "for", "aromatic", "amino", "acid", "hydroxylases", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]
5863	[ "To", "deepen", "our", "understanding", "of", "this", "protein", ",", "we", "characterized", "its", "expression", "in", "human", "tissues", "and", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5864	[ "Human", "PCD", "/", "DCoH", "was", "present", "predominantly", "in", "liver", "and", "kidney", ",", "with", "significant", "amounts", "in", "testis", "and", "ovary", ",", "trace", "amounts", "in", "lung", ",", "and", "undetectable", "levels", "in", "whole",...	[ "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5865	[ "It", "was", "expressed", "in", "all", "of", "the", "cells", "that", "were", "examined", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5866	[ "Importantly", ",", "it", "was", "also", "present", "in", "the", "nucleus", "of", "HeLa", "cells", ",", "which", "lack", "HNF1", ",", "and", "in", "the", "cytoplasm", "of", "fibroblasts", "that", "have", "little", "or", "no", "tetrahydrobiopterin", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O" ]
5867	[ "The", "expression", "of", "human", "PCD", "/", "DCoH", "in", "the", "liver", "and", "nonhepatic", "cells", "was", "compared", "at", "both", "the", "mRNA", "and", "protein", "levels", "." ]	[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5868	[ "Although", "the", "mRNA", "level", "in", "liver", "was", "only", "fourfold", "higher", "than", "that", "in", "keratinocytes", "and", "fibroblasts", ",", "the", "hepatic", "PCD", "/", "DCoH", "protein", "level", "was", "20", "-", "fold", "higher", "than", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5869	[ "Cloning", "of", "the", "5", "'", "and", "3", "'", "untranslated", "region", "(", "UTR", ")", "of", "human", "keratinocyte", "PCD", "/", "DCoH", "revealed", "that", "it", "has", "53", "bp", "more", "of", "GC", "-", "rich", "5", "'", "untranslated", "...	[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]
5870	[ "In", "vitro", "transcription", "and", "translation", "analysis", "showed", "that", "the", "longer", "5", "'", "UTR", "resulted", "in", "about", "a", "35", "%", "decrease", "in", "translation", "efficiency", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5871	[ "These", "data", "show", "that", "human", "PCD", "/", "DCoH", "is", "not", "only", "present", "in", "cells", "where", "tetrahydrobiopterin", "is", "synthesized", "or", "HNF1", "is", "present", "but", "is", "a", "widely", "distributed", "protein", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5872	[ "Its", "differential", "expression", "in", "different", "tissues", "and", "cells", "is", "regulated", "not", "only", "at", "the", "transcriptional", "level", "but", "also", "at", "the", "translational", "level", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5873	[ "NF", "-", "kappaB", "regulates", "Fas", "/", "APO", "-", "1", "/", "CD95", "-", "and", "TCR", "-", "mediated", "apoptosis", "of", "T", "lymphocytes", "." ]	[ "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5874	[ "The", "maintenance", "of", "lymphocyte", "homeostasis", "by", "apoptosis", "is", "a", "critical", "regulatory", "mechanism", "in", "the", "normal", "immune", "system", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5875	[ "The", "transcription", "factor", "NF", "-", "kappaB", "has", "been", "shown", "to", "play", "a", "role", "in", "protecting", "cells", "against", "death", "mediated", "by", "TNF", "We", "show", "here", "that", "NF", "-", "kappaB", "also", "has", "a", "ro...	[ "O", "B", "I", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "...
5876	[ "Reciprocally", ",", "inhibition", "of", "NF", "-", "kappaB", "activation", "by", "a", "soluble", "peptide", "inhibitor", "or", "a", "dominant", "form", "of", "the", "NF", "-", "kappaB", "inhibitor", ",", "IkappaB", ",", "makes", "the", "cells", "more", "s...	[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5877	[ "Furthermore", ",", "inhibition", "of", "NF", "-", "kappaB", "activation", "by", "a", "soluble", "peptide", "inhibitor", "rendered", "a", "T", "cell", "hybridoma", "more", "susceptible", "to", "TCR", "-", "mediated", "apoptosis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5878	[ "Correspondingly", ",", "transfection", "of", "p50", "and", "p65", "provided", "considerable", "protection", "from", "TCR", "-", "mediated", "apoptosis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5879	[ "These", "observations", "were", "corroborated", "by", "studies", "on", "Fas", "-", "mediated", "death", "in", "primary", "T", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5880	[ "Concanavalin", "A", "-", "activated", "cycling", "T", "cell", "blasts", "from", "mice", "that", "are", "transgenic", "for", "the", "dominant", "IkappaB", "molecule", "have", "increased", "sensitivity", "to", "Fas", "-", "mediated", "apoptosis", ",", "associated...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O" ]
