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pretty_name: SchemaBio Bundle
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# 🧬 SchemaBio Bundle

[English](./README_EN.md) | 中文

## 📖 概述
本数据集是一个全面、精心整理的一站式注释库，专为生物信息学和基因组变异分析设计（如 WES/WGS 流水线）。它将核心的变异效应预测器、临床数据库和基因组参考文件整合到统一的资源库中，大幅减少数据收集、格式对齐和预处理的时间。



## 🗂️ 包含数据与来源

本资源库包含以下类别的数据：
1. **变异效应预测器与评分：** AlphaMissense、EVOScore2、Pangolin。
2. **临床与人群频率数据：** gnomAD、CIViC、mskcc_hotspot。
3. **基因组参考与区域：** UCSC 注释文件（`cytoband`、`ncbiRefSeq.gtf`）、Ensembl 参考文件（`GRCh38/37 FASTA`、`vep_cache`）、ManeSelectBed。



## ⚖️ 许可证与商业使用

**好消息：本资源库包含的所有基础数据集目前均允许商业使用**，前提是用户严格遵守各自的署名和相同方式共享要求。

由于本资源库作为聚合器，**它不受单一许可证约束**。您必须遵守各基础数据源的单独许可证。下表概述了每个组件的具体许可证：

### 📊 数据库许可证汇总

| 数据库 / 来源 | 版本 | 官方许可证 | 商业使用 | 再分发 | 关键要求与说明 |
| :--- | :--- | :--- | :--- | :--- | :--- |
| [**AlphaMissense**](https://zenodo.org/records/10813168) | v3 | **CC BY 4.0** | ✅ 允许 | ✅ 允许 | 必须署名 DeepMind Technologies Limited。 |
| [**EVOScore2**](https://huggingface.co/datasets/pzweuj/EVOScore-2) | 20260128 | **MIT** | ✅ 允许 | ✅ 允许 | 必须包含原始版权声明。 |
| [**Pangolin**](https://zenodo.org/records/15649338) | v1 | **CC BY 4.0** | ✅ 允许 | ✅ 允许 | 必须提供适当署名。 |
| [**ManeSelectBed**](https://github.com/pzweuj/ManeSelectBed) | v49 | **MIT** | ✅ 允许 | ✅ 允许 | 必须包含原始版权声明。 |
| [**mskcc_hotspot**](https://www.cancerhotspots.org/) | v2 | **ODbL** | ✅ 允许 | ✅ 允许 | **相同方式共享：** 如果您修改/改编此数据库，衍生作品也必须采用 ODbL 许可证。 |
| [**CIViC**](https://civicdb.org/welcome) | 20260301 | **CC0 1.0** | ✅ 允许 | ✅ 允许 | 公共领域。无限制。 |
| [**gnomAD**](https://gnomad.broadinstitute.org/) | v4.1 | **无限制** | ✅ 允许 | ✅ 允许 | Broad Institute 声明对使用无限制。 |
| [**UCSC Data**](https://hgdownload.soe.ucsc.edu/goldenPath) | / | **公共领域** | ✅ 允许 | ✅ 允许 | 公共资助数据，可自由用于任何用途。 |
| [**Ensembl Data**](https://ftp.ensembl.org/pub/release-115/) | release 115 | **无限制** | ✅ 允许 | ✅ 允许 | EMBL-EBI 对使用或再分发无限制。 |

*免责声明：本组合数据集的创建者对原始源数据不主张任何所有权。用户需自行确保其下游使用符合原始数据提供者的条款。*