Search is not available for this dataset
id stringlengths 9 65 | sequence stringlengths 28 512 | secondary_structure stringlengths 28 512 | family stringclasses 9
values |
|---|---|---|---|
16S_rRNA-A.fulgidus_domain1 | AUUCUGGUUGAUCCUGCCAGAGGCCGCUGCUAUCCGGCUGGGACUAAGCCAUGCGAGUCAAGGGGCUUGUAUCCCUUCGGGGAUGCAAGCACCGGCGGACGGCUCAGUAACACGUGGACAACCUGCCCUCGGGUGGGGGAUAACCCCGGGAAACUGGGGCUAAUCCCCCAUAGGGGAUGGGUACUGGAAUGUCCCAUCUCCGAAAGCGCUUAGCGCCCGAGGAUGGGUCUGCGGCGGAUUAGGUUGUUGGUGGGGUAACGGCCCACCAAGCCGAAGAUCCGUACGGGCCAUGAGAGUGGGAGCCCGGAGAUGGACCCUGA... | ...(((((.......))))).((((((((((.((((((((((.....(((.(((..(((..((.(((((((((((....))))))))))).)))))......(((.......(((((((..((...(((((((.((((.....((((((....))))))......))))....((((((((.((......)))))))))).....((.....)).)))))))..))))))))).(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))..((((((((....))))...))))))).((((((....... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-A.fulgidus_domain2 | UUUAUUGGGCCUAAAGCGUCCGUAGCCGGGCUGGUAAGUCCUCCGGGAAAUCUGGCGGCUUAACCGUCAGACUGCCGGAGGAUACUGCCAGCCUAGGGACCGGGAGAGGCCGGGGGUAUUCCCGGAGUAGGGGUGAAAUCCUGUAAUCCCGGGAGGACCACCUGUGGCGAAGGCGCCCGGCUGGAACGGGUCCGACGGUGAGGGACGAAGGCCAGGGGAGCGAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCUGGCUGUAAACGAUGCGGACUAGGUGUCACCGAAGCUACGAGCUUCGGUGGUGCCGGAGGGAAGCCGUUAAG... | .......(((((...(.((((.(.(((.(((((((.((((((((((.....(((((((.....)))))))....))))))))..)))))))))...((((((.....(((((((((..(((((((....(((......))).......)))))))..)).......((....)).)))))))....))).)))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........((((((..((((((((((((((.....))))))))))))))...((..)))).....)... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-A.fulgidus_domain3 | AAGGAAUUGGCGGGGGAGCACUACAACGGGUGGAGCCUGCGGUUUAAUUGGAUUCAACGCCGGGAAGCUUACCGGGGGAGACAGCGGGAUGAAGGUCGGGCUGAAGACCUUACCAGACUAGCUGAGAGGUGGUGCAUGGCCGCCGUCAGUUCGUACUGUGAAGCAUCCUGUUAAGUCAGGCAACGAGCGAGACCCGCGCCCCCAGUUGCCAGCGGUUCCCUUCGGGGAAGCCGGGCACACUGGGGGGACUGCCGGCGCUAAGCCGGAGGAAGGUGCGGGCAACGGCAGGUCCGUAUGCCCCGAAUCCCCCGGGCUACACG... | .......(((((.(((((((..((..((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((...((((.(......(((.(((.......))).)))...)..))))...((.((((..(((((((((...((((((.((....))...((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..((((((((....))))).)))))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).))... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-A.fulgidus_domain4 | ACCGCCCGUCAAGCCACCCGAGUGGGCCAGGGGCGAGGGGGUGGCCCUAGGCCACCUUCGAGCCCAGGGUCCGCGAGGGGGGCUAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAGGGGAAUCUGCGGCUGGAUCACCUCCU | .(.(..((...((((.(((..(((((((..((((..((((((((((...))))))))))..))))..)))))))..))).))))....))...)..).((((((((((....))))))))))........... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-A.pyrophilus_domain2 | UCACUGGGCGUAAAGCGUCCGCAGCCGGUCGGGUAAGCGGGAUGUCAAAGCCCACGGCUCAACCGUGGAAUGGCAUCCCGAACUGCCCGACUUGAGGCACGCCCGGGCAGGCGGAAUUCCCGGGGUAGCGGUGAAAUGCGUAGAUCUCGGGAGGAACACCGAAGGGGAAGCCAGCCUGCUGGGGCUGUCCUGACGGUCAGGGACGAAAGCCGGGGGAGCGAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCCGGC | ................((((...(((.(((((((.(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...(((((..((..((((((((...((((((((...(((......)))......))))))))...).......((....)).))))))).))..)).)))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...)))))))) | 16S_rRNA |
16S_rRNA-A.pyrophilus_domain4 | CCGCCCGUCACGCCACGGAAGUCGGUCCGGCCGGAAGUCCCCGAGCUAACCGGCCCUUUUUGGGCCGGGGGCAGGGGCCGAUGGCCGGGCCGGCGACUGGGGCGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAGGGGAACCUGC | ..(..((...((((.(((..((((((((((((....(.((((..(((..(((((((.....))))))).))).)))).)...))))))))))))..))).))))....))...).........(((((....))))) | 16S_rRNA |
16S_rRNA-B.burgdorferi_domain2 | GGGAUUAUUGGGCGUAAAGGGUGAGUAGGCGGAUAUAUAAGUCUAUGCAUAAAAUACCACAGCUCAACUGUGGACCUAUGUUGGAAACUAUAUGUCUAGAGUCUGAUAGAGGAAGUUAGAAUUUCUGGUGUAAGGGUGGAAUCUGUUGAUAUCAGAAAGAAUACCGGAGGCGAAGGCGAACUUCUGGGUCAAGACUGACGCUGAGUCACGAAAGCGUAGGGAGCAAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCUACGCUGUAAACGAUGCACACUUGGUGUUAACUAAAAGUUAGUACCGAAGCUAACGUGUUAAGUGUGCCG... | ..........(((((...(.((((.(.(((.(((((((.((((((.(((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((...((((((((...((((((((...(((......)))......))))))))...).......((....)).)))))))..)))).))))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........((((((..((((((((((...))))))))))...((..)))).....))))))))... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-B.burgdorferi_domain3 | UCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGAUACGCGAGGAACCUUACCAGGGCUUGACAUAUAUAGGAUAUAGUUAGAGAUAAUUAUUCCCCGUUUGGGGUCUAUAUACAGGUGCUGCAUGGUUGUCGUCAGCUCGUGCUGUGAGGUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUGUUAUCUGUUACCAGCAUGUAAUGGUGGGGACUCAGAUAAGACUGCCGGUGAUAAGUCGGAGGAAGGUGAGGAUGACGUCAAAUCAUCAUGGCCCUUAUGUCCUGGGCUACAC... | ............(((.(((((((.((..((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((......((((((((..(((((((....))))))).((((....))))))))))))..((.((((..((((((.((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..(((......)))))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))....)).).)))...))))))))....)))))))...)).)... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-B.burgdorferi_domain4 | ACACACCGCCCGUCACACCACCCGAGUUGAGGAUACCCGAAGCUAUUAUUCUAACCCGUAAGGGAGGAAGGUAUUUAAGGUAUGUUUAGUGAGGGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACUGGAAAGUGCGGCUGGAUCACCUC | .....(.(..((...((((.(((..((((((.(((((....(.((((.((((..(((....))).)))))))).)...))))).))))))..))).))))....))...)..).((((((((((....))))))))))......... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-B.subtilis_domain2 | AUUAUUGGGCGUAAAGGGCUCGCAGGCGGUUUCUUAAGUCUGAUGUGAAAGCCCCCGGCUCAACCGGGGAGGGUCAUUGGAAACUGGGGAACUUGAGUGCAGAAGAGGAGAGUGGAAUUCCACGUGUAGCGGUGAAAUGCGUAGAGAUGUGGAGGAACACCAGUGGCGAAGGCGACUCUCUGGUCUGUAACUGACGCUGAGGAGCGAAAGCGUGGGGAGCGAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCACGCCGUAAACGAUGAGUGCUAAGUGUUAGGGGGUUUCCGCCCCUUAGUGCUGCAGCUAACGCAUUAAGCACU... | .......(((((.....((((.(.(((.(((((((.(((((((((.......((((((.....)))))).....)))))))..)))))))))...((((((((...((((((((...((((((((...(((......)))......))))))))...).......((....)).)))))))..))))).)))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........((((((..((((((((((((......))))))))))))...((..)))).....)))))... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-B.subtilis_domain3 | AAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAAGCAACGCGAAGAACCUUACCAGGUCUUGACAUCCUCUGACAAUCCUAGAGAUAGGACGUCCCCUUCGGGGGCAGAGUGACAGGUGGUGCAUGGUUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUGAUCUUAGUUGCCAGCAUUCAGUUGGGCACUCUAAGGUGACUGCCGGUGACAAACCGGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAAUCAUCAUGCCCCUUAUGACCUGGGCUACACACGUGC... | .......(((((.(((((((.((..((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((......(((((((....(((((....)))))...((((....))))))))).))..((.((((..((((((.((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..((......))))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))....)).).)))...))))))))....)))))))...)).)))))))... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-B.subtilis_domain4 | ACCGCCCGUCACACCACGAGAGUUUGUAACACCCGAAGUCGGUGAGGUAACCUUUUAGGAGCCAGCCGCCGAAGGUGGGACAGAUGAUUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAUCGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUUCU | ...(..((...((((.(((..((((((..((((....(.((((..(((..(((...))).))).)))).)...))))..))))))..))).))))....))...)....((((((((((....))))))))))............... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-C.elegans_domain1 | AAUAGGUUUGGUCCUAGCCUUUCUAUUAACUCUUAGUAGGAUUACACAUGCAAGCAUCCCCGCCCCAGUGAGUCACCCUCUAAAUCACCACGAUCAAAAGGAACAAGCAUCAAGUACGCAGAAAUGCAGCUCAAAACGCUUAGCCUAGCCACACCCCCACGGGAGACAGCAGU | ...(((((.......))))).........................((.(((..(......)......(((......(((....(((.....)))....)))....(((....(((..(((....))).)))......)))..((...))))).(.((....)).)...))))) | 16S_rRNA |
