[ { "id": "0", "translation": { "en": "The deletion of a gene may result in 'death' or in a block of 'cell division'.", "fr": "La suppression d'un gène peut conduire à la mort ou bien à un blocage de la division cellulaire." } }, { "id": "1", "translation": { "en": "Gammaretroviral sequences count for about 9% of the human genome, remnants of infections and germline transmissions that have occurred many times during mammal speciation and evolution.", "fr": "Les séquences gammarétrovirales représentent environ 9% du génome humain, et sont autant de vestiges des infections à gammarétrovirus et des transmissions dans la lignée germinale qui se sont produites à de nombreuses reprises au cours de l'évolution des mammifères." } }, { "id": "2", "translation": { "en": "This interaction requires C-terminal extension of the PDZ domains which likely adopts a beta strand conformation in solution.", "fr": "Cette interaction requiert la présence d'extensions C-terminales dans les deux domaines PDZ. Ces extensions adoptent une structure en brins beta." } }, { "id": "3", "translation": { "en": "These analyzes allowed us to identify about fifty point mutations as insertions, deletions or substitutions in exonic, intronic and intergenic regions, and with a frequency higher than 5%. Of eight simple nucleotide deletions found in gastric cancers collected in Brest University Hospital, two could lead to a splice defect.", "fr": "Parmi une cinquantaine de mutations ponctuelles de type insertion, délétion ou substitution, situées dans des régions exoniques et introniques et d'une fréquence supérieure à 5%, huit délétions ont été retrouvées dans les cancers gastriques archivés au CHRU de Brest, deux d'entre elles pouvant conduire à un défaut d'épissage." } }, { "id": "4", "translation": { "en": "Recently, Rinaudo et al. gave a fully general parameterised algorithm for structure-sequence comparison, which is able to take as input any type of pseudoknotted structures.", "fr": "Récemment, Rinaudo et al. ont donné un algorithme paramétré général pour la comparaison structure-séquence d'ARN, qui est capable de prendre en entrée n'importe quel type de structures comportant des pseudo-noeuds." } }, { "id": "5", "translation": { "en": "We ran a comprehensive study to compare the power and false positive performance of a selection of Genome-Wide Interaction Search (GWIS) methods, in particular BOOST, MBMDR, PLINK and EPIBLASTER.", "fr": "Nous avons réalisé une étude comparative des performances de quelques méthodes de recherches d'interaction sur génome entier (GWIS), en particulier BOOST, MBMDR, PLINK et EPIBLASTER." } }, { "id": "6", "translation": { "en": "We found that prokaryotes have a higher proportion of AR containing proteins, while eukaryotes have more EAR containing proteins.", "fr": "Nous avons constaté que les procaryotes ont une proportion plus élevée de protéines contenant des RAs, tandis que les eucaryotes ont plus de protéines contenant des RAEs." } }, { "id": "7", "translation": { "en": "The goal of this thesis is to elucidate the biological functions of the TgREMIND protein in intracellular trafficking and biogenesis of specific secretory organelles in T. gondii.", "fr": "Le but principal de cette thèse était d'élucider les fonctions biologiques de la protéine TgREMIND dans le trafic intracellulaire et la biogénèse des organites sécrétoires spécifiques chez T. gondii." } }, { "id": "8", "translation": { "en": "The search is based on a Markovian index improving the execution time by 30% compared to the state of art.", "fr": "La recherche est basée sur un index markovien améliorant les vitesses de recherche de 30% par rapport à l'état de l'art." } }, { "id": "9", "translation": { "en": "A large number of Campylobacter strains and gastric biopsies from clinical cases are received daily at the French National Reference Center for Campylobacters and Helicobacter (NRCCH) where analyses such as species identification and antimicrobial resistance determination are performed.", "fr": "De très nombreuses souches de Campylobacter et de biopsies gastriques sont reçues quotidiennement au CNR des Campylobacters et des Hélicobacters (CNRCH) où y sont menées des analyses telles l'identification de l'espèce et de la résistance aux antibiotiques." } }, { "id": "10", "translation": { "en": "As a perspective of this PhD work and as main objective of the APOPTRA project, this last promising result will soon permit the development of a protein array which will be tested on a large number of RA, from the national ESPOIR cohort.", "fr": "Perspective de cette thèse et objectif ultime du projet APOTRA, ce dernier résultat \" prometteur \" est à l'origine de la réalisation prochaine d'une \" biopuce \" à protéines qui devrait être testée sur un échantillon plus important de PR : la cohorte nationale ESPOIR." } }, { "id": "11", "translation": { "en": "This could have taken place thanks to the implementation of the process of the oxidative photosynthesis in living organisms.", "fr": "Celui-ci a pu avoir lieu grâce la mise en place du processus de la photosynthèse oxydative chez les organismes vivants." } }, { "id": "12", "translation": { "en": "However, because of the lack of adapted biological resources, those data are often scattered in various formats and databases.", "fr": "Toutefois, les données issues de ces diverses études, par manque de système informatique adapté, sont souvent dispersées dans différentes bases de données et sous des formats différents." } }, { "id": "13", "translation": { "en": "The full catalogue of somatic genetic alterations will result in a completely new individual management for breast cancer patients.", "fr": "Le catalogue complet des altérations génétiques d'une tumeur aura pour conséquence une prise en charge personnalisée, totalement nouvelle, des patientes atteintes de cancer du sein." } }, { "id": "14", "translation": { "en": "Given a popular view, evolution is an incremental process based on an increase of molecular complexity of organisms.", "fr": "Selon une vision populaire, l'évolution serait un processus de \" progrès \" qui s'accompagnerait d'un accroissement de la complexité moléculaire des êtres vivants." } }, { "id": "15", "translation": { "en": "The successful application of combined bioinformatics approaches associating WGS-genotypes and specific phenotypes is a major step in the refinement of QMRA models.", "fr": "L'application d'approches bioinformatiques combinées associant des génotypes WGS et des phénotypes spécifiques est une étape majeure dans le perfectionnement des modèles d'AQRM." } }, { "id": "16", "translation": { "en": "The impact of TEs in a genome is explored by searching for insertions events.", "fr": "L'impact des ETs dans un génome est étudié en recherchant des événements d'insertion." } }, { "id": "17", "translation": { "en": "From a research point of view, IaaS platforms raise new questions in terms of making efficient virtual platform scaling decisions and then efficiently scheduling applications on dynamic platforms.", "fr": "D'un point de vue scientifique, les plateformes IaaS soulèvent de nouvelles questions concernant l'efficacité des décisions prises en terme de passage à l'échelle, et également l'ordonnancement des applications sur les plateformes dynamiques." } }, { "id": "18", "translation": { "en": "First, we showed that hospital Big Data were highly correlated with signals from traditional surveillance networks.", "fr": "Tout d'abord, nous avons montré que les données massives hospitalières étaient très corrélées aux signaux des réseaux de surveillance traditionnels." } }, { "id": "19", "translation": { "en": "However, as current inference tools mostly rely on species names orfunction names, a significant part of the available meta-omic sequences are currently ignored.", "fr": "Cependant, comme les outils d'inférence actuels reposent principalement sur des noms d'espèces ou des noms de fonctions, une partie importante des séquences (méta-)omiques actuellement disponibles est ignorée." } }, { "id": "20", "translation": { "en": "Through the study of some phylogenetic markers we have been able to establish that this bacterium does not belong to the MTBC sensu stricto and can therefore be used as an outgroup in order to root the phylogeny to study the emergence of the MTBC. The next step was to study the genetic diversity of a collection of strains of \"M. canettii\",using the “next generation sequencing” (NGS) approach..", "fr": "Par le biais de l'étude de certains marqueurs phylogénétiques, nous avons pu établir que cette bactérie n'appartenait pas au MTBC au sens strict et pouvait donc être utilisée comme point d'ancrage dans le cadre de l'étude de la phylogénie et de l'émergence de ce dernier.C'est pourquoi nous avons choisi d'étudier la diversité de la collection de souches de \"Mycobacterium canettii\", qui proviennent toutes d'une même région du globe, la Corne de l'Afrique." } }, { "id": "21", "translation": { "en": "In this context, three informatic tools have been developed.", "fr": "Dans ce contexte, 3 outils informatiques ont été développés." } }, { "id": "22", "translation": { "en": "I have tried through my work to highlight evolutionary constraints associated to DNA structure and not to its information contents. For this reason, I am mainly studying duplication mechanisms which explain many of the chromosomal rearrangements.", "fr": "Il m'importe, au travers de mes travaux, d'essayer de mettre en évidence des contraintes évolutive qui sont liées à la nature même du support de l'information génétique et non à l'information portée. La stratégie suivie m'a conduit à étudier les mécanismes de duplication à l'origine de nombreux remaniements chromosomiques." } }, { "id": "23", "translation": { "en": "Analytical approaches coupling liquid chromatography and high resolution mass spectrometry (LC/HRMS) offer a strong potential, limited by the massive amount of data obtained.", "fr": "Les approches analytiques couplant chromatographie en phase liquide et spectrométrie de masse haute résolution (LC/HRMS) offrent un fort potentiel, limité par la quantité massive de données obtenues." } }, { "id": "24", "translation": { "en": "However a detailed understanding of the functioning of a protein requires the acquisition and analysis of its three-dimensional structure.", "fr": "La compréhension fine du fonctionnement d'une protéine nécessite l'acquisition et l'analyse de sa structure tri-dimensionnelle." } }, { "id": "25", "translation": { "en": "The signaling pathways involved in this oncogenic process are however only partially elucidated.", "fr": "Cependant, les voies de signalisation impliquées ne sont que partiellement élucidées." } }, { "id": "26", "translation": { "en": "In order to improve tHDA performance, TteUvrD and Bstpol were modified by protein engineering using the following two approaches.", "fr": "Dans le but d améliorer les performances de la tHDA, TteUvrD et Bstpol ont été modifiées par ingénierie des protéines suivant deux approches." } }, { "id": "27", "translation": { "en": "PA-production was placed in signaling cascade downstream of flagellin recognition by FLS2-BAK1 receptor complex receptor, but upstream or ROS formation by NADPH-oxidase RbohD.", "fr": "La production du PA a été placée dans la cascade de la signalisation en aval de la reconnaissance du flg22 par le complexe de récepteur FLS2-BAK1, mais aprés la formation du ROS par NADPH-oxydase RbohD." } }, { "id": "28", "translation": { "en": "These developments will contribute to shed more light on the origins of numerous gene families yet not described, as genes resulting from multiple combinatorics still largely fall out of the scope of traditional, tree-based detection methods.", "fr": "Ces développements contribueront à éclairer les origines de nombreuses familles de gènes encore non décrites, les gènes issus de combinatoires multiples échappant souvent aux méthodes plus classiques de détection basées sur des arbres." } }, { "id": "29", "translation": { "en": "The level of expression of these asRNAs is lower than mRNAs but is comparable to lncRNAs.", "fr": "Le niveau d'expression de ces asRNA est très faible et comparable à celui des lncRNA." } }, { "id": "30", "translation": { "en": "Although displaying normal proliferation in culture, DMSXL OL precursor cells (OPC) display signs of impaired migration and defective differentiation.", "fr": "Malgré une prolifération normale en culture, les précurseurs des OL (OPC) présentent des défauts de migration et de différenciation." } }, { "id": "31", "translation": { "en": "The inhibition of PKC-δ isoform totally inhibited HIV-1 replication.", "fr": "L'inhibition de cet isoforme bloque totalement la réplication virale." } }, { "id": "32", "translation": { "en": "A large variety of statistical tools have been developed, at the interface between bioinformatics, machine learning, and statistical physics, to extract information from these ever increasing datasets.", "fr": "Un grand nombre d'outils statistiques ont été développés à l'interface entre bioinformatique, apprentissage automatique et physique statistique, dans le but d'extraire de l'information de ce déluge de données." } }, { "id": "33", "translation": { "en": "The rise of omics technologies that simultaneously measure thousands of molecules in a complex biological sample represents the core of systems biology.", "fr": "L'essor des technologies omiques qui mesurent simultanément des milliers de molécules dans un échantillon biologique complexe représente le cœur de la biologie des systèmes." } }, { "id": "34", "translation": { "en": "The applications of these techniques to real-world biological problems include first and foremost the reconstruction of genomic sequences that existed in the past (and now long lost), but also extend to the improvement of current multiple alignment programs, and to the inference of k-mers that can be used for alignment-free phylogenetic classification of new sequences.", "fr": "Parmi les applications de ces techniques à des problèmes biologiques réels, on compte avant tout la reconstruction de séquences génomiques ayant existé dans le passé (perdues depuis longtemps), mais aussi l'amélioration des programmes actuels d'alignement multiple, et l'inférence de k-mers pouvant être utilisés pour la classification taxonomique sans alignement de nouvelles séquences." } }, { "id": "35", "translation": { "en": "SGNSim can generate ensembles of GRNs within a set of user-defined parameters, such as topology.", "fr": "SGNSim peut générer des ensembles de RRG dans un ensemble de paramètres définis par l'utilisateur, tels que la topologie." } }, { "id": "36", "translation": { "en": "We also addressed issues related to the design of massively parallel specialized hardware accelerators, targeting bioinformatics and multimedia content based search applications.", "fr": "Ensuite, la conception d'accélérateurs matériels spécialisés et massivement parallèles, pour des applications de calcul intensif issues de la bioinformatique et du traitement de données multimédia." } }, { "id": "37", "translation": { "en": "Nematostella has fascinating features such as whole-body regeneration, the absence of signs of aging and importantly, the absence of age-related diseases.", "fr": "Nematostella, petite anémone de mer, possède de fascinantes propriétés, telles que la régénération du corps entier, l'absence de signes de vieillissement et d'affections liées à l'âge comme, par exemple, le développement de cancers." } }, { "id": "38", "translation": { "en": "However, assemblies of a majority of the large eukaryotic genomes remain incompletely resolved and therefore do not, as such, allow their exploitation for the reconstruction of evolutionary history of the order of the genes of these species.", "fr": "Cependant, les assemblages d'une majorité des grands génomes d'eucaryotes demeurent incomplètement résolues et ne permettent donc pas, en tant que tel, leur exploitation pour la reconstruction de l'histoire évolutive de l'ordre des gènes de ces espèces." } }, { "id": "39", "translation": { "en": "Results revealed several major limitations of the method linked either to highly similar protein families or the lack of complete proteomes for some organisms.", "fr": "Leur analyse a révélé des problèmes majeurs liés aux familles de protéines très conservées au cours de l'évolution et à la couverture imparfaite des protéomes de certains organismes." } }, { "id": "40", "translation": { "en": "In order to identify new genes potentially involved in disease resistance, we performed genomewide genetic studies in two populations living in endemic regions for Plasmodium falciparum malaria in Burkina-Faso and in a cohort of septic shock patients.", "fr": "Afin d'identifier de nouveaux gènes potentiellement impliqués dans la résistance à ces deux maladies, nous avons effectué des études génétiques pangénomiques dans deux populations vivant en zone endémique pour le paludisme à Plasmodium falciparum au Burkina-Faso et dans une cohorte de patients atteints de sepsis." } }, { "id": "41", "translation": { "en": "Title: Last universal common ancestor.", "fr": "Title: Dernier ancêtre commun universel." } }, { "id": "42", "translation": { "en": "We hope to see direct improvements for patients in the near future, such as a more accurate, faster and more comprehensive molecular.", "fr": "On espère voir des améliorations directes pour le patient dans un futur proche, par exemple un diagnostic moléculaire plus rapide, plus sûr et plus exhaustif." } }, { "id": "43", "translation": { "en": "The characterization of malignant tumour growth and the understanding of resistance mechanisms to treatment in cancer is of utmost importance for the discovery of novel “druggable” targets.", "fr": "La caractérisation des tumeurs malignes et la compréhension des mécanismes de résistance aux traitements anticancéreux sont essentielles pour la découverte de nouvelles cibles thérapeutiques." } }, { "id": "44", "translation": { "en": "The overall subject of this thesis is mathematical modelling of biological systems.", "fr": "Le sujet général de cette thèse est la modélisation mathématique des systèmes biologiques." } }, { "id": "45", "translation": { "en": "The last phase of the pipeline consists of an original integrative annotation of the proteins, based on their evolutionary context thanks to multiple alignments.", "fr": "La dernière phase consiste en une annotation intégrative des protéines dont l'originalité repose sur l'exploitation du contexte évolutif grâce à l'alignement multiple." } }, { "id": "46", "translation": { "en": "The link between the methyl donor deficiency and impaired methylation of PGC-1[alpha] alters the activities of enzymes involved in methylation and acetylation of PGC-1[alpha].", "fr": "Le lien entre la carence en donneurs de méthyles et l'altération de la méthylation de PGC-1[alpha] modifie les activités des enzymes impliquées dans la méthylation et l'acétylation de PGC-1." } }, { "id": "47", "translation": { "en": "The third part describes a background and the results of testing MBD4 (methyl binding domain 4) as a cancer predisposition gene for Uveal Melanoma (UM) by massive-parallel sequencing.", "fr": "La troisième partie décrit le contexte et l'investigation de MBD4 (Methyl-CpG Binding Domain 4) en tant que gène de prédisposition au cancer pour le mélanome uveal (UM)." } }, { "id": "48", "translation": { "en": "Adding data on chromosomal repeats to the present schema will allow the construction of complex requests integrating different levels of information such as genome, proteome and functional classification.", "fr": "L'ajout des données de répétition au schéma actuel permettra de poser au système des requêtes complexes intégrant les différents niveaux de données que sont le génome, le protéome et les classifications fonctionnelles." } }, { "id": "49", "translation": { "en": "This thesis deals with the joint use of healthcare administrative databases and biomedical knowledge for the study of patient care trajectories.", "fr": "Cette thèse porte sur l'utilisation conjointe de bases de données médicoadministratives et de connaissances biomédicales pour l'étude des trajectoires de soin." } }, { "id": "50", "translation": { "en": "These bioinformatic tools will also be used to build the super pan-genome of wild and cultivated Coffea genus to identifyPAVs that could be useful in breeding programs.", "fr": "Ces outils bioinformatiques seront également utilisés pourconstruire le super pangénome du genre Coffea sauvage et cultivé afi n d'identifi er les PAV qui pourraient être utiles dansles programmes de sélection." } }, { "id": "51", "translation": { "en": "Multiple sclerosis (MS) is an inflammatory, neurodegenerative disease in which infiltration of immune cells in the central nervous system (CNS) leads to myelin destruction.", "fr": "La sclérose en plaques (SEP) est une maladie inflammatoire neurodégénérative où l'invasion des cellules immunitaires dans le système nerveux central (SNC) entraîne la destruction de la myéline." } }, { "id": "52", "translation": { "en": "The majority if these protists were related to species of freshwater and marine origins. Most of them were putatively anaerobic, in line with the cave environment, and suggesting that in addition to their predatory role, they might participate in prokaryote-protist symbioses.", "fr": "De plus, la plupart ont été affiliées à des groupes d'organismes typiquement anaérobies, ce qui est concordant avec les paramètres abiotiques de la cave. Écologiquement, ces protistes sont des prédateurs mais aussi vraisemblablement des partenaires symbiotiques avec des espèces procaryotes de la cave." } }, { "id": "53", "translation": { "en": "We have implemented this framework in ProViz.", "fr": "Nous avons mis en oeuvre ce cadre formel dans le logiciel ProViz." } }, { "id": "54", "translation": { "en": "For this work, the thesis will rely on data from the FLEGME participatory science project (2019-2022), which aims to (i) assess the diversity of microbial ecosystems associated with fermented vegetables supplied by citizen fermenters and (ii) document the impact of processing practices on fermentative ecosystem composition from samples produced by small, specialized companies.", "fr": "La thèse s'appuiera pour ce travail sur les données du projet de science participative FLEGME (2019-2022) qui a pour objectif (i) d'évaluer la diversité des écosystèmes microbiens associés aux légumes fermentés fournis par des citoyens- fermenteurs et (ii) de documenter l'impact des pratiques de transformation sur la composition de l'écosystème fermentaire à partir d'échantillons produits par des petites entreprises spécialisées." } }, { "id": "55", "translation": { "en": "This work was set within this frame of viral diversity study through metagenomics, and organized into four main themes : • The development of bioinformatics tools adapted to the specific features of viral genomes and metagenomes led to the release of Metavir, the first web server dedicated to virome analysis.", "fr": "C'est dans ce cadre de l'étude des communautés virales de l'environnement par métagénomique que se sont inscrits les travaux de cette thèse, organisée autour de quatre axes principaux : • Le développement de nouvelles méthodes d'analyses adaptées aux spécificités des génomes et métagénomes viraux par la mise en place du serveur web Metavir, premier serveur dédié à l'analyse des viromes." } }, { "id": "56", "translation": { "en": "Using reporter assays, we showed that miR-9 was a negative regulator of PC-1, Pit-1 and TNAP, according or not to bioinformatics prediction Mineralocorticoid Receptor Antagonists (MRA) are clinically beneficial in individuals with chronic heart failure (HF).", "fr": "Nos travaux avec des systèmes rapporteurs ont démontré l'implication de miR-9 en tant que régulateur négatif de l'expression des gènes PC-1, Pit-1 et TNAP, de façon cohérente ou non avec les prédictions bio-informatiques. L'utilisation d'antagonistes du récepteur aux minéralocorticoïdes (ARM) a prouvé son efficacité dans le traitement de l'insuffisance cardiaque (IC)." } }, { "id": "57", "translation": { "en": "To overcome this weakness, in the last part of the thesis, we propose a new comparison method based on internal distances which we call DAST (for Distance-based Alignment Search Tool).", "fr": "Pour palier à cette faiblesse, dans la dernière partie de cette thèse, nous proposons une nouvelle méthode de comparaison de structures de protéines basée sur les distances internes que nous appelons DAST (pour Distance-based Alignment Search Tool)." } }, { "id": "58", "translation": { "en": "The moths, Helicoverpa armigera and Helicoverpa zea, are recognized as the two most damaging species of their genus.", "fr": "Les noctuelles, Helicoverpa armigera et Helicoverpa zea, sont reconnues comme les deux espèces les plus nuisibles de leur genre." } }, { "id": "59", "translation": { "en": "The second problem is the decomposition of a protein into simple volumes.", "fr": "Le second problème est celui de la décomposition d'un objet en volumes élémentaires." } }, { "id": "60", "translation": { "en": "Only about 10% of MIBC patients present mutations in ERCC2 (Kamoun et al, 2020), so this marker alone is not sufficient to predict for most patients.", "fr": "Seulement environ 10% des patients avec TVIM présentent des mutations de ERCC2 (Kamoun et al, 2020), donc ce marqueur seul n'est pas suffisant pour prédire la réponse pour la plupart des patients." } }, { "id": "61", "translation": { "en": "The training we provide to our doctoral students will give them first-rate assets to pursue a career in the private sector, hospital or academic sector and acquire multidisciplinary training.", "fr": "La formation que nous apportons à nos doctorants leur donne des atouts de premier plan pour poursuivre une carrière dans le domaine privé, secteur hospitalier ou académique et acquérir une formation pluridisciplinaire." } }, { "id": "62", "translation": { "en": "The Whole Slide Image scanner can acquire and store slides in the form of digital images.", "fr": "Le Whole Slide Image scanner peut acquérir et stocker des lames de microscopie sous forme d'image numériques." } }, { "id": "63", "translation": { "en": "The main objective of this thesis was to provide the first genomic classification of pituitary adenomas.", "fr": "L'objectif essentiel de cette thèse était de fournir la première classification génomique des adénomes hypophysaires." } }, { "id": "64", "translation": { "en": "An estimated 72% of rare diseases are genetic in origin.", "fr": "72 % des maladies rares sont d'origine génétique." } }, { "id": "65", "translation": { "en": "To this end, classical techniques from bioinformatics and statistical learning were used.", "fr": "Pour cela, nous faisons appel à des techniques classiques de la bioinformatique et de l'apprentissage statistique." } }, { "id": "66", "translation": { "en": "My PhD will aim at inferring the