extraordinarylab/genia-ner · Datasets at Hugging Face

tokens listlengths 1 149	ner_tags listlengths 1 149
[ "Further", "studies", "will", "have", "to", "prove", "if", "Urapidil", "is", "suited", "for", "prepartal", "treatment", "of", "PIH", "as", "well." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Suppression", "of", "a", "cellular", "differentiation", "program", "by", "phorbol", "esters", "coincides", "with", "inhibition", "of", "binding", "of", "a", "cell-specific", "transcription", "factor", "(", "NF-E2", ")", "to", "an", "enhancer", "element", "require...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O" ]
[ "Induction", "by", "hemin", "increases,", "while", "induction", "with", "12-O-tetradecanoylphorbol-13-acetate", "(", "TPA", ")", "represses,", "erythroid-specific", "gene", "expression", "in", "the", "human", "cell", "line", "K562", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "B-CELL_LINE", "I-CELL_LINE", "I-CELL_LINE", "I-CELL_LINE", "O" ]
[ "We", "analyzed", "the", "effects", "of", "hemin", "or", "TPA", "induction", "on", "the", "binding", "and", "activity", "of", "transcription", "factors", "at", "a", "regulatory", "element", "found", "within", "the", "transcriptional", "regulatory", "sequences", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O" ]
[ "TPA", "induction", "increases", "the", "binding", "of", "ubiquitous", "AP-1", "factors", "to", "this", "element." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O" ]
[ "TPA", "induction", "inhibits", "the", "binding", "of", "the", "lineage", "limited", "transcription", "factor", "NF-E2", "to", "this", "transcriptional", "control", "element", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "B-PROTEIN", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O" ]
[ "Hemin", "induction", "of", "K562", "cells", "does", "not", "facilitate", "the", "binding", "of", "NF-E2", "to", "its", "recognition", "site", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CELL_LINE", "I-CELL_LINE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O" ]
[ "Hemin", "induction", "appears", "to", "nonspecifically", "increase", "the", "expression", "of", "transiently", "transfected", "genes", "in", "K562", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CELL_LINE", "I-CELL_LINE", "O" ]
[ "Beyond", "this", "nonspecific", "increase", "in", "gene", "expression,", "hemin", "induction", "acts", "to", "increase", "the", "activity", "of", "the", "lineage", "limited", "transcription", "factor", "NF-E2." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O" ]
[ "The", "divergent", "effects", "of", "hemin", "and", "TPA", "on", "gene", "expression", "in", "K562", "cells", "are", "mediated,", "in", "part,", "by", "their", "contrasting", "effects", "on", "the", "transcription", "factor", "NF-E2", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CELL_LINE", "I-CELL_LINE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "B-PROTEIN", "O" ]
[ "Interleukin-3", "expression", "by", "activated", "T", "cells", "involves", "an", "inducible,", "T-cell-specific", "factor", "and", "an", "octamer", "binding", "protein", "." ]	[ "B-PROTEIN", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O" ]
[ "Interleukin-3", "(", "IL-3", ")", "is", "exclusively", "expressed", "by", "activated", "T", "and", "natural", "killer", "cells", ",", "a", "function", "that", "is", "tightly", "controlled", "both", "in", "a", "lineage-specific", "and", "in", "a", "stimulation...	[ "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "O", "B-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "have", "investigated", "the", "protein", "binding", "characteristics", "and", "functional", "importance", "of", "the", "ACT-1-activating", "region", "of", "the", "IL-3", "promoter." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O", "O", "B-PROTEIN", "O" ]
[ "This", "region", "binds", "an", "inducible,", "T-cell-specific", "factor", "over", "its", "5'", "end", ",", "a", "site", "that", "is", "necessary", "for", "the", "expression", "of", "IL-3", "in", "the", "absence", "of", "other", "upstream", "elements." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Over", "its", "3'", "end", ",", "it", "binds", "a", "factor", "that", "is", "ubiquitously", "and", "constitutively", "expressed." ]	[ "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "factor", "is", "Oct-1", "or", "an", "immunologically", "related", "octamer-binding", "protein", ",", "and", "it", "plays", "a", "role", "in", "coordinating", "the", "activity", "of", "several", "regulatory", "elements", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O" ]
[ "These", "characteristics", "make", "the", "ACT-1", "site", "analogous", "to", "the", "activating", "ARRE-1", "site", "in", "the", "IL-2", "promoter", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O" ]
[ "Furthermore,", "and", "despite", "a", "lack", "of", "sequence", "homology,", "the", "promoters", "of", "IL-3", "and", "IL-2", "share", "an", "organizational", "pattern", "of", "regulatory", "elements", "that", "is", "likely", "to", "be", "important", "for", "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Interleukin-4", "inhibits", "the", "lipopolysaccharide-induced", "expression", "of", "c-jun", "and", "c-fos", "messenger", "RNA", "and", "activator", "protein-1", "binding", "activity", "in", "human", "monocytes", "." ]	[ "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "O" ]
[ "We", "studied", "the", "effect", "of", "interleukin-4", "(", "IL-4", ")", "on", "the", "lipopolysaccharide", "(", "LPS", ")", "induction", "of", "two", "immediate", "early", "genes", "c-fos", "and", "c-jun", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "O", "B-DNA", "O" ]
[ "These", "genes", "encode", "proteins", "that", "form", "the", "dimeric", "complex", "activator", "protein-1", "(", "AP-1", "),", "which", "is", "active", "as", "a", "transcriptional", "factor", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O" ]
[ "Maximal", "accumulation", "of", "either", "c-fos", "and", "c-jun", "messenger", "RNA", "(mRNA)", "occurred", "30", "minutes", "after", "LPS", "addition." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "When", "cells", "were", "treated", "with", "IL-4", "for", "5", "hours", "before", "LPS", "activation,", "both", "the", "c-fos", "and", "the", "c-jun", "mRNA", "expression", "was", "decreased." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Further", "studies", "will", "have", "to", "prove", "if", "Urapidil", "is", "suited", "for", "prepartal", "treatment", "of", "PIH", "as", "well." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Suppression", "of", "a", "cellular", "differentiation", "program", "by", "phorbol", "esters", "coincides", "with", "inhibition", "of", "binding", "of", "a", "cell-specific", "transcription", "factor", "(", "NF-E2", ")", "to", "an", "enhancer", "element", "require...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O" ]