16S_rRNA-C.elegans_domain2 | GAUAAACCUUUAGCAAUAAACGAAAGUUUAACUAAGCCAUACUAACCCCAGGGUUGGUCAAUUUCGUGCCAGCCACCGCGGUCACACGAUUAACCCAAGCCAAUAGAAAUCGGCGUAAAGAGUGUUUUAGAUCAAUCCCCCAAUAAAGCUAAAAUUCACCUG | ........(.(((...(((((....))))).))))...............((((((((.....(((.....((.))))).......)))..))))).................................................................. | 16S_rRNA |
16S_rRNA-C.elegans_domain3 | AGUUGUAAAAAACUCCAGCUGAUAUAAAAUAAACUACGAAAGUGGCUUUAAUAUAUCUGAACACACAAUAGCUAGGACCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCCUAGCCCUAAACUUCAACAGUUAAAUUAACAAGACUGCUCGCCAGAACACUACGAGCCACAGCUUAAAACUCAAAGGACCUGGCGGUGCUUCACAUCCUUCUAGAGGAGCCUGUUCUGUAAUCGAUAAACCCCGAUCAACCUCACCACCUCUUGCUCAGCCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAA | .(((......)))....................(.((....)))..........................((((((...((...((((.........))))...))))))))..........(.(((((..........))))).).....((.......((((....)))).....))................................................((((........))))............................................... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-C.elegans_domain4 | ACCCUGACGAAGGCCACAAAGUAAGCACAAGUACCCACGUAAAGACGUUAGGUCAAGGUGUAGCCCAUGAGGU | .((((.....))).......)..........(((....)))................................ | 16S_rRNA |
16S_rRNA-C.psittaci_domain2 | UUUAUUGGGCGUAAAGGGCGUGUAGGCGGAAAGGAAAGUUAGAUGUUAAAUCUUGGGGCUCAACCCCAAGCCAGCAUCUAAUACUAUCUUUCUAGAGGGUAGAUGGAGAAAAGGGAAUUCCACGUGUAGCGGUGAAAUGCGUAGAUAUGUGGAAGAACACCAGUGGCGAAGGCGCUUUUCUAAUUUACACCUGACGCUAAGGCGCGAAAGCAAGGGGAGCAAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCUUGCCGUAAACGAUGCAUACUUGAUGUGGAUAGUCUCAACCCUAUCCGUGUCGUAGCUAACGCGUUAAGUAUG... | .......(((((.....((((.(.(((.((((((..(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)).))))))...(((((((((..((((((((...((((((((...(((......)))......))))))))...).......((....)).))))))).)))))).)))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........((((((..(((((((((((........)))))))))))...((..)))).....)))))... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-C.psittaci_domain3 | AAAGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCAGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAACGCGAAGAACCUUACCUGGGCUUGACAUGUAUUUGACCGCGGCAGAAAUGUCGUUUUCCGCAAGGACAGAUACACAGGUGCUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGCCGUGAGGUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUAUCGUUAGUUGCCAACACUUAGGGUGGGAACUCUAACGAGACUGCCUGGGUUAACCAGGAGGAAGGCGAGGAUGACGUCAAGUCAGCAUGGCCCUUAUGCCCAGGGCUACACACGUGC... | .......(((((.(((((((.((..((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((......((((((((...((((((....))))))..(((....)))))))))))..((.((((..((((((.((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..(((.....)))))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))....)).).)))...))))))))....)))))))...)).)))))))... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-C.psittaci_domain4 | ACCGCCCGUCACAUCAUGGGAGUUGGUUUUGCCUUAAGUCGUUGACUCAACCUGCAAAGGAGAGAGGCGCCCAAGGUGAGGCUGAUGACUGGGAUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCCUACCGGAAGGUGGGGCUGGAUCACCUCCUUU | ...(..((...((((.(((..((((((((((((....(.((((..(((..(((....))).))).)))).)...))))))))))))..))).))))....))...)....((((((((((....))))))))))............. | 16S_rRNA |
16S_rRNA-C.reinhardtii.chloro_domain1 | AUCCAUGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGACGAACGCUGGCGGCAUGCUUAACACAUGCAAGUCGAACGAGCAAAGCAAUUUGUGUAGUGGCGAACGGGUGCGUAACGCGUAAGAACCUACCUAUCGGAGGGGGAUAACAUUGGGAAACUGUUGCUAAUACCCCAUACAGCUGAGGAGUGAAAGGUGAAAAACCGCCGAUAGAGGGGCUUGCGUCUGAUUAGCUAGUUGGUGGGGGUAACGGCCUCCCAAGGCCACGAGCAGUAGCUGGUCUGAGAGGAUGAUCAGCCACACUGGGACUGAGACACGGCCCAGACUCCUA... | .........(((((.......))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..((..(((((....)))))...)))))......(((......(((((((..((...(((((((.((((.....((.(((....))).))......)))).....(((....)))....(((.....))).)))))))..)).)))))))(((..(.(((..((((.((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).(((((............))))).((((..... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-C.reinhardtii.chloro_domain2 | AUGAUUGGGCGUAAAGCGUCUGUAGGUGGCUCGUAAAGUCUAAUGUCAAAUACCAGGGCUCAACCUUGGACCGGCAUUGGAGUACUCACGAGCUUGAGUACGGUAGGGGCAGAGGGAAUUCCAUGUGGAGCGGUGAAAUGCGUAGAGAUAUGGAGGAACACCAGUGGCGAAGGCGCUCUGCUGGGCCGAAACUGACACUGAGAGACGAAAGCUGGGGGAGCGAAUAGGAUUAGAUACCCUAGUAGUCCCAGCCGUAAACUAUGGAGACUAAGUGCUGCCGCAAGCAGUGCUGUAGCUAACGCGUUAAGUCUCCCGCCUGG... | .......(((((...(.((((.(.(((.((((((..(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))...)).))))))...(((.((((...((((((((...((((((((...(((......)))......))))))))...).......((....)).)))))))..))))..)))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........((((((..((((((((.....))))))))...((..)))).....)))))))))).((... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-C.reinhardtii.chloro_domain3 | AAGGAAUUGACGGGACCGCACAAGCGGUGGAUUAUGUGGAUUAAUUCGAUACAACGCGAAGAACCUUACCAGGGUUUGACAUGUCAAGAACCUCUCAGAAAUGGGAGGGUGCCCUAACGGACUUGAACACAGGUGGUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGCUGUGAAGUGUAUAGUUAAGUCUCAUAACGAGCGCAACCCUCGUCUUUAGUUGCCAUUUGGUUCUCUAAAGAGACUGCCAGUGUAAGCUGGAGGAAGGUGAGGAUGACGUCAAGUCAGCAUGCCCCUUACAUCCUGGGCUUCACACGUAAUACAAUGGUUG... | .......(((((((((((.((..((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((......(((((((..(((((((....)))))))...((.....)).))))).))..((.((((..((((((.((...(((((((((....)))....((......))....)))))).....((((.(((((((...((....))....)))))))..((.(((((....))))).)).....))))....)).).)))...))))))))....)))))))...)).)))))))).)...(((((... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-C.reinhardtii.chloro_domain4 | ACCGCCCGUCACACCAUGGAAGCUGGUUCUGCUCCAAGUCGUUACCCUAACCUUCGGGAGGGGGGCGCCUAAAGCAGGGCUAGUGACUAGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGGGCUACUGGAAGGUGGCCCUGGCUCACCUCCUUC | ...(..((.(.((((.(((..((((((((((((....(.((((.((((..((....)).)))))))).)...))))))))))))..))).))))..).))...)....((((((((((....))))))))))............. | 16S_rRNA |