5881	[ "In", "addition", ",", "blocking", "TNF", ",", "itself", "a", "positive", "regulator", "of", "NF", "-", "kappaB", ",", "with", "neutralizing", "antibodies", "renders", "the", "cells", "more", "susceptible", "to", "anti", "-", "Fas", "-", "mediated", "apoptos...	[ "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5882	[ "In", "summary", ",", "our", "results", "provide", "compelling", "evidence", "that", "NF", "-", "kappaB", "protects", "against", "Fas", "-", "mediated", "death", "and", "is", "likely", "to", "be", "an", "important", "regulator", "of", "T", "cell", "homeostas...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5883	[ "T", "helper", "differentiation", "proceeds", "through", "Stat1", "-", "dependent", ",", "Stat4", "-", "dependent", "and", "Stat4", "-", "independent", "phases", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5884	[ "Much", "of", "our", "focus", "in", "understanding", "Th1", "/", "Th2", "development", "has", "been", "on", "the", "signals", "delivered", "by", "IL", "-", "12", "and", "IL", "-", "4", "as", "final", "determinants", "of", "terminal", "T", "cell", "differ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5885	[ "Because", "extinction", "of", "IL", "-", "12", "signaling", "in", "early", "Th2", "development", "could", "potentially", "be", "important", "in", "imprinting", "a", "more", "permanent", "Th2", "phenotype", "on", "a", "population", "of", "T", "cells", ",", "...	[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O" ]
5886	[ "Whereas", "IL", "-", "4", "appears", "to", "repress", "functional", "IL", "-", "12", "signaling", "through", "inhibition", "of", "IL", "-", "12R", "beta", "2", "expression", ",", "IFN", "-", "gamma", "in", "the", "mouse", ",", "and", "IFN", "-", "alph...	[ "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "...
5887	[ "We", "propose", "that", "Th1", "development", "can", "be", "considered", "in", "two", "stages", ",", "capacitance", "and", "development", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5888	[ "The", "second", "stage", ",", "development", ",", "we", "propose", "is", "the", "true", "IL", "-", "12", "induced", "developmental", "stage", ",", "involving", "expression", "of", "Stat4", "inducible", "proteins", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]
5889	[ "In", "the", "human", ",", "this", "may", "also", "occur", "via", "IFN", "-", "alpha", ",", "which", "is", "able", "to", "activate", "Stat4", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O" ]
5890	[ "It", "is", "perhaps", "possible", "that", "all", "of", "Stat4", "actions", "on", "Th1", "development", "may", "be", "exert", "directly", "by", "Stat4", "at", "the", "IFN", "-", "gamma", "gene", ",", "however", "we", "suggest", "that", ",", "more", "like...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
5891	[ "Lineage", "-", "specific", "activation", "of", "STAT3", "by", "interferon", "-", "gamma", "in", "human", "neutrophils", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O" ]
5892	[ "Binding", "of", "interferon", "-", "gamma", "(", "IFN", "-", "gamma", ")", "to", "its", "heterodimeric", "receptor", "induces", "activation", "of", "the", "tyrosine", "kinases", "JAK1", "and", "JAK2", "followed", "by", "tyrosine", "phosphorylation", "of", "ST...	[ "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "B", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O" ]
5893	[ "Selective", "activation", "of", "STAT1alpha", "at", "the", "IFN", "-", "gamma", "receptor", "is", "achieved", "by", "specific", "interaction", "between", "a", "cytosolic", "tyrosine", "motif", "including", "Y440", "in", "the", "IFN", "-", "gamma", "receptor", ...	[ "O", "O", "O", "B", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "O" ]
5894	[ "We", "demonstrate", "that", ",", "in", "addition", "to", "STAT1alpha", ",", "STAT3", "is", "also", "activated", "by", "IFN", "-", "gamma", "in", "human", "neutrophils", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O" ]
5895	[ "The", "cell", "type", "-", "specific", "activation", "of", "STAT3", "by", "IFN", "-", "gamma", "was", "also", "observed", "in", "neutrophils", "that", "are", "differentiated", "in", "vitro", "from", "human", "CD34", "+", "hematopoietic", "stem", "cells", "....	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5896	[ "These", "results", "indicate", "that", "a", "single", "cytokine", "receptor", "can", "activate", "different", "STAT", "family", "members", "in", "a", "cell", "-", "specific", "manner", ",", "which", "might", "result", "in", "cell", "-", "specific", "gene", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5897	[ "Alternative", "polyadenylation", "events", "contribute", "to", "the", "induction", "of", "NF", "-", "ATc", "in", "effector", "T", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5898	[ "Due", "to", "a", "switch", "from", "the", "use", "of", "a", "3", "'", "polyA", "site", "to", "a", "more", "proximal", "polyA", "site", ",", "NF", "-", "ATc", "expression", "switches", "from", "the", "synthesis", "of", "the", "two", "longer", "isoforms...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "...
5899	[ "The", "relative", "low", "binding", "affinity", "of", "cleavage", "stimulation", "factor", "CstF", "-", "64", "to", "the", "proximal", "polyA", "site", "seems", "to", "contribute", "to", "its", "neglect", "in", "naive", "T", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
5900	[ "These", "alternative", "polyadenylation", "events", "ensure", "the", "rapid", "accumulation", "of", "high", "concentrations", "of", "NF", "-", "ATc", "necessary", "to", "exceed", "critical", "threshold", "levels", "of", "NF", "-", "ATc", "for", "gene", "inducti...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5801