mechanisms behind those differences in contribution from cell phylogenies.", "fr": "Mon projet de thèse a pour objectif d'inférer les mécanismes à l'origine de ces différences en contributions à partir de phylogénies cellulaires." } }, { "id": "67", "translation": { "en": "Among these microorganisms, the planctomycete Rhodopirellula baltica appears as a good model to indentify enzymes specific for algal polysaccharides.", "fr": "Parmi ces microorganismes, la planctomycète Rhodopirellula baltica apparaît comme un bon modèle pour identifier les enzymes spécifiques de ces polysaccharides algaux." } }, { "id": "68", "translation": { "en": "Over the past decade, techniques based on chromosome conformation capture (3C) have accelerated our understanding of eukaryote's nuclear architecture.", "fr": "Au cours de la dernière décennie, les différentes techniques dites de capture de la conformation des chromosomes (3C) ont accéléré notre compréhension de l'architecture nucléaire des cellules eucaryotes." } }, { "id": "69", "translation": { "en": "We identified a pathogenic mutation of the CDKN2A gene, in the 3 cases.", "fr": "Nous avons identifié une mutation pathogénique du gène CDKN2A, dans les 3 cas." } }, { "id": "70", "translation": { "en": "This genetic association work is complex because the genetic variants do not always have the same distribution at the international level and it will be necessary to adapt the search for associations on the data according to the geographical regions of origin.", "fr": "Ce travail d'association génétique est complexe car les variants génétiques n'ont pas toujours la même répartition au niveau international et il faudra adapter la recherche d'associations sur les données selon les régions géographiques d'origine." } }, { "id": "71", "translation": { "en": "The discovery of new HPVs is of paramount importance to expand our knowledge on the role of these viruses in human diseases.", "fr": "La découverte de nouveaux HPV est d'une importance cruciale pour élargir nos connaissances sur ces virus." } }, { "id": "72", "translation": { "en": "Aurora A is necessary for mitotic entry and for the maturation and separation of centrosomes.", "fr": "En effet, Aurora A est nécessaire à l'entrée en mitose et joue un rôle dans la maturation des centrosomes." } }, { "id": "73", "translation": { "en": "We present a theoretical framework for the formal study of control sequences.", "fr": "Nous présentons un nouveau cadre théorique pour l'étude formelle des séquences de contrôle." } }, { "id": "74", "translation": { "en": "During the past decades, experimental approaches have allowed us to gain important insights in developmental biology, and led to the delineation of complex regulatory networks controlling developmental processes.", "fr": "Au cours des dernières décennies, les approches expérimentales nous ont permis d'obtenir des informations importantes en biologie du développement et nous ont conduit à la définition de réseaux complexes de régulation contrôlant les processus développementaux." } }, { "id": "75", "translation": { "en": "In particular, among all the machine learning models, we focus on Support Vector Machines (SVMs) that are standard methods mostly used for automatic classification.", "fr": "Nous nous intéressons en particulier aux Machines à Vecteurs Supports (SVMs), des méthodes populaires utilisées en général pour des tâches de classification automatique mais qui peuvent être adaptées à d'autres applications." } }, { "id": "76", "translation": { "en": "This method builds on a multi-tree variant of the TRRT algorithm, developed at LAAS-CNRS, and which provided good results for small and middle-sized biomolecules.", "fr": "Elle repose sur une variante multi-arbres de l'algorithme TRRT, développé au LAAS-CNRS, et qui a donné de bons résultats pour de petites et moyennes biomolécules." } }, { "id": "77", "translation": { "en": "Indeed, the published data may be sensitive, and consequently, data providers may avoid to release their information, unless they are certain that the desired access rights of different accessing entities are enforced properly, to their data.", "fr": "En effet, les données publiées peuvent être sensibles, et par conséquent, les fournisseurs de données peuvent être réticents à publier leurs informations, à moins qu'ils ne soient certains que les droits d'accès à leurs données par les différents requérants sont appliqués correctement." } }, { "id": "78", "translation": { "en": "The goal was to identify the miRNAs that are expressed during the four developmental stages of this species, allowing further biological conclusions concerning the regulatory system of such an organism.", "fr": "L'objectif était d'identifier les miARN qui sont différentiellement exprimés au cours des quatre stades de développement de cette espèce et sont donc des candidats à la régulation des gènes au cours du développement." } }, { "id": "79", "translation": { "en": "Each subsystem is vehicles. Our primary focus is on In-vehicle communication security.", "fr": "Notre objectif principal est la sécurité des communications entres les différents systèmes dans la voiture." } }, { "id": "80", "translation": { "en": "The models could then evolve towards an adaptation of the PRS according to women's exposure profiles and that throughout their life.", "fr": "Les modèles pourraient alors évoluer vers une adaptation des PRS en fonction des profils d'expositions des femmes et cela tout au long de leur vie." } }, { "id": "81", "translation": { "en": "Moreover, this work enabled to better understand and characterize the molecula rmechanisms involved in tenderization processes.", "fr": "De plus, ce travail a permis de mieux comprendre et caractériser les mécanismes moléculaires impliqués dans la mise en place de la tendreté." } }, { "id": "82", "translation": { "en": "The obtained intermediate conformations were further used to guide the rational search for inhibitors of the EF toxin, in an approach combining computational and experimental methods.", "fr": "Les conformations intermédiaires obtenues ont servi à guider la recherche rationnelle d'inhibiteurs de la toxine EF, dans le cadre d'une approche combinant méthodes computationnelles et expérimentales." } }, { "id": "83", "translation": { "en": "The dcmA gene encodes a DCM dehalogenase of the glutathione-S transferase family which is essential for growth with DCM.", "fr": "Le gène dcmA code la DCM déshalogénase de la famille des glutathion-S transférases essentielle à la croissance avec le DCM." } }, { "id": "84", "translation": { "en": "Due to the specificity of action of its insecticidal crystals in target organisms, it is the best-selling bacterial biopesticide against lepidopteran larvae pests of various vegetable crops.", "fr": "Grâce à la spécificité d'action ses cristaux insecticides chez des organismes cibles, elle occupe le premier rang des ventes de biopesticides bactériens contre les larves de lépidoptères ravageurs de diverses cultures maraîchères." } }, { "id": "85", "translation": { "en": "This work has improved our knowledge on the M. bovis lineages circulating in France and worldwide by establishing a list of genetic characteristics specific to them.", "fr": "Ce travail a permis d'améliorer nos connaissances des génotypes de M. bovis circulant en France et dans le monde en établissant des listes de caractéristiques génétiques." } }, { "id": "86", "translation": { "en": "From the results we obtained on AtMAP65-4 properties during this work such as the in vivo localization, biochemical properties and functional effetc on the MT polymerization, we suggested that the in vivo function of AtMAP65-4 is involved in setting up and maintaining microtubule bundles within kinetochore fibers during cell division.", "fr": "La localisation d'AtMAP65-4 apparait comme très intéressante car elle est strictement associée avec les microtubules du fuseau mitotique. D'après les résultats obtenus au cours de ce travail, nous avons suggéré que la fonction in vivo d'AtMAP65-4 est de participer à la mise en place et au maintient des microtubules en faisceaux dans les fibres kinétochoriennes lors de la division cellulaire." } }, { "id": "87", "translation": { "en": "The issues addressedconcern, on the one hand, the modeling of such asystem, in particular the choice of the formalism andthe level of abstraction of the model, and on the otherhand, the implementation of an evaluation protocol ofdecision making of vehicles.", "fr": "Les problématiques traitéesconcernent, d'une part, la modélisation d'un tel système,notamment le choix du formalisme et du niveaud'abstraction du modèle, et d'autre part, la mise enplace d'un protocole d'évaluation de la prise de décisiondes véhicules." } }, { "id": "88", "translation": { "en": "The third tool is CRISPRcompar for the identification and comparison of CRISPRs loci and their component determination.", "fr": "Le troisième outil est CRISPRcompar qui sert à identifier et comparer les CRISPRs dans des génomes proches pour faciliter la procédure de typage." } }, { "id": "89", "translation": { "en": "Mathematical models of GRNs have been developed to capture the behavior of the system being modeled, and in some cases generate predictions corresponding with experimental observations.", "fr": "Des modèles mathématiques de RRG ont été développés pour capturer le comportement du système modélisé et, dans certains cas, générer des prédictions correspondant aux observations expérimentales." } }, { "id": "90", "translation": { "en": "Without question, the field of perioperative genomics is dynamic and evolving.", "fr": "Il ne fait aucun doute que le domaine de la génomique périopératoire est dynamique et en constante évolution." } }, { "id": "91", "translation": { "en": "The odorome network will allow us to propose new odorant-OR associations and useful leads to explore the biological role of odorant molecules in a broad sense.", "fr": "Le réseau odorome permettra de proposer de nouvelles associations odorant-ROs et des pistes utiles pour explorer le rôle biologique au sens large des molécules odorantes." } }, { "id": "92", "translation": { "en": "However, field reports of the last decade, mainly from Africa and Asia, suggest partial vaccination failures in some farms despite proper vaccination.", "fr": "Toutefois, depuis une dizaine d'années, des observations de terrain, principalement en Afrique et en Asie, font état d'échecs partiels de vaccination avec occurrence de foyers réduits dans des élevages a priori correctement vaccinés." } }, { "id": "93", "translation": { "en": "The central question of my thesis was to investigate whether this goal could be achieved in a polyploid crop species without negatively affecting their fertility and genomic stability.", "fr": "La question centrale de ma thèse était d'étudier si cet objectif pouvait être atteint chez une espèce cultivée polyploïde sans affecter négativement sa fertilité et sa stabilité génomique." } }, { "id": "94", "translation": { "en": "The tumor heterogeneity phenomenon in primary tumors is also observed in metastases with inter- and intra- metastatic heterogeneity.", "fr": "L'hétérogénéité tumorale retrouvée au niveau des tumeurs primitives est également retrouvée au niveau des métastases sous forme d'hétérogénéité inter- et intra-métastatique." } }, { "id": "95", "translation": { "en": "Networks on the other hand are much more suited for handling modularity, and graph theory can be used to search networks for patterns that are characteristic of such reticulate evolution.", "fr": "Les réseaux sont bien plus aptes à modéliser la modularité, et la théorie des graphes peut être utilisée pour chercher dans ces réseaux des patrons caractéristiques d'une évolution réticulée." } }, { "id": "96", "translation": { "en": "Rather than non-random acquisition of genes according to their genomic location, a differential probability of retention of transferred genes as a consequence of fluctuating effective population size along the genome might be considered.", "fr": "Plutôt qu'une acquisition non aléatoire des gènes en fonction de leur localisation génomique, une probabilité différentielle de rétention des gènes transférés comme conséquence de la fluctuation de la taille efficace de la population le long du génome peut être envisagée." } }, { "id": "97", "translation": { "en": "I also propose several perspectives, notably the simulation of the data required for the improvement of the tools, a way complementary to the modeling of transposable element dynamics.", "fr": "Je propose également plusieurs pistes de recherche, notamment la simulation des données nécessaires à l'amélioration des algorithmes de détection, démarche complémentaire de la modélisation de la dynamique des éléments transposables." } }, { "id": "98", "translation": { "en": "They are mostly rare diseases that occur at all ages, including in children and young adolescents.", "fr": "Ce sont pour la plupart des maladies rares qui peuvent survenir à tout âge, y compris pendant l'enfance et la jeune adolescence." } }, { "id": "99", "translation": { "en": "The aim of this project is to detect and characterize couples of motifs that interviene in gene regulation expression taking account for distance between 2 motifs.", "fr": "L'objectif de ce projet est de détecter des couples de motifs intervenant dans la régulation de l'expression des gènes en tenant compte de la distance qui sépare ces 2 motifs." } }, { "id": "100", "translation": { "en": "The aim of this part was to characterized the genetic profile of MF by sequencing 67 WES samples and identified recurrent SNVs, SCNVs, mutational signatures and approached clonal evolution in patients, some of whom had sequential samples.", "fr": "L'objectif de cette partie a été de caractériser le profil génétique du MF par le séquençage WES de 67 échantillons tumoraux et identifier les SNVs récurrents, les SCNVs, les signatures mutationnelles et de visualiser l'évolution clonale chez les patients dont certains présentaient des échantillons séquentiels." } }, { "id": "101", "translation": { "en": "We propose to explore all the technologies mastered by the two partners, including generative molecules algorithms, docking, and machine-learning approaches capable of predicting whether the molecules generated are likely to exhibit a desired biological activity.", "fr": "Nous proposons d'explorer l'ensemble des technologies maîtrisées par les deux partenaires, incluant des algorithmes génératifs de molécules, du docking, et des approches de machine-learning capables de prédire si les molécules générées sont susceptibles de présenter une activité biologique recherchée." } }, { "id": "102", "translation": { "en": "The research work of this thesis is structured around two main axes.", "fr": "Les travaux de recherche de cette thèse s'articulent sur deux axes principaux." } }, { "id": "103", "translation": { "en": "Nevertheless, this thesis provides an incremental methodology, in order to design discrete models for biology, which has some similarities to software spiral development model.", "fr": "Cette thèse fournit néanmoins une méthode incrémentale de conception de modèles discrets, pour la biologie, qui possède certaines similarités avec les méthodes de développement de logiciel en spirale." } }, { "id": "104", "translation": { "en": "Class A G-protein-coupled receptors (GPCRs) constitute the largest family of transmembrane receptors in the human genome and are involved in the regulation of many physiological functions.", "fr": "Les récepteurs couplés aux protéines G de classe A (RCPG) constituent la plus grande famille de récepteurs transmembranaires du génome humain et sont impliqués dans la régulation de nombreux mécanismes physiologiques." } }, { "id": "105", "translation": { "en": "In this context, my pHDthesis (2010-2013) aimed to analyze the role of Hsp27 in muscle development and its involvement in the determination of the characteristics related to the quality of the meat tissue.", "fr": "Dans cette optique, mon travail de thèse (2010-2013) avait pour objectif d'analyser le rôle de Hsp27 dans le développement du muscle et son implication dans le déterminisme des caractéristiques des tissus liés à la qualité de la viande." } }, { "id": "106", "translation": { "en": "Standard inference methods include maximum-likelihood and Bayesian approaches.", "fr": "Les méthodes standards d'estimation incluent le maximum de vraisemblance et les approches bayésiennes." } }, { "id": "107", "translation": { "en": "We have also defined the concept of cluster of ME-sustainability, related to the biomass components to which they are required and which we have applied over the six previous metabolic networks and over 3600 degraded networks of iJR904 of E. coli and reconstructed according to three methods of gapfilling (Gapfill, Fastgapfill and Meneco) to compare the results.", "fr": "Nous avons aussi défini le concept de cluster de métabolites essentiels du point du vue de la persistance du réseau lié aux composants de la biomasse auxquels ils sont nécessaires et que nous avons appliqué sur les six réseaux métaboliques précédents et sur 3600 réseaux dégradés du réseau iJR904de E. coli puis reconstruits selon trois méthodes de gapfilling (Gapfill, Fastgapfill et Meneco) afin de comparer ces dernières." } }, { "id": "108", "translation": { "en": "Subfunctionalization is a neutral mutation process of constructive neutral evolution meaning that no new adaptations are formed.", "fr": "La sous-fonctionnalisation est un processus mutationnel neutre, ce qui signifie qu'aucune adaptation nouvelle n'est formée." } }, { "id": "109", "translation": { "en": "A disease-related locus has been identified in one breed and candidate point mutations and structural variants were identified in the two breeds and are being validated by targeted sequencing.", "fr": "Un locus lié à la maladie a été identifié dans une race et des variants ponctuels et structuraux candidats ont été identifiés dans les deux races et sont en cours de validation par séquençage ciblé." } }, { "id": "110", "translation": { "en": "Bioinformatic analyses predict amongst others, three potential phosphorylation sites on p73 for the calcium-calmodulin dependant kinase 2 (CamKII), which is also implicated in cell cycle, neuronal apoptosis and differenciation.", "fr": "Notre analyse bio-informatique prédit entre autres, trois sites sur p73 potentiellement phosphorylés par la calcium-calmoduline dépendante kinase 2 (CamKII), qui est aussi impliquée dans le cycle cellulaire, l'apoptose et la différenciation neuronale." } }, { "id": "111", "translation": { "en": "Additional experiments allowed us to identify genes that are specifically associated with the thermal component of sun exposure, among which genes encoding HSP, ABC transporters, and enzymes of flavonoid metabolism.", "fr": "Des expériences complémentaires ont permis d'identifier divers gènes spécifiquement associés à la composante thermique de l'exposition au soleil, parmi lequels des gènes codant pour des HSP, des transporteurs ABC, et des enzymes du métabolisme flavonoïdique." } }, { "id": "112", "translation": { "en": "Due to the heterogeneity of resources, the composition of services is a difficult task.", "fr": "À cause de l'hétérogénéité des ressources, la composition de services est une tâche difficile." } }, { "id": "113", "translation": { "en": "A regulatory network was then built by merging their automatically-extracted contents and the most connected elements related to energy metabolism were found by topological analysis.", "fr": "Suite à cette analyse un graphe d'influence a été construit et l'analyse de sa topologie a permis de mettre en évidence les éléments les plus connectés possédant un lien avec le métabolisme énergétique." } }, { "id": "114", "translation": { "en": "This thesis presents an algorithm, called P-DCFold, based on the comparative approach, for the prediction of RNA secondary structures with a complexity of O(n2).", "fr": "Cette thèse présente un algorithme, appelé P-DCfold, basé sur l'approche comparative pour la prédiction de structures secondaires des ARN avec une complexité en O(n2)." } }, { "id": "115", "translation": { "en": "The predictions were in agreement with the available experimental data, and helped to propose several new target candidates.", "fr": "Les prédictions réalisées sont apparues être en accord avec les données expérimentales disponibles, et ont permis de proposer plusieurs nouvelles cibles candidates." } }, { "id": "116", "translation": { "en": "They are scattered across a geographical area defining the terrain of interest for the phenomenon captured.", "fr": "Ils sont dispersés à travers une zone géographique définissant le terrain d'intérêt pour le phénomène capté." } }, { "id": "117", "translation": { "en": "Moreover, large-scale GWA analysis using worldwide populations was conducted to decipher the genetic architecture at the metabolic level and provide links between the metabolomic plasticity and phenotypic diversity behind local adaptation. In addition, this extends our vision of the diversity at the species scale.", "fr": "En outre, une analyse GWA à grande échelle utilisant un set d'accession mondial a été menée pour déchiffrer l'architecture génétique au niveau métabolique afin de rapprocher la compréhension de la plasticité métabolomique et de la diversité phénotypique et d'étendre notre vision de cette diversité à l'échelle des espèces." } }, { "id": "118", "translation": { "en": "The fight against forest fires is a key issue at the beginning of the twenty-first century.", "fr": "La lutte contre les feux de forêts est un enjeu primordial en ce début de XXIime siècle." } }, { "id": "119", "translation": { "en": "These uses, as we will see it, do not concern all the socioprofessional categories in the same way and they also influence how the respondents interact with their online friends.", "fr": "Ces usages, comme on le verra, sont ainsi différemment adoptés selon les catégories socioprofessionnelles et influent par ailleurs sur les modalités d'échanges et d'interactions des enquêtés avec leurs amis en ligne." } }, { "id": "120", "translation": { "en": "Breast cancer is now considered as a large collection of distinct biological entities, the management of which is increasingly personalized.", "fr": "Le cancer du sein est de plus en plus reconnu comme une large collection d'entités biologiques différentes, dont la prise en charge tend vers une personnalisation accrue." } }, { "id": "121", "translation": { "en": "A large portion of the information contained in next-generation sequencing data is potentially lost through classical bioinformatics analysis.", "fr": "Une grande partie des informations contenues dans les données de séquençage de nouvelle génération est potentiellement perdue par l'analyse bioinformatique classique." } }, { "id": "122", "translation": { "en": "contraction) is said \"of arity n and order m\" if it copies (resp.", "fr": "la contraction) est dite \" n-aire d'ordre m \", si elle copie (resp." } }, { "id": "123", "translation": { "en": "Genetic information is encoded in DNA, a huge-size nucleotidic polymer.", "fr": "L'information génétique est portée par la molécule d'ADN, un polymère de nucléotides de très grande taille." } }, { "id": "124", "translation": { "en": "For example, a common pattern in Security is the detection of concerted attacks toward a same target, such as a DDOS.", "fr": "Par exemple, dans le cadre de la sécurité, on souhaite détecter des tentatives d'intrusions concertées, tel des DDOS." } }, { "id": "125", "translation": { "en": "This result confirms the low involvement of the burmannica group in the genome of cultivated bananas.", "fr": "Ce résultat confirme la faible implication du groupe burmannica dans le génome des bananiers cultivés." } }, { "id": "126", "translation": { "en": "The concept of reactions modules may then reflect the ancestral metabolic pathways for which they would be basic elements.", "fr": "Appliqué à diverses voies, le concept de modules réactionnels refléterait donc les voies métaboliques ancestrales dont ils seraient les éléments de base." } }, { "id": "127", "translation": { "en": "The search for biomarkers is conducted using large equipments in a specialised laboratory; The results being communicated to the doctor, who will then interpret them by applying a medical diagnostic algorithm.", "fr": "La recherche des bio-marqueurs se fait a l'aide d'équipements importants, dans un laboratoire d'analyse; les résultats étant communiqués au médecin, qui va les interpréter en appliquant un algorithme de diagnostic médical." } }, { "id": "128", "translation": { "en": "Hence it is essential to prove the specificity of antigenic proteins, a combination of various antigens therefore needs to be tested to enable the development of new biomarkers for the diagnosis and prognosis of CC.", "fr": "Pour trouver des protéines antigéniques spécifiques du CC, une combinaison de plusieurs semble nécessaire afin de permettre le développement de nouveaux biomarqueurs pour le diagnostic et le pronostic des CC." } }, { "id": "129", "translation": { "en": "It can thus be envisaged that sequence databases of major veterinary pathogens will have an ever-increasing role in animal health especially if enriched by related metadata.", "fr": "Il est dès lors possible d'envisager que les bases de données sur les séquences des principaux agents pathogènes vétérinaires joueront un rôle croissant dans la santé animale, surtout si elles sont enrichies par les métadonnées connexes." } }, { "id": "130", "translation": { "en": "Orthology is defined relative to the last common ancestor of the species being considered, thereby determining the hierarchical nature of orthologous classifications.", "fr": "L'orthologie est définie par rapport au dernier ancêtre commun des espèces considérées, de manière à déterminer la nature hiérarchique des orthologues." } }, { "id": "131", "translation": { "en": "One of the selected scFvs, P90C2, was optimized and expressed in E. coli BL21 (DE3) bacteria in the form of inclusion bodies and then solubilized and refolded.", "fr": "L'un d'entre eux, le scFv P90C2, a été cloné et exprimé dans des bactéries E. coli BL21 (DE3) sous forme de corps d'inclusion, puis solubilise et enfin renaturé." } }, { "id": "132", "translation": { "en": "Toxoplasma gondii is a member of Apicomplexa phylum, which is charaterzied by the presence of three parasite's specific secretory organelles named micronemes, rhoptries and dense granules.", "fr": "Toxoplasma gondii est membre des parasites Apicomplexa qui sont caractérisés non seulement par un développement intracellulaire obligatoire, mais aussi par trois organites sécrétoires spécifiques à savoir les micronèmes, rhoptries et les granules denses." } }, { "id": "133", "translation": { "en": "The TDG is very complicated to manage because of risk for the environment and human life.", "fr": "Le TMD est très compliqué à gérer en