16S_rRNA-C.reinhardtii.mito_domain1 | AAAUUAGAGUUUGGUGCUGGCUCAGCUUUCAUGCGCCGAGCGGUGGUUUAUACAUGCGAGCUUAAAAGAUUAAGGCCACGAGUGCGUAAUACGCGAGUUUAAAUUUAUUAUACAAAAGUUGCUAGGUGACCCAAUACGGGCAUCGGGCAAAACUCGCGUAGGAUUAGCGAGCUGGGUCGCGACGCCAAUACAGCGGCCCAUGGCUUAUCCUUAGCCUGUCUUAACGGUACUAGGCCACGGUGGCACUGAAAAGGGGCCACGGUUCUUAUGAACCCAGCAGUGUUGAAUUUUGGACAAUCGCUUGAACGGCGGAUCCAGAU... | ......(((((.......)))))..............((((((.......(((.(((..((((....................................................))))......(((.....((.((((............)))).))(((....((....(((((((..............)))))))..))....)))..((((..((....))....))))))).(((((...........))))).((((....))))...)))))).......(.(((...(((((.....))))).))))...... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-C.reinhardtii.mito_domain2 | CCCCCAAGCACGUGCCAGAAGGGUCGGUAAAACGUGCGGUGUCAGUAUAAAGCGUCUUGACUAGGCAGGCAGCGCGUCUGAGCGUUAAUGGUGAACACUUUAAACGUUGGGUAAUAUUCGGAGGAUCGGUCAAAUGAGAAUAUUCCGGAUGGAAAGCCGAAGGCGAAAGCACCAACAUCAGAGUCACUAAAGCUUCAACGCGUAAGUUUGGGUAGCGAACCGGAUUAGAGACCCGCAGUAGUCCAAACCGUCAACA | .......(((((....................)))))....................................((((..((((.............(((((..(.(((((.(..((((((((...(((......)))......))))))))..)........((....)).))))).).))))).......))))..))))....(((((((...(....(((.........))).....))))))))........ | 16S_rRNA |
16S_rRNA-C.reinhardtii.mito_domain3 | CAUUAUAGUUUUCAAAUCUAUAACGCCUGGUGAUACGGUGGCAACACUAUAAAUCAAAGCAAUUGGCAGCGAUAGAGAUGCGCGGUGGAAUAUGCUGUUUAAAUCGAAUUUACGCGCAAAAUCUUACCACUUUUUAUUAAAAUAGCUCUUGCAUUGCUGAAAAGUUCGAGCGGGACCUCGCCCUUAGUGCCGGUCUUUGCCACGUUUUCUGAACGGUCGAGCAAGUCAUCAUGGGGCUUAUAGAGUGGGCUACAGGCGUAUUACAUUGGACACCCACAAGUUGGAUACCAAAACUGUCCGAAUAUACGGAUUGGAGUAGC... | ..((((((.........)))))).....(((.....((((....))))....))).................................((((((((((......((........))..........(((((((...........((.((((..(.(((....((.(((((......)))............)).))......((.((.......)).))....)))....)))))))....)))))))...)).))))))))...(((((((......................))))))).....(....(((((....... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-C.reinhardtii.mito_domain4 | GAAUCGCGAGUAAUCGUAGAUCAUUAGCGCUACGGUGAAGGUAACCUCUAUUGUGCACACAUUGCCCGUCACCUCCGAUAAUAGUAUUGUACAGGAAGAACUAUGGCUACACUUA | ............(((((((..........)))))))............................................................................... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-D.melanogaster_domain4 | ACCGCCCGUCGCUACUACCGAUUGAAUUAUUUAGUGAGGUCUCCGGACGUGAUCACUGUGACGCCUUGCGUGUUACGGUUGUUUCGCAAAAGUUGACCGAACUUGAUUAUUUAGAGGAAGUAAAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUA | .(.(..((.(..((((..(..((((((.(((.(((..((((..(....((((.(((((((((((.....))))))))).)).).)))....)..))))..))).))).))))))..).))))...).))...)..).((((((((((....))))))))))........ | 16S_rRNA |
16S_rRNA-E.coli_domain2 | AUUACUGGGCGUAAAGCGCACGCAGGCGGUUUGUUAAGUCAGAUGUGAAAUCCCCGGGCUCAACCUGGGAACUGCAUCUGAUACUGGCAAGCUUGAGUCUCGUAGAGGGGGGUAGAAUUCCAGGUGUAGCGGUGAAAUGCGUAGAGAUCUGGAGGAAUACCGGUGGCGAAGGCGGCCCCCUGGACGAAGACUGACGCUCAGGUGCGAAAGCGUGGGGAGCAAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCACGCCGUAAACGAUGUCGACUUGGAGGUUGUGCCCUUGAGGCGUGGCUUCCGGAGCUAACGCGUUAAGUCGAC... | .......(((((...(.((((...(((.(((((((.(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((...((((((((...((((((((...(((......)))......))))))))...).......((....)).)))))))..)))).))))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........((((((..((((((((((((.....))))))))))))...((..)))).....))))))... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-E.coli_domain3 | AAUGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAACGCGAAGAACCUUACCUGGUCUUGACAUCCACGGAAGUUUUCAGAGAUGAGAAUGUGCCUUCGGGAACCGUGAGACAGGUGCUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUUGUGAAAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUAUCCUUUGUUGCCAGCGGUCCGGCCGGGAACUCAAAGGAGACUGCCAGUGAUAAACUGGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAGUCAUCAUGGCCCUUACGACCAGGGCUACACACGUG... | .......(((((.(((((((.((..((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((......(((((((..(((((((....))))))).(.((....)).)))))).))..((.((((..((((((.((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..(((.....)))))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))....)).).)))...))))))))....)))))))...)).))))))... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-E.coli_domain4 | ACCGCCCGUCACACCAUGGGAGUGGGUUGCAAAAGAAGUAGGUAGCUUAACCUUCGGGAGGGCGCUUACCACUUUGUGAUUCAUGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAACCGUAGGGGAACCUGCGGUUGGAUCACCUCCUUA | .(.(..((.(.((((.(((..((((((((((((....((((((.((((..((....)).))))))))))...))))))))))))..))).))))..).))...)..).((((((((((....))))))))))............. | 16S_rRNA |
16S_rRNA-F.ananassa_domain3 | AAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUGGAGCCUGCGCUUAAUUUGACUCAACACGGGGAAACUUACCAGGUCCAGACAUAGUAAGGAUUGACAGACUGAGAGCUCUUUCUUGAUUCUAUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGCGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGUUAACGAACGAGACCUCAGCCUGCUAACUAGCUAUCGGGAGGUCUCCUCGGGCCAGCUUCUUAGAGGGACUAUGGCCGCUUAGCGAACCAAGUUUGAGGCAAUAACAGGUCUGUCAUGCCCUUAGAUGUUCUGGGCCGCA... | .......(((((.(((((((..((..((((((.(((.(((((....((((........))))........(((((.(....(((((........((.(((........))).))......)))))...((.((((..((((((((....(((.(((((....)))...(((......)))...)).))).....((((.(((.((((..((((..(((((....))).))....))))..))))))).....(.((......)).)........)))).....))).)))...).))))))).....).)))))...)).... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-F.ananassa_domain4 | ACCGCCCGUCGCUCCUACCGAUUGAAUGGUCCGGUGAAGUUGUUCGGAUCGCGGCGACGGGGGGCCGGUUCGCUGCCCGCGACGUCGCGAGAAGUUCCACUGAACCUUAUCAUUUAGAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUG | .(.(..((.(.(((((.((..(.(((((((..(((..(((.(..(...((((((((.((.(((..(((....)))))).)).))))))))...)..).)))..)))..))))))))..)).)))))..).))...)..).((((((((((....))))))))))........ | 16S_rRNA |
16S_rRNA-G.intestinalis_domain1 | CAUCCGGUCGAUCCUGCCGGAGCGCGACGCUCUCCCCAAGGACGAAGCCAUGCAUGCCCGCUCACCCGGGACGCGGCGGACGGCUCAGGACAACGGUUGCACCCCCCGCGGCGGUCCCUGCUAGCCGGACACCGCUGGCAACCCGGCGCCAAGACGUGCGCGCAAGGGCGGGCGCCCGCGGGCGAGCAGCGUGACGCAGCGACGGCCCGCCCGGGCUUCCGGGGCAUCACCCGGUCGGCGCGGUCGCGGCGCGCCGAGGGCCCGACGCCUGGCGGAGAAUCAGGGUUCGACUCCGGAGAGCGGGCCUGCGAGACGGCCCG... | ...(((((.......))))).((((((((((.(((((..((.....(((.(((..((.(((...........)))))......(((.......(((..(...((...((((..............((.....((((((....))))))......))..................................................))))..)).)..))).(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))...((((((((....))))...))))))).(((((((........))))))... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-G.intestinalis_domain2 | CGCUGCUGCAGUUGAAACGCCCGUAGUUGGCCCCCCGCCGCCACGAGGAAACGGGAGCGCUCCAGGCAGGCCCGUUGGACCCGCCGCGUGGGACCGCGCAGCGGGCCGGCGCGCCGCGGCAGCCCCGAGGAGAGCGGGCGGGGGCACCGGUACCGGCCGGGGACGGGUGAAACAGGAUGAUCCCGCCGAGACCGCCGGCCGCGCAGGCGCCUGCCAAGACCGCCUCUGUCAAUCAAGGGCGAAGGCCGGGGGCUAGAAGGCGAUCAGACACCACCGUAUUCCCGGCCGUAAACGGUGCCGCCCCGCGGCCGGCGCGCGCG... | ........(((((.....((((...(((............(((((.........................................))))).........((((((....)).)))).............(((((((.(...((((..((...((((.((...(.(......).)......)).))))...)).......((....))...))))..).)))).)))...)))...))))....