[ "Initiation", "of", "DNA", "replication", "requires", "the", "function", "of", "MCM", "gene", "products", ",", "which", "participate", "in", "ensuring", "that", "DNA", "replication", "occurs", "only", "once", "in", "the", "cell", "cycle", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5802

[ "Expression", "of", "all", "mammalian", "genes", "of", "the", "MCM", "family", "is", "induced", "by", "growth", "stimulation", ",", "unlike", "yeast", ",", "and", "the", "mRNA", "levels", "peak", "at", "G1", "/", "S", "boundary", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5803

[ "In", "this", "study", ",", "we", "examined", "the", "transcriptional", "activities", "of", "isolated", "human", "MCM", "gene", "promoters", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O" ]

5804

[ "Human", "MCM5", "and", "MCM6", "promoters", "with", "mutation", "in", "the", "E2F", "sites", "failed", "in", "promoter", "regulation", "following", "serum", "stimulation", "and", "exogenous", "E2F", "expression", "." ]

[ "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O" ]

5805

[ "In", "addition", ",", "we", "identified", "a", "novel", "E2F", "-", "like", "sequence", "in", "human", "MCM6", "promoter", "which", "cooperates", "with", "the", "authentic", "E2F", "sites", "in", "E2F", "-", "dependent", "regulation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O" ]

5806

[ "Forced", "expression", "of", "E2F1", "could", "induce", "expression", "of", "all", "members", "of", "the", "endogenous", "MCM", "genes", "in", "rat", "embryonal", "fibroblast", "REF52", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5807

[ "Our", "results", "demonstrated", "that", "the", "growth", "-", "regulated", "expression", "of", "mammalian", "MCM5", "and", "MCM6", "genes", ",", "and", "presumably", "other", "MCM", "members", ",", "is", "primarily", "regulated", "by", "E2F", "through", "bin...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "O" ]

5808

[ "An", "essential", "role", "for", "NF", "-", "kappaB", "in", "human", "CD34", "(", "+", ")", "bone", "marrow", "cell", "survival", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5809

[ "The", "transcription", "factor", ",", "NF", "-", "kappaB", ",", "is", "important", "for", "T", "-", "cell", "activation", ",", "B", "-", "cell", "maturation", ",", "and", "human", "immunodeficiency", "virus", "transcription", "and", "plays", "a", "role", ...

[ "O", "B", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5810

[ "However", ",", "a", "role", "for", "NF", "-", "kappaB", "in", "human", "CD34", "(", "+", ")", "bone", "marrow", "cells", "has", "not", "been", "described", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5811

[ "We", "provide", "evidence", "here", "that", "virtually", "all", "human", "CD34", "(", "+", ")", "bone", "marrow", "cells", "express", "NF", "-", "kappaB", "that", "can", "be", "activated", "by", "exposure", "to", "phorbol", "12", "-", "myristate", "13", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "...