raison des risques pour l'environnement et la vie humaine." } }, { "id": "134", "translation": { "en": "I also show how Bwolo can be used and have set up an original study on the distribution of potential miRNA target sites in two plant genomes, Arabidopsis thaliana and Arabidopsis lyrata.", "fr": "Nous montrons également comment utiliser Bwolo pour mettre en place une analyse originale sur l'étude de la distribution des cibles potentielles de miARN dans deux génomes de plantes, Arabidopsis thaliana et Arabidopsis lyrata." } }, { "id": "135", "translation": { "en": "As potentially important components of unmanaged and cultivated ecosystems, there is a need to explore the diversity of the viruses associated with plant populations and to understand the drivers shaping their diversity in space and time.", "fr": "Ces virus constituant une composante potentiellement importante des écosystèmes naturels ou des agrosystèmes anthropisés, il est important d'explorer la diversité des virus associés aux populations végétales et de comprendre les forces structurant cette diversité dans le temps et dans l'espace." } }, { "id": "136", "translation": { "en": "We showed its usefulness for short-term studies (find specificity of a pathogenic strain of E. anophelis), long-term (genomic diversity of E. coli species), or to identify different species in an little-known genus (Morganella).", "fr": "Nous avons montré l'utilité de l'outil sur des études à court terme (recherche de la particularité d'une souche épidémique d'E. anophelis), sur du long terme (étude de la diversité génomique de l'espèce E. coli), ou encore pour différencier différentes espèces d'un genre peu connu (Morganella)." } }, { "id": "137", "translation": { "en": "While their expression is clearly deregulated in endometriosis, precise identification of the miRNAs involved in the disease is still to be achieved, as the studies published so far have produced discordant results.", "fr": "S'il est clair que leur expression est dérégulée dans l'endométriose, l'identification des micro-ARNs en cause est loin d'être achevée, les études publiées à ce jour étant discordantes entre elles." } }, { "id": "138", "translation": { "en": "A metagenomics-based approach was also carried out in France on asymptomatic plants and revealed a high prevalence (11.6%) of a persistent rice endornavirus (oryza sativa alphaendornavirus,OsEV).", "fr": "La même analyse réalisée en France révèle une prévalence importante (11.6%) d'un endornavirus persistant du riz (oryza sativa alphaendornavirus, OsEV) qui a été retrouvé au sein de plantes asymptomatiques." } }, { "id": "139", "translation": { "en": "Moreover, some proteins were not identified in transcripts, due to the dynamics of the expression of these transcripts in P. falciparum.", "fr": "De plus, certaines protéines n'ont pas été identifiées en transcrits, dû à la dynamique de l'expression de ces transcrits chez P. falciparum." } }, { "id": "140", "translation": { "en": "The recent advent of high-throughput experimental procedures has opened a new era for the quantitative study of biological systems.", "fr": "L'avènement récent des procédures expérimentales à haut débit a ouvert une nouvelle ère pour l'étude quantitative des systèmes biologiques." } }, { "id": "141", "translation": { "en": "HDX-MS identifies a putative binding site of TUA-diCl on the helical domain of EF, a critical region for CaM insertion.", "fr": "Les expériences HDX-MS ont révélé que le TUA-diCl se lierait au domaine hélicoïdal de EF, une région critique pour l'insertion de CaM." } }, { "id": "142", "translation": { "en": "This study extend the previous observations made by the team about implication of some proteins in the QC pathway by genome-wide methods (RNA-seq, ChIP-seq).", "fr": "La présente étude étend les précédentes observations faites par l'équipe quant à l'implication de certaines protéines dans le système de QC par des approches globales (RNA-seq, ChIP-seq)." } }, { "id": "143", "translation": { "en": "This thesis aimed at providing a rational explanation for the observed impact of mutations on the regioselectivity of BaSP in view of controlling the synthesis of rare pre-biotic disaccharides like kojibiose and nigerose.", "fr": "Cette thèse vise d'une part, à fournir une explication rationnelle quant aux modifications de la régiosélectivité de BaSP apportées par des mutations et d'autre part à proposer un canevas pour le contrôle de la régiosélectivité de couplage en vue de la synthèse de disaccharides pré-biotiques rares comme le kojibiose et le nigerose." } }, { "id": "144", "translation": { "en": "Quantitative super-resolution microscopy provides access to the nanoscale organization of membrane receptors playing a physiological role.", "fr": "La microscopie de super-résolution permet l'accès à l'organisation et la dynamique des récepteurs membranaires avec des résolutions nanométrique." } }, { "id": "145", "translation": { "en": "By combining these and public-domain data, this bioinformatics/biostatistics project will first extract genomic alterations, immunologic types and activated oncogenic pathways in each tumor sample.", "fr": "En combinant ces données et des données du domaine public, ce projet de bioinformatique / biostatistique extraira d'abord les altérations génomiques, les profils immunologiques et les voies oncogéniques activées dans chaque échantillon de tumeur." } }, { "id": "146", "translation": { "en": "In this study we showed that the ORs are associated with DNA sequences that are prone to form secondary structures, termed G-quadruplexes, which have been linked to transcriptional regulation.", "fr": "Nous avons montré que les ORs sont associés à des séquences d'ADN capables de former des structures secondaires (appelés G-quadruplex) qui sont connus comme régulateur de la transcription." } }, { "id": "147", "translation": { "en": "The main advantages of this method are its reliability, speed and low cost.", "fr": "Cette méthode a comme principaux avantages d'être fiable, rapide et peu coûteuse." } }, { "id": "148", "translation": { "en": "To identify these compounds, we developed fractionation of the bear serum (chromatography, proteolysis, high abundance protein depletion) and showed that ketone bodies could be involved.", "fr": "Pour identifier ces composés, nous avons développé le fractionnement du sérum d'ours (chromatographie, protéolyse, déplétion des protéines majoritaires) et montré que les corps cétoniques pourraient être impliqués." } }, { "id": "149", "translation": { "en": "Thanks to the participation of the four European Reference Networks (ERN) ITHACA (Rare Congenital Malformations and Rare Intellectual Disability), RND (Rare Neurological Diseases), NMD (Rare Neuromuscular Diseases) and GENTURIS (Genetic Tumor Risk Syndromes), this project will allow us to build the first European cohort of patients with rare diseases.", "fr": "Grâce à la participation des quatre European Reference Networks (ERN) ITHACA (Rare Congenital Malformations and Rare Intellectual Disability), RND (Rare Neurological Diseases), NMD (Rare Neuromuscular Diseases) et GENTURIS (Genetic Tumor Risk Syndromes), ce projet permettra de construire la première cohorte européenne de patients atteints de maladies rares." } }, { "id": "150", "translation": { "en": "Over the last few decades, the emergence of a wide range of new technologies has produced a massive amount of biological data (genomics, proteomics...).", "fr": "Au cours des dernières décennies, l'émergence d'une large gamme de nouvelles technologies a permis de produire une quantité massive de données biologiques (génomique, protéomique...)." } }, { "id": "151", "translation": { "en": "We are interested in an open, dynamic and unstable context in which agents can dynamically cooperate.", "fr": "Nous nous intéressons à un contexte ouvert, dynamique et instable dans lequel les agents peuvent coopérer de manière dynamique." } }, { "id": "152", "translation": { "en": "Some papers in this Review focus on specific pathogens of veterinary importance, such as foot and mouth disease virus, Mycobacterium bovis (the bacteria that causes tuberculosis in bovines and a range of other animals, including humans) and the Middle East respiratory syndrome (MERS) coronavirus, which circulates in camels and is responsible for zoonotic respiratory infections in humans, many of them lethal.", "fr": "Certains articles de ce numéro de la Revue sont consacrés à des agents pathogènes importants au plan vétérinaire, par exemple le virus de la fièvre aphteuse, Mycobacterium bovis (bactérie responsable de la tuberculose chez les bovins et d'autres espèces ainsi que chez l'homme) et le coronavirus responsable du syndrome respiratoire du Moyen-Orient (Cov-MERS) chez les camélidés et d'infections respiratoires zoonotiques chez l'homme, dont certaines sont mortelles." } }, { "id": "153", "translation": { "en": "Many bio-informatics methods are still developed for RNA-seq data processing, trying to get the maximum out of it.", "fr": "De nombreuses méthodes bioinformatiques ont été et sont encore développées pour permettre l'analyse des données issues du RNAseq et en tirer le maximum d'information." } }, { "id": "154", "translation": { "en": "This thesis proposes a new approach to discover signatures of families (and superfamilies) enzymes.", "fr": "Cette thèse propose une nouvelle approche de découverte de signatures de familles (et superfamilles) d'enzymes." } }, { "id": "155", "translation": { "en": "Next generation sequencing (NGS) technologies offer new opportunities to explore polyploid genomes and their corresponding transcriptomes.", "fr": "Les nouvelles technologies de séquençage (NTS) offrent de nouvelles opportunités d'explorer les génomes et transcriptomes d'espèces polyploïdes." } }, { "id": "156", "translation": { "en": "It has been suggested that there are only around 2,000 distinct protein folds in nature, though there are many millions of different proteins.", "fr": "Il a été suggéré qu'il n'y aurait qu'environ 2 000 plis protéiques distincts dans la nature, contre plusieurs millions de protéines différentes." } }, { "id": "157", "translation": { "en": "To cope with this, the photoactive Orange Carotenoid Protein (OCP) induces thermal dissipation of the excess energy harvested by the antenna complex, the phycobilisome (PBS) to decrease the energy arriving at the photochemical centers.", "fr": "Pour y faire face, la photoactive orange carotenoid protein (OCP) induit une dissipation thermique de l'énergie excédentaire récoltée par le complexe d'antennes, le phycobilisome (PBS), afin de diminuer l'énergie arrivant aux centres photochimiques." } }, { "id": "158", "translation": { "en": "Additional structural and functional information could also be exploited to improve the final alignment accuracy.", "fr": "Des informations structurales et fonctionnelles supplémentaires peuvent également être utilisées pour améliorer la précision de l'alignement final." } }, { "id": "159", "translation": { "en": "Finally, this work also allowed the identification of two potential new clusters of immune genes, the GBHs and the UNKs, which are among the most overexpressed genes during the tripartite interaction.", "fr": "Ce travail a également été marqué par la découverte de deux potentiels nouveaux clusters de gènes immunitaires, les GBHs et les UNKs, qui sont parmi les gènes les plus fortement induits lors de l'interaction tripartite." } }, { "id": "160", "translation": { "en": "Finally, the third part of my thesis links the first two parts.", "fr": "Enfin, la troisième partie de ma thèse fait le lien entre les deux premières." } }, { "id": "161", "translation": { "en": "Without timely diagnosis and proper treatment, metastasis can develop and lead to lethal diseases.", "fr": "Sans un diagnostic en temps utile et un traitement approprié, des métastases peuvent se développer et entraîner des maladies mortelles." } }, { "id": "162", "translation": { "en": "Phenotype switching of arterial smooth muscle cells (SMC) from a contractile phenotype through a synthetic phenotype in response to pathogenic stimuli is involved in the development of arteriosclerosis.", "fr": "La modulation phénotypique des cellules musculaires lisses (CML) artérielles d'un phénotype contractile vers un phénotype synthétique en réponse à des stimuli pathogènes est impliquée dans le développement de l'artériosclérose." } }, { "id": "163", "translation": { "en": "Wendl and Wilson report a simple set of optimization rules that maximize the probability of discovery for a given set of parameters.", "fr": "Wendl et Wilson proposent un ensemble simple de règles d'optimisation qui maximisent la probabilité de découverte pour un ensemble donné de paramètres." } }, { "id": "164", "translation": { "en": "Based on crystallographic data, it has become possible to study on a large scale the existing interaction modalities between the two molecular entities.", "fr": "En s'appuyant sur des informations fournies par la bio-cristallographie, il est devenu possible d'étudier à grande échelle les modalités d'interaction existantes entre ces deux entités moléculaires." } }, { "id": "165", "translation": { "en": "Eukaryotic genes are composed of exons and introns.", "fr": "Les gènes des organismes eucaryotes sont structurés en exons et en introns." } }, { "id": "166", "translation": { "en": "We observe a multi-colonization process that implies not only one but several tumor clones that could cooperate in the metastatic process.", "fr": "Enfin il semble exister un phénomène de multi-colonisation, qui implique non pas un, mais plusieurs clones tumoraux qui pourraient agir conjointement dans le processus métastatique." } }, { "id": "167", "translation": { "en": "This review will develop the process of computational imaging analysis and present its potential in immuno-oncology.", "fr": "Cette revue développe le processus de l'analyse en imagerie computationnelle et présente le potentiel de son utilisation en immuno-oncologie." } }, { "id": "168", "translation": { "en": "Myeloproliferative Neoplasms (MPN) are chronic hematological malignancies characterized by an excessive proliferation of myeloid progenitors, resulting from the acquisition of driver mutations.", "fr": "Les Néoplasies Myéloprolifératives(NMP) sont des hémopathies malignes chroniques caractérisées par une prolifération excessive des progéniteurs myéloïdes, résultant de l'acquisition de mutations \" driver \" dans les voies de signalisation des cytokines." } }, { "id": "169", "translation": { "en": "Finally, a pipeline dedicated to the ChIP-seq analyses has been implemented.", "fr": "Enfin, un pipeline d'analyse dédié au ChIP-seq a été implémenté." } }, { "id": "170", "translation": { "en": "Based on the literature, hypotheses of causal relationships have been established between certain contaminants detected in the WWTP effluent (38 PPs and 4 pesticides) and the effects observed.", "fr": "En se basant sur la littérature, des hypothèses de relation de cause à effet ont pu être établies entre certains contaminants détectés dans le rejet de STEP (38 PP et 4 pesticides) et les effets observés." } }, { "id": "171", "translation": { "en": "This acquisition was likely performed via multiple horizontal transfers of genes belonging to this metabolic pathway.", "fr": "Cette acquisition a vraisemblablement été réalisée par le biais de multiples transferts horizontaux de gènes de cette voie métabolique." } }, { "id": "172", "translation": { "en": "This thesis focuses on the development of new bioinformatics solutions, integrating Big Data and Big Data associated approaches to improve the study of rare diseases.", "fr": "Cette thèse porte sur le développement de nouvelles solutions bioinformatiques, intégrant des données Big Data et des approches guidées par la connaissance pour améliorer l'étude des maladies rares." } }, { "id": "173", "translation": { "en": "With a high pluri-disciplinary potential, the graphlet methodology is also discussed and explored itself.", "fr": "A fort potentiel pluri-disciplinaire, la méthodologie graphlets elle même est également discutée et explorée." } }, { "id": "174", "translation": { "en": "In summary, during our thesis, we followed an epidemiologic approach and proposed integrated designs in order to upgrade the investigations on genetic epidemiology of cardiovascular diseases Most commonly used similarity search methods in genomic sequences are heuristic ones.", "fr": "En conclusion, lors de notre thèse, nous avons eu à la fois une démarche épidémiologique et une démarche de proposition de designs intégrés permettant de mener plus avant les investigations sur l'étiologie génétique des pathologies cardiovasculaires." } }, { "id": "175", "translation": { "en": "Characterize the expression profile of AKI and the underlying mechanisms using RNA sequencing.", "fr": "Caractériser le profil d'expression de l'IRA et des mécanismes sous-jacents en utilisant le séquençage de l'ARN." } }, { "id": "176", "translation": { "en": "The knowledge of protein interactions is essential to understand cell functions.", "fr": "La connaissance des interactions entre protéines est indispensable à la compréhension du fonctionnement de la cellule." } }, { "id": "177", "translation": { "en": "Specifically, three main categories of complexity measurements are introduced, which further divide the 414 pseudoknots into a series of subclasses respectively.", "fr": "Plus précisément, trois grandes catégories de mesures complexes sont introduites, qui divisent encore les 414 pseudonoeuds en une série de sous-classes respectivement." } }, { "id": "178", "translation": { "en": "The emergence of new sequencing technologies, as long-read sequencing, has paved the way for the production of reference genomes at an affordable cost.", "fr": "L'avènement des nouvelles technologies de séquençage puis du séquençage longues lectures a ouvert la voie vers la production de génomes de référence à un coût abordable." } }, { "id": "179", "translation": { "en": "First, I deeply analyzed the sequences of the orphan domain family HHD, found in few neuronal proteins, using bioinformatics tools to predict functional surfaces involved in protein-protein interactions and the effect of human pathogenic mutations.", "fr": "J'ai en premier lieu analysé les séquences protéiques de la famille de domaines HHD, exprimés seulement dans quelques protéines neuronales, en utilisant des outils bioinformatiques afin de prédire la fonction de différentes surfaces dans des interactions protéine-protéine ainsi que l'effet de mutations pathogènes humaines." } }, { "id": "180", "translation": { "en": "Current climate projections predict that crops will be exposed to an increase of multiple and combined environmental constraints, leading to complex and generally non-deductible impacts.", "fr": "Les modélisations climatiques actuelles prévoient l'augmentation des contraintes environnementales multiples et combinées sur les cultures, dont les effets complexes s'avèrent généralement peu prédictibles." } }, { "id": "181", "translation": { "en": "The icosahedral particle of the CeV virus has a diameter of 160 nm and contains a 474-kb genome. The analysis of the latter confirmed that CeV is related to the viruses of the Mimiviridae family, originally defined around the giant viruses prototypes Mimivirus and Megavirus which infect the amoebae.", "fr": "La particule icosahédrique du virus CeV a un diamètre de 160 nm et contient un génome de 474-kb dont l'analyse a confirmé que CeV est apparenté aux virus de la famille des Mimiviridae, initialement définie autour des virus géant prototypes Mimivirus et Megavirus infectant des amibes." } }, { "id": "182", "translation": { "en": "The work initiated here opens up a field of innovative investigation to identify new targets for plant breeding and for an improved end-use value and nutritional quality of wheat in the context of inputs limitation.", "fr": "Les travaux initiés dans cette thèse ouvrent un champ d'investigation innovant pour l'identification de nouvelles cibles de sélection variétale pour l'amélioration de la valeur technologique et de la qualité nutritionnelle du blé." } }, { "id": "183", "translation": { "en": "With this background in mind, there are several significant and intriguing studies, both cardiac and non-cardiac, that have added to our understanding of perioperative neurologic outcome and genomics.13,16 The first investigations of perioperative genetic variation and cerebral outcome (now almost 15 years old) focused on single gene variants.", "fr": "Gardant ces faits à l'esprit, il existe tout de même plusieurs études importantes et intrigantes, dans les domaines cardiaque et non cardiaque, qui ont permis d'étendre notre compréhension des devenirs neurologiques et de la génomique périopératoire.13,16 Les premières études portant sur les variations génétiques périopératoires et le devenir cérébral (il y a près de 15 ans) se sont concentrées sur les variantes d'un seul gène." } }, { "id": "184", "translation": { "en": "As we describe in more detail below, not only do we seek efficient algorithms, but also methods that can deal with the high level of uncertainty in reconstructing past indel events.", "fr": "Comme nous le décrivons plus en détail ci-dessous, nous recherchons non seulement des algorithmes efficaces, mais aussi des méthodes capables de gérer le niveau élevé d'incertitude dans la reconstruction des indels passés." } }, { "id": "185", "translation": { "en": "Therefore, the aim of this work was to determine the role of ERα36 in the physiological development of the mammary gland.", "fr": "C'est pourquoi le premier objectif de ce travail était de déterminer le rôle d'ERα36 dans le développement physiologique de cette glande." } }, { "id": "186", "translation": { "en": "It include the development of a new tool to manage analytical correlation generated on metabolomics data during acquisition and filter it ; deployment of variable selection strategies using different statistical models to provide a MetS signature for elderly people ; or execution of bio-informatics tools to go further in biological interpretation of data across visualization on metabolomics networks.", "fr": "Il a inclus le développement d'un outil de filtration des corrélations analytiques rencontrées en métabolomique lors de la génération des données ; la mise en place d'une stratégie de sélection de variables utilisant différents modèles statistiques afin d'arriver à proposer une signature du SMet chez la personne âgée ; ou encore la mise en oeuvre d'outils bio-informatiques permettant d'aller plus loin dans l'interprétation biologique des données à travers la visualisation dans des réseaux métaboliques." } }, { "id": "187", "translation": { "en": "Some regulatory elements are conserved at a precise location in promoters.", "fr": "Certains éléments régulateurs sont conservés à une position préférentielle dans les promoteurs." } }, { "id": "188", "translation": { "en": "iv) 4420 DMCs from the comparison between constant genomic cow (Somatic cell nuclear transfer, clones) and variable genomic cows but with the same age and raised in the same conditions than clones.", "fr": "Iv) 4420 DMC issues de la comparaison entre méthylomes de vaches à génome constant (issues du transfert nucléaire, clones) et de vaches à génome variable mais de même âge et élevées dans les mêmes conditions que les clones." } }, { "id": "189", "translation": { "en": "Novel strategies are needed to treat epilepsy, in order to ensure efficiency, security and prevention.", "fr": "Des stratégies nouvelles sont nécessaires pour le traitement de l'épilepsie, du point de vue de l'efficacité, de la sécurité et de la prévention." } }, { "id": "190", "translation": { "en": "(2) Each DC type is plastic, expressing a specific array of innate immune recognition receptors, able to sense different input signals.", "fr": "2) Chaque type de DC est lui-même plastique. Il exprime des récepteurs de reconnaissance de l'immunité innée, chacun capable de détecter différents signaux d'entrée." } }, { "id": "191", "translation": { "en": "In-vivo validation of these predictions is in progress.", "fr": "La validation in-vivo de ces prédictions est en cours." } }, { "id": "192", "translation": { "en": "Then, we search dynamical properties which can be deduced from the interaction graph.", "fr": "Ensuite, nous recherchons des propriétés dynamiques qui peuvent se déduire du graphe d'interactions." } }, { "id": "193", "translation": { "en": "By formalizing simple rules used by researchers to infer gene regulatory events, I was able to automatically recover, from the experimental data available in ANISEED, a network of gene regulatory interactions throughout ascidian development.", "fr": "A partir de la formalisation de règles simples utilisées par les chercheurs pour inférer des interactions, j'ai pu extraire automatiquement, des données expérimentales disponibles en ANISEED, un réseau de régulation de gènes pendant le développement embryonnaire de l'ascidie." } }, { "id": "194", "translation": { "en": "This approach has been experimented in the case of bacterial mixtures where the model bacterium was largely in minority and for samples containing various food matrices such as mineral water or milk.", "fr": "Cette approche a été expérimentée dans le cas de mélanges de bactéries où la bactérie modèle était largement minoritaire et dans des échantillons de matrices alimentaires diverses telles que de l'eau minérale ou du lait." } }, { "id": "195", "translation": { "en": "To characterize in detail the immune microenvironment and oncogenic processes of specific sarcomas, single-cell RNA-seq was performed for some of them, notably dedifferentiated liposarcomas (DDLPS).", "fr": "Pour caractériser en détail le microenvironnement immunitaire et les processus oncogéniques de sarcomes spécifiques, certains d'entre eux ont été étudiés par du RNA-seq à l'échelle unicellulaire (single-cell RNA-seq), notamment les liposarcomes dédifférenciés (DDLPS)." } }, { "id": "196", "translation": { "en": "This network was compared to an experimental network in terms of structure.", "fr": "Ce dernier a été comparé à un réseau d'interactions identifiées expérimentalement, notamment en termes de structure." } }, { "id": "197", "translation": { "en": "In the second part, the design and the use of a chip dedicated to Buchnera allowed to study the bacterial transcriptome, under nutritionnal and osmotic stress in the diet of the aphid.", "fr": "Dans une seconde partie, la conception et l'utilisation d'une puce dédiée à Buchnera ont permis d'étudier le transcriptome de la bactérie, lorsque son hôte subit un stress nutritionnel et osmotique." } }, { "id": "198", "translation": { "en": "This evaluation led to the isolation of datasets features that impact the performance of the aggregation algorithms, and to design a guide to characterize the needs of a user and advise him in the choice of the algorithm to be use.", "fr": "Cette