((((((....(...((.(.........).))...).))))))..........((((((..(((.((((((......... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-G.intestinalis_domain3 | AAGGCAUUGACGGAGGGGUACCACCAGACGUGGAGUCUGCGGCUCAAUCUGACUCAACGCGCGCACCUCACCAGGCCCGGACGCGCGGAGGACCGACAGCCGGGCGCGCUUUCGCGAUCGCGCGGGCGGUGGUGCAUGGCCGCUCCCAGCCCGUGGCGCGAGCCGUCUGCUCCAUUGCGACAACGAGCGAGACCCCGGCCGCGGGCGCCGCGGGACGGCCCGCGCGAGCGGGAGGACGGCGGGGCGAUAGCAGGUCUGUGAUGCCCUCAGACGCCCUGGGCCGCACGCGCGCUACACUGGCGGGGCCAGCCGGCGCGCGC... | .......(((((.(((((((..((..((((((.(((.((((((....(.((........)).).......(((((.(....(((((.......(((.(((.......))).))).....)))))...((.((((..((((((((....((.((((((....)))...(((......)))...))).)).....((((.((((((...))))))..(..(((((....)))))..)....)))).....))).)))...).))))))).....).)))))...)).)))).))).)...((((((.....((((((..(..... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-G.intestinalis_domain4 | ACCGCCCGUCGCUCCUACCGACUGGGCGCGGCGGCGAGCGCCCCGGACGCGCGAAGGGCCGCGAGCCCCCGCGCCUGGAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUAUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAUGGAUCCCUC | ...(..((.(.(((((.((..(.((((((((.(((..(((.(((...........))).)))..))).)))))))))..)).)))))..).))...)....((.((((((((....))))))))))........ | 16S_rRNA |
16S_rRNA-H.sapiens.mito_domain1 | AAUAGGUUUGGUCCUAGCCUUUCUAUUAGCUCUUAGUAAGAUUACACAUGCAAGCAUCCCCGUUCCAGUGAGUUCACCCUCUAAAUCACCACGAUCAAAAGGAACAAGCAUCAAGCACGCAGCAAUGCAGCUCAAAACGCUUAGCCUAGCCACACCCCCACGGGAAACAGCAGUGAUUAACCUUUAGCAAUAAACGAAAGUUUAACUAAGCUAUACUAACCCCAGGGUUGGUCAAUUUCGUGCCAGCCACCGCGGUCACACGAUUAACCCAAGUCAAUAGAA | ...(((((.......))))).((((((.(((.(((((((((...(((.(((..(......)......(((.......(((....(((.....)))....)))....(((....(((..(((....))).)))......)))..((...)))))...((....)).....)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).)))))).....((((((((.....(((.....((.))))).......)))..))))).))).)))))). | 16S_rRNA |
16S_rRNA-H.sapiens.mito_domain2 | CCCGGCGUAAAGAGUGUUUUAGAUCACCCCCUCCCCAAUAAAGCUAAAACUCACCUGAGUUGUAAAAAACUCCAGUUGACACAAAAUAGACUACGAAAGUGGCUUUAACAUAUCUGAACACAGAAUAGCUAAGACCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCCUAAACCUCAACAGUUAAAUCAACAAAACUGCUCGCCAGAACACUACGAGCCACAGCUUAAAACUCA | ...(((((......(((...(((...............(((((((.....(((.((..(((......)))...)).))).....).....(.((....))))))))).....)))....))).....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........(.(((((......))..))))).).))).((.......((((....)))).....)). | 16S_rRNA |
16S_rRNA-H.sapiens.mito_domain3 | AAGGACCUGGCGGUGCUUCAUAUCCCUCUAGAGGAGCCUGUUCUGUAAUCGAUAAACCCCGAUCAACCUCACCACCUCUUGCUCAGCCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAAACCCUGAUGAAGGCUACAAAGUAAGCGCAAGUACCCACGUAAAGACGUUAGGUCAAGGUGUAGCCCAUGAGGUGGCAAGAAAUGGGCUACAUUUUCUACCCCAGAAAACUACGAUAGCCCUUAUGAAACUUAAGGGUCGAAGGUGGAUUUAGCAGUAAACUAAGAGUAGAGUGCUUAGUUGAACAGGGCCCUGAAGCGCGUACAC | .......(((((.(((((((...((..((((((.((((((((((...((((........))))........(((((((.......((.((((..((((((.(.(..((..(((((.....))).......))..)).....(((....)))...).).).)))...))))))))....)))))))..)).)))))))).)...((((.....)))).....(..(.(((((((.......))))))).)..).....))))).....(((((((.........)))))))......))...)))))))))).)). | 16S_rRNA |
16S_rRNA-H.sapiens.mito_domain4 | ACCGCCCGUCACCCUCCUCAAGUAUACUUCAAAGGACAUUUAACUAAAACCCCUACGCAUUUAUAUAGAGGAGACAAGUCGUAACAUGGUAAGUGUACUGGAAAGUGCACUUGGACGAAC | ...(..((.(...((((((...((.......................................))..))))))....).))...)....((((((((((....))))))))))....... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-H.sapiens_domain3 | AAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGAAACCUCACCCGGCCCGGACACGGACAGGAUUGACAGAUUGAUAGCUCUUUCUCGAUUCCGUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGCGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGAUAACGAACGAGACUCUGGCAUGCUAACUAGUUACGCGACCCCCGAGCGGUCGGCGUCCCCCAACUUCUUAGAGGGACAAGUGGCGUUCAGCCACCCGAGAUUGAGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGAUGUCCG... | .......(((((.(((((((..((..((((((.(((.((((((....((((........))))........(((((.(....(((((........((.(((........))).))......)))))...((.((((..((((((((....(((.(((((....)))...(((......)))...)).))).....(.((.(.(.((((..((((....(((..((((....)))).)))....))))..))))).)..(..(((((.....)))))..)....)).)....))).)))...).))))))).....).)))... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-H.sapiens_domain4 | ACCGCCCGUCGCUACUACCGAUUGGAUGGUUUAGUGAGGCCCUCGGAUCGGCCCCGCCGGGGUCGGCCCACGGCCCUGGCGGAGCGCUGAGAAGACGGUCGAACUUGACUAUCUAGAGGAAGUAAAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUA | ...(..((.(..((((.((..(.((((((((.(((..((((.((...(((((.((((((((((((.....))))))))))))...)))))...)).))))..))).)))))))))..)).))))...).))...)....((((((((((....))))))))))........ | 16S_rRNA |
16S_rRNA-H.volcanii_domain1 | AUUCCGGUUGAUCCUGCCGGAGGUCAUUGCUAUUGGGGUCCGAUUUAGCCAUGCUAGUUGCACGAGUUCAUACUCGUGGCGAAAAGCUCAGUAACACGUGGCCAAACUACCCUACAGAGAACGAUAACCUCGGGAAACUGAGGCUAAUAGUUCAUACGGGAGUCAUGCUGGAAUGCCGACUCCCCGAAACGCUCAGGCGCUGUAGGAUGUGGCUGCGGCCGAUUAGGUAGACGGUGGGGUAACGGCCCACCGUGCCGAUAAUCGGUACGGGUUGUGAGAGCAAGAGCCCGGAGACGGAAUCUGAGACAAGAUUCCGGGCC... | ...(((((.......))))).((((((((((.((((((((((.....(((.(((..(((..((((((....)))))))))......(((.......(((((((..((...(((((((.((((.....((((((....))))))......))))....(((((((..((......)).)))))))......((....)).)))))))..))))))))).(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).(((... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-H.volcanii_domain2 | AUUAUUGGGCCUAAAGCGUCCGUAGCCGGCCACGAAGGUUCAUCGGGAAAUCCGCCAGCUCAACUGGCGGGCGUCCGGUGAAAACCACGUGGCUUGGGACCGGAAGGCUCGAGGGGUACGUCCGGGGUAGGAGUGAAAUCCCGUAAUCCUGGACGGACCACCGAUGGCGAAAGCACCUCGAGAAGACGGAUCCGACGGUGAGGGACGAAAGCUAGGGUCUCGAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCUAGCUGUAAACGAUGCUCGCUAGGUGUGACACAGGCUACGAGCCUGUGUUGUGCCGUAGGGAAGCCGAGAAG... | .......(((((.....((((.(.(((.((((((..(((((((((((....(((((((.....)))))))...)))))))))..)).))))))...((((((.....(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..)).......((....)).)))))))....))).)))...))))..))))....((((((....(...((((.........))))...).))))))..........((((((..((((((((((((((.....))))))))))))))...((..)))).....)... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-H.volcanii_domain3 | AAGGAAUUGGCGGGGGAGCACUACAACCGGAGGAGCCUGCGGUUUAAUUGGACUCAACGCCGGACAUCUCACCAGCUCCGACUACAGUGAUGACGAUCAGGUUGAUGACCUUAUCACGACGCUGUAGAGAGGAGGUGCAUGGCCGCCGUCAGCUCGUACCGUGAGGCGUCCUGUUAAGUCAGGCAACGAGCGAGACCCGCACUUCUAAUUGCCAGCAGCAGUUUCGACUGGCUGGGUACAUUAGAAGGACUGCCGCUGCUAAAGCGGAGGAAGGAACGGGCAACGGUAGGUCAGUAUGCCCCGAAUGAGCUGGGCUACAC... | .......(((((.(((((((..((..((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((...((((((((.....(((.(((.......))).)))....))))))))...((.((((..(((((((((...((((((.((....))...((((......))))..)))))).....(((..(((((((...((..(((((((....)))).)))))....)))))))..((.(((((.....))))).))......)))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).)... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-H.volcanii_domain4 | CCGCCCGUCAAAGCACCCGAGUGAGGUCCGGAUGAGGCCACCACACGGUGGUCGAAUCUGGGCUUCGCAAGGGGGCUUAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAGGGGAAUCUGCGGCUGGAUCACCUCCUG | ..(..((...((((.(((..(((((((((((((..(((((((....)))))))..)))))))))))))..))).))))....))...)....((((((((((....))))))))))............ | 16S_rRNA |