5812

[ "In", "addition", ",", "we", "demonstrate", "that", "NF", "-", "kappaB", "may", "be", "required", "for", "human", "CD34", "(", "+", ")", "bone", "marrow", "cell", "clonogenic", "function", "and", "survival", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5813

[ "These", "results", "offer", "insight", "into", "a", "new", "role", "for", "NF", "-", "kappaB", "in", "maintaining", "survival", "and", "function", "in", "hematopoietic", "stem", "and", "progenitor", "cells", "and", "suggest", "that", "proposed", "strategies", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

5814

[ "High", "molecular", "weight", "dextran", "sulfate", "increases", "the", "activity", "of", "NF", "-", "kappaB", "-", "regulated", "promoter", "in", "monocyte", "-", "derived", "macrophages", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5815

[ "It", "is", "known", "that", "sulfated", "polysaccharides", "can", "mimic", "the", "action", "of", "common", "T", "-", "cell", "mitogens", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O" ]

5816

[ "To", "investigate", "the", "molecular", "basis", "of", "the", "mitogenic", "effect", "of", "high", "molecular", "weight", "dextran", "sulfate", "(", "HMDS", ")", ",", "monocyte", "-", "derived", "macrophages", "were", "transfected", "with", "recombinant", "plas...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "...

5817

[ "We", "observed", "that", "HMDS", ",", "similar", "to", "bacterial", "lipopolysaccharide", "(", "LPS", ")", ",", "increases", "the", "expression", "of", "CAT", "reporter", "gene", "suggesting", "increased", "activity", "of", "NF", "-", "kappaB", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]

5818

[ "The", "activation", "of", "NF", "-", "kappaB", "correlated", "with", "the", "increased", "expression", "of", "B7", ".", "1", "molecules", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]

5819

[ "It", "was", "postulated", "that", "this", "NF", "-", "kappaB", "-", "regulated", "promoter", "might", "play", "a", "role", "in", "the", "activation", "of", "the", "accessory", "cells", "as", "well", "as", "the", "rate", "of", "replication", "of", "HIV", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5820

[ "We", "demonstrate", "here", "that", "the", "expression", "of", "the", "lysosomal", "enzyme", "acid", "sphingomyelinase", "(", "ASM", ";", "E", ".", "C", ".", "3", ".", "1", ".", "4", ".", "12", ")", "is", "induced", "during", "this", "process", "and",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

5821

[ "Using", "Northern", "blotting", ",", "RNase", "protection", "assay", ",", "and", "nuclear", "run", "-", "on", "analyses", ",", "we", "show", "that", "the", "up", "-", "regulation", "of", "ASM", "expression", "is", "regulated", "mainly", "at", "the", "leve...

[ "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5822

[ "This", "cell", "-", "type", "specific", "induction", "by", "PMA", "treatment", "was", "further", "investigated", "with", "respect", "to", "transcriptional", "control", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5823

[ "A", "series", "of", "5", "'", "deletion", "derivatives", "of", "the", "upstream", "regulatory", "region", "were", "used", "in", "transient", "transfection", "assays", "to", "identify", "promoter", "elements", "required", "for", "basal", "and", "inducible", "gen...

[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5824

[ "Using", "electrophoretic", "mobility", "shift", "assays", "and", "supershift", "assays", "we", "demonstrate", "that", "this", "region", "is", "specifically", "bound", "by", "Sp1", "and", "AP", "-", "2", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "I", "I", "O" ]

5825

[ "These", "factors", "are", "present", "in", "nuclear", "extracts", "prepared", "from", "both", "induced", "and", "uninduced", "THP", "-", "1", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5826

[ "From", "these", "studies", ",", "we", "conclude", "that", "a", "concerted", "action", "of", "the", "transcription", "factors", "AP", "-", "2", "and", "Sp1", "is", "essential", "for", "the", "up", "-", "regulation", "of", "ASM", "expression", "during", "th...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5827

[ "LPS", "-", "Induced", "NF", "-", "kappaB", "activation", "and", "TNF", "-", "alpha", "release", "in", "human", "monocytes", "are", "protein", "tyrosine", "kinase", "dependent", "and", "protein", "kinase", "C", "independent", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O" ]

5828

[ "BACKGROUND", ":", "Tumor", "necrosis", "factor", "alpha", "(", "TNF", "-", "alpha", ")", "is", "an", "important", "mediator", "of", "septic", "shock", "." ]

[ "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5829

[ "Endotoxin", "(", "LPS", ")", "signal", "transduction", "in", "human", "monocytes", "leads", "to", "activation", "of", "nuclear", "factor", "-", "kappa", "B", "(", "NF", "-", "kappaB", ")", "and", "TNF", "-", "alpha", "release", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O" ]

5830

[ "Previous", "studies", "have", "implicated", "activation", "of", "both", "protein", "kinase", "C", "(", "PKC", ")", "and", "protein", "tyrosine", "kinases", "(", "PTK", ")", "in", "LPS", "-", "induced", "NF", "-", "kappaB", "activation", "and", "TNF", "-",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O" ]