[ "Induction", "by", "hemin", "increases,", "while", "induction", "with", "12-O-tetradecanoylphorbol-13-acetate", "(", "TPA", ")", "represses,", "erythroid-specific", "gene", "expression", "in", "the", "human", "cell", "line", "K562", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "B-CELL_LINE", "I-CELL_LINE", "I-CELL_LINE", "I-CELL_LINE", "O" ]

[ "We", "analyzed", "the", "effects", "of", "hemin", "or", "TPA", "induction", "on", "the", "binding", "and", "activity", "of", "transcription", "factors", "at", "a", "regulatory", "element", "found", "within", "the", "transcriptional", "regulatory", "sequences", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O" ]

[ "TPA", "induction", "increases", "the", "binding", "of", "ubiquitous", "AP-1", "factors", "to", "this", "element." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O" ]

[ "TPA", "induction", "inhibits", "the", "binding", "of", "the", "lineage", "limited", "transcription", "factor", "NF-E2", "to", "this", "transcriptional", "control", "element", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "B-PROTEIN", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O" ]

[ "Hemin", "induction", "of", "K562", "cells", "does", "not", "facilitate", "the", "binding", "of", "NF-E2", "to", "its", "recognition", "site", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CELL_LINE", "I-CELL_LINE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O" ]

[ "Hemin", "induction", "appears", "to", "nonspecifically", "increase", "the", "expression", "of", "transiently", "transfected", "genes", "in", "K562", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CELL_LINE", "I-CELL_LINE", "O" ]