16S_rRNA-M.polymorpha_domain2 | UGCGAUUAUGACAAGACUCGAAGAAGAAGCCCCGGCUAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAGACGGGGGGGGCAAGUGUUAUUCGGAAUGACUAGGCGUAAAGGGCACGUAGGCGGUGAAUCCAGUUGAAAGUGAAAGUCGCCAGCUCAACUGGCGGAAUGCUUUCAAAACCAAUUUACUAGAGUAAGGCAUAGAGGAAAGCGGAAUUUCGUGUGUAGCGAUAAAAUGCAAAAAUAUACGAAGGAACGCCAAAAGCGAAGGCAGCUUUCUGGUUCUUUAACUGACGCUAAAGUGCGAAAGCAUGGGGAGCAAACAGGAU... | .(.........)................(((((......(((((....................))))))))))...............................((((...((((((((((...((((((((((.....(((((.......)))))...)))))))))..)..)))))).....(((((.(....((((((((...((((((((...(((......)))......))))))))...).......((....)).)))))))...)))))).....))))...))))....(((((((...(...((((..... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-M.polymorpha_domain3 | GUGUUCGUUCUUGGUCUACUGAUAUCGCACUCUUUUGGGCUGACUUAAGCUCGGCUUAAUGCUUAAAUUACUGCAAAGGUAGUGUGACUCGAUUGUUUUCUUCAAGUUCCAACAAUCGUGAAAAAUAUGUGAUGAUCAGGGGCUGAGCUAACGCGUUAAACACUCCGCCUGGGGAGUACGGUCGCAAGGCUGAAACUCAAAGAAUUGACGGGGGCCUGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUUCAACGCGCAAAACCUUACCAGCCCUUGACAUAUGAAUAAGUGUGCUUGUCCUUAACGGGAUGGUACGAA... | .((((.((((((((((.....................................................................................................................))))))))))...((....))....))))........(((......((((....))))....)))..............................................(.((........)).).....................((((((........(((((.....)))))............. | 16S_rRNA |
16S_rRNA-M.polymorpha_domain4 | CGAGCUAAGUUUUUGCAAACGCCGUGUGGCUCAUUCUGAAAAGAAUAUGACCAUACAAAGUUUUCAUACGGUAUUCUCCGACGAACGAAGCUCUCAGAGCAUUGUACACUUCACACUGAGGAACUCGAUCUUAGUCAAAAUGA | ............................................................................................................................................... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-P.occultum_domain2 | AUUACUGGGCCUAAAGCGCCCGUAGCCGGCCCGGUAAGUCCCCCCCUAAAGCCCCGGGCUCAACCCGGGGAGUGGGGGGGAUACUGCCGGGCUAGGGGGCGGGAGAGGCCGAGGGUACUCCCGGGGUAGGGGCGAAAUCCGAUAAUCCCGGGAGGACCACCAGUGGCGAAGGCGCUCGGCUGGAACGCGCCCGACGGUGAGGGGCGAAAGCCGGGGGAGCAAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCCGGCUGUAAACGAUGCGGGCUAGGUGUUGGGCGGGCUUGGAGCCCGCCCAGUGCCGCAGGGAAGCCGUUAAGC... | .......(((((...(.((((.(.(((.(((((((.((((((((((.....(((((((.....)))))))...))))))))..)))))))))...((((((.....(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..)).......((....)).)))))))....))).)))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........((((((..((((((((((((((.....))))))))))))))...((..)))).....))... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-P.occultum_domain3 | AAGGAAUUGGCGGGGGAGCACCACAAGGGGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUGGAGUCAACGCCGGGAAUCUUACCGGGGGCGACAGCAGGAUGACGGCCAGGCUGACGACCUUGCCCGACACGCUGAGAGGAGGUGCAUGGCCGUCGCCAGCUCGUGCCGUGAGGUGUCCGGUUAAGUCCGGCAACGAGCGAGACCCCCACCCCUAGUUGCUACCCCGGGGCCACCCCGGGGGCACACUAGGGGGACUGCCGCCGUCCAAGGCGGAGGAAGGAGGGGGCCACGGCAGGUCAGCAUGCCCCGAAUCCCCCGGGCUGCACGCGG... | .......(((((.((.((((..((..((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((...((((.(......(((.(((.......))).)))...)..))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..(((((((...)))))))))....)))))))..((.(((.(......).))).)).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).)))))... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-P.occultum_domain4 | ACCGCCCGUCGCUCCACCCGAGCGGGGGAGGGGUGAGGCCCCGUCCCUCGCCAGGGCGGGGUCGAACCUCUCCCCCGCGAGGGGGGAGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAGGGGAACCUGCGGCUGGAUCACCUCCU | .(.(..((...((((.(((..(((((((((((((..((((((((((.......))))))))))..)))))))))))))..))).))))....))...)..).((((((((((....))))))))))........... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-P.staleyi_domain2 | UUUACUGGGCUUAAAGAGUUCGUAGGCGGUCUUGUAAGUGGGGUGUGAAAUCCCUCGGCUCAACCGAGGAACUGCGCUCCAAACUACAAGACUUGAGGGGGAUAGAGGUAAGCGGAACUGAUGGUGGAGCGGUGAAAUGCGUUGAUAUCAUCAGGAACACCGGAGGCGAAGGCGGCUUACUGGGUCCUUUCUGACGCUGAGGAACGAAAGCUAGGGGAGCAAACGGGAUUAGAUACCCCGGUAGUCCUAGCCGUAAACGAUGAGCACUGGACCGGAGCUCUGCACAGGGUUUCGGUCGUAGCGAAAGUGUUAAGUGCUCC... | .......(((((...(.((((.(.(((.(((((((.(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((...((((((((...((((((((...(((......)))......))))))))...).......((....)).)))))))..)))).))))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........((((((..((((((((((((....))))))))))))...((..)))).....)))))))... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-P.staleyi_domain3 | AAGGAAUUGACGGGGGCUCACACAAGCGGUGGAGGAUGUGGCUUAAUUCGAGGCUACGCGAAGAACCUUAUCCUAGUCUUGACAUGCUUAGGAAUCUUCCUGAAAGGGAGGAGUGCUCGCAAGAGAGCCUUUGCACAGGUGCUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUCGGGUUAAGUCCCUUAACGAGCGAAACCCUUGUCCUUAGUUACCAGCGCGUCAUGGCGGGGACUCUAAGGAGACUGCCGGUGUUAAACCGGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAGUCCUCAUGGCCUUUAUGAUUAGGGCUGCAC... | .......(((((.(((((((.((..((((((.((((((((((....((((........)))).........(((((((......(((..(((..(((((((....))))))).(.(((....))).))))..)))..((.((((..((((((.((...(((((((((....)))...(((......)))...)))))).....((((.(((((((...((..(((......)))))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))....)).).)))...))))))))....)))))))...)).)... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-P.staleyi_domain4 | ACCGCCCGUCAAGCCACGAAAGUGGGGGGGACCCAACAGCGCUGCCGUAACCGCAAGGAACAAGGCGCCUAAGGUCAACUCCGUGAUUGGGACUAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAGGGGAACCUGCGGCUGGAUCACCUCCUUUCU | .(.(..(....((.(.(((..((((((..((((.....(((((...((..((....)).))..)))))....))))..))))))..))).).)).....)...)..).((((((((((....))))))))))............... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-S.cerevisiae_domain3 | AGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGGAAACUCACCAGGUCCAGACACAAUAAGGAUUGACAGAUUGAGAGCUCUUUCUUGAUUUUGUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGUGAUUUGUCUGCUUAAUUGCGAUAACGAACGAGACCUUAACCUACUAAAUAGUGGUGCUAGCAUUUGCUGGUUAUCCACUUCUUAGAGGGACUAUCGGUUUCAAGCCGAUGGAAGUUUGAGGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGACGUUCUGGGCCG... | ......(((((.(((((((..((..((((((.(((.((((((....((((........))))........(((((.(....(((((........((.(((........))).))......)))))...((.((((..((((((((....(((.(((((....)))...(((......)))...)).))).....((((.(((.((((..(((((.((((((....))))))...)))))..)))))))..((((((((.....)))))))).....)))).....))).)))...).))))))).....).)))))...)... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-S.cerevisiae_domain4 | CGCCCGUCGCUAGUACCGAUUGAAUGGCUUAGUGAGGCCUCAGGAUCUGCUUAGAGAAGGGGGCAACUCCAUCUCAGAGCGGAGAAUUUGGACAAACUUGGUCAUUUAGAGGAACUAAAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUA | .(..((.(..((((.((..(.((((((((.(((..(.((..(...(((((((.((((.((((....)))).)))).)))))))...)..)).)..))).)))))))))..)).))))...).))...)....((((((((((....))))))))))........ | 16S_rRNA |