5831

[ "We", "hypothesized", "that", "inhibition", "of", "either", "PKC", "or", "PTK", "would", "decrease", "LPS", "-", "induced", "NF", "-", "kappaB", "DNA", "binding", "and", "TNF", "-", "alpha", "release", "in", "human", "monocytes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5832

[ "MATERIALS", "AND", "METHODS", ":", "Human", "monocytes", "were", "stimulated", "with", "PMA", "(", "50", "ng", "/", "ml", ")", "alone", "or", "LPS", "(", "100", "ng", "/", "ml", ")", "with", "and", "without", "a", "nonspecific", "serine", "/", "threon...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

5833

[ "TNF", "-", "alpha", "release", "in", "culture", "supernatants", "was", "measured", "by", "an", "ELISA", "." ]

[ "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5834

[ "RESULTS", ":", "LPS", "increased", "NF", "-", "kappaB", "DNA", "binding", "and", "TNF", "-", "alpha", "release", "in", "human", "monocytes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5835

[ "Nonspecific", "protein", "kinase", "inhibition", "inhibited", "NF", "-", "kappaB", "activation", "and", "TNF", "-", "alpha", "release", ",", "while", "specific", "PKC", "inhibition", "with", "Bis", "had", "no", "effect", "on", "LPS", "-", "induced", "NF", "...

[ "O", "B", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O" ]

5836

[ "PTK", "inhibition", "with", "Gen", "attenuated", "both", "LPS", "-", "induced", "NF", "-", "kappaB", "DNA", "binding", "and", "TNF", "-", "alpha", "production", "in", "human", "monocytes", "." ]

[ "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5837

[ "CONCLUSIONS", ":", "These", "results", "suggest", "that", "LPS", "-", "induced", "NF", "-", "kappaB", "activation", "and", "TNF", "-", "alpha", "release", "in", "human", "monocytes", "are", "independent", "of", "PKC", "activity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O" ]

5838

[ "Copyright", "1999", "Academic", "Press", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O" ]

5839

[ "Amelioration", "of", "rat", "cerulein", "pancreatitis", "by", "guamerin", "-", "derived", "peptide", ",", "a", "novel", "elastase", "inhibitor", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O" ]

5840

[ "Increased", "activity", "of", "various", "proteases", "is", "observed", "in", "both", "human", "and", "experimental", "pancreatitis", ";", "however", ",", "the", "information", "on", "the", "effects", "of", "specific", "protease", "inhibitors", "on", "the", "di...

[ "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5841

[ "In", "this", "study", "we", "show", "that", "a", "novel", "elastase", "inhibitor", ",", "guamerin", "-", "derived", "synthetic", "peptide", "(", "GDSP", ")", ",", "improves", "the", "parameters", "of", "cerulein", "-", "induced", "acute", "pancreatitis", "i...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5842

[ "The", "effects", "of", "GDSP", "were", "also", "measured", "on", "superoxide", "formation", "by", "activated", "human", "neutrophils", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5843

[ "The", "effects", "of", "GDSP", "were", "compared", "with", "those", "of", "another", "elastase", "inhibitor", ",", "elastatinal", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5844

[ "GDSP", "significantly", "inhibited", "edema", "formation", ",", "neutrophil", "infiltration", ",", "acinar", "cell", "damage", ",", "and", "plasma", "lipase", "and", "amylase", "increases", "caused", "by", "cerulein", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5845

[ "GDSP", "also", "completely", "inhibited", "superoxide", "formation", "in", "the", "human", "neutrophils", "stimulated", "by", "N", "-", "formyl", "-", "methionine", "-", "leucine", "-", "phenyl", "-", "alanine", "(", "fMLP", ")", "or", "12", "-", "O", "-"...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5846

[ "These", "results", "demonstrate", "a", "beneficial", "effect", "of", "GDSP", ",", "a", "novel", "specific", "elastase", "inhibitor", ",", "on", "the", "development", "of", "rat", "cerulein", "pancreatitis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5847

[ "A", "novel", "lipopolysaccharide", "-", "induced", "transcription", "factor", "regulating", "tumor", "necrosis", "factor", "alpha", "gene", "expression", ":", "molecular", "cloning", ",", "sequencing", ",", "characterization", ",", "and", "chromosomal", "assignment",...