évaluation a permis d'isoler les caractéristiques des jeux de données ayant un impact sur les performances des algorithmes d'agrégation et de concevoir un guide pour caractériser le besoin d'un utilisateur et le conseiller dans le choix de l'algorithme à privilégier." } }, { "id": "199", "translation": { "en": "Indeed, there are several thematic deficiencies present in most of the reported studies.", "fr": "En effet, plusieurs faiblesses thématiques sont apparentes dans la plupart des études rapportées à ce sujet." } }, { "id": "200", "translation": { "en": "Living cells use 20 canonical α amino acids during ribosomal protein synthesis, although in rare cases, other amino acids such as selenocysteine or pyrrolysine can be used.", "fr": "Les cellules vivantes utilisent 20 acides α aminés canoniques lors de la synthèse ribosomale des protéines, même si dans de rares occasions, d'autres acides aminés (selenocysteine ou pyrrolysine) peuvent être utilisés." } }, { "id": "201", "translation": { "en": "Nevertheless, the choice of the structure(s) used as reference remains a topical issue when several are available.", "fr": "Néanmoins, le choix de la/des structure(s) à utiliser demeure une question d'actualité." } }, { "id": "202", "translation": { "en": "In the second part, we investigated one of the PPARs, PPARgamma;, in the trophoblasts, the cells that make up the main part of the placenta.", "fr": "Dans la deuxième partie, nous avons étudié l'un des PPAR, PPARgamma;, dans les trophoblastes, les cellules qui constituent la partie principale du placenta." } }, { "id": "203", "translation": { "en": "Nevertheless, rare diseases represent a real interest as the fundamental knowledge accumulated as well as the developed therapeutic solutions can also benefit to common underlying disorders.", "fr": "Néanmoins, les maladies rares représentent un réel intérêt, car les connaissances fondamentales accumulées en temps que modèle d'études et les solutions thérapeutique qui en découlent peuvent également bénéficier à des maladies plus communes." } }, { "id": "204", "translation": { "en": "However, genotyping costs with this tool still remain high for a routine use on the selection candidates.", "fr": "Toutefois cet outil reste cher pour une utilisation en routine sur les candidats de la sélection." } }, { "id": "205", "translation": { "en": "Many computational tools have been developed along with the automation of annotation.", "fr": "L'automatisation des protocoles d'annotation a vu naître un grand nombre d'outils informatiques." } }, { "id": "206", "translation": { "en": "The second part of our work consisted in an original discriminative approach which proposes an algorithm for discovering motifs based on the ascending hierarchical paradigm.", "fr": "Une seconde approche repose sur l'utilisation originale d'un algorithme de découverte de motifs suivant le paradigme de la classification hiérarchique." } }, { "id": "207", "translation": { "en": "This evaluation allowed to better understand experimental design biases, which can affect the results and biological conclusions.", "fr": "Cette évaluation a permis de mieux comprendre les biais du plan d'expérience qui peuvent affecter les résultats et les conclusions biologiques associées." } }, { "id": "208", "translation": { "en": "Transposable elements (TEs) are major components of most genomes, and their impact on genome evolution is now well documented.", "fr": "Les éléments transposables sont des composants majeurs de la plupart des génomes, et leur impact sur l'évolution des génomes est maintenant bien documenté." } }, { "id": "209", "translation": { "en": "Given their ecological importance, much progress has been made in identifying key elements of the mechanisms underlying coral calcification.", "fr": "Compte tenu de l'importance écologique des coraux constructeurs de récifs, de nombreux progrès ont été réalisés dans l'identification des mécanismes à la base de la calcification des coraux." } }, { "id": "210", "translation": { "en": "In fact, studies showed that those bacteria are significantly more abundant in the microbiome of lean subjects.", "fr": "En effet, plusieurs études ont montré que cette bactérie est significativement plus abondante chez les personnes présentant un faible indice de masse corporelle." } }, { "id": "211", "translation": { "en": "Then, to identify molecular targets of VapC7 and VapC10 ribonucleases, we have developed a MORE RNA-seq analysis (Mapping by Overexpression of an RNase in E. coli).", "fr": "Afin d'identifier les cibles moléculaires des ribonucléases VapC7 et VapC10, nous avons développé une analyse de MORE RNA-seq (Mapping by Overexpression of an RNase in E. coli)." } }, { "id": "212", "translation": { "en": "Then, it is important to identify the selection pressure of the gene which is in the frame -2 and show that its presence and conservation are not only due to mechanical constraints induced by the \"fixed\" gene.", "fr": "Il est alors important d'identifier la pression de sélection propre au gène situé sur la phase -2, et montrer ainsi que sa présence et sa conservation ne sont pas seulement dues aux contraintes induites par le gène fixe." } }, { "id": "213", "translation": { "en": "This review details the different radiobiological approaches that have been developed to better predict the tumor response but also the radiation-induced late effects.", "fr": "Cette revue détaille les différentes avancées en radiobiologie clinique sur les outils disponibles pour la prédire la réponse tumorale mais également les effets secondaires tardifs après radiothérapie." } }, { "id": "214", "translation": { "en": "In this unsupervised molecular representation, the classification based on the six transcriptome groups and the mutation status GNAS and USP8 forme more homogeneous and better separated groups than the histological classification OMS 2017.", "fr": "Dans cette représentation moléculaire non supervisée, la classification reprenant les 6 groupes du transcriptome et le statut mutationnel GNAS et USP8 forme des groupes plus homogènes et mieux séparés que la classification histologique OMS 2017." } }, { "id": "215", "translation": { "en": "Multiple polymorphisms have been identified that impact our response to infections or to anti-infective drugs, and some of them are already used in the clinic.", "fr": "De nombreux polymorphismes modulant notre réponse aux infections ou à leurs traitements ont déjà été identifiés, et certains d'entre eux sont utilisés en clinique." } }, { "id": "216", "translation": { "en": "The problem can be decomposed as follows: • Segmentation of the nuclei • Detection of individual mRNAs (spot detection) • Estimation of the cytoplasmic regions from the RNA detection and nuclei segmentation results.", "fr": "Le problème peut être décomposé comme suit: • Segmentation des noyaux • Détection des ARNm individuels (détection ponctuelle) • Estimation des régions cytoplasmiques à partir des résultats de détection d'ARN et de segmentation des noyaux." } }, { "id": "217", "translation": { "en": "It comprises the 187 protein-DNA complexes in our benchmark, protein unbound forms and structures of other complexes where the proteins, or closed homologs, were in contact with other proteins.", "fr": "Elle inclut les 187 complexes protéine-ADN de notre ensemble de référence, les forme libres des protéines et les structures des autres complexes où ces protéines, ou des homologues proches, sont impliqués." } }, { "id": "218", "translation": { "en": "Interestingly, among these mRNAs, some key biological functions such as catabolism or autophagy are over-represented in most cancers.", "fr": "Pour la plupart des cancers, certaines fonctions biologiques importantes telles que le catabolisme ou l'autophagie sont sur-représentées parmi ces ARNm." } }, { "id": "219", "translation": { "en": "Complexity of biological systems originates not only from their emergent properties but also from the feedbacks exerted by these properties on elementary structures and mechanisms.", "fr": "La complexité des systèmes biologiques vient non seulement de leurs propriétés émergentes mais aussi des rétroactions que ces propriétés peuvent exercer sur les structures et mécanismes élémentaires." } }, { "id": "220", "translation": { "en": "I validated this approach by finding and completing the known OPR and PPR families in the model species Chlamydomonas reinhardtii and Arabidopsis thaliana.", "fr": "J'ai validé cette approche en retrouvant et complétant les familles OPR et PPR connues chez les espèces modèles Chlamydomonas reinhardtii et Arabidopsis thaliana." } }, { "id": "221", "translation": { "en": "The goal of our study was to characterize new target genes of this factor in humans.", "fr": "L'objectif de ma thèse était de caractériser de nouveaux gènes cibles de ce facteur chez l'homme." } }, { "id": "222", "translation": { "en": "We show that the non-redundant sampling estimator performs better than the naive counterpart in most cases, specifically where most of the search space is covered by the sampling.", "fr": "Nous montrons que l'estimateur des échantillons non-redondants est plus efficace que l'estimateur naïf, notamment dans les cas où la majorité des l'espace de recherche est échantillonné." } }, { "id": "223", "translation": { "en": "Within the scope of this thesis we used several cutting-edge sequencing approaches applied to renal disease's clinical research to: 1.", "fr": "Dans le cadre de cette thèse, nous avons utilisé plusieurs méthodes de pointe de séquençage appliquées à la recherche clinique sur la maladie rénale afin de: 1." } }, { "id": "224", "translation": { "en": "Finally a prediction method using neural network and SVM has been done to predict impact or not of mutation on phenotype. Symbiosis, a term that brings all types of species interaction under one banner, is defined as a close association of different species living together.", "fr": "Enfin, nous avons mis en place une méthode de prédiction utilisant réseaux de neurones et SVM pour prédire l'impact phénotypique d'une mutation Le terme symbiose recouvre tous types d'interactions entre espèces et peut être défini comme une association étroite d'espèces différentes vivant ensemble." } }, { "id": "225", "translation": { "en": "In this thesis, I develop a new sampling algorithm, Convective Replica-Exchange, sought to find probable structures more robustly.", "fr": "Dans cette thèse, je développe un nouvel algorithme d'échantillonnage, l'Échange de Répliques Convectif, qui perme de trouver des structures probables de façon plus robuste." } }, { "id": "226", "translation": { "en": "However, requirements can be even greater, depending upon what kinds of genomic events are to be found.", "fr": "Cependant, les exigences peuvent être encore plus grandes, selon les types d'événements génomiques à trouver." } }, { "id": "227", "translation": { "en": "IDHm enzyme inhibitors represent an innovative treatment strategy for a significant proportion of AML patients, as well as for patients with other malignant hematological diseases or solid tumours with IDH abnormalities, for whom these therapies are being considered or already in clinical trials.", "fr": "Les inhibiteurs des enzymes IDHm représentent une stratégie de traitement innovante pour une proportion significative de patients atteints de LAM, ainsi que pour des patients atteints d'autres d'hémopathies malignes ou tumeurs solides présentant des anomalies IDH, pour lesquels ces thérapies sont envisagées ou déjà en essai clinique." } }, { "id": "228", "translation": { "en": "The main biological focus is the search for signatures of symmetric versus asymmetric division mode in neural progenitors.", "fr": "Le principal objectif biologique est la recherche de signatures de mode de division symétrique et asymétrique au sein de progéniteurs neuronaux." } }, { "id": "229", "translation": { "en": "The third tool is CRISPRcompar for the identification and comparison of CRISPRs loci and their component determination.", "fr": "le troisième outil est CRISPRcompar qui sert à identifier et comparer les CRISPRs dans des génomes proches pour faciliter la procédure de typage." } }, { "id": "230", "translation": { "en": "Our second theoretical contribution is to identify four mechanisms of challenge to the industry's dominant logic: new value propositions, alliances with large diversifying entrants, orchestration of networks, and portfolios of business models.", "fr": "Notre seconde contribution théorique est d'identifier quatre mécanismes de remise en cause de la logique dominante d'une industrie :nouvelles propositions de valeur, alliances avec de grandes entreprises d'autres industries, orchestration de réseaux, et portefeuilles de business models." } }, { "id": "231", "translation": { "en": "Thus, predictions realized with the TOMOCOMD-CARDD software together with biological tests enable to identify the cyclocoumarol as a potential anti-inflammatory molecule.", "fr": "Ainsi, des prédictions réalisées avec le logiciel TOMOCOMD-CARDD combinées à des tests biologiques, ont permis d'identifier le cyclocoumarol comme une molécule potentiellement anti-inflammatoire." } }, { "id": "232", "translation": { "en": "For example, many researchers seek to understand whether there are convergent genetic bases underlying these phenotypic convergences.", "fr": "Par exemple, de nombreux chercheurs cherchent à comprendre s'il existe des bases génétiques convergentes sous-jacentes à ces convergences phénotypiques." } }, { "id": "233", "translation": { "en": "Using next generation sequencing (NGS) we screened STK11 mutations in a series of 567 resected NSCLC patients.", "fr": "Grâce à l'utilisation du séquençage de nouvelle génération (NGS), nous avons caractérisé les mutations STK11 dans une série de 567 patients opérés pour un CBNPC." } }, { "id": "234", "translation": { "en": "A bioinformatic functional analysis identified metabolic pathways in relation with p53 and cell cycle, as well as molecular mechanisms associated with thiopurine resistance.", "fr": "Une analyse fonctionnelle bioinformatique a abouti à l'identification de voies métaboliques liées à la protéine p53 et au cycle cellulaire, ainsi que des mécanismes moléculaires associés à la résistance aux thiopurines." } }, { "id": "235", "translation": { "en": "I shall discuss how the performances of these cartography solutions that have been developed here are impacted by the experimental limitations of the present technique, and by the bioinformatics limits.", "fr": "Je discuterais en quoi les performances des solutions de cartographie développées ici sont influencées par, d'une part les limites du montage expérimental actuel, et d'autre part les limites des approches bioinformatiques." } }, { "id": "236", "translation": { "en": "Studied since the 60s, this problem is notoriously difficult to solve by both exactly and approximate methods. Genome assembly requires some reads preprocessing, such as the correction of errors introduced by the sequencing.", "fr": "Ce problème étudié depuis les années 60 est notoirement difficile à résoudre de manière exacte et approchée.L'assemblage nécessite certains pré-traitements des lectures, comme par exemple la correction des erreurs dues au séquençage dans les lectures (au sens où on cherche à enlever les erreurs)." } }, { "id": "237", "translation": { "en": "In this study, we examined the effects of hybridization between the hexaploid American-native species Spartina alterniflora and the European species S. maritima, that gave rise to two F1 hybrids (S. x townsendii in England et S. x neyrautii in France) and the new invasive allododecaploid species (S. anglica).", "fr": "On s'intéresse plus particulièrement, à l'hybridation récente entre une espèce hexaploïde d'origine américaine Spartina alterniflora et une espèce hexaploïde européenne S. maritima ayant donnés deux hybrides F1 (S. x townsendii et S. x neyrautii) et la nouvelle espèce envahissante allododécaploïde (S. anglica)." } }, { "id": "238", "translation": { "en": "This project initially contributed to the development of an immunoassay detecting type II hCGß, specifically encoded by a subset of CGB genes and detected in the serum of patients with non-placental cancers and fetal Down Syndrome.", "fr": "Ce projet a contribué initialement au développement d'un test d'immunoanalyse qui détecte l'hCGß de type II, spécialement codée par un sous-groupe de gènes CGB et détectée dans le sérum de patients atteints de cancers non-placentaires et de trisomie 21 fœtale." } }, { "id": "239", "translation": { "en": "Numerous clinical studies aim to integrate immunotherapy in radiotherapy oncology, either for generating abscopal responses in metastatic patients in combination with radiotherapy, or in the treatment of a locally advanced tumor.", "fr": "De nombreuses études cliniques visent à intégrer l'immunothérapie en oncologie radiothérapie, soit pour favoriser des réponses abscopales en association à la radiothérapie chez des patients atteints de cancer métastatique, soit dans le cadre du traitement d'une tumeur localement évoluée." } }, { "id": "240", "translation": { "en": "In single-celled organisms, regulatory networks respond to the external environment, optimising the cell at a given time for survival in this environment.", "fr": "Dans les organismes unicellulaires, les réseaux de régulation répondent à l'environnement extérieur, optimisant la cellule à un instant donné pour sa survie dans cet environnement." } }, { "id": "241", "translation": { "en": "However the repeat overlap at the three level is weak and most repeats are only found at one level, this confirm the relevance of studying repeats at three levels at the same time. The study of long structural repeats shows that about 30% of these repeats are symmetrical at 180°, as are the two elements of a homodimer.", "fr": "Cependant, le recouvrement des répétitions aux trois niveaux est assez faible et beaucoup de répétitions ne sont trouvées qu'à un seul niveau, ce qui confirme l'intérêt de cette étude sur les trois niveaux en parallèle L'étude des répétitions structurales longues montre qu'environ 30% de ces répétitions sont symétriques à 180°, comme le sont les deux éléments d'un homo-dimère." } }, { "id": "242", "translation": { "en": "Our results showed that the differentiation of the myocardial progenitor cells required RA.", "fr": "Ces résultats montrent que l'AR est nécessaire à la différenciation de la population de cellules progénitrices du myocarde." } }, { "id": "243", "translation": { "en": "The algorithms and tools we made are all generic, they can be applied to extract any kind of structured signals that are common to a set of sequences.", "fr": "Les représentations, algorithmes et outils développés dans cette thèse sont généraux, et peuvent donc être appliqués à l'extraction de tous types de signaux structurés et approchés, communs à plusieurs séquences." } }, { "id": "244", "translation": { "en": "Finally, link prediction results will be examined and evaluated by experts on rare diseases.", "fr": "Enfin, les résultats de prédiction seront examinés et évalués par des experts des maladies rares." } }, { "id": "245", "translation": { "en": "HPRD contains manually curated scientific information pertaining to the biology of most human proteins.", "fr": "L'HPRD contient des data scientifiques manuellement organisées relatives à la biologie de la majorité des protéines humaines." } }, { "id": "246", "translation": { "en": "This increased protein synthesis is typically seen in proteins that modulate cell metabolism and growth processes.", "fr": "Cette augmentation de la synthèse protéique est généralement observée dans les protéines qui modulent le métabolisme cellulaire et les processus de croissance." } }, { "id": "247", "translation": { "en": "Efficiency of new generation sequencing methods and the reduction of their cost have led to use new methods based on big data to analyse genomic data.", "fr": "L'efficacité des méthodes de séquençage de nouvelle génération et la réduction de leur coût ont conduit à l'utilisation de nouvelles méthodes, basées sur le concept de l'analyse de big data, appliqué aux données génomiques." } }, { "id": "248", "translation": { "en": "Conclusions: the very high level of satisfaction promotes the maintenance and the development of this health insurance in Togo.", "fr": "Conclusion: le niveau de satisfaction très élevé encourage le maintien et le développement de ce régime d'assurance maladie au Togo." } }, { "id": "249", "translation": { "en": "One of the interesting applications of the graph matching problem is the alignment of protein-protein interaction networks. This problem is important when investigating evolutionary conserved pathways or protein complexes across species, and to help in the identification of functional orthologs through the detection of conserved interactions.", "fr": "Une application importante du problème d'alignement de graphes est l'alignement de réseaux d'interactions de protéines, qui joue un rôle central pour la recherche de voies de signalisation conservées dans l'évolution, de complexes protéiques conservés entre les espèces, et pour l'identification d'orthologues fonctionnels." } }, { "id": "250", "translation": { "en": "The highcontiguity of the assembly allowed to exhaustively detect the transposable elements, which represented over half the assembly, thus providing an unprecedented opportunity to investigate the uncharacterized regions of a tree genome.", "fr": "La grande contiguité de l'assemblage a permis de détecter les éléments transposables de façon exhaustive, ce qui fournit une opportunité sans précédents d'étudier les régions non-caractérisées d'un génome d'arbre." } }, { "id": "251", "translation": { "en": "My PhD work was also dedicated to the processing of the raw data from DMS experiments which were generated by our collaborators, O. Pereira-Ramos and L. Martin, in order to design a high affinity peptide for the protein Asf1 and to screen interaction surfaces between Asf1 and its binding partners.", "fr": "Mon travail de thèse a également été consacré au traitement des données de DMS générées avec nos collaborateurs O. Pereira-Ramos et L. Martin dans un cas de design de peptides à haute affinité pour la protéine Asf1 et pour le criblage des surfaces d'interaction de cette protéine avec ses partenaires." } }, { "id": "252", "translation": { "en": "In refractory disease we must rethink precision medicine in a more humanistic vision for our patients and not only in a dimension of medico-industrial promotion.", "fr": "Dans la maladie réfractaire, nous nous devons de repenser la médecine de précision dans une vision plus humaniste pour nos malades et non pas uniquement dans une dimension de promotion médico-industrielle." } }, { "id": "253", "translation": { "en": "Finally, gap safe screening rules speed up computations enough that our method can run at a genome-wide scale.", "fr": "Enfin, les règles \"Gap Safe Screening Rules\" accélèrent les calculs en permettant à nos méthodes de fonctionner à l'échelle génomique." } }, { "id": "254", "translation": { "en": "Opa1, a dynamin GTPase, is involved in the remodeling of the mitochondrial inner membrane, apoptosis, maintenance of mitochondrial DNA, and energy metabolism.", "fr": "Cette dynamine GTPase est impliquée dans le remodelage de la membrane interne mitochondriale, l'apoptose, la maintenance de l'ADN mitochondrial et le métabolisme énergétique." } }, { "id": "255", "translation": { "en": "Monoclonal antibodies have been a revolution for the treatment of chronic inflammatory diseases, but their use shows major drawbacks (non-response, resistance, side effects and prohibitive costs).", "fr": "Les anticorps monoclonaux anti-cytokine ont constitué une révolution dans le traitement des maladies inflammatoires chroniques, mais leur utilisation présente des inconvénients (non réponse, résistance, effets secondaires, coûts élevés)." } }, { "id": "256", "translation": { "en": "Firstly, this work describes two studies illustrating cases where DNA chips are a powerful exploratory tool allowing, by basic but adapted analysis, to discover tracks validated during complementary experiments.", "fr": "Ce travail décrit dans un premier temps deux études illustrant des cas où les puces à ADN sont un outil exploratoire performant ayant permis, par des analyses basiques mais adaptées, de découvrir des pistes validées au cours d'expériences complémentaires." } }, { "id": "257", "translation": { "en": "These results could provide new insights on clinical results conducted on the Pulmozyme®, a recombinant DNase I used in cystic fibrosis treatment.", "fr": "Ces résultats pourraient apporter un nouveau regard sur des résultats cliniques menés sur la Pulmozyme®, une DNase I recombinante utilisée dans le traitement de la mucoviscidose." } }, { "id": "258", "translation": { "en": "We propose new testing units to gather rare variants that are predefined on the whole-genome.", "fr": "Nous proposons de nouvelles unités prédéfinies sur tout le génome pour regrouper ces variants rares." } }, { "id": "259", "translation": { "en": "They are lighter and more adjustable than their binocular counterparts, can be integrated into any aircraft, and allow information to be retained regardless of gaze direction.", "fr": "Ils sont plus légers et plus ajustables que leurs homologuesbinoculaires, peuvent s'intégrer dans n'importe quel aéronef et permettent de conserver l'information quelle que soit la direction de regard." } }, { "id": "260", "translation": { "en": "Using a primary care pharmacogenetic database, we first analyzed TPMT distribution and genotype-phenotype correlation, in relation with thiopurine metabolites in a large population.", "fr": "A l'aide d'une base de données pharmacogénétiques hospitalière et d'une étude \" PheWAS \" à partir d'un entrepôt de données cliniques, nous avons analysé la distribution et la corrélation génotype-phénotype pour la TPMT, en lien avec les concentrations des métabolites thiopuriniques." } }, { "id": "261", "translation": { "en": "The biological activities of the isolated compounds were then evaluated.", "fr": "La valorisation des molécules isolées a ensuite été envisagée via l'évaluation de leurs activités biologiques." } }, { "id": "262", "translation": { "en": "It is thought that some genetic variants of malaria candidate genes affect malaria resistance through their effect on the acquired immune response.", "fr": "Il est très probable que certains variants génétiques de gènes candidats du paludisme affectent la résistance du paludisme à travers leur effet sur la réponse immunitaire acquise." } }, { "id": "263", "translation": { "en": "The end goal of radiomics is to determine imaging biomarkers as decision support tools for clinical practice and to facilitate better understanding of cancer biology, allowing the assessment of the changes throughout the evolution of the disease and the therapeutic