16S_rRNA-T.gondii_domain3 | AAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGCGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGGAAACUCACCAGGUCCAGACAUAGGAAGGAUUGACAGAUUGAUAGCUCUUUCUUGAUUCUAUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGUGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGUUAACGAACGAGACCUUAACCUGCUAAAUAGGAUCAGGAACUUCGUGUUCUUGUAUCACUUCUUAGAGGGACUUUGCGUGUCUAACGCAAGGAAGUUUGAGGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGAUGUUCUGGGC... | .......(((((.(((((((..((..((((((.(((.((((((....((((........))))........(((((.(....(((((........((.(((........))).))......)))))...((.((((..((((((((....(((.(((((....)))...(((......)))...)).))).....((((.(((.((((..((((((((((((.....))))))).))).))..)))))))..((((((((.....)))))))).....)))).....))).)))...).))))))).....).)))))..... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-T.gondii_domain4 | ACCGCCCGUCGCUCCUACCGAUUGAGUGUUCCGGUGAAUUAUUCGGACCGUUUUGUGGCGCGUUCGUGCCCGAAAUGGGAAGUUUUGUGAACCUUAACACUUAGAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUC | .(.(..((.(.(((((.((..(.(((((((..(((..((.(..(...((((((((.(((((....)))))))))))))...)..).))..)))..))))))))..)).)))))..).))...)..).((((((((((....))))))))))........ | 16S_rRNA |
16S_rRNA-T.maritima_domain2 | UUUACUGGGCGUAAAGGGGGCGUAGGCGGCCUGGUGUGUCGGAUGUGAAAUCCCACGGCUCAACCGUGGGGCUGCAUCCGAAACUACCAGGCUUGGGGGCGGUAGAGGGAGACGGAACUGCCGGUGUAGGGGUGAAAUCCGUAGAUAUCGGCAGGAACGCCGGUGGGGAAGCCGGUCUCCUGGGCCGACCCCGACGCUGAGGCCCGAAAGCCAGGGGAGCAAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCUGGCUGUAAACGAUGCCCACUAGGUGUGGGGGGGUAAUCCCUCCGUGCUGAAGCUAACGCGUUAAGUGGGCCG... | .......(((((...(.((((.(.(((.(((((((..((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..).)))))))...((((((((...((((((((...((((((((...(((......)))......))))))))...).......((....)).)))))))..)))).))))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........((((((..((((((((((((...))))))))))))...((..)))).....))))))))... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-T.maritima_domain3 | GGUACCUCCCCGAAAGGGGUAGGGACCCAGUCCUUCGGGACUGGGAGCCGGCACAGGUGGUGCACGGCCGUCGUCAGCUCGUGCCGUGAGGUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCCUGCCCCUAGUUGCCAGCGGUUCGGCCGGGCACUCUAGGGGGACUGCCGGCGACGAGCCGGAGGAAGGAGGGGAUGACGUCAGGUACUCGUGCCCCUUAUGCCCUGGGCGACACACGCGCUACAAUGGGCGGUACAAUGGGUUGCGACCCCGCGAGGGGGAGCCAAUCCCCAAAGCCGCCCUCAGUUCGGAUCGCAG... | ....(((((((....)))).)))..((((((((....))))))))..........((.((((..((((((.((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..(((.....)))))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))....)).).)))...))))))))..............................(((((((.....(((..((...(((....)))...))....)))....)))))))......(....(((((... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-T.maritima_domain4 | ACCGCCCGUCACGCCACCCGAGUCGGGGGCUCCCGAAGACACCUACCCCAACCCGAAAGGGAGGGGGGGUGUCGAGGGAGAACCUGGCGAGGGGGGCGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACCGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUUCU | .(.(..((...((((.(((..((((((..((((....(((((((.((((..(((....))).)))))))))))...))))..))))))..))).))))....))...)..).((((((((((....))))))))))............... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-Z.mays_domain1 | CUCAUGGAGAGUUCGAUCCUGGCUCAGGAUGAACGCUGGCGGCAUGCUUAACACAUGCAAGUCGAACGGGAAGUGGUGUUUCCAGUGGCGAACGGGUGAGUAACGCGUAAGAACCUGCCCUUGGGAGGGGAACAACAACUGGAAACGGUUGCUAAUACCCCGUAGGCUGAGGAGCAAAAGGAGAAAUCCGCCCAAGGAGGGGCUCGCGUCUGAUUAGCUAGUUGGUGAGGCAAUAGCUUACCAAGGCGAUGAUCAGUAGCUGGUCCGAGAGGAUGAUCAGCCACACUGGGACUGAGACACGGCCCAGACUCCUACGGGAG... | ........(((((.......))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..((.(((((.....))))).)))))......(((......((((.((..((...(((((((.((((.....((((((....))))))......))))....(((....)))....(((....))).)))))))..)).)).))))(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))..((((((((....))))...))))))).(((((............))))).((((....))))... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-Z.mays_domain2 | AUGAUUGGGCGUAAAGCGUCUGUAGGUGGCUUUUCAAGUCCGCCGUCAAAUCCCAGGGCUCAACCCUGGACAGGCGGUGGAAACUACCAAGCUGGAGUACGGUAGGGGCAGAGGGAAUUUCCGGUGGAGCGGUGAAAUGCAUUGAGAUCGGAAAGAACACCAACGGCGAAAGCACUCUGCUGGGCCGACACUGACACUGAGAGACGAAAGCUAGGGGAGCAAAUGGGAUUAGAGACCCCAGUAGUCCUAGCCGUAAACGAUGGAUACUAGGUGCUGUGCGACUCGACCCGUGCAGUGCUGUAGCUAACGCGUUAAGUAUC... | .......(((((.....((((.(.(((.((((....(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..))...))))...(((.((((...((((((((...((((((((...(((......)))......))))))))...).......((....)).)))))))..))))..)))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........((((((..(((((((((((........)))))))))))...((..)))).....)))))... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-Z.mays_domain3 | AAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAAGGCGAAGAACCUUACCAGGGCUUGACAUGCCGCGAAUCCUCUUGAAAGAGAGGGGUGCCCUCGGGAACGCGGACACAGGUGGUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGCCGUAAGGUGUUGGGUUAAGUCUCGCAACGAGCGCAACCCUCGUGUUUAGUUGCCACUAUGAGUUUGGAACCCUGAACAGACCGCCGGUGUUAAGCCGGAGGAAGGAGAGGAUGAGGCCAAGUCAUCAUGCCCCUUAUGCCCUGGGCGACACACGUGCU... | .......(((((.(((((((.((..((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((......(((((((..(((((((....))))))).(.((....)).)))))).))..((.((((..((((((.(....(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...(((.........)))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....)))).....).).)))...))))))))....)))))))...)).))))))))... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-Z.mays_domain4 | ACCGCCCGUCACACUAUAGGAGCUGGCCAGGUUUGAAGUCAUUACCCUUAACCGUAAGGAGGGGGAUGCCUAAGGCUAGGCUUGCGACUGGAGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACUGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUU | ...(..((...((((.(((..((.((((.((((....(.((((.((((...((....)).)))))))).)...)))).)))).))..))).))))....))...)....((((((((((....))))))))))............. | 16S_rRNA |
23S_rRNA-B.subtilis_domain3 | AGAGGGGUGAGAAUCCCUCCACCGAAUGCCUAAGGGUUCCUGAGGAAGGCUCGUCCGCUCAGGGUUAGUCGGGACCUAAGCCGAGGCCGAAAGGCGUAGGCGAUGGACAACAGGUUGAUAUUCCUGUACCACCUCCUCACCAUUUGAGCAAUGGGGGGUCGCAGGAGGAUAGGGUAAGCGCGGUAUUGGAUAUCCGCGUCCAAGCAGUUAGGCUGGGAAAUAGGCAAAUCCGUUUCCCAUAAGGCUGAGCUGUGAUGGCGAGCGAAAUAUAGUAGCGAAGUUCCUGAUUCCACACUGCCAAGAAAAGCCUCUAGCGAGGU... | .((((((......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....((((((.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))))(((((.((((((......((...((((....((((..(((..(((.((((((((..........))))))((..((((...(((((((((((.((.....)))))))))....))))...))))...))...((.(.......).))....)))))...)))...)))).........))))..))..)))... | 23S_rRNA |
23S_rRNA-B.subtilis_domain4 | UCGAGAGAACUCUCGUUAAGGAACUCGGCAAAAUGACCCCGUAACUUCGGGAGAAGGGGUGCUCUGUUAGGGUGCAAGCCCGAGAGAGCCGCAGUGAAUAGGCCCAGGCGACUGUUUAGCAAAAACACAGGUCUCUGCGAAGCCGUAAGGCGAAGUAUAGGGGCUGACGCCUGCCCGGUGCUGGAAGGUUAAGAGGAGCGCUUAGCGUAAGCGAAGGUGCGAAUUGAAGCCCCAGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCCGCACGAAAGGCGCAACGAU... | .((((....((((((((.(((..............(((((....(....).....)))))(((((.((.((((....)))))).)))))(...).......(((((((((..(((.........)))..(((((((((...(((....)))...)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((...(((((..((....))...)))))...))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...).....(.........((((((.....))))))).........))))...)).)... | 23S_rRNA |
