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$\smiles{[R]C(=O)[X]} $
这样形成的亲电中心允许亲核的非离子化氨基对它进行攻击：
$\smiles{C=C(C)C(=O)OSi(C)NC[NH2-]}\rightarrow\smiles{FC@@HNC}+HX $
羧基的活化最早采用的方法是酰氯法（acid chloride）即把氨基被保护后的氨基酸用五氯化磷处理，生成酰氯（$\smiles{-C(=O)-Cl}$）。这个方法因反应条件剧烈，现已不大采用。比较温和的方法如叠氮法、混合酸酐法和活化酯法，现已广泛地被用于肽的合成。
(1) 叠氮(azide)法 由小肽进一步缩合成大肽时，常用叠氮法。此法不引起消旋，因此产物的光学纯度较高。
$\smiles{CC(=O)NC@@HC(=O)OC}\xrightarrow{NH_2NH_2} \smiles{CC(=O)NC@@HC(=O)NN}\xrightarrow{HN0_2} \smiles{CC(=O)NC@@HC(=O)N=[N+]=[N-]}\xrightarrow{\smiles{NC@@HC(=O)OC}} \smiles{CC(=O)NC@@HC(=O)NC@@HC(=O)OC} $
(2) 活化酯(activated ester)法 氨基被保护的氨基酸对硝基苯酯(一种活化酯)能与另一个氨基酸的氨基缩合成肽。此法作用温和，产率较高。
$\smiles{CC(=O)NC@@HC(=O)Oc1ccc(cc1)N+[O-]}+\smiles{NC@@HC(=O)OC} \rightarrow\smiles{CC(=O)NC@@HC(=O)NC@@HC(=O)OC} $
(3) 混合酸酐(mixed anhydride)法 氨基被保护的氨基酸，在低温且有叔胺$\left(\mathrm{NR}_{3}\right)$的存在下与氯甲酸乙酯生成混合酸酐，能与另一氨基酸酯缩合成肽。缺点是容易产生消旋，但在无水溶剂中消旋可以保持较低水平。
$\smiles{CC(=O)NC@@HC(=O)O}\xrightarrow{\smiles{CCOC(=O)Cl}} \smiles{CC(=O)NC@@HC(=O)OC(=O)OCC}\xrightarrow{NR_3\smiles{NC@@HC(=O)OCC}} \smiles{CC(=O)NC@@HC(=O)NC@@HC(=O)OCC} $