sequence.", "fr": "L'imagerie médicale computationnelle a pour objectif final de déterminer des biomarqueurs d'imagerie apportant une aide à la décision médicale et permettant aussi de mieux comprendre la biologie du cancer." } }, { "id": "264", "translation": { "en": "Reusing healthcare administrative databases for public health research is relevant and opens new perspectives.", "fr": "Pour la recherche en santé publique, réutiliser les bases médicoadministratives est pertinent et ouvre de nouvelles perspectives." } }, { "id": "265", "translation": { "en": "We are studying Asterionella formosa, a freshwater pennate diatom. We characterized the community using a combination of omics and laboratory techniques.", "fr": "Nous avons étudié Asterionella formosa, une diatomée pennée présente dans de nombreux lacs et cours d'eau à l'aide de données omiques." } }, { "id": "266", "translation": { "en": "The use of a in silico/invitro hierarchical approach screening allowed to identify new IL-6 inhibitors, that could be used in rheumatoid arthritis treatment.", "fr": "L'application d'un protocole hiérarchique de criblage in silico/in vitro, a permis d'identifier de nouveaux composés inhibiteurs de l'IL-6, potentiellement utilisables dans le traitement de la polyarthrite rhumatoïde." } }, { "id": "267", "translation": { "en": "In this thesis, we study the structural context of RNA structural motifs in order to make progress in their prediction.", "fr": "Dans cette thèse, nous étudions le contexte structural de motifs structuraux d'ARN dans le but de progresser vers leur prédiction." } }, { "id": "268", "translation": { "en": "Sex determining (SD) mechanisms in teleost fishes have been investigated mainly at a macro-evolutionary scale highlighting a high turnover of master SD genes and their associated sex chromosomes.", "fr": "L'évolution des mécanismes de détermination du sexe (SD), qui a souvent été abordée principalement dans un contexte macro-évolutif chez les poissons, montre une variabilité saisissante des gènes SD et de leurs chromosomes sexuels associés." } }, { "id": "269", "translation": { "en": "This is illustrated by the integration of DOLPHIN data into UMD-Predictor, which increased its efficiency from 83 to 91.4% on the ClinVar reference dataset.", "fr": "Ceci est illustré par l'intégration des données de DOLPHIN dans UMD-Predictor qui voit son efficacité augmentée de 83 à 91,4% sur le jeu de données de référence ClinVar." } }, { "id": "270", "translation": { "en": "It will be completed, and inspired, by the development of Bioinformatics methods, not only dedicated to the search for structured homologous RNAs, but also to RNA (positive) design, a setting where the problem of a principled model simplification also naturally arise.", "fr": "Il sera complété, et inspiré, par des développements bioinformatiques, consacrés non-seulement à la recherche d'ARN dans les génomes, mais aussi au design positif d'ARN, où des problèmatiques de simplification de modèle apparaissent aussi naturellement." } }, { "id": "271", "translation": { "en": "We also generated a genome-wide genetic diversity map across 10 ecotypes of P. tricornutum revealing the presence of a species-complex within the genus Phaeodactylum as aconsequence of ancient hybridization (Chapter 3).", "fr": "Nous avons également généré une carte de la diversité génétique à l'échelle du génome chez 10 écotypes de P. tricornutum révélant ainsi la présence d'un complexe d'espèces dans le genre Phaeodactylum comme la conséquence d'une hybridation ancienne (chapitre 3)." } }, { "id": "272", "translation": { "en": "This mutation alone does not explain the phenotypic heterogeneity within MPN.", "fr": "Cette mutation, seule, n'explique pas l'hétérogénéité phénotypique au sein des NMP." } }, { "id": "273", "translation": { "en": "We wrote a review dedicated to the genomic contribution in comprehension of diversity, evolution and phenotypes, in a bacterial super-phylum named PVC (for Planctomycetes, Verrucomicrobiae and Chlamydiae).", "fr": "Nous avons rédigé une revue littéraire consacrée à la contribution de la génomique dans la compréhension de la diversité, de l'évolution et des phénotypes d'un super-phylum bactérien, le super-phylum PVC (Planctomycetes, Verrucomicrobiae et Chlamydiae)." } }, { "id": "274", "translation": { "en": "Aurora A in turn phosporylates a number of them, thus regulating their activity, localisation and stability.", "fr": "En retour Aurora A phosphoryle un bon nombre d'entre eux régulant ainsi leur activité, localisation et stabilité." } }, { "id": "275", "translation": { "en": "During this process, epithelial cells acquire the capacity to produce cytokines, chemokines, and autoantigens which can in turn be presented to the immune system.", "fr": "Lors de ce processus, la cellule épithéliale devient capable de synthétiser des cytokines, des chémokines, et des auto-antigènes qui seront présentés au système immunitaire." } }, { "id": "276", "translation": { "en": "The method is applied to three pulse experiments in Escherichia coli to show that it can retrieve connected active pathways and predict distinct directions for reversible reactions that are in accordance with known biological observations.", "fr": "La méthode est appliquée à trois expériences d'impulsions dans Escherichia coli pour montrer qu'elle peut récupérer des voies actives connectées et prédire des directions distinctes pour des réactions réversibles qui sont conformes aux observations biologiques connues." } }, { "id": "277", "translation": { "en": "From the resulting classification, a pattern recognition technique is used to reconstruct all combinations of switching thresholds that are consistent with measured data.", "fr": "À partir de la classification résultante, une technique de reconnaissance de forme est utilisée pour reconstruire toutes les combinaisons de seuils de transition qui sont cohérentes avec les données mesurées." } }, { "id": "278", "translation": { "en": "However, the ability of these fungi to compete with iron is likely a key factor of their virulence, as iron is involved in many essential biological processes.", "fr": "Cependant, l'aptitude de ces champignons à accéder aux ressources en fer constitue vraisemblablement un facteur clé de leur virulence, le fer étant impliqué dans de nombreux processus biologiques essentiels." } }, { "id": "279", "translation": { "en": "This paper will review the different types of molecular alterations and \" -omics \" biological analyses, bioinformatics tools, coupled drug/biomarkers already validated, the ethical issues of whole genomic sequencing of an individual as part of an inclusion in a clinical trial and finally the first results of precision medicine trials.", "fr": "Cette revue permettra de faire le point sur les différents types d'altérations moléculaires et d'analyses biologiques \" -omiques \", la notion de biomarqueurs, les outils bio-informatiques, les couples médicaments – biomarqueurs déjà validés, la problématique éthique considérant que le génome entier d'un individu peut être séquencé dans le cadre d'une inclusion dans un essai clinique, et enfin les premiers résultats des essais de la médecine de précision." } }, { "id": "280", "translation": { "en": "Identifying causative genetic variants is crucial.", "fr": "Il est crucial d'arriver à identifier les variants génétiques causaux." } }, { "id": "281", "translation": { "en": "As an example, one such motif is called feed-forward loops, which consist three nodes.", "fr": "À titre d'exemple, un tel motif est appelé boucles de rétroaction, qui consistent en trois nœuds." } }, { "id": "282", "translation": { "en": "With the increase of available experimental data, these two tasks can no longer be realized by hand.", "fr": "Avec l'augmentation du nombre de données expérimentales, elles ne peuvent plus être réalisées manuellement." } }, { "id": "283", "translation": { "en": "Within the framework of this collaboration, the team must analyze genomic data from an international psychiatry consortium, called PGC.", "fr": "Dans le cadre de cette collaboration, l'équipe doit analyser les données génomiques issues d'un consortium international de psychiatrie, appelé PGC." } }, { "id": "284", "translation": { "en": "Comparison of the repertoiresof two individuals uses the earth-mover distance (EMD). By exploiting amapping between the clonotypes of the repertoires, we show that EMD revealsinformation beyond classical methods based on diversity indexes. Tocharacterize the notion of public / private immune response, we quantify theoverlap of clonotypes between individuals of the same or different conditions This research project is focused on the link between chemical structures of odorant molecules and their interactions with odorant receptors expressed in olfactory neurons.", "fr": "Nous comparons lesrépertoires de deux individus en utilisant la \" earth-mover distance \", laquelleexploite la correspondance entre clonotypes de deux répertoires, révélant ainsides informations inaccessibles aux méthodes basées sur les indices dediversité.Dépôt de thèseDonnées complémentairesPour caractériser la notion de réponse immunitaire publique / privée, nousquantifions le chevauchement des clonotypes exprimés entre individus de lamême ou de différentes conditions Ce projet de recherche est focalisé sur le lien entre la structure des molécules odorantes et leurs interactions avec les récepteurs olfactifs exprimés dans les neurones olfactifs." } }, { "id": "285", "translation": { "en": "Exploiting the consistency of event-based cameras with the brightness constancy conditions, we discuss the availability of building a visual odometry system based on optical flow estimation.", "fr": "En exploitant la cohérence des caméras événementielles avec les conditions de constance de la luminosité, nous discutons de la possibilité de construire un système d'odométrie visuelle basé sur l'estimation du flot optique." } }, { "id": "286", "translation": { "en": "We have respected the curation and exchange standards of the IMEx consortium that includes MatrixDB.", "fr": "Nous avons respecté les standards de curation et d'échange de données du consortium IMEx dont fait partie MatrixDB." } }, { "id": "287", "translation": { "en": "The model predicts that an elevation of skin surface pH above physiologic levels accelerates the desquamation process through its action on serine proteases.", "fr": "Le modèle prédit qu'une augmentation du pH au-dessus de son niveau physiologique accélère la desquamation, à travers son action sur l'activité des protéases à sérine." } }, { "id": "288", "translation": { "en": "The bibliographic monographs of the species Pandanus utilis, Terminalia catappa, Tamarindus indica and Ravenala madagascariensis were therefore drafted and submitted to the ANSM.", "fr": "Les monographies bibliographiques des espèces Pandanus utilis, Terminalia catappa, Tamarindus indica et Ravenala madagascariensis ont donc été rédigées et soumises à l'ANSM." } }, { "id": "289", "translation": { "en": "In contrast with neurons, these cells do not propagate electrical signals but communicate instead through changes in their intracellular calcium concentration.", "fr": "Contrairement aux neurones, ces cellules ne transmettent pas de signaux électriques mais communiquent par des changements intracellulaires de leurs concentrations en calcium." } }, { "id": "290", "translation": { "en": "This leads us to define and validate the new SGD-QN algorithm.", "fr": "Cela nous amène à définir et étudier le nouvel algorithme, SGD-QN." } }, { "id": "291", "translation": { "en": "To have easily implantable algorithms and adaptable to changes in parameters and conditions of use, we favor the synthesis of Linear Parameter Varying (LPV) Unknown Input Observer (UIO), LPV quadratic state feedback, robust state feedback, and static output feedback controllers.", "fr": "Pour avoir des algorithmes facilement implantables et adaptables aux changements de paramètres et de conditions d'utilisation, nous privilégions la synthèse de l'Observateur d'Entrées Inconnues (UIO) à Paramètre Linéaire Variable (LPV), et des contrôleurs retour d'état quadratique LPV, retour d'état robuste et retour de sortie statique." } }, { "id": "292", "translation": { "en": "Is the grammatical formalism really relevant to the recognition of biological patterns?", "fr": "Le formalisme grammatical est-il vraiment pertinent pour modéliser des motifs biologiques ?" } }, { "id": "293", "translation": { "en": "Transcriptomic analyses showed mainly deregulated expression of genes involved inimmunity, inflammation, and signaling pathways, consistent with other published studies of murine models or MPN patient cells.", "fr": "Des analyses transcriptomiques ont montré une dérégulation d'expression des gènes principalement impliqués dans les voies de l'immunité, de l'inflammation et de la signalisation, concordante avec des études publiées à partir de modèles murins et de patients NMP." } }, { "id": "294", "translation": { "en": "These results indicate that synonymous mutations may play a major role in etiology of genetic disorders.", "fr": "Ces résultats indiquent que les mutations synonymes peuvent avoir un rôle majeur dans l'étiologie des maladies génétiques." } }, { "id": "295", "translation": { "en": "Limits of the current technologies, especially not covered regions, exist, but have been significantly reduced in the recent years.", "fr": "Des limites techniques inhérentes à la technologie, avec en particulier des régions non couvertes, existent, mais se sont également significativement réduites ces dernières années." } }, { "id": "296", "translation": { "en": "To conclude, we propose a methodology adapted to the needs for similar integration projects.", "fr": "Pour conclure, fort de l'expérience menée sur l'intégration et le partage, nous proposons une méthodologie adaptée aux besoins d'intégration pour des projets analogues." } }, { "id": "297", "translation": { "en": "The host and the symbiont phylogenies are usually considered as given and without any errors.", "fr": "Les phylogénies des hôtes et des symbiotes sont généralement considérés comme donnés, et sans aucune erreur." } }, { "id": "298", "translation": { "en": "This thesis aims to develop an intelligent invehicle Intrusion detection system (IDS) using machine learning (ml) from an automotive perspective, to assess and evaluate the impact of machine learning on enhancing the security of future vehicle intrusion detection system that fits in-vehicle computational constraints. Future In-vehicle network architecture is composed of different subsystems formed of other ECUs (Electronic Controller Units).", "fr": "Cette thèse vise à développer un system intelligent de détection d'intrusion en utilisant l'apprentissage automatique dans un contexte automobile. L'objectif est d'évaluer l'impact de l'apprentissage automatique sur l'amélioration de la sécurité des véhicules futurs (autonomes)." } }, { "id": "299", "translation": { "en": "The effectiveness of all approaches has been assessed through extensive experimental studies and compared with well-know state-of-the-art methods.", "fr": "L'efficacité de toutes les approches a été évaluée par des études expérimentales extensives, et comparée avec des méthodes bien connues de l'état de l'art." } }, { "id": "300", "translation": { "en": "The integration of these different data sources allows a better classification of lymphomas which are today divided into several dozen distinct entities in the last WHO classification.", "fr": "L'intégration de ces différentes sources de données a permis une meilleure classification des lymphomes aujourd'hui scindés en plusieurs dizaines d'entités distinctes." } }, { "id": "301", "translation": { "en": "Both case studies are limited by the fact that we would want some specific events, for example changes in management scenarios or species invasions, to occur only in a controlled manner.", "fr": "Ces deux études de cas sont limitées par le fait que l'on voudrait que certains événements, par exemple des changements de scénarios de gestion ou des invasions d'espèces, ne se produisent que d'une manière contrôlée." } }, { "id": "302", "translation": { "en": "However, despite this carbon reallocation, we showed that a shift from hexose accumulating metabolism to starch and amino acids accumulating metabolism, was inefficient to compensate the decrease in the total osmolarity, leading to the reduction of fruit size.", "fr": "Cependant, nous avons montré que cette réallocation du carbone (passage d'un métabolisme accumulant des hexoses à un métabolisme accumulant de l'amidon et des acides aminés) était inefficace pour compenser la diminution de l'osmolarité, conduisant à la réduction de la taille des fruits." } }, { "id": "303", "translation": { "en": "ICEs (Integrative Conjugative Elements) and IMEs (Integrative Mobilizable Elements) are bacterial mobile elements that play a key role in horizontal transfers.", "fr": "Les ICE (Éléments intégratifs conjugatifs) et les IME (Éléments intégratifs mobilisables) sont des éléments mobiles bactériens qui jouent un rôle clé dans les transferts horizontaux." } }, { "id": "304", "translation": { "en": "Finally, we have designed three PCR primer systems targeting a conserved gene that encodes an alanine-tRNA ligase, for an effective and specific identification of Acanthamoeba.", "fr": "Finalement, nous avons mis au point différents systèmes d'amorces permettant une identification des espèces d'Acanthamoeba." } }, { "id": "305", "translation": { "en": "My thesis concerns the study of holoprosencephaly (HPE) - an extremely severe cerebral pathology associated with a very low diagnostic yield due to its genetic complexity.", "fr": "Mes travaux de thèse concernent l'étude d'holoprosencéphalie (HPE) - une pathologie cérébrale extrêmement sévère, associée à un rendement diagnostique très faible due à sa complexité génétique." } }, { "id": "306", "translation": { "en": "Three different methods were developed and applied to the protein domain families of the ProDom-CG database.", "fr": "Trois méthodes différentes ont été développées et appliquées aux familles de domaines protéiques issues de la base de données ProDom-CG." } }, { "id": "307", "translation": { "en": "Among the potential factors inducing dysbiosis, bacteriophages, called phages, are relevant candidates by their predatory function. The aim of the thesis was to determine whether prophages of bacterial strains from the human gut microbiota have a negative impact on the stability of their host in the gut environment.", "fr": "Parmi les facteurs qui pourraient induire la dysbiose, les bactériophages (dit phages), sont des candidats pertinents par leur fonction prédatrice.L'objectif de la thèse a été de déterminer si les prophages de souches bactériennes du microbiote intestinal humain ont un impact négatif sur la stabilité de leur hôte dans l'intestin." } }, { "id": "308", "translation": { "en": "Septic shock is the combination of a severe sepsis and a hemodynamic dysfunction characterized by an acute fall in blood pressure that cannot be corrected by a procedure of vascular filling.", "fr": "Le choc septique est l'association d'un état septique grave et d'une défaillance hémodynamique caractérisée par une chute aiguë de la pression artérielle ne pouvant pas être corrigée par une procédure standard de remplissage vasculaire." } }, { "id": "309", "translation": { "en": "Integrative analysis of epigenomic and transcriptomic data in normal T-cell precursors and primary T-ALLs lead to the identification of an alternative promoter of ATP2C1 as frequently up-regulated in T-ALL patients.", "fr": "L'analyse intégrative des données épigénomiques et transcriptomiques des précurseurs normaux des lymphocytes T et des LAL-T primaires a conduit à l'identification d'un promoteur alternatif de l'ATP2C1 comme étant fréquemment régulé à la hausse chez les patients LAL-T." } }, { "id": "310", "translation": { "en": "Extracted CBPV RNAs were used for in vitro translation experiments.", "fr": "Les ARN extraits du CBPV ont été utilisés dans des expériences de traduction in vitro." } }, { "id": "311", "translation": { "en": "In this particular context, the structural annotations of the genes and of the LRR motifs in the protein sequences obtained by generic tools contain many errors.", "fr": "Dans ce contexte particulier, les annotations structurales des gènes et celles des motifs LRR dans les séquences protéiques obtenues par les outils génériques contiennent beaucoup d'erreurs." } }, { "id": "312", "translation": { "en": "Within the epigenetic markers, DNA methylation holds a crucial position: indeed, its reprogramming is indispensable to the fundamental processes that are germinal cell differentiation, spermatogenesis and the embryonic development.", "fr": "Parmi les marques épigénétiques, la méthylation de l'ADN tient une place essentielle : son remaniement est en effet indispensable aux processus fondamentaux que sont la différenciation des cellules germinales, la spermatogénèse et le développement embryonnaire précoce." } }, { "id": "313", "translation": { "en": "Method. Urinary DNA was extracted from 81 patients with superficial bladder cancer and has been hybridized on the BCA-oligo array.", "fr": "Méthode L'ADN de 81 échantillons urinaires de patients atteints d'un cancer de vessie superficiel a été extrait et hybridé sur la puce BCA-oligo." } }, { "id": "314", "translation": { "en": "The present thesis project demonstrates that a population of CD4+ T lymphocytes called regulatory T cells (Tregs), which express the transcription factor Forkhead box P3 (Foxp3), is responsible for TGF-beta activation in tumors.", "fr": "Ces travaux de thèse démontrent qu'une population de lymphocytes T (LT) CD4+ dite T régulateurs (Tregs), qui exprime le facteur de transcription Forkhead box P3 (Foxp3), est responsable de l'activation du TGF-bêta au sein de la tumeur." } }, { "id": "315", "translation": { "en": "This program uses the same dynamic programming algorithm at all levels and a sequential representation of 3D structures.", "fr": "Ce programme utilise le même algorithme de programmation dynamique à tous les niveaux et une représentation séquentielle des structures 3D." } }, { "id": "316", "translation": { "en": "This second part of the study, performed on a collection of strains also gathered by the SSA, has lead to the identification of a new, previously unknown, lineage of the MTBC.", "fr": "Cette seconde partie de l'étude, menée sur une collection à nouveau constituée par le SSA, a conduit à l'identification d'une nouvelle lignée au sein du MTBC, jusqu'alors inconnue." } }, { "id": "317", "translation": { "en": "The higher expression of miR-92a and the down regulation of FOXP1 mRNA and proteinwere also found in human samples of PMBL, while miR-92a expression was low and FOXP1was high in DLBCL.", "fr": "L'expression plus élevée de miR-92a et la sous-expression de FOXP1 au niveau ARN et protéique a également été retrouvé dans les prélèvements humains de PMBL, alors que le niveau d'expression de miR-92a était bas et FOXP1 était haut dans les DLBCL." } }, { "id": "318", "translation": { "en": "One of the current challenges is to reconstruct pathobiomes from metabarcoding data, in order to identify potential biocontrol agents and to monitor in real time their responses to environmental changes.", "fr": "L'un des défis actuels consiste à reconstruire les pathobiomes à partir de données de metabarcoding, pour identifier des agents potentiels de biocontrôle et pour surveiller en temps réel leurs réponses aux changements environnementaux." } }, { "id": "319", "translation": { "en": "The proteomics analysis of the bioinformatics data identifies PGC-1[alpha], ERR[alpha] and PPAR[alpha] as major determinants of changes in protein expression of mitochondrial oxidative metabolism.", "fr": "L'étude protéomique du myocarde et l'analyse des données par bioinformatique identifient PGC-1[alpha], PPAR[alpha] et ERR[alpha] comme principaux déterminants des variations d'expression des protéines du métabolisme oxydatif mitochondrial." } }, { "id": "320", "translation": { "en": "It is modelled as a maximum clique problem in alignment graphs, for which we design a dedicated solver with very good performances.", "fr": "Elle est modélisée comme une recherche de clique maximum dans des graphes d'alignements, pour laquelle nous présentons un solveur dédié montrant de très bonnes performances." } }, { "id": "321", "translation": { "en": "The basic ideas of LanderWaterman theory led to a number of additional results for particular variations in mapping techniques.", "fr": "Les idées de base de la théorie de Lander-Waterman ont conduit à l'obtention d'un certain nombre de résultats supplémentaires concernant des variations particulières des techniques de cartographie." } }, { "id": "322", "translation": { "en": "Molecules directly encoded by the genome, such as nucleic acids, proteins and peptides derived from proteins by proteolytic cleavage, are not as a rule included in ChEBI.", "fr": "Les molécules directement codées par le génome, telles que les acides nucléiques, les protéines et les peptides dérivés de protéines par clivage protéolytique, n'y sont généralement pas répertoriées." } }, { "id": "323", "translation": { "en": "The second condition I studied is the abdominal aortic aneurysm (AAA), a common disorder with a strong hereditary component and rare situations of fully penetrant, dominant inheritance.", "fr": "La seconde pathologie étudiée, l'anévrysme de l'aorte abdominale (AAA), est une maladie commune à forte composante héréditaire, avec de rares formes dominantes à pénétrance élevée." } }, { "id": "324", "translation": { "en": "In this thesis, we propose a method set for mining the molecular biology literature and extracting relevant facts about human gene expression regulation We first present a generic methodology to extract potential named entities from texts.", "fr": "Dans cette thèse, nous proposons un ensemble de méthodes pour fouiller la littérature de biologie moléculaire et extraire les faits pertinents en relation avec l'expression de gènes humains. Nous présentons tout d'abord une procédure générique destinée à l extraction d'entités nommées candidates à partir des textes." } }, { "id": "325", "translation": { "en": "My PhD work consisted of developing a set of bioinformatics methods to perform DNA mapping using magnetics tweezer signal consisting of hybridization positions along the studied molecule.", "fr": "Mon travail de thèse consiste à développer un ensemble de méthodes bio-informatique visant à réaliser cette étape de cartographie. Le signal expérimental consiste en lecture des positions d'hybridation d'un, ou de plusieurs petits oligonucléotides sur la molécule étudiée." } }, { "id": "326", "translation": { "en": "Darwin exposed to the world that living species continuously evolve. Yet the molecular mechanisms of evolution remain under intense