[ "Beyond", "this", "nonspecific", "increase", "in", "gene", "expression,", "hemin", "induction", "acts", "to", "increase", "the", "activity", "of", "the", "lineage", "limited", "transcription", "factor", "NF-E2." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O" ]

[ "The", "divergent", "effects", "of", "hemin", "and", "TPA", "on", "gene", "expression", "in", "K562", "cells", "are", "mediated,", "in", "part,", "by", "their", "contrasting", "effects", "on", "the", "transcription", "factor", "NF-E2", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CELL_LINE", "I-CELL_LINE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "B-PROTEIN", "O" ]

[ "Interleukin-3", "expression", "by", "activated", "T", "cells", "involves", "an", "inducible,", "T-cell-specific", "factor", "and", "an", "octamer", "binding", "protein", "." ]

[ "B-PROTEIN", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O" ]

[ "Interleukin-3", "(", "IL-3", ")", "is", "exclusively", "expressed", "by", "activated", "T", "and", "natural", "killer", "cells", ",", "a", "function", "that", "is", "tightly", "controlled", "both", "in", "a", "lineage-specific", "and", "in", "a", "stimulation...

[ "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "O", "B-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "have", "investigated", "the", "protein", "binding", "characteristics", "and", "functional", "importance", "of", "the", "ACT-1-activating", "region", "of", "the", "IL-3", "promoter." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O", "O", "B-PROTEIN", "O" ]

[ "This", "region", "binds", "an", "inducible,", "T-cell-specific", "factor", "over", "its", "5'", "end", ",", "a", "site", "that", "is", "necessary", "for", "the", "expression", "of", "IL-3", "in", "the", "absence", "of", "other", "upstream", "elements." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Over", "its", "3'", "end", ",", "it", "binds", "a", "factor", "that", "is", "ubiquitously", "and", "constitutively", "expressed." ]

[ "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "factor", "is", "Oct-1", "or", "an", "immunologically", "related", "octamer-binding", "protein", ",", "and", "it", "plays", "a", "role", "in", "coordinating", "the", "activity", "of", "several", "regulatory", "elements", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O" ]

[ "These", "characteristics", "make", "the", "ACT-1", "site", "analogous", "to", "the", "activating", "ARRE-1", "site", "in", "the", "IL-2", "promoter", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O" ]

[ "Furthermore,", "and", "despite", "a", "lack", "of", "sequence", "homology,", "the", "promoters", "of", "IL-3", "and", "IL-2", "share", "an", "organizational", "pattern", "of", "regulatory", "elements", "that", "is", "likely", "to", "be", "important", "for", "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Interleukin-4", "inhibits", "the", "lipopolysaccharide-induced", "expression", "of", "c-jun", "and", "c-fos", "messenger", "RNA", "and", "activator", "protein-1", "binding", "activity", "in", "human", "monocytes", "." ]

[ "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "O" ]

[ "We", "studied", "the", "effect", "of", "interleukin-4", "(", "IL-4", ")", "on", "the", "lipopolysaccharide", "(", "LPS", ")", "induction", "of", "two", "immediate", "early", "genes", "c-fos", "and", "c-jun", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "O", "B-DNA", "O" ]

[ "These", "genes", "encode", "proteins", "that", "form", "the", "dimeric", "complex", "activator", "protein-1", "(", "AP-1", "),", "which", "is", "active", "as", "a", "transcriptional", "factor", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O" ]

[ "Maximal", "accumulation", "of", "either", "c-fos", "and", "c-jun", "messenger", "RNA", "(mRNA)", "occurred", "30", "minutes", "after", "LPS", "addition." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "When", "cells", "were", "treated", "with", "IL-4", "for", "5", "hours", "before", "LPS", "activation,", "both", "the", "c-fos", "and", "the", "c-jun", "mRNA", "expression", "was", "decreased." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]