23S_rRNA-B.subtilis_domain6 | UGGAAAUUUGAGAGGAGCUGUCCUUAGUACGAGAGGACCGGGAUGGACGCACCGCUGGUGUACCAGUUGUUCUGCCAAGGGCAUCGCUGGGUAGCUAUGUGCGGACGGGAUAAGUGCUGAAAGCAUCUAAGCAUGAAGCCCCCCUCAAGAUGAGAUUUCCCAUUCCGCAAGGAAGUAAGAUCCCUGAAAGAUGAUCAGGUUGAUAGGUCUGAGGUGGAAGUGUGGCAACACAUGGAGCUGACAGAUACUAAUCGAUCG | .((((((((..((((..(((((((...............))))))).(((((...(((....(((((((((((....))))))..)))))....))).)))))...(((....(((((...........)))))....))).))))......))))))))..((((....))))....(((((((((.......)))))....((((((((.((.....(((((....)))))....))..))))).)))...)))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-E.coli_domain3 | AAGCGGGUGAAAAGCCCGCUCGCCGGAAGACCAAGGGUUCCUGUCCAACGUUAAUCGGGGCAGGGUGAGUCGACCCCUAAGGCGAGGCCGAAAGGCGUAGUCGAUGGGAAACAGGUUAAUAUUCCUGUACUUGGUGUUACUGCGAAGGGGGGACGGAGAAGGCUAUGUUGGCCGGGCGACGGUUGUCCCGGUUUAAGCGUGUAGGCUGGUUUUCCAGGCAAAUCCGGAAAAUCAAGGCUGAGGCGUGAUGACGAGGCACUACGGUGCUGAAGCAACAAAUGCCCUGCUUCCAGGAAAAGCCUCUAAGCAUCAGGUAACAU... | .((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....(((((..((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))))(((((((((((((..(((((....((((..(((..(((((((((((..........))))))((..((((...((((((((((((.((.....))))))))))..))))...))))...))...(((((....)))))....)))))...)))...)))).........)))))..))....))))))))... | 23S_rRNA |
23S_rRNA-E.coli_domain4 | UUGAGAGAACUCGGGUGAAGGAACUAGGCAAAAUGGUGCCGUAACUUCGGGAGAAGGCACGCUGAUAUGUAGGUGAGGUCCCUCGCGGAUGGAGCUGAAAUCAGUCGAAGAUACCAGCUGGCUGCAACUGUUUAUUAAAAACACAGCACUGUGCAAACACGAAAGUGGACGUAUACGGUGUGACGCCUGCCCGGUGCCGGAAGGUUAAUUGAUGGGGUUAGCGCAAGCGAAGCUCUUGAUCGAAGCCCCGGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCA... | .((((....((((((((.(((..............(((((....(....).....)))))((((((...(((.....((((.....))))....)))..))))))(...).......(((((((((..(((.........)))..(((((((((...(((....)))...)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((........(((((..((....))...)))))........))))))))..)))))((((((.......))))))(...).....(.........((((((.....)))))))....... | 23S_rRNA |
23S_rRNA-E.coli_domain6 | UGGAGAACUGAGGGGGGCUGCUCCUAGUACGAGAGGACCGGAGUGGACGCAUCACUGGUGUUCGGGUUGUCAUGCCAAUGGCACUGCCCGGUAGCUAAAUGCGGAAGAGAUAAGUGCUGAAAGCAUCUAAGCACGAAACUUGCCCCGAGAUGAGUUCUCCCUGACCCUUUAAGGGUCCUGAAGGAACGUUGAAGACGACGACGUUGAUAGGCCGGGUGUGUAAGCGCAGCGAUGCGUUGAGCUAACCGGUACUAAUGAACCG | .((((((((..((((..(((((((...............))))))).(((((...(((....(((((((((((....))))))..)))))....))).)))))...(((....(((((...........)))))....))).))))......))))))))..((((((...)))))).....((..(((((.......)))))....((((((((..(.....(((((....)))))....)...))))).))).....)). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-H.pylori_domain3 | AGAUAUAUGAGAAUUGUAUCCGCCGUAAAUCUAAGGUUUCCUACGCGAUGGUCGUCAUCGUAGGGUUAGUCGGGUCCUAAGCCGAGUCCGAAAGGGGUAGGUGAUGGCAAAUUGGUUAAUAUUCCAAUACCGACUGUGGAGCGUGAUGGGGGGACGCAUAGGGUUAAGCGAGCUAGCUGAUGGAAGCGCUAGUCUAAGGGCGUAGAUUGGAGGGAAGGCAAAUCCACCUCUGUAUUUGAAACCCAAACAGGCUCUUUGAGUCCUUUUAGGACAAAGGGAGAAUCGCUGAUACCGUCGUGCCAAGAAAAGCCUCUAAGCAU... | .((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))......((((.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))..((((((((((..((...((((....((((..(((..(((((((((((..........))))))((..(((....(((....(((..((.....)).)))....))).....)))....)).((((((..(((((...)))))..))))))..)))))...)))...)))).........))))...))..... | 23S_rRNA |
23S_rRNA-H.pylori_domain4 | GUGAAAGAACUCUGGUUAAGGAACUCUGCAAACUAGCACCGUAAGUUCGCGAUAAGGUGUGCCACAGCGAUGUGGUCUCAGCAAAGAGUCCCUCCCGACUGUUUACCAAAAACACAGCACUUUGCCAACUCGUAAGAGGAAGUAUAAGGUGUGACGCCUGCCCGGUGCUCGAAGGUUAAGAGGAUGCGUCAGUCGCAAGAUGAAGCGUUGAAUUGAAGCCCGAGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGUUAAAUACCGACCUGCAUGAAUGGCGUAACGAGAUGGGAGCUGU... | .((((....((((((((.(((..............(((((....(....).....)))))((((((....))))))(...).......((((..(((..(((.........)))..(((((((((...(((....)))...)..))))))))..((((.(((..(((((((..((((..((....((((..(((....)))...))))....))..)))))))))..)))))((((((.......))))))(...)...............((((((.....))))))..........))))...)).)..))))....)... | 23S_rRNA |
23S_rRNA-H.pylori_domain6 | AGGAAAGUUGAGGAGAGCUGUCCCUAGUACGAGAGGACCGGGAUGGACGUGUCACUGGUGCACCAGUUGUCUGCCAAGAGCAUCGCUGGGUAGCACACACGGAUGUGAUAACUGCUGAAAGCAUCUAAGCAGGAACCAACUCCAAGAUAAACUUUCCCUGAAGCUCGCACAAAGACUAUGUGCUUGAUAGGGUAGAUGUGUGAGCGCAGUAAUGCGUUUAGCUGACUACUACUAAUAGAGCG | .((((((((..((((..(((((((...(.(....).)..))))))).(((((...(.(....((((((((((....))).))..)))))....)).)))))....((....(((((...........)))))....)).))))......)))))))).....(((((((((.......)))))....((((((((..(.....(((((....)))))....)...))))).)))...)))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-S.aureus_domain3 | AGACGGGUGAGAAUCCCGUCCACCGAUUGACUAAGGUUUCCAGAGGAAGGCUCGUCCGCUCUGGGUUAGUCGGGUCCUAAGCUGAGGCCGACAGGCGUAGGCGAUGGAUAACAGGUUGAUAUUCCUGUACCACCUAUAAUCGUUUUAAUCGAUGGGGGGACGCAGUAGGAUAGGCGAAGCGUGCGAUUGGAUUGCACGUCUAAGCAGUAAGGCUGAGUAUUAGGCAAAUCCGGUACUCGUUAAGGCUGAGCUGUGAUGGGGAGAAGACAUUGUGUCUUCGAGUCGUUGAUUUCACACUGCCGAGAAAAGCCUCUAGAUAG... | .((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....((((((.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))))(((((((..((.......((...((((....((((..(((..(((((.((((((.........))))))((..((((...(((((((((((.((.....))))))))).....))))...))))...))...(((((((...)))))))...)))))...)))...)))).........))))..))..)... | 23S_rRNA |
23S_rRNA-S.aureus_domain4 | GCGAGCGAACUCUCGUUAAGGAACUCGGCAAAAUGACCCCGUAACUUCGGGAGAAGGGGUGCUCUUUAGGGUUAACGCCCAGAAGAGCCGCAGUGAAUAGGCCCAAGCGACUGUUUAUCAAAAACACAGGUCUCUGCUAAACCGUAAGGUGAUGUAUAGGGGCUGACGCCUGCCCGGUGCUGGAAGGUUAAGAGGAGUGGUUAGCUUCUGCGAAGCUACGAAUCGAAGCCCCAGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCCGCACGAAAGGCGUAACGAUU... | .((((....((((((((.(((..............(((((....(....).....)))))(((((((.((((....)))).)))))))(...).......(((((((((..(((.........)))..(((((((((...(((....)))...)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((...(((((..((....))...)))))...))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...)...............((((((.....))))))..........))))...)).))... | 23S_rRNA |
23S_rRNA-S.aureus_domain6 | AGGAAAUUUGAGAGGAGCUGUCCUUAGUACGAGAGGACCGGGAUGGACAUACCUCUGGUGUACCAGUUGUCGUGCCAACGGCAUAGCUGGGUAGCUAUGUGUGGACGGGAUAAGUGCUGAAAGCAUCUAAGCAUGAAGCCCCCCUCAAGAUGAGAUUUCCCAACUUCGGUUAUAAGAUCCCUCAAAGAUGAUGAGGUUAAUAGGUUCGAGGUGGAAGCAUGGUGACAUGUGGAGCUGACGAAUACUAAUCGAUCG | .((((((((..((((..(((((((...............))))))).(((((...(((....(((((((((((....))))))..)))))....))).)))))...(((....(((((...........)))))....))).))))......)))))))).(((....)))....(((((((((.......)))))....((((((((.((.....(((((....)))))....))..))))).)))...)))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-T.thermophilus_domain3 | AAGAGGGUGAGAAUCCCUCUCGCCGUAAGCCCAAGGGUUCCUACGCAAUGGUCGUCAGCGUAGGGUUAGGCGGGACCUAAGGUGAAGCCGAAAGGCGUAGCCGAAGGGCAGCCGGUUAAUAUUCCGGCCCUUCCCGCAGGUGCGAUGGGGGGACGCUCUAGGCUAGGGGGACCGGAGCCAUGGACGAGCCCGGCCAGAAGCGCAGGGUGGGAGGUAGGCAAAUCCGCCUCCCAACAAGCUCUGCGUGGUGGGGAAGCCCGUACGGGUGACAACCCCCCGAAGCCAGGGAGCCAAGAAAAGCCUCUAAGCACAACCUGCGG... | .((((((......).)))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))......((((.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))..(((((((((((((...((((....((((..(((..(((((.((((..............))))......((((((((((((((((.((.....)))))))))).....)))))))).........((((....))))......)))))...)))...)))).........))))...))...))))))))... | 23S_rRNA |