[ "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5848

[ "Lipopolysaccharide", "(", "LPS", ")", "is", "a", "potent", "stimulator", "of", "monocytes", "and", "macrophages", ",", "causing", "secretion", "of", "tumor", "necrosis", "factor", "alpha", "(", "TNF", "-", "alpha", ")", "and", "other", "inflammatory", "mediat...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5849

[ "Given", "the", "deleterious", "effects", "to", "the", "host", "of", "TNF", "-", "alpha", ",", "it", "has", "been", "postulated", "that", "TNF", "-", "alpha", "gene", "expression", "must", "be", "tightly", "regulated", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5850

[ "We", "have", "used", "this", "DNA", "fragment", "to", "isolate", "and", "purify", "a", "60", "-", "kDa", "protein", "binding", "to", "this", "fragment", "and", "obtained", "its", "amino", "-", "terminal", "sequence", ",", "which", "was", "used", "to", "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5851

[ "A", "novel", "cDNA", "clone", "(", "1", ".", "8", "kb", ")", "was", "isolated", "and", "fully", "sequenced", "." ]

[ "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5852

[ "Characterization", "of", "this", "cDNA", "clone", "revealed", "that", "its", "induction", "was", "dependent", "on", "LPS", "activation", "of", "THP", "-", "1", "cells", ";", "hence", ",", "the", "name", "LPS", "-", "induced", "TNF", "-", "alpha", "factor"...

[ "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "O", "O" ]

5853

[ "Finally", ",", "chromosomal", "localization", "using", "fluorescence", "in", "situ", "hybridization", "revealed", "that", "LITAF", "mapped", "to", "chromosome", "16p12", "-", "16p13", ".", "3", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O" ]

5854

[ "Together", ",", "these", "findings", "suggest", "that", "LITAF", "plays", "an", "important", "role", "in", "the", "activation", "of", "the", "human", "TNF", "-", "alpha", "gene", "and", "proposes", "a", "new", "mechanism", "to", "control", "TNF", "-", "al...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O" ]

5855

[ "The", "immunogenetic", "basis", "of", "severe", "infections", "caused", "by", "bacille", "Calmette", "-", "Guerin", "vaccine", "and", "environmental", "mycobacteria", "in", "humans", "remains", "largely", "unknown", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5856

[ "We", "describe", "18", "patients", "from", "several", "generations", "of", "12", "unrelated", "families", "who", "were", "heterozygous", "for", "1", "to", "5", "overlapping", "IFNGR1", "frameshift", "small", "deletions", "and", "a", "wild", "-", "type", "IFNG...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O" ]

5857

[ "There", "were", "12", "independent", "mutation", "events", "at", "a", "single", "mutation", "site", ",", "defining", "a", "small", "deletion", "hotspot", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]

5858

[ "Neighbouring", "sequence", "analysis", "favours", "a", "small", "deletion", "model", "of", "slipped", "mispairing", "events", "during", "replication", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5859

[ "The", "mutant", "alleles", "encode", "cell", "-", "surface", "IFNgamma", "receptors", "that", "lack", "the", "intra", "-", "cytoplasmic", "domain", ",", "which", ",", "through", "a", "combination", "of", "impaired", "recycling", ",", "abrogated", "signalling", ...

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5860

[ "We", "thus", "report", "a", "hotspot", "for", "human", "IFNGR1", "small", "deletions", "that", "confer", "dominant", "susceptibility", "to", "infections", "caused", "by", "poorly", "virulent", "mycobacteria", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5861

[ "Pterin", "carbinolamine", "dehydratase", "/", "dimerization", "cofactor", "of", "HNF1", "(", "PCD", "/", "DCoH", ")", "is", "a", "dual", "-", "function", "protein", "." ]

[ "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]

5862

[ "In", "the", "cytoplasm", "it", "acts", "as", "a", "dehydratase", "in", "the", "regeneration", "of", "tetrahydrobiopterin", ",", "the", "cofactor", "for", "aromatic", "amino", "acid", "hydroxylases", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]

5863

[ "To", "deepen", "our", "understanding", "of", "this", "protein", ",", "we", "characterized", "its", "expression", "in", "human", "tissues", "and", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5864

[ "Human", "PCD", "/", "DCoH", "was", "present", "predominantly", "in", "liver", "and", "kidney", ",", "with", "significant", "amounts", "in", "testis", "and", "ovary", ",", "trace", "amounts", "in", "lung", ",", "and", "undetectable", "levels", "in", "whole",...