research.", "fr": "Darwin a révélé au monde que les espèces vivantes ne cessent jamais d'évoluer, mais les mécanismes moléculaires de cette évolution restent le sujet de recherches intenses." } }, { "id": "327", "translation": { "en": "In order to complete analysis of the post-translational modifications, we studied the modifications of O-GlcNAc for each one of these proteins.", "fr": "Afin de compléter l'analyse des modifications post-traductionnelles, nous avons étudié les modifications de O-GlcNAc pour chacune de ces protéines." } }, { "id": "328", "translation": { "en": "High viral richness is also observed in savannah areas.", "fr": "Une richesse virale importante est également observée dans les zones de savane." } }, { "id": "329", "translation": { "en": "The first part of my thesis project has consisted in characterizing inherited genetic factors modifying cancer risk in women participating in the prospective cohort CoF-AT (“cohorte de femmes apparentées à un enfant atteint d'A-T).", "fr": "Dans le premier volet de ma thèse, j'ai recherché des facteurs génétiques constitutionnels pouvant modifier le risque de cancer chez les femmes de la cohorte CoF-AT (cohorte de femmes apparentées à un enfant atteint d'A-T)." } }, { "id": "330", "translation": { "en": "The results demonstrate the polyphyletic nature of the Derby serovar with 3 genetically distant lineages. Four different MLST profiles were identified within the strains analysed (ST39, ST40, ST71 and ST682).", "fr": "Les résultats démontrent la nature polyphylétique du sérovar Derby avec 3 lignées génétiquement distantes caractérisées par 4 profils MLST (ST39, ST40, ST71 and ST682)." } }, { "id": "331", "translation": { "en": "Thus, we introduce the MAXIMUM COLORFUL ARBORESCENCE problem (MCA) in order to de novo determine the molecular formula of unknown metabolites.", "fr": "Ainsi, on introduit le problème MAXIMUM COLORFUL ARBORESCENCE (MCA) dans le but de déterminer de novo la formule moléculaire de métabolites inconnus." } }, { "id": "332", "translation": { "en": "In addition, we built a bioinformatic tool to screen the whole fungal kingdom for sesquiterpene synthases (STS), which are involved in the synthesis of secondary metabolite used by the fungi to compete with other microorganisms in their natural habitat.", "fr": "De plus, nous avons développé un outil bioinformatique pour l'identification, dans l'ensemble du règne fongique, des enzymes impliquées dans la cyclisation des sesquiterpènes, métabolites secondaires impliqués dans la communication chimique entre micro-organismes dans leur habitat naturel." } }, { "id": "333", "translation": { "en": "Over the course of treatment, genetic heterogeneity and effective population size in the NS5B regions increases sharply after treatment initiation compared to baseline.", "fr": "Au cours du traitement, l'hétérogénéité génétique et la taille efficace de la population dans la région NS5B augmente fortement après le début du traitement." } }, { "id": "334", "translation": { "en": "Nowadays, we know that RNA interference is a major regulatory process involved in developmental biology and tumor progression.", "fr": "Nous savons aujourd'hui que le rôle de l'interférence par l'ARN est fondamental, dans le développement embryonnaire comme dans la progression tumorale." } }, { "id": "335", "translation": { "en": "This metabolic endotoxemia associated with a chronic immuno-inflammatory reaction contributes to the development and/or aggravation of metabolic disorders.", "fr": "Cette endotoxémie métabolique associée à une réaction immuno-inflammatoire chronique peut contribuer au développement et/ou à l'aggravation de troubles métaboliques." } }, { "id": "336", "translation": { "en": "Hypergraphs are a generalization of graphs in which edges are not just couples of nodes but arbitrary n-tuples.", "fr": "Les hypergraphes sont une généralisation des graphes dans lesquels les arêtes ne sont pas seulement des couples de nœuds mais des n-uplets arbitraires." } }, { "id": "337", "translation": { "en": "Recently, in silico research of pathways common to the different genes described to be involved in both PN and deafness, has found the direct link between PMP22 and MPZ.", "fr": "Dernièrement, la recherche in silico de voies communes aux différents gènes décrits comme impliqués dans NP+surdité a permis de confirmer le lien direct entre PMP22 et MPZ." } }, { "id": "338", "translation": { "en": "We further developed Hi-C aggregation plots to enable the analysis of asymmetric LRIs such as enhancer-promoter or insulator-promoter contacts, by orientating the sub-matrices before aggregation.", "fr": "Nous avons développé une méthode basée sur la visualisation par agrégation permettant l'analyse de LRIs asymétriques telles que présentes dans les contacts enhancer-promoteur et insulateur-promoteur, en orientant les sous matrices avant l'agrégation." } }, { "id": "339", "translation": { "en": "One of the important problems encountered in this study was the selection of alternative transcripts and this led me to develop a software called BATfinder (Best Aligned Transcript finder ).", "fr": "Un problème important rencontré dans cette étude a consisté en la sélection de transcrits alternatifs et ceci m'a conduit à développer un logiciel dédié nommé BATfinder (\\Best Aligned Transcript finder)." } }, { "id": "340", "translation": { "en": "In this thesis, we propose two approaches for selecting representative subgraphs among frequent ones in order to remove redundancy.", "fr": "Dans cette thèse, nous proposons deux approches de sélection des sous-graphes représentatifs parmi les fréquents a n d'éliminer la redondance." } }, { "id": "341", "translation": { "en": "Moreover, this analysis and the identification of expressed variants allowed us to identify frequent mutations of tumor suppressor genes such as ATRX (16% of cases) and more generally members of the SWI/SNF complex (47% of cases).", "fr": "De plus, cette analyse ainsi que l'identification de variants exprimés nous ont permis d'identifier de fréquentes mutations de gènes suppresseurs de tumeurs tels qu'ATRX (16% des tumeurs) et plus généralement des membres du complexe SWI/SNF (47% des tumeurs)." } }, { "id": "342", "translation": { "en": "To our knowledge, this is the first test on the context of survival analysis.", "fr": "À notre connaissance, il s'agit du premier test sur le contexte de l'analyse de survie." } }, { "id": "343", "translation": { "en": "Hidden Markov Models (HMMs) - from Pfam database for example - are popular tools for protein domain annotation.", "fr": "Les modèles de Markov cachés (MMC) - par exemple ceux de la librairie Pfam - sont des outils très populaires pour l'annotation des domaines protéiques." } }, { "id": "344", "translation": { "en": "Among them is Selenoprotein N or SelenoN; mutations in the SELENON gene can lead to a group of congenital dystrophies now designated as SELENON-related myopathies.", "fr": "Parmi elles, la sélénoprotéine N ou SelenoN ; des mutations dans le gène SELENON donnent lieu à un groupe de dystrophies musculaires congénitales appelées myopathies liées à SELENON." } }, { "id": "345", "translation": { "en": "Last but not least, my thesis was dedicated to the generation of a macrophage cell model, based on THP-1 cellsand gene editing by CRISPR-Cas9.", "fr": "Une partie de ma thèse a été consacrée à la mise en place d'un modèle cellulaire macrophagique basé sur une édition génique de cellules THP-1 par CRISPR-Cas9." } }, { "id": "346", "translation": { "en": "In 2016, this species invaded Africa and devastated crop fields.", "fr": "En 2016, cette espèce a envahi l'Afrique et dévasté les champs de culture." } }, { "id": "347", "translation": { "en": "We therefore created AMYPdb (AMYloid Protein database), the first database dedicated to amyloid proteins.", "fr": "Dans ce but, nous avons créé AMYPdb (AMYloid Protein database), la première base de données de données dédiée à ces protéines." } }, { "id": "348", "translation": { "en": "We review some of the strategies that can be applied for personalization to combined radiotherapy and immunotherapy treatments.", "fr": "Nous passons en revue certaines des stratégies applicables pour la personnalisation aux traitements associant radiothérapie et immunothérapie." } }, { "id": "349", "translation": { "en": "Finally, we search for the X circular code motifs in the complete DNA sequences of chromosomes of the eukaryotic genomes.", "fr": "Enfin, nous avons généralisé la recherche de motifs de code circulaire X dans l'ADN aux chromosomes d'eucaryotes complets." } }, { "id": "350", "translation": { "en": "Nodes still represent genes and connections between them regulatory influences on gene expression.", "fr": "Les nœuds représentent toujours les gènes et les connexions entre eux influencent la régulation de l'expression des gènes." } }, { "id": "351", "translation": { "en": "We characterized fusion transcripts in these tumors by high-throughput sequencing (RNA-seq).", "fr": "Nous avons caractérisé les transcrits de fusion exprimés dans ces tumeurs par séquençage haut-débit (RNA-seq)." } }, { "id": "352", "translation": { "en": "This analysis is more complex and can be hazardous in the context of a candidate gene approach.", "fr": "Cette approche s'est révélée plus complexe à mettre en place, et son efficacité peut être discutée dans le cas d'une étude d'association centrée sur un gène candidat." } }, { "id": "353", "translation": { "en": "We then applied FORCE and PLINK on psoriasis case-control data from the WTCCC.", "fr": "Nous avons ensuite utilisé FORCE et PLINK pour analyser un jeu de données du WTCCC, concernant psoriasis." } }, { "id": "354", "translation": { "en": "Live cell imaging is an excellent tool to study in detail the consequences of chemical perturbation on a given biological process.", "fr": "L'imagerie sur cellules vivantes est un excellent outil pour étudier en détail les conséquences d'une perturbation chimique sur un processus biologique." } }, { "id": "355", "translation": { "en": "We use in this thesis notions of combinatorics, mathematics, graph theory and algorithmics.", "fr": "Nous utilisons, dans ce manuscrit, des notions d'optimisation combinatoire, de mathématiques, de théorie des graphes et d'algorithmique." } }, { "id": "356", "translation": { "en": "The model I propose is that the two secreted effectors, LphD and RomA, work together to hijack the host's epigenetic machinery in order to facilitate the subversion of the host immune response and promotes the intracellular replication of L. pneumophila.", "fr": "Le modèle que je propose est que les deux effecteurs sécrétés, LphD et RomA, travaillent ensemble pour détourner la machinerie épigénétique de l'hôte afin de faciliter la subversion de la réponse immunitaire et favoriser la réplication intracellulaire de L. pneumophila." } }, { "id": "357", "translation": { "en": "In this thesis we present four applications in bioinformatics with Markov models.", "fr": "Dans cette thèse nous présentons quatre applications en bioinformatique avec des modèles de Markov." } }, { "id": "358", "translation": { "en": "It has recently been shown that macrophages are essential for replication of Burkholderia cenocepacia and for triggering acute pro-inflammatory and fatal infection in zebrafish larvae.", "fr": "Nous avons récemment démontré que les macrophages sont essentiels pour la réplication de Burkholderia cenocepacia, et pour le développement d'une infection pro-inflammatoire aigue et fatale dans des embryons de poisson zèbre." } }, { "id": "359", "translation": { "en": "In this study, I used populations of a common tree species of the Guiana Shield - Eperua falcata (Fabaceae) - to study how neutral and adaptive processes shape the distribution of genetic diversity across forest landscapes characterized by local micro-habitat patchiness.", "fr": "Dans cette étude, j'ai étudié le processus de différentiation génétique d'une espèce d'arbre (Eperua falcata, Fabaceae) dans les paysages forestiers de Guyane française grâce à la combinaison d'une approche phénotypique (génétique quantitative) et d'une approche moléculaire (génétique des populations)." } }, { "id": "360", "translation": { "en": "The discovery of the first cytochrome P450 from Citrus involved in the production of these compounds, opens up new prospects for the elucidation of their biosynthetic pathway in citrus Molecular evolution, based on the study of sequencing data, established itself as a fundamental approach in the study of the history of living organisms (noticeably through the inference of phylogenetic trees).", "fr": "La découverte du premier cytochrome P450 de Citrus intervenant dans la production de ces composés, ouvre de nouvelles perspectives quant à l'élucidation de leur voie de biosynthèse chez les agrumes. L'évolution moléculaire, basée sur l'étude des données de séquençage, s'est imposée comme une approche majeure pour l'étude de l'Histoire des organismes vivants (notamment à travers les arbres phylogénétiques)." } }, { "id": "361", "translation": { "en": "Significant advances in early diagnosis, prognostic markers, therapeutic response and toxic effect indicators, together with the identification of new potential drug targets, have improved the survival of patients with breast cancer.", "fr": "Les progrès significatifs enregistrés ou attendus dans le diagnostic précoce, la prédiction du pronostic, de la réponse thérapeutique ou de la toxicité, ainsi que l'identification de nouvelles cibles thérapeutiques devraient permettre l'amélioration de la survie des cancers du sein." } }, { "id": "362", "translation": { "en": "According to the nature of the data and the type of technologies, speedup from 3 to 20 has been measured compared with the reference software, BLAST, with the same level of quality.", "fr": "En fonction de la nature des données et des technologies employées des accélérations de 3 à 20 ont été mesurées par rapport à la référence du domaine, le logiciel BLAST, pour un niveau de qualité équivalent." } }, { "id": "363", "translation": { "en": "In order to dissect the genes that enable the diversification of committed muscle cells to attain their final identity, we generated transcriptomics data for mRNA under translation in two muscle subsets expressing the iTFs Lms and Slou and the Duf+ global muscle RNA by TRAP as well as global embryonic mRNA over three time windows of development.", "fr": "Afin d'identifier les gènes de la diversification musculaire, nous avons généré les données de transcriptomique par TRAP dans deux sous-ensembles musculaires exprimant les iTFs Lms et Slou. Nous avons également extrait l'ARN musculaire global Duf+ ainsi que les ARNm embryonnaire global sur trois fenêtres temporelles de développement." } }, { "id": "364", "translation": { "en": "Our working hypothesis was that these melanomas occur as a result of a de novo genetic accident.", "fr": "Notre hypothèse de travail était que ces mélanomes surviennent suite à un accident génétique de novo." } }, { "id": "365", "translation": { "en": "This strategy can be applied for other immune cells, other diseases, and even in a physiological setting, so as to functionally map immune cells.", "fr": "Cette stratégie peut donc être appliquée pour d'autres types de cellules que les cellules T, d'autres pathologies que le cancer, et même dans un contexte physiologique, afin de cartographier les fonctions des cellules immunitaires." } }, { "id": "366", "translation": { "en": "The aim of my PhD work was first to automatize the PRODISTIN method, developped in the lab in order to extract biological information from interaction networks, and to expand it to weighted networks.", "fr": "Mon travail de thèse a consisté dans une première étape à automatiser la méthode PRODISTIN, développée au laboratoire dans le but d'extraire de l'information biologique des réseaux d'interactions, et à la faire évoluer vers la prise en compte de la pondération des arêtes du réseau." } }, { "id": "367", "translation": { "en": "It has been shown in vitro that when a double-stranded break of the DNA is non-homologously repaired, the strand used for repairing is close in space to the breakpoint.", "fr": "Il a été montré in vitro que lors d'une cassure double-brin suivie d'une réparation non-homologue, le brin utilisé pour la réparation se situe spatialement proche de la cassure." } }, { "id": "368", "translation": { "en": "To extend the study of this intriguing trans effect, we developed a bioinformatic tool called DeMinEr that unveiled that MARsEμ regions were also involved in AID-induced collateral damages to \"off-targets\". Using FISH 3D, we show that MARsEμ regions harboured the potential not only to locally recruit SHM but also to cause dynamic changes of nuclear structures. The surprising cis and trans effect of MARsEμ deletion, impacting simultaneously nuclear positioning and SHM, revealed an additional level of regulation for targeting mutations to Ig and \"off-targets\" genes.", "fr": "A l'aide d'une outil bioinformatique (DeMinEr) que nous avons développé dans le but d'identifier des mutations rares, nous montrons également que les régions MARsEμ sont impliquées dans les dommages collatéraux infligés aux \"off targets\" des cellules B. Grâce à la technique de FISH 3D, nous proposons que les régions MARsEμ participent à la régulation de la SHM en influençant la position des cibles de AID dans le noyau des cellules B. Notre étude met en évidence un niveau de régulation spatiale du processus de SHM médié par les régions MARsEμ du locus IgH." } }, { "id": "369", "translation": { "en": "(2) The DHODases superfamily (after DHOases) show a similar phylogeny as DHOases, including enzymes from other pathways, DHPDases in particular (after DHPases).", "fr": "(2) L'étude de la superfamille des DHODases (qui suivent les DHOases) montre une phylogénie semblable aux DHOases, avec également des enzymes d'autres voies, dont les DHPDases (qui suivent les DHPases)." } }, { "id": "370", "translation": { "en": "For that, a conduction velocity vector field is estimated and analyzed.", "fr": "Pour cela, un champ vectoriel de vitesse est estimé et analysé." } }, { "id": "371", "translation": { "en": "Additional methods include the Min Cut Supertree approach, Most Similar Supertree Analysis MSSA, Distance Fit DFIT and Quartet Fit QFIT, implemented in the software CLANN.", "fr": "Les méthodes supplémentaires incluent la Min Cut Supertree approach, la Most Similar Supertree Analysis MSSA, la Distance Fit DFIT et la Quartet Fit QFIT, implémentées dans le logiciel CLANN." } }, { "id": "372", "translation": { "en": "Sixty percent of PPIs annotated in HPRD are supported by a single experiment whereas 26 of them are found to have two of the three experimental methods annotated.", "fr": "Soixante pour cent des IPP annotés dans l'HPRD sont supportés par une seule expérimentation, alors que 26 entre eux ont deux des trois méthodes expérimentales annotées." } }, { "id": "373", "translation": { "en": "The objectives of the thesis project will be : (1) by integrating genomic data from high throughput sequencing generated by the team on primary samples of LAM IDHm patients (gene expression, methylation, hydroxymethylation), to identify the molecular mechanisms and biological pathways associated with the response to the allosteric inhibitors AG-221 and AG-120; interest will be given to demethylation dynamics as a contribution to the restoration of TET2 protein activity (2) identify the somatic variants acquired during resistance to the inhibitor ivosidenib, in matched samples of AML IDH1m patients (diagnosis/relapse) (3) to initiate a meta-analysis integrating these data with those of other tumour pathologies with IDH anomalies available in the literature. This study is located at the interface of molecular biology, bioinformatics and the clinic.", "fr": "Le projet de thèse aura pour objectifs (1) par l'intégration de données génomiques issues du séquençage à haut débit générées par l'équipe sur des échantillons primaires de patients LAM IDHm (expression génique, methylation, hydroxymethylation), d'identifier les mécanismes moléculaires et les voies biologiques associés à la réponse aux inhibiteurs allostériques AG-221 et AG-120 ; un intérêt sera porté à la dynamique de déméthylation signant une contribution d'une restauration de l'activité de la protéine TET2 (2) identifier les variants somatiques acquis lors de la résistance à l'inhibiteur ivosidenib, dans des échantillons appariés de patients LAM IDH1m (diagnostic/rechute) (3) d'engager une meta-analyse intégrant ces données à celles d'autres pathologies tumorales présentant des anomalies IDH disponibles dans la littérature ou localement (collections CIT), afin d'établir des Cette étude se situe à l'interface de la biologie moléculaire, la bioinformatique et la clinique." } }, { "id": "374", "translation": { "en": "Multiple substrates are targets for proteostatic degradation.", "fr": "Les substrats multiples sont des cibles pour la dégradation protéostatique." } }, { "id": "375", "translation": { "en": "Given the key role of TFs in phenotype establishment, this PhD aim at identify the TFs involved in that of the mutant phenotype of T. lutea.A TFs identification and classification pipeline was elaborated and applied to T. lutea's genome.", "fr": "Compte tenu du rôle clé des FTs dans l'établissement du phénotype, cette thèse vise à identifier les FTs impliqués dans la mise en place de ce phénotype mutant. Un pipeline bio-informatique d'identification et classification des FTs présents dans le génome de T. lutea a été élaboré." } }, { "id": "376", "translation": { "en": "Because of the limited number of patients with certain diseases and the lack of knowledge about them, diagnosis for patients is often delayed.", "fr": "En raison du nombre limité de patients atteints de certaines maladies et du manque de connaissances à leur sujet, le diagnostic pour les patients est souvent retardé." } }, { "id": "377", "translation": { "en": "Interesting results were obtained highlighting the influence of active site volume and opening on methods performances.", "fr": "D'intéressants résultats ont été obtenus mettant en évidence l'influence du volume et de l'ouverture des sites actifs sur les performances des méthodes." } }, { "id": "378", "translation": { "en": "We found that constitutive expression of shvR in B. cenocepacia H111 increased virulence in zebrafish larvae to almost K56-2 levels in an afc dependent manner, which strengthens the finding that AFC is a key factor in acute virulence of B. cenocepacia K56-2, and strengthens our hypothesis that differences in regulatory signals between strains may be a major reason for differences in pathogenicity.", "fr": "Nous avons montré que l'expression constitutive de shvR dans H111 augmente la virulence de la souche dans les embryons de poisson zèbre, à un niveau similaire à K56-2, dépendamment de la présence de afc. Ceci renforce notre hypothèse que AFC est un facteur clé pour la virulence aigue, et que la différence de pathogénicité observée entre différentes souches pourrait être due à des différences de régulation." } }, { "id": "379", "translation": { "en": "The second objective is to make accessible and exploitable the data generated during this thesis for the largest number of people.", "fr": "Le deuxième objectif est de rendre accessibles et exploitables les données générées au cours de cette thèse pour le plus grand nombre." } }, { "id": "380", "translation": { "en": "This change in physicochemical property of the pocket is probably a major determinant in the acquisition of the transport property of di-protonated CQ from the digestive vacuole to the cytoplasm of the parasite.", "fr": "Ce changement de propriété physico-chimique de la poche du transporteur est probablement un déterminant majeur de l'acquisition de la propriété de transport de la CQ di-protonée de la vacuole digestive vers le cytoplasme du parasite." } }, { "id": "381", "translation": { "en": "In this thesis, we propose a refined modeling framework ABAN (Asynchronous Binary Automata Network) and develop reachability analysis techniques based on ABAN: PermReach (Reachability via Permutation search) and ASPReach (Reachability via Answer Set Programming).", "fr": "Ici, nous proposons un cadre de modélisation raffiné ABAN (Asynchronous Binary Automata Network) et développons des outils pour analyser l'atteignabilité : PermReach (Reachability via Permutation search) et ASPReach (Reachability via Answer Set Programming)." } }, { "id": "382", "translation": { "en": "Recent developments in whole genome sequencing and in machine learning algorithms provide huge opportunities that are largely unexploited in antibiotic resistance.", "fr": "Les développements récents dans le séquençage génomique et en apprentissage automatique bien que impressionnants ne sont pas exploités dans la résistance aux antibiotiques." } }, { "id": "383", "translation": { "en": "We develop a versatile formalism to calculate the asymptotic distribution of the FDP an the associated regularity conditions, for a wide range of multiple testing procedures, and compare their asymptotic power.", "fr": "On introduit un formalisme flexible qui permet de calculer la loi asymptotique du FDP et les conditions de régularité associées pour une vaste famille de procédures de tests multiples, et de comparer la puissance de ces procédures." } }, { "id": "384", "translation": { "en": "It has been favoured by the use of the universal Luer connector for medical devices with a risk of confusion with the intravenous route.", "fr": "Elles sont favorisées par la connexion universelle Luer® utilisée pour la connectique des dispositifs médicaux avec un risque de confusion avec la voie intraveineuse." } }, { "id": "385", "translation": { "en": "Among them, two showed an antiplasmodial activity (pancixanthone B and pratensein), three a selective antiinflammatory activity (6-methoxy-7-hydroxyflavanol, 3-(2',3'-dihydroxy-4'-methoxyphenyl)-5,7-dihydroxyisoflavanone and khrinone C) and eight a cytotoxic activity (three inophyllums, three triterpenes, pyranojacareubin and afromorsin).", "fr": "Parmi ces composés, deux ont montré une activité antiplasmodiale (la pancixanthone B et la pratenséine), trois une activité antiinflammatoire et sélective (le 6-méthoxy-7-hydroxyflavanol, la 3-(2',3'-dihydroxy-4'-méthoxyphényl)-5,7-dihydroxy-isoflavanone et la khrinone C) et huit une activité cytotoxique (trois inophyllums, trois triterpènes, la pyranojacareubine et l'afromorsine)." } }, { "id": "386", "translation": { "en": "In the third part, we analysed the sequence-dependent structural properties of the bacterium genome.", "fr": "La troisième partie porte sur les propriétés structurelles séquence-dépendantes du chromosome de Buchnera." } }, { "id": "387", "translation": { "en": "Our work has led to the development of novel bioinformatics tools that should contribute to a better understanding of mitochondrial