23S_rRNA-T.thermophilus_domain4 | GCGGGAGAACCCUCGCCAAGGAACUCUGCAAGUUGGCCCCGUAACUUCGGGAGAAGGGGUGCUCCCUGGGGUGAUGAGCCCCGGGGAGCCGCAGUGAACAGGCUCUGGCGACUGUUUACCAAAAACACAGCUCUCUGCGAACUCGUAAGAGGAGGUAUAGGGAGCGACGCUUGCCCGGUGCCGGAAGGUCAAGGGGAGGGGUGCAAGCCCCGAACCGAAGCCCCGGUGAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAAAGCGUAACGACCGGAGCGCU... | .((((....((((((((.(((..............(((((....(....).....)))))((((((((((((.....))))))))))))(...).......(((((((((..(((.........)))..(((((((((...(((....)))...)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((...(((((....)))))...))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...)...............((((((.....))))))..........))))...)).)))))))...... | 23S_rRNA |
23S_rRNA-T.thermophilus_domain6 | AGGAGGCUUGAGGGGGGCUCUUCCUAGUACGAGAGGACCGGAAGGGACGCACCUCUGGUUUCCCAGCUGUCCCUCCAGGGGCAUAAGCUGGGUAGCCAUGUGCGGAAGGGAUAACCGCUGAAAGCAUCUAAGCGGGAAGCCCGCCCCAAGAUGAGGCCUCCCACGGCGUCAAGCCGGUAAGGACCCGGGAAGACCACCCGGUGGAUGGGCCGGGGGUGUAAGCGCCGCGAGGCGUUGAGCCGACCGGUCCCAAUCGUCCG | .((((((((..((((..(((((((...............))))))).(((((...(((....(((((((((((....))))))...)))))....))).)))))...(((....(((((...........)))))....))).))))......))))))))..((((.....))))....(((((((((.......)))))....((((((((.((.....(((((....)))))....))..))))).)))...)))). | 23S_rRNA |
5S_rRNA-Acanthamoeba-castellanii-1 | GGAUACGGCCAUACUGCGCAGAAAGCACCGCUUCCCAUCCGAACAGCGAAGUUAAGCUGCGCCAGGCGGUGUUAGUACUGGGGUGGGCGACCACCCGGGAAUCCACCGUGCCGUAUCCU | (((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acanthamoeba-castellanii-2 | GGAUACGGCCAUACUGCGCAGAAAGCACCGCUUCCCAUCCGAACAGCGAAGUUAAGCUGCGCGAGGCGGUGUUAGUACUGGGGUGGGCGACCACCCGGGAAUCCACCGUGCCGUAUCCU | (((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acetobacter-aceti-2 | GGACCUGGUGGCUAUGGCGGGAGAGAUCCACCCGAUCCCAUCCCGAACUCGGCCGUGAAAACCCCCAGCGCCUAUGAUACUGCGGCUUAAGCCGUGGGAAAGUCGGUCGCCGCCAGGUCC | .((((((((((.....(((((.(......((((((.............))))..)).....).))).)).((.((....(((((((....)))))))....)).))...)))))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acetobacter-sp.-1 | GAUCUGGUGGCCAUGGCGGGGCGCAAUCACCCGAUCCCAUCCCGAACUCGGCCGUCAAAUGCCCCAGCGCCCAUGAUACUCUGCCUCAAGGCACGGAAAAGUCGGUCGCCGCCAGAUCC | ((((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.((((....)))).))....)).))...)))))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acheta-domesticus-1 | GCCAACGUCCAUACCACGUUGAAAGCACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGCAGCGUCGGGCGCGGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAACCCCGCGUGACGUUGGCAU | (((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).(((((......((.((.(((....))))).)).....))))).))))))))).. | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acholeplasma-laidlawii-1 | UCUGGUGACGAUAGGUAAGAUGGUUCACCUGUUCCCAUCCCGAACACAGAAGUUAAGCAUCUUAGCGCCGACGAUAGUUAUUACAAUUAGCGAAAAUAGGACGUUGCCAGGC | ((((((((......((((((((....((((((.............))))..))....)))))).)).((.(.....((((.(...).)))).....).))...)))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acholeplasma-laidlawii-2 | UCUGGUGACGAUGGCAAGAUGUUCCACCUGUUCCCUACCCGAAUAUAGAAGUUAAGCAUCUUAGCGCCGACGAUAGUUAUUACAAUUAGCGAAAAUAGGACGUUGCCAGGC | ((((((((.....((((((((....((((((.............))))..))....)))))).)).((.(.....((((.(...).)))).....).))...)))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acholeplasma-laidlawii-3 | UCUGGUGACGAUGGCAAGAUGGUUCCACCUGUUCCCAUCCCGAACACAGAAGUUAAGCAUCUUAGCGCCGACGAUAGUUAUUACAAUUAGCGAAAAUAGGACGUUGCCAGGC | ((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.(.....((((.(...).)))).....).))...)))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Achromobacter-cycloclastes-1 | CGACCUGGUGGUUCUGGCGGGGUGGCUGCACCCGUUCCCAUUCCGAACACGGCCGUGAAACGCCCCAGCGCCGAUGGUACUUCGUCUUAAGACGCGGGAGAGUAGGUCGCUGCCAGGUCU | .((((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.((((....)))).))....)).))...)))))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Achromobacter-denitrificans-1 | UGCCUGACGACCAUAGCGAGUUGGUCCCACUCCUUCCCAUCCCGAACAGGACAGUGAAACGACUUUGCGCCGAUGAUAGUGGACGGACGUCUGUGAAAGUAGGUCAUCGUCAGGC | .(((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((((((....))))))....)).))...))))))))) | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Achromobacter-xylosoxidans-1 | CCUGACGACCAUAGCAAGGUGGUACCACUCCUUCCCAUCCCGAACAGGACAGUGAAACGCCUUUGCGCCGAUGAUAGUGGACGGACGUCUGUGAAAGUAGGUCAUCGUCAGGCU | ((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((((((....))))))....)).))...)))))))).. | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acidiphilium-acidophilum-1 | CGACCUGGUGGCCAUUGCGGGGGGCCCGCACCCGAUCCCAUCCCGAACUCGGCCGUGAAAACCCCCAGCGCCCAUGGUACUGUGCCUCAAGGCACGGGAGAGUAGGUCGCCGCCAGGUCC | .((((((((((.....(((((((......((((((.............))))..)).....))))).)).((.((....(((((((....)))))))....)).))...)))))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acidiphilium-cryptum-1 | CGACCUGGUGGCCAUUGCGGGGAGCCUGCACCCGAUCCCAUCCCGAACUCGGCCGUGAAAAUCCCCAGCGCCCAUGGUACUGUGCCUCAAGGCACGGGAGAGUAGGUCGCCGCCAGGUCCUC | .((((((((((.....(((((((......((((((.............))))..)).....))))).)).((.((....(((((((....)))))))....)).))...))))))))))... | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acidithiobacillus-ferrooxidans-1 | UGUCUGGCGGCCAUAGCGCAGUGGAACCACCCCUUCCCAUCUCGAACAGGACCGUGAAACGCUGCAGCGCCUAUGAUAGUUGAGGGUCUCCCUCCGCGAAAGUCGGUCACCGCCAGAC | .(((((((((.....((((((((.....((.(((.............)))...))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...))))))))) | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acidithiobacillus-ferrooxidans-2 | UGCCUGGUGGCCAUAGCGAGCGGGAACCACCCGAUCCCAUUCCGAACUCGGAAGUGAAAACGCUUAGCGCCGAUGAUAGUAUGGGGUCUCCCUAUGCGAAAGUAGGACACUGCCAGGCUU | .(((((((((.....(((((((......((((((.............))))..)).....))))).)).((.((....((((((((...))))))))....)).))...))))))))).. | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acidithiobacillus-ferrooxidans-3 | UGUCUGGCGGCCAUAGCGCAGUGGAACCACCCCUUCCCAUCUCGAACAGGACCGUGAAACGCUGCAGCGCCUAUGAUAGUUGAGGGUCUCCCUCCGCGAAAGUCGGUCACCGCCAGACAC | ((((((((((.....((((((((.....((.(((.............)))...))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...)))))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acidithiobacillus-thiooxidans-1 | UUGUCUGGCGGCCAUAGCGCAGUGGAACCACCCCUUCCCAUCCCGAACAGGACCGUGAAACACUGCAGCGCCUAUGAUAGUUGAGGGCCUCCCUCCGCGAAAGUCGGUCACCGCCAGACAC | .((((((((((.....((((((((.....((.(((.............)))...))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...)))))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acidovorax-delafieldii-1 | UGCCUGAUGACCAUAGCAAGUUGGUCCCACUCCUUCCCAUCCCGAACAGGACAGUGAAACGACUUUGCGCCGAUGAUAGUGCGGGUUCCCGUGUGAAAGUAGGUCAUCGUCAGGC | .(((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((((((....))))))....)).))...))))))))) | 5S_rRNA |
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.