[ "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5865

[ "It", "was", "expressed", "in", "all", "of", "the", "cells", "that", "were", "examined", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5866

[ "Importantly", ",", "it", "was", "also", "present", "in", "the", "nucleus", "of", "HeLa", "cells", ",", "which", "lack", "HNF1", ",", "and", "in", "the", "cytoplasm", "of", "fibroblasts", "that", "have", "little", "or", "no", "tetrahydrobiopterin", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O" ]

5867

[ "The", "expression", "of", "human", "PCD", "/", "DCoH", "in", "the", "liver", "and", "nonhepatic", "cells", "was", "compared", "at", "both", "the", "mRNA", "and", "protein", "levels", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5868

[ "Although", "the", "mRNA", "level", "in", "liver", "was", "only", "fourfold", "higher", "than", "that", "in", "keratinocytes", "and", "fibroblasts", ",", "the", "hepatic", "PCD", "/", "DCoH", "protein", "level", "was", "20", "-", "fold", "higher", "than", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5869

[ "Cloning", "of", "the", "5", "'", "and", "3", "'", "untranslated", "region", "(", "UTR", ")", "of", "human", "keratinocyte", "PCD", "/", "DCoH", "revealed", "that", "it", "has", "53", "bp", "more", "of", "GC", "-", "rich", "5", "'", "untranslated", "...

[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]

5870

[ "In", "vitro", "transcription", "and", "translation", "analysis", "showed", "that", "the", "longer", "5", "'", "UTR", "resulted", "in", "about", "a", "35", "%", "decrease", "in", "translation", "efficiency", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5871

[ "These", "data", "show", "that", "human", "PCD", "/", "DCoH", "is", "not", "only", "present", "in", "cells", "where", "tetrahydrobiopterin", "is", "synthesized", "or", "HNF1", "is", "present", "but", "is", "a", "widely", "distributed", "protein", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5872

[ "Its", "differential", "expression", "in", "different", "tissues", "and", "cells", "is", "regulated", "not", "only", "at", "the", "transcriptional", "level", "but", "also", "at", "the", "translational", "level", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5873

[ "NF", "-", "kappaB", "regulates", "Fas", "/", "APO", "-", "1", "/", "CD95", "-", "and", "TCR", "-", "mediated", "apoptosis", "of", "T", "lymphocytes", "." ]

[ "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5874

[ "The", "maintenance", "of", "lymphocyte", "homeostasis", "by", "apoptosis", "is", "a", "critical", "regulatory", "mechanism", "in", "the", "normal", "immune", "system", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5875

[ "The", "transcription", "factor", "NF", "-", "kappaB", "has", "been", "shown", "to", "play", "a", "role", "in", "protecting", "cells", "against", "death", "mediated", "by", "TNF", "We", "show", "here", "that", "NF", "-", "kappaB", "also", "has", "a", "ro...

[ "O", "B", "I", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "...

5876

[ "Reciprocally", ",", "inhibition", "of", "NF", "-", "kappaB", "activation", "by", "a", "soluble", "peptide", "inhibitor", "or", "a", "dominant", "form", "of", "the", "NF", "-", "kappaB", "inhibitor", ",", "IkappaB", ",", "makes", "the", "cells", "more", "s...

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5877

[ "Furthermore", ",", "inhibition", "of", "NF", "-", "kappaB", "activation", "by", "a", "soluble", "peptide", "inhibitor", "rendered", "a", "T", "cell", "hybridoma", "more", "susceptible", "to", "TCR", "-", "mediated", "apoptosis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5878

[ "Correspondingly", ",", "transfection", "of", "p50", "and", "p65", "provided", "considerable", "protection", "from", "TCR", "-", "mediated", "apoptosis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5879

[ "These", "observations", "were", "corroborated", "by", "studies", "on", "Fas", "-", "mediated", "death", "in", "primary", "T", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5880

[ "Concanavalin", "A", "-", "activated", "cycling", "T", "cell", "blasts", "from", "mice", "that", "are", "transgenic", "for", "the", "dominant", "IkappaB", "molecule", "have", "increased", "sensitivity", "to", "Fas", "-", "mediated", "apoptosis", ",", "associated...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O" ]

5881

[ "In", "addition", ",", "blocking", "TNF", ",", "itself", "a", "positive", "regulator", "of", "NF", "-", "kappaB", ",", "with", "neutralizing", "antibodies", "renders", "the", "cells", "more", "susceptible", "to", "anti", "-", "Fas", "-", "mediated", "apoptos...

[ "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5882

[ "In", "summary", ",", "our", "results", "provide", "compelling", "evidence", "that", "NF", "-", "kappaB", "protects", "against", "Fas", "-", "mediated", "death", "and", "is", "likely", "to", "be", "an", "important", "regulator", "of", "T", "cell", "homeostas...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5883

[ "T", "helper", "differentiation", "proceeds", "through", "Stat1", "-", "dependent", ",", "Stat4", "-", "dependent", "and", "Stat4", "-", "independent", "phases", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5884

[ "Much", "of", "our", "focus", "in", "understanding", "Th1", "/", "Th2", "development", "has", "been", "on", "the", "signals", "delivered", "by", "IL", "-", "12", "and", "IL", "-", "4", "as", "final", "determinants", "of", "terminal", "T", "cell", "differ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5885

[ "Because", "extinction", "of", "IL", "-", "12", "signaling", "in", "early", "Th2", "development", "could", "potentially", "be", "important", "in", "imprinting", "a", "more", "permanent", "Th2", "phenotype", "on", "a", "population", "of", "T", "cells", ",", "...