pathophysiology.", "fr": "À travers ces deux approches, nous avons pu développer de nouveaux outils bio-informatiques qui devraient contribuer à une meilleure compréhension de la physiopathologie mitochondriale." } }, { "id": "388", "translation": { "en": "In this work, TP53INP1 expression was analyzed in pancreatic tumors in order to study this potential suppressive role.", "fr": "Dans ce travail, l'expression de TP53INP1 a été analysée dans des tumeurs pancréatiques pour étudier ce rôle potentiel." } }, { "id": "389", "translation": { "en": "Among others, this manuscript introduces a self calibration algorithm for Inertial Measurement Units (IMUs) alignment.", "fr": "En outre, ce manuscrit introduit un algorithme d'auto-calibration pour l'alignement des unités de mesure inertielle (IMU)." } }, { "id": "390", "translation": { "en": "Canonical role of XPC is to recognize UV DNA damage and allowed DNA reparation by Nucleotide Excision Repair mechanism (NER).", "fr": "Le rôle canonique de XPC est la reconnaissance des dommages à l'ADN induits par les UVs et permet la réparation de l'ADN par le mécanisme de réparation par excision de nucléotide (NER)." } }, { "id": "391", "translation": { "en": "This is being tested with a cosmological simulation workflow application called RAMSES.", "fr": "Les tests ont été effectuées sur une simulation de cosmologie appelée RAMSES." } }, { "id": "392", "translation": { "en": "A theoretical approach, based on computer simulations, was initiated to evaluate medium-term influence of a geographically restrained fishing pressure on global patterns of genetic variability in dendritic river networks.", "fr": "Une approche théorique, basée sur les outils de simulation, a été amorcée pour évaluer l'influence à moyen-terme d'une pression de pêche géographiquement localisée sur les patrons généraux de variabilité génétique au sein des réseaux hydrographiques dendritiques." } }, { "id": "393", "translation": { "en": "Analyses show an over-expression of X-linked genes in females in cell types where an atypical inactivation status is observed.", "fr": "Des analyses montrent une sur-expression de gènes liés au chromosome X chez la femelle dans les types cellulaires où un statut atypique de l'inactivation est observé." } }, { "id": "394", "translation": { "en": "Combining innovative software that leverages the power of statistical smoothing algorithms and a strong biological rationale, this study thus contributed to the identification of megabase-scale patterns of hypomethylation distinguishing early pregnancy from late pregnancy placenta cells as they distinguish normal from cancers cells.", "fr": "En combinant, des logiciels innovants reposant sur la puissance d'algorithmes de lissage statistique et sur un solide rationnel biologique, cette étude a ainsi contribué à l'identification de motifs d'hypométhylation à l'échelle du mégabase distinguant les cellules placentaires du début de la grossesse de celles de la fin de la grossesse tout comme ils distinguent les cellules cancéreuses des cellules normales." } }, { "id": "395", "translation": { "en": "In the model plant Arabidopsis thaliana, 51 genas encoding LEA proteins have been previously identified.", "fr": "Chez la plante modèle Arabidopsis thaliana, 51 gènes codant des protéines LEA ont été identifiés précédemment." } }, { "id": "396", "translation": { "en": "Genome is subdivided in euchromatin and heterochromatin domains.", "fr": "Le génome est subdivisé en euchromatine et hétérochromatine." } }, { "id": "397", "translation": { "en": "Our third contribution is managerial.", "fr": "Notre troisième contribution est managériale." } }, { "id": "398", "translation": { "en": "Although GCs are extensively used to treat inflammatory diseases and antiandrogens for prostate cancer, long-term treatments induce major side effects such as muscle atrophy.", "fr": "Même si les GCs sont fréquemment utilisés pour traiter les maladies inflammatoires et les antiandrogènes pour le cancer de la prostate, les traitements à long terme induisent des effets secondaires majeurs, notamment l'atrophie musculaire." } }, { "id": "399", "translation": { "en": "They also enable to generate data converters to use between services in workflows.", "fr": "Elles permettent également de générer des convertisseurs de données à utiliser entre services dans les workflows." } }, { "id": "400", "translation": { "en": "Nevertheless, many questions still remain, and more specifically the question of the importance and frequency of horizontal transfers in nature.", "fr": "Néanmoins, de nombreuses questions subsistent encore en raison des limites liées aux méthodes utilisées pour caractériser les transferts horizontaux chez les eucaryotes et du manque d'études menées directement dans les écosystèmes naturels." } }, { "id": "401", "translation": { "en": "It is generally believed that the Rut sites are, respectively, rich and poor in Cytosines and Guanines as well as relatively poor in secondary structures.", "fr": "Il est généralement admis que les sites de fixation de Rho présentent une richesse en Cytosines et une pauvreté en Guanines, ainsi qu'une relative pauvreté en structures secondaires." } }, { "id": "402", "translation": { "en": "Lastly, I uncover signatures of the ancestral host-pathogen co-evolution in the topology of a host protein interaction network.", "fr": "Enfin, j'ai mis en évidence des signatures de la co-évolution ancestrale hôte-pathogène dans l'organisation topologique du réseau d‘interactions entre protéines de l'hôte." } }, { "id": "403", "translation": { "en": "Moreover, this study suggests that RA is a modifier of 22q11microdeletion (DiGeorge syndrome) in patient. In a collaborative work, we have analyzed the role of RA in differentiation of ventricular myocardium progenitors.", "fr": "Nos résultats suggèrent que l'AR estun modificateur de la micro-délétion 22q11 (syndrome de DiGeorge) chez l'homme, ceci pouvant expliquer en partie la grande variabilité des malformations cardiaques des patients DiGeorge.J'ai aussi participé à l'étude du rôle de l'AR dans la différenciation des progéniteurs du myocarde ventriculaire." } }, { "id": "404", "translation": { "en": "ANA-3 (SHWaglu, GH97), and the development of their overexpression and purification protocols.", "fr": "ANA-3 (SHWaglu, GH97), exposent la mise au point de leurs protocoles de surexpression et de purification." } }, { "id": "405", "translation": { "en": "Thus, the crystallographic structure of Rv0813c of Mycobacterium tuberculosis (Mtb) reveals the existence of a whole family of proteins restricted to bacteria, highly similar to eukaryotic proteins binding lipids.", "fr": "Ainsi, la structure cristallographique de Rv0813c de Mycobacterium tuberculosis (Mtb) révèle l'existence de toute une famille de protéines restreintes aux bactéries, ressemblant beaucoup aux protéines eucaryotes liant des acides gras." } }, { "id": "406", "translation": { "en": "Imatinib mesylate, a tyrosine kinase inhibitor, specifically eliminates CML cells by targeting and blocking the kinase activity of this protein, yet, as for all targeted therapies in cancer, resistance to treatment exists.", "fr": "L'imatinib mesylate, un inhibiteur de tyrosine kinase, élimine de manière spécifique les cellules leucémiques en ciblant et en bloquant l'activité kinase de cette protéine. Malheureusement, comme pour tout type de thérapie ciblée, une résistance au traitement survient chez certains patients." } }, { "id": "407", "translation": { "en": "I integrated gene expression data and networks to identify such modules.", "fr": "J'ai intégré des données d'expression génique et des réseaux pour identifier de tels modules." } }, { "id": "408", "translation": { "en": "To date, no adjuvant therapy has proven effective following the initial treatment of ocular melanoma.", "fr": "De plus, à ce jour, aucune thérapie adjuvante n'a montré son efficacité après le traitement du mélanome oculaire primaire." } }, { "id": "409", "translation": { "en": "This newly identified Coronavirus was further analysed and characterised.", "fr": "Ce nouveau coronavirus a fait l'objet d'études complémentaires afin de le caractériser." } }, { "id": "410", "translation": { "en": "A theoretical framework is defined to extend causal inference methods to the evaluation of such precision medicine algorithms.", "fr": "Un cadre théorique est proposé pour étendre les méthodes d'inférence causale à l'évaluation de tels algorithmes de médecine de précision." } }, { "id": "411", "translation": { "en": "From this model, an approach for the \" de novo protein sequencing \" problem has been proposed and validated. In this problem, a protein sequence has to be found with only spectral information.", "fr": "Ce modèle d'identification a permis ensuite de proposer et de valider une modélisation pour le problème de \" de novo protein sequencing \" qui consiste à retrouver la séquence d'une protéine à partir seulement des données expérimentales." } }, { "id": "412", "translation": { "en": "Cell imaging also allows to quantify biological processes at the cellular level, to analyse both stoechiometry and dynamics of molecular interactions involved in cell and tissue regulations.", "fr": "Leur quantification a l'echelle de la cellule unique est maintenant possible. L'imagerie cellulaire fournit des resultats pertinents sur la stoechiometrie et la dynamique des interactions moleculaires impliquees dans les regulations cellulaires." } }, { "id": "413", "translation": { "en": "These maps reflect in a synthetic manner the propensity of the surface of proteins to interact with other proteins.", "fr": "Ces cartes (en deux dimensions) reflètent de manière synthétique la propension des surfaces protéiques à engager des interactions avec d'autres protéines." } }, { "id": "414", "translation": { "en": "Today, detecting the set of transcripts that can be expressed by a gene is an open problem to which many computational methods such as RNA sequencing, spliced sequence alignment methods or comparative genomics methods try to address.", "fr": "Détecter l'ensemble des transcrits pouvant être exprimés par un gène est aujourd'hui un problème ouvert auquel de nombreuses méthodes informatiques telles que le séquençage des données de l'ARN, les méthodes d'alignements de séquences épissées ou encore les méthodes de génomiques comparative tentent de répondre." } }, { "id": "415", "translation": { "en": "Better knowledge of the factors that drive recombination (crossovers; COs) in bread wheat (Triticum aestivum L.) is of main interest since this process is the main tool allowing breeders to admix the genetic diversity and to introgress regions of interest in agronomic varieties.", "fr": "Mieux connaitre les facteurs qui gouvernent l'apparition des évènements de recombinaison (crossing-overs ; CO) chez le blé tendre (Triticum aestivum L.) est primordial car ce processus est l'outil principal du sélectionneur pour permettre le brassage de la diversité génétique et l'introgression de régions d'intérêt dans des variétés agronomiques." } }, { "id": "416", "translation": { "en": "Our method is empirically validated on several databases, performing better than the state of the art.", "fr": "Dans un premier temps, nous validons empiriquement notre approche en obtenant des performances supérieures à l'état de l'art sur de nombreux jeux de données." } }, { "id": "417", "translation": { "en": "We finish this thesis by a discussion on load balancing of the solutions suggested and on the predictivity of the adaptation of other systolic solutions to CGM.", "fr": "Nous finissons cette thèse par une discussion sur l'équilibrage de charge des solutions proposées et sur la prédictivité de l'adaptation d'autres solutions systoliques au modèle CGM." } }, { "id": "418", "translation": { "en": "In addition, I propose a method for extracting the biological rules identified by the model for each mutation evaluated, allowing an informed selection of candidate mutations.I discuss the functional properties identified by the learning model, based on examples of non-coding variations associated with Mendelian diseases.", "fr": "Par ailleurs, je propose une méthode d'extraction des règles biologiques identifiées par le modèle pour chaque mutation évaluée, ce qui permet une sélection éclairée des mutations hiérarchisées. Je discute les propriétés fonctionnelles identifiées par le modèle d'apprentissage, à partir d'exemples de variations non-codantes associées à des maladies mendéliennes." } }, { "id": "419", "translation": { "en": "Using the tools we developed, we propose a putative regulatory network and analyze it to rank the relevance of central regulators.", "fr": "En utilisant les outils que nous avons développés, nous proposons un réseau de régulation putatif et analysons la pertinence de ses régulateurs centraux." } }, { "id": "420", "translation": { "en": "The direct or indirect binding of these regulatory proteins to cis-regulatory elements allows the regulation of genes in space and time.", "fr": "La fixation directe ou indirecte de ces protéines régulatrices sur les éléments cis-régulateurs permettent une régulation des gènes dans l'espace et dans le temps." } }, { "id": "421", "translation": { "en": "We proposed a binding site of carbendazime on the tubulin-colchicine complex, using docking and molecular dynamics simulation, which lead to the design of hybrid molecules composed of both colchicines and carbendazime moieties attached with a linker.", "fr": "Nous avons proposé un site de fixation du carbendazime dans les complexes tubuline-colchicine à l'aide de l'amarrage moléculaire et de simulations de dynamiques moléculaires. Ces expériences ont mené au design de molécules hybrides composées des noyaux colchicine et carbendazime reliés par un linker." } }, { "id": "422", "translation": { "en": "We will take into account the presence of the binding pocket and the 3D geometry of the environment.", "fr": "Nous prendrons en compte la présence de la poche de reliure et la géométrie 3D de l'environnement." } }, { "id": "423", "translation": { "en": "The organisms studied for this project are the human immunodeficiency virus (HIV) and the hepatitis C virus (HCV), both of which are responsible for long-term illnesses, treated with antiviral therapy and responsible for millions of infections worldwide.", "fr": "Les organismes étudiés pour ce projet sont le virus de l'immunodéficience humaine (VIH) et le virus de l'hépatite C (VHC), tous deux responsables d'affections longue durée, traitées par traitements antiviraux et responsables de millions d'infections à travers le monde." } }, { "id": "424", "translation": { "en": "Such antibodies may be isolated from nonhumanprimates, whose immunization is much easier to conceive and realized thanimmunization of humans.", "fr": "De tels anticorps peuvent être isolés à partir de primates non humains, dont l'immunisation est plus facile à concevoir et à réaliser que l'immunisation d'humains." } }, { "id": "425", "translation": { "en": "Radiation-induced toxicity of the digestive tract is a major clinical concern as many cancer survivors have received radiotherapy for tumours of the abdominopelvic area.", "fr": "French La toxicité digestive radio-induite est une préoccupation clinique majeure car de nombreux patients survivants du cancer ont bénéficié d'une radiothérapie pour des tumeurs de la zone abdominopelvienne." } }, { "id": "426", "translation": { "en": "RNA-based fluorogenic modules are extremely promising tools to reach this goal. To this end, two light-up RNA aptamers (Spinach and Mango) display attractive properties but they suffer from a limited brightness.", "fr": "Les ARN fluorogènes tels que Spinach et Mango sont des outils extrêmement prometteurs pour atteindre cet objectif. Cependant ces deux ARN fluorogènes présentent une brillance limitée." } }, { "id": "427", "translation": { "en": "Therefore, one of the major challenges in radiobiology is to accurately predict tumour radioresistance and to determine normal tissue radiosensitivity to tailor treatment.", "fr": "Un des défis actuels en radiobiologie consiste donc à prédire avec exactitude le risque de radiorésistance du tissu tumoral de même qu'à déterminer l'existence d'une radiosensibilité du tissu sain périphérique afin de proposer un traitement à la carte pour chaque patient." } }, { "id": "428", "translation": { "en": "We intend to fill this important methodological gap.", "fr": "Nous avons l'intention de combler cette importante lacune méthodologique." } }, { "id": "429", "translation": { "en": "A targeted sequencing of these genes was performed for 40 more patients, with a confirmed mosaic SNV in 17, and a global diagnostic yield of 55% (46/84).", "fr": "Une étude ciblée de ces gènes chez 40 autres patients était positive pour 17, soit un rendement diagnostique global à 55% (46/84)." } }, { "id": "430", "translation": { "en": "CGGA is a knowledge-based approach which automatically integrates gene expression profiles and gene annotations obtained from genome-wide information databases such as Gene Ontology.", "fr": "CGGA est une méthode de l'approche a priori qu'intègre l'information issue des données des biopuces, i.e. les profils d'expression des gènes, avec les annotations fonctionnelles des gènes issues des différentes sources d'information génomique tel que Gène Ontologie." } }, { "id": "431", "translation": { "en": "Metabolomic data suggests that even though these species are extremely similar from a genomic and metabolic point of views, the products and reaction rates differ and gene regulation may interfere directly in metabolism.", "fr": "Les données de métabolomique suggèrent que même si ces espèces sont extrêmement similaires du point de vue de leurs génomes et des métabolismes, les produits et les taux de réaction diffèrent et la régulation des gènes peuvent interférer directement dans le métabolisme." } }, { "id": "432", "translation": { "en": "I first looked for signs of RNA toxicity in OLs and characterised myelin phenotypes in DMSXL mice.", "fr": "J'ai d'abord caractérisé la toxicité des ARN CUG dans les OL et les phénotypes de la myéline dans les DMSXL." } }, { "id": "433", "translation": { "en": "This thesis proposes a co-similarity based algorithm that is based on the concept of distributional semantics using higher-order co-occurrences, which are extracted from the given data.", "fr": "Dans cette thèse, nous proposons une mesure de co-similarité basée sur la notion de co-occurrences d'ordre supérieur, directement extraites à partir des données." } }, { "id": "434", "translation": { "en": "However, recent evidences have shown that ncRNAs, in particular lncRNAs, are actively implicated in various cancer processes.", "fr": "Toutefois, des preuves récentes ont montré que les ARN non-codants, en particulier les lncRNAs, sont activement impliqués dans divers processus de cancer." } }, { "id": "435", "translation": { "en": "It is also possible to classify these methods according to the data provided, only bacterial and/or resistance gene identification or also bacterial susceptibility to antibiotics.", "fr": "Il est possible également de classer ces méthodes suivant qu'elles ne permettent que des identifications (bactérienne et/ou gènes résistance aux antibiotiques) ou également une étude de la sensibilité à certains antibiotiques." } }, { "id": "436", "translation": { "en": "This implementation was realized thanks to, but also for projects of studies of epigenetic mechanisms, mainly centered around the human thymopoiesis and the murine spermatogenesis.", "fr": "Cette implémentation a été réalisée grâce à, mais aussi pour des projets d'études de mécanismes épigénétiques, principalement centrés autour de la thymopoïèse humaine et de la spermatogénèse murine." } }, { "id": "437", "translation": { "en": "Although this problem has numerous applications (consensus among user votes, consensus between results ordered differently by different search engines ...), computing an optimal consensus is rarely feasible in cases of real applications (problem NP-Hard).", "fr": "Bien que ce problème ait de très nombreuses applications (consensus entre les votes d'utilisateurs, consensus entre des résultats ordonnés différemment par divers moteurs de recherche...), calculer un consensus exact est rarement faisable dans les cas d'applications réels (problème NP-difficile)." } }, { "id": "438", "translation": { "en": "These mutations pose a problem for the correct estimates of biodi- versity and for the taxon assignation process.", "fr": "Ces mutations posent un grand problème pour les estimations correctes de la biodiversité et pour le d'assignation de taxon." } }, { "id": "439", "translation": { "en": "Finally, we identify a hypervirulent phenotype associated with ΔesxUT deletion characterized by increased animal mortality and bacterial growth in mice and zebrafish.", "fr": "Enfin, nous identifions un phénotype hypervirulent associé à ΔesxUT, caractérisé par une augmentation de la mortalité et de la croissance bactérienne chez la souris et le poisson zèbre." } }, { "id": "440", "translation": { "en": "Indeed, more than 80% of all proteins are estimated to interact transiently/permanently with other molecules in the cell [1].", "fr": "En effet, plus de 80% de l'ensemble des protéines est estimé à avoir des interactions transitoires/permanentes avec d'autres molécules dans la cellule [1]." } }, { "id": "441", "translation": { "en": "Furthermore, a process of integration of genotype and epigenotype data has been started, which underlines the potential interaction between these levels of information.", "fr": "De plus, une démarche d'intégration des données de génotype et d'épigénotype a été amorcée, soulignant les interactions potentielles en ces strates d'informations." } }, { "id": "442", "translation": { "en": "Indeed, the process of drug development is currently estimated to require about 1.8 billion US dollars over about 13 years on average.", "fr": "En effet, on estime actuellement que le développement d'un médicament nécessite environ 1,8 milliard de dollars américains sur environ 13 ans." } }, { "id": "443", "translation": { "en": "In a third step, we study the predictive ability of the common topological context of A-minor motif occurrences, sharing similar 3D contexts, as well as the predictive ability of a sequence signal on these same occurrences.", "fr": "Dans un troisième temps, nous étudions la capacité de prédiction du contexte topologique commun à des occurrences de motif A-minor, partageant des contextes 3D similaires, ainsi que la capacité de prédiction d'un signal de séquence sur ces mêmes occurrences." } }, { "id": "444", "translation": { "en": "We demonstrated that there is a geographically restricted cluster of S. saprophyticus circulating in Marseille community as compared to Nice.", "fr": "Nous avons démontré qu'il existe un groupe de S. saprophyticus géographiquement restreint à Marseille comparé au souches de Nice." } }, { "id": "445", "translation": { "en": "Breeding can use genetic variability and epigenetics modifications highlighted in recent years.", "fr": "L'amélioration des variétés peut se baser sur la variabilité génétique, mais également sur les modifications épigénétiques mises en évidence ces dernières années." } }, { "id": "446", "translation": { "en": "Such developments will open the way to a better description of the 3D nucleus that we hope will benefit the largest number of researcher in the field and advance our knowledge on the role of the nucleus in the regulation of gene expression.", "fr": "De tels développements ouvriront la voie à une meilleure description du noyau en 3D et, nous l'espérons, bénéficieront au plus grand nombre de chercheurs dans le domaine de l'imagerie 3D dédiée à la microscopie afin de faire progresser nos connaissances sur le rôle du noyau dans la régulation de l'expression des gènes." } }, { "id": "447", "translation": { "en": "holarctica LVS, responsible for tularemia, allowed us to identify the most abundant proteins and peptides, and for which the most intense signals are observed when using mass spectrometry.", "fr": "holarctica LVS, responsable de la tularémie, a permis d'identifier les protéines et les peptides les plus abondants donnant un signal intense par spectrométrie de masse." } }, { "id": "448", "translation": { "en": "Bacteria belonging to the Burkholderia cepacia complex (Bcc) are life threatening opportunistic pathogens of cystic fibrosis patients and an emerging cause of serious infections in immune-compromised individuals.", "fr": "Les bactéries apparentant au complexe Burkholderia cepacia sont des pathogènes opportunistes chez les patients atteints de mucoviscidose, et sont responsables de sérieuses infections chez les individus immunodéprimés." } }, { "id": "449", "translation": { "en": "Considering a growing world population and the increasing impact of global warming, major gains in crop improvement are required to ensure food security for future generations. Breeding programs rely on the variation generated by the genetic reshuffling that occurs during meiosis via the crossovers (CO, reciprocal exchanges of large DNA fragments between chromosomes).", "fr": "L'augmentation de la population mondiale et l'impact croissant du réchauffement climatique imposent une accélération des programmes de sélection variétale qui reposent sur la variation générée au cours de la méoise par les crossing-overs (CO, échanges réciproques de fragments d'ADN entre chromosomes)." } }, { "id": "450", "translation": { "en": "Androgen receptor (AR), a member of the nuclear receptor family, remains themajor actor in the development of prostate cancer.", "fr": "Le récepteur aux androgènes (AR), membre de la famille desrécepteurs nucléaires, reste toutefois l'acteur majeur de l'évolution du cancer de la prostate." } }, { "id": "451", "translation": { "en": "Thus gene regulatory networks approximate a hierarchical scale free network topology.", "fr": "Ainsi, les réseaux de régulation des gènes se rapprochent d'une topologie de réseau sans échelle hiérarchique." } }, { "id": "452", "translation": { "en": "Identifying their role helps to understand and potentially control these processes.", "fr": "Identifier leurs fonctions aide à comprendre et éventuellement à contrôler ces processus." } }, { "id": "453", "translation": { "en": "Since these criteria are qualitative rather than quantitative, diagnosis often depends on the sensitivity and the experience of the pathologist.", "fr": "Ces critères étant qualitatifs et non quantitatifs, le diagnostic dépend souvent de la sensibilité et de l'expérience du pathologiste." } }, { "id": "454", "translation": { "en": "We propose here new methods for the analysis protein-protein interfaces of pharmaceutical interest.", "fr": "Nous proposons ici de nouvelles méthodes d'analyse des interfaces protéine-protéine à visée pharmaceutique." } }, { "id": "455", "translation": { "en": "With mitoXplorer 2.0, scientists interested in deciphering mitochondrial dynamics are provided with the most complete web-based platform dedicated to mitochondria available at date.", "fr": "Avec mitoXplorer 2.0, les scientifiques disposent de la plateforme web la plus complète dédiée aux mitochondries à ce jour." } }, { "id": "456", "translation": { "en": "Then, a global quantification method was optimized for the monitoring of protein impurities present in the final drug substances, which represent a real analytical challenge.", "fr": "Par la suite, une méthode de quantification globale a été optimisées pour le suivi des impuretés protéiques présentes dans les substances médicamenteuses finales qui représentes un véritable défi analytique." } }, { "id": "457", "translation": { "en": "When a cell's DNA is damaged, the DNA damage checkpoint detects it and stops the cell cycle, allowing time for the cell to repair its DNA.", "fr": "Lorsque l'ADN d'une cellule est endommagé, le point de contrôle des dommages à l'ADN les détecte et arrête le cycle cellulaire, laissant ainsi du temps pendant lequel la cellule peut réparer son ADN." } }, { "id": "458", "translation": { "en": "The deregulation of epigenetic mechanisms plays a major role in the pathophysiology of AML.", "fr": "La dérégulation des mécanismes épigénétiques joue un rôle majeur dans la physiopathologie des LAM." } }, { "id": "459", "translation": { "en": "This strategy aim, from a set of clusterings of a patient cohort obtained by considering various omics data and/or different existing clustering algorithms, to produce a consensus clustering by reconciling all the predictions contained in the clusterings submitted as input to the algorithm.", "fr": "Cette stratégie permet, à partir de clusterings de cohortes de patients obtenus en considérant diverses données omiques et/ou différents algorithmes de clusterings existants, de produire un clustering consensus en réconciliant l'ensemble des prédictions contenues dans les clusterings soumis en entrée de l'algorithme." } }, { "id": "460", "translation": { "en": "NetGate creates libraries containing hundreds of enzymatic logic gates obtained from the metabolic networks of living organisms.", "fr": "NetGate, qui va créer des bibliothèques contenant des centaines de portes logiques enzymatiques obtenues à partir de réseaux métaboliques d'organismes existants." } }, { "id": "461", "translation": { "en": "A weighting parameters estimation method based on a stochastic optimization process has been designed to allow the incorporation of new types of data, like inter- and intra-genomic homology information.", "fr": "Une méthode d'estimation des paramètres du modèle basée sur une procédure d'optimisation stochastique des performances a permis la prise en compte de nouvelles informations, comme des données d'homologie inter- et intra-génomique." } }, { "id": "462", "translation": { "en": "Few studies based on machine learning approaches suggested the use of reject-option in decision support systems.", "fr": "Des études basées sur des approches d'apprentissage computationnel suggèrent l'utilisation d'une option de rejet dans les systèmes de décision." } }, { "id": "463", "translation": { "en": "The impact of these results is crucial and would lead to therapyand cardiac muscle repair.", "fr": "La portée de ces résultats est importante et pourra conduire à plus long terme à la thérapie et la réparation du muscle cardiaque." } }, { "id": "464", "translation": { "en": "I also developed a new method of community detection.", "fr": "J'ai aussi développé une nouvelle approche de détection de communautés." } }, { "id": "465", "translation": { "en": "Antiviral research is a recent discipline and the number of molecules available to fight against viral infections remains still insufficient.", "fr": "La recherche antivirale est une discipline encore récente et le nombre de molécules disponibles pour lutter contre les infections virales demeure insuffisant." } }, { "id": "466", "translation": { "en": "Studying LRR-containing genes and their evolution is essential to understand how new resistances emerge, disappear or are maintained in plants, as well as to develop new breeding strategies.", "fr": "Étudier ces gènes et leur évolution est essentiel non seulement pour comprendre comment les résistances émergent, disparaissent ou se maintiennent chez les plantes, mais aussi pour mettre en place de nouvelles stratégies de sélection variétale." } }, { "id": "467", "translation": { "en": "This and other configurations were already modeled with approaches from game theory and economics.", "fr": "Ceci et d'autres configurations ont déjà été modélisées avec des approches de la théorie des jeux et de l'économie." } }, { "id": "468", "translation": { "en": "Transcriptomic analysis revealed a high degree of similarity between the dystrophic muscle and a normal muscle that ectopically overexpressed the 14-DD-miRNAs, supporting that DD-miRNAs mediate mitochondrial adaptation in DMD.", "fr": "Une analyse transcriptomique a montré une importante similitude entre le muscle dystrophique et un muscle normal surexprmant ectopiquement les DD-miRNAs, suggèrant que les DD-miRNAs puissent médier l'adaptation mitochondriale dans DMD." } }, { "id": "469", "translation": { "en": "A consensus among the members of the Committee was obtained in order to synthesize the current data, with a particular focus on the practical considerations regarding indications and developments of molecular testing circuits concerning DNA repair genes, for theranostics purpose.", "fr": "Un consensus entre les membres du Comité a été obtenu afin de faire la synthèse des données actuelles, avec un focus particulier sur les considérations pratiques de l'indication et de la mise en place des circuits d'analyse moléculaire concernant les gènes de réparation de l'ADN, à visée théranostique." } }, { "id": "470", "translation": { "en": "Conclusion: Tunisian travellers' knowledge of malaria is insufficient.", "fr": "Conclusion: les connaissances des voyageurs tunisiens à propos du paludisme sont insuffisantes." } }, { "id": "471", "translation": { "en": "Further analysis of the transcriptomic data, as well as of copy number alteration data revealed that both subtypes may rely on different pathways and oncogenes.", "fr": "Grâce à une étude plus approfondie des transcriptomes et de données d'altérations génomiques, nous avons ensuite montré que les sous-types dépendent de voies de signalisation et d'oncogènes différents." } }, { "id": "472", "translation": { "en": "It is applied to model regulations responsible for amphibian metamorphosis.", "fr": "Ceci est alors appliqué pour modéliser les régulations responsables de la métamorphose amphibienne." } }, { "id": "473", "translation": { "en": "In the first one, we investigated the assessment of the robustness of complete bacterial genome alignments.", "fr": "Dans un premier temps, nous nous sommes employés à évaluer la robustesse des alignements de génomes complets bactériens." } }, { "id": "474", "translation": { "en": "For the “pangenome” module, we developed a new method, based on recent tools of genome comparison and clustering.", "fr": "Concernant le module \" pangenome \", nous avons développé une nouvelle méthode, s'appuyant sur des outils récents de comparaison et clustering de séquences." } }, { "id": "475", "translation": { "en": "I first isolated a new kind of TCase, potentially involved in the purine degradation, and I proposed a new role for it in the light of reaction modules (linked with ALNase).", "fr": "J'ai d'abord montré l'existence d'une nouvelle TCase potentiellement impliquée dans la dégradation des purines et lui ai proposé un nouveau rôle en utilisant le concept de module réactionnel (enchaînement avec l'ALNase)." } }, { "id": "476", "translation": { "en": "This thesis therefore proposes a new method of bacterial strain identification based on the assumption that a nanopore read is long enough to distinguish one strain (or group of strains) from others.", "fr": "Cette thèse propose donc une nouvelle méthode d'identification de souches bactériennes basée sur l'hypothèse qu'une lecture nanopore est suffisamment longue pour permettre de distinguer une souche (ou un groupe de souches) des autres." } }, { "id": "477", "translation": { "en": "A set of genes, whose expression is co-ordinated or altered because of the inhibition of a transcription factor, should share within their promoters some regulatory elements allowing them to be transcribed at a given moment of the development. Diverse regulatory elements have been searched for with several bioinformatic programs and positioned all along the promoter sequences. In addition, some of the regulatory elements have been combined to elicit putative modules of regulation. Factors able to bind DNA have been searched for by sequence homology.", "fr": "Les différentes familles de gènes dont l'expression est cordonnée ou altérée par l'expression diminuée d'un facteur de transcription, devraient partager dans leurs promoteurs des éléments de régulation leur permettant d'être exprimées à un moment précis du développement. Des facteurs se liant à l'ADN et impliqués dans la régulation transcriptionnelle ont été recherchés dans le génome du parasite." } }, { "id": "478", "translation": { "en": "The second project of our PhD is to decipher a community outbreak of Staphylococcus saprophyticus involved in (UTI) using MALDI-TOF MS technology and a comparative genome analysis of clinical and non-clinical S. saprophyticus to understand their genomic evolution.", "fr": "Le deuxième projet de notre thèse est de déchiffrer une epidémis de Staphylococcus saprophyticus causant des infections urinaires en utilisant la technologie MALDI-TOF MS et une analyse comparative du génome de S. saprophyticus pour comprendre leur évolution génomique." } }, { "id": "479", "translation": { "en": "Malaria, a protozoan vector-borne disease, is mainly prevalent in tropical areas, where nearly 40% of the world population is residing and remains one of the most concerns for public health worldwide.", "fr": "Le paludisme, maladie parasitaire et vectorielle, sévissant principalement dans les zones intertropicales où vit près de 40% de la population mondiale, reste un problème majeur en santé publique." } }, { "id": "480", "translation": { "en": "ABCG2 export is characterized by two major conformational transitions between inward- and outward-facing states, the structures of which have been resolved.", "fr": "Il est caractérisé par deux transitions conformationnelles majeures entre un état ouvert vers l'intérieur de la cellule et l'autre vers l'extérieur, dont les structures ont été résolues expérimentalement." } }, { "id": "481", "translation": { "en": "During my phD, we questionned the role of histone 3 lysine 9 demethylated (H3K9me2) in S.fru, a histone modification known in other yet described organisms to be a constitutive constitutive heterochromatinian hallmark.", "fr": "Dans le cadre de la thèse, nous nous sommes demandés si la diméthylation de la lysine 9 de l'histone 3 (H3K9me2), marqueur de l'hétérochromatine constitutive, possédait un rôle conservé chez S.fru." } }, { "id": "482", "translation": { "en": "In this thesis, we address this issue by designing a molecular tangible interface combining the perks of physical and virtual representations.", "fr": "Pour aborder la problématique de l'interaction avec ces structures moléculaires, nous proposons dans cette thèse de concevoir une interface tangible moléculaire combinant les avantages des représentations physiques et virtuelles." } }, { "id": "483", "translation": { "en": "In conclusion, we have revealed the putative implication of a new gene in the pathophysiology of endometriosis, KIAA1324 whose expression is reduced by two circulating microRNAs, let-7b-5p and miR-92a-3p.", "fr": "En conclusion, nous avons mis en évidence l'implication potentielle d'un nouveau gène dans la physiopathologie de l'endométriose, le gène KIAA1324 dont l'expression est diminuée par deux micro-ARNs circulants, let-7b-5p et miR-92a-3p." } }, { "id": "484", "translation": { "en": "In addition, the comparison of our RNA-Seq data with published RNA-seq data from CodY transcription factor showed that SarA and CodY share common sRNA targets. Among them, we focused on teg1, rsaOB, rsaD and teg16, which seem to be regulated by both transcription factors in a coordinated manner during growth.", "fr": "Par ailleurs, l'analyse comparative entre les cibles sARN de SarA et celles publiées pour le facteur de transcription CodY révèle que les gènes sARN teg1, rsaOB, rsaD et teg16 seraient régulés par CodY et SarA de manière coordonnée au cours de la croissance." } }, { "id": "485", "translation": { "en": "These data suggest promising avenues for the understanding, diagnosis and treatment of these very aggressive cancers.", "fr": "Ces données suggèrent des pistes prometteuses pour la compréhension, le diagnostic et le traitement de ces cancers très agressifs." } }, { "id": "486", "translation": { "en": "Finally, I have tested these algorithms, both on simulated data in silico and on experimental fingerprint in vitro.", "fr": "Enfin, j'ai testé ces algorithmes, à la fois sur des données simulées in silico et in vitro sur de l'ADN d'origine bactérienne." } }, { "id": "487", "translation": { "en": "Hence, feature selection models reduce the dimensionality of data by keeping only the relevant features associated with disease.", "fr": "Par conséquent, les modèles de sélection de variables réduisent la dimensionnalité des données en ne conservant que les variables pertinentes." } }, { "id": "488", "translation": { "en": "I also show how including networks in GWAS and GWAIS boosts the interpretability of the results and produces compelling biological hypotheses.", "fr": "Je montre aussi comment l'incorporation de réseaux biologique dans les GWAS et GWAIS permet d'améliorer l'interprétabilité des résultats et de produire des hypothèses biologiques convaincantes." } }, { "id": "489", "translation": { "en": "For that, we use model cheking techniques.", "fr": "Nous utilisons pour cela des techniques de \" model checking \"." } }, { "id": "490", "translation": { "en": "We confirmed the association of rs10900585 and also found significant associations of severe malaria with our candidate SNPs (rs11240734, rs1541252, rs1541253, rs1541254, and rs1541255) in a Senegalese population.", "fr": "Nous confirmé l'association de rs10900585 et trouvé des associations significatives de paludisme sévère avec nos candidats dans population sénégalaise." } }, { "id": "491", "translation": { "en": "Malaria being a multifactorial disease, its evolution is subject to the influence of environmental effects, variables such as age of the individual, and a combination of genetic factors.", "fr": "Le paludisme étant une maladie multifactorielle, son évolution est soumise à l'influence d'effets environnementaux, à des variables telles que l'âge de l'individu, ainsi qu'à une combinaison de facteurs génétiques." } }, { "id": "492", "translation": { "en": "Not only this architecture provides the first reliable thrombusidentification, it also provides new insights to neural network design.", "fr": "Cette ar-chitecture fournit non seulement la première identification fiablede thrombus, mais elle fournit également de nouvelles informationssur la conception des réseaux neuronaux." } }, { "id": "493", "translation": { "en": "MIIC is available through a web interface at the address: https://miic.curie.fr, and as an R package available on CRAN.", "fr": "MIIC est disponible par le biais d'une interface Web à l'adresse suivante: https://miic.curie.fr, et sous la forme d'un paquet R disponible sur CRAN." } }, { "id": "494", "translation": { "en": "This work represents a first large validation study of an automated sequencing data re-interpretation system that could become a standard in genomic medicine.", "fr": "Ce travail représente la première validation à grande échelle d'un système automatisé de réinterprétation des données de séquençage qui pourrait devenir un standard en médecine génomique." } }, { "id": "495", "translation": { "en": "In this case there are two possibilities of linkers length: one short linker and one long linker, and two relatively the same length linkers. As a result, we established the minimal linkers allowing fibrillogenesis for all considered hybrid molecules. We also were able to establish a more general relationship between the size of the globular domain and the length of the linker by using mesoscopic protein modeling. In the second part of our studies, we have demonstrated what may happen when the length of the linker is shorter than the one allowing the formation of the infinite fibrils.", "fr": "En conséquence, nous avons établi les linkers le plus court possible permettent la fibrillogénèse pour toutes les molécules hybrides considérées Dans la deuxième partie de nos études, nous avons analysé les conséquences topologiques et structurales induites par la longueur du segment linker lorsqu'elle est plus courte que celle permettant la formation des fibrilles infinies." } }, { "id": "496", "translation": { "en": "In this thesis, I address the important problem of the determination of the structure of complex networks, with the widely used class of Bayesian network models as a concrete vehicle of my ideas.", "fr": "Dans cette thèse, j'aborde le problème important de l'estimation de la structure des réseaux complexes, à l'aide de la classe des modèles stochastiques dits réseaux Bayésiens." } }, { "id": "497", "translation": { "en": "In patients who have developed resistance to enasidenib, there is a selection or evolution of cell clones, which may be minority at diagnosis, and that acquire abnormalities.", "fr": "Chez les patients ayant acquis une résistance à l'énasidenib, on observe la sélection ou l'évolution de clones cellulaires, pouvant être minoritaires au diagnostic, qui acquièrent des anomalies dont certaines sont récurrentes." } }, { "id": "498", "translation": { "en": "Despite changes in the management of coronary artery disease (CAD) that have lead to a gradual decline in these procedures over the past 5–10 years, coronary artery bypass graft surgery (CABG) remains one of the most commonly performed operations.", "fr": "Malgré les changements apportés à la prise en charge des maladies coronariennes qui ont provoqué un déclin progressif dans le nombre de pontages aortocoronariens (PAC) ces 5–10 dernières années, ces derniers demeurent l'une des opérations les plus pratiquées." } }, { "id": "499", "translation": { "en": "Finally, the MinION sequencing technology was used to obtain the whole genome of HPV227, directly from the original skin sample where this virus was discovered.", "fr": "Enfin, la technologie de séquençage par nanopores (MinION, Oxford Nanopore Technologies) a été utilisée afin d'obtenir le génome entier du HPV227, directement à partir de l'échantillon cutané d'origine et ainsi permettre un gain de temps important dans la caractérisation du génome complet des HPV." } }, { "id": "500", "translation": { "en": "We investigated the structure of Kir2.1 by cryo-EM and obtained an electronic density at 7 Å resolution.", "fr": "L'étude de Kir2.1 par cryo-microscopie a donné une densité électronique de résolution de 7 Å." } }, { "id": "501", "translation": { "en": "Deep learning (DL) methods have recently been shown to be powerful strategies for predicting the regulatory activity of a genomic sequence and thus for ultimately assessing the impact of regulatory mutations on gene expression.", "fr": "Les méthodes d'apprentissage profond (DL) se sont récemment révélées être de puissantes stratégies pour prédire l'activité régulatrice d'une séquence génomique et donc pour, in fine, évaluer l'impact des mutations régulatrices sur l'expression des gènes." } }, { "id": "502", "translation": { "en": "The input data for constructing a gene co-expression network is often represented as a matrix.", "fr": "Les données d'entrée pour la construction d'un réseau de co-expression de gènes sont souvent représentées par une matrice." } }, { "id": "503", "translation": { "en": "Recently, a wide range of graph learning and graph generation methods has been proposed, aiming to optimise some properties of small molecules [3-12].", "fr": "Récemment, une large gamme de méthodes d'apprentissage et de génération de graphes a été proposée, visant à optimiser certaines propriétés de petites molécules [3-12]." } }, { "id": "504", "translation": { "en": "First, 1155 β-lactamase protein sequences were retrieved from ARG-ANNOT database and MIC values from the corresponding literature.", "fr": "Premièrement, des séquences de protéines ß-lactamase 1155 ont été extraites de la base de données ARG-ANNOT et des valeurs CMI la littérature correspondante." } }, { "id": "505", "translation": { "en": "In summary, our studies brought some evidence for the ability of CD to induce epigenetic and genetic alterations.", "fr": "En résumé, nos études ont apporté des preuves de la capacité du CD à induire des altérations épigénétiques et génétiques." } }, { "id": "506", "translation": { "en": "Furthermore, several additional mutations have a prognostic role.", "fr": "Certaines mutations additionnelles ont également un intérêt dans l'évaluation pronostique des patients." } }, { "id": "507", "translation": { "en": "This resource can be accessed via a web interface (http://bcl2db.ibcp.fr) which allows researchers to extract data and perform sequence analysis The choroid is a layer of highly vascularised tissue surrounding the eye. Choroidal blood nourishes the retinal pigment epithelium and the photoreceptors on the outer layer of the retina.", "fr": "Celle-ci est accessible via une interface Web (http://bcl2db.ibcp.fr) qui permet aux chercheurs d'extraire des données et d'effectuer des analyses de séquence La choroïde ou uvée, située entre la rétine et la sclérotique, est une membrane vasculaire qui tapisse la paroi de l'œil, son rôle est d'assurer l'apport en nutriment de la rétine et de l'iris." } }, { "id": "508", "translation": { "en": "Chronic lymphocytic leukemia (CLL) is one of the most common small cell lymphoma subtype. Frequently associated with an indolent clinical course, it is now effectively controlled with targeted therapies.", "fr": "La leucémie lymphoïde chronique (LLC) est l'une des formes les plus fréquentes de lymphomes à petite cellules, à évolution clinique indolente, aujourd'hui bien maîtrisée grâce à des thérapies ciblées efficaces." } }, { "id": "509", "translation": { "en": "Influenza A viruses (IAV) infect a wide range of hosts, including avian species, humans and swine.", "fr": "Les influenzavirus A peuvent infecter des hôtes très divers, en particulier les espèces aviaires, les humains et les porcins." } }, { "id": "510", "translation": { "en": "The data is also subject to technical biases and noise inherent in these technologies.", "fr": "Les données brutes sont aussi sujettes aux biais techniques et au bruit inhérent à ces technologies." } }, { "id": "511", "translation": { "en": "This study introduces novel tools for structural biology.", "fr": "Cette étude présente de nouveaux outils pour la biologie structurale." } }, { "id": "512", "translation": { "en": "This method derives from phylogenetic profiling, a method used to predict the function of unknown proteins.", "fr": "NAPP est une adaptation du profilage phylogénétique, une méthode utilisée pour prédire la fonction de protéine de fonction inconnue." } }, { "id": "513", "translation": { "en": "We propose a new approach for building maximum likelihood phylogenies. The core of this method is a simple hill climbing algorithm that adjusts tree topology and branch lengths simultaneously.", "fr": "Nous proposons ici une nouvelle méthode pour l'estimation d'arbres de vraisemblances maximales, basée sur la modification simultanée de la topologie de l'arbre et de ses longueurs de branches." } }, { "id": "514", "translation": { "en": "RNASeq transcriptomics provides direct information on the repertoire of TSSs and transcription units and thereby offers renewed perspectives to address the problem of transcription factor binding sites identification.", "fr": "La technologie RNA-Seq donne accès au répertoire des TSS et des unités de transcriptions et offre donc des perspectives renouvelées pour s'attaquer au problème de l'identification des motifs de fixation des facteurs de transcription." } }, { "id": "515", "translation": { "en": "Finally, the last part of the thesis will be devoted to the implementation of a generic approach to work with a non-specialist public on the modalities of dissemination of the results of the analyses of microbial diversity and of the associated metabolic potential obtained in the FLEGME project, in an innovative approach of science mediation and in a context of participatory science.", "fr": "Enfin, la dernière partie de la thèse sera consacrée à la mise en place d'une démarche générique pour travailler avec un public non spécialiste sur les modalités de diffusion des résultats des analyses de diversité microbienne et du potentiel métabolique associé obtenus dans le projet FLEGME, dans une démarche de médiation des sciences et un contexte de sciences participatives." } }, { "id": "516", "translation": { "en": "Malaria kills a child every 30 seconds in Africa and 1 to 3 million people per year.", "fr": "Le paludisme tue un enfant toutes les 30 secondes en Afrique et 1 à 3 millions de personnes par an." } }, { "id": "517", "translation": { "en": "In addition to their simplicity, they exhibit a natural way to control regularization and thus to avoid overfitting.", "fr": "Outre leur simplicité, elles présentent une manière naturelle de contrôler la régularisation et ainsi d'éviter le surapprentissage." } }, { "id": "518", "translation": { "en": "This manuscript is focused on two main projects I led during this Ph.D. with SeqOne Genomics and CHU Grenoble Alpes.", "fr": "Ce manuscrit est axé sur deux principaux projets que j'ai menés au cours de ce doctorat avec l'équipe de SeqOne Genomics et le CHU Grenoble Alpes." } }, { "id": "519", "translation": { "en": "For the more complex task of structured output prediction, we refine intensively LaSVM: this results in the LaRank algorithm which is detailed in Chapter 5.", "fr": "Pour la tˆache plus complexe de prédiction de sorties structurées, nous modifions par la suite en profondeur l'algorithme LaSVM, ce qui conduit à l'algorithme LaRank présenté dans le Chapitre 5." } }, { "id": "520", "translation": { "en": "Data amount, variety, and heterogeneity have been increasing drastically for several years, offering a unique opportunity to better understand complex systems.", "fr": "La quantité de données, ainsi que leur variété et leur hétérogénéité, augmentent depuis de nombreuses années. Cette disponibilité des données à grande échelle représente une opportunité sans précédent pour mieux comprendre les systèmes complexes." } }, { "id": "