[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O" ]

5886

[ "Whereas", "IL", "-", "4", "appears", "to", "repress", "functional", "IL", "-", "12", "signaling", "through", "inhibition", "of", "IL", "-", "12R", "beta", "2", "expression", ",", "IFN", "-", "gamma", "in", "the", "mouse", ",", "and", "IFN", "-", "alph...

[ "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "...

5887

[ "We", "propose", "that", "Th1", "development", "can", "be", "considered", "in", "two", "stages", ",", "capacitance", "and", "development", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5888

[ "The", "second", "stage", ",", "development", ",", "we", "propose", "is", "the", "true", "IL", "-", "12", "induced", "developmental", "stage", ",", "involving", "expression", "of", "Stat4", "inducible", "proteins", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]

5889

[ "In", "the", "human", ",", "this", "may", "also", "occur", "via", "IFN", "-", "alpha", ",", "which", "is", "able", "to", "activate", "Stat4", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O" ]

5890

[ "It", "is", "perhaps", "possible", "that", "all", "of", "Stat4", "actions", "on", "Th1", "development", "may", "be", "exert", "directly", "by", "Stat4", "at", "the", "IFN", "-", "gamma", "gene", ",", "however", "we", "suggest", "that", ",", "more", "like...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

5891

[ "Lineage", "-", "specific", "activation", "of", "STAT3", "by", "interferon", "-", "gamma", "in", "human", "neutrophils", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O" ]

5892

[ "Binding", "of", "interferon", "-", "gamma", "(", "IFN", "-", "gamma", ")", "to", "its", "heterodimeric", "receptor", "induces", "activation", "of", "the", "tyrosine", "kinases", "JAK1", "and", "JAK2", "followed", "by", "tyrosine", "phosphorylation", "of", "ST...

[ "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "B", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O" ]

5893

[ "Selective", "activation", "of", "STAT1alpha", "at", "the", "IFN", "-", "gamma", "receptor", "is", "achieved", "by", "specific", "interaction", "between", "a", "cytosolic", "tyrosine", "motif", "including", "Y440", "in", "the", "IFN", "-", "gamma", "receptor", ...

[ "O", "O", "O", "B", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "O" ]

5894

[ "We", "demonstrate", "that", ",", "in", "addition", "to", "STAT1alpha", ",", "STAT3", "is", "also", "activated", "by", "IFN", "-", "gamma", "in", "human", "neutrophils", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O" ]

5895

[ "The", "cell", "type", "-", "specific", "activation", "of", "STAT3", "by", "IFN", "-", "gamma", "was", "also", "observed", "in", "neutrophils", "that", "are", "differentiated", "in", "vitro", "from", "human", "CD34", "+", "hematopoietic", "stem", "cells", "....

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5896

[ "These", "results", "indicate", "that", "a", "single", "cytokine", "receptor", "can", "activate", "different", "STAT", "family", "members", "in", "a", "cell", "-", "specific", "manner", ",", "which", "might", "result", "in", "cell", "-", "specific", "gene", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5897

[ "Alternative", "polyadenylation", "events", "contribute", "to", "the", "induction", "of", "NF", "-", "ATc", "in", "effector", "T", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5898

[ "Due", "to", "a", "switch", "from", "the", "use", "of", "a", "3", "'", "polyA", "site", "to", "a", "more", "proximal", "polyA", "site", ",", "NF", "-", "ATc", "expression", "switches", "from", "the", "synthesis", "of", "the", "two", "longer", "isoforms...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "...

5899

[ "The", "relative", "low", "binding", "affinity", "of", "cleavage", "stimulation", "factor", "CstF", "-", "64", "to", "the", "proximal", "polyA", "site", "seems", "to", "contribute", "to", "its", "neglect", "in", "naive", "T", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

5900

[ "These", "alternative", "polyadenylation", "events", "ensure", "the", "rapid", "accumulation", "of", "high", "concentrations", "of", "NF", "-", "ATc", "necessary", "to", "exceed", "critical", "threshold", "levels", "of", "NF", "-", "ATc", "for", "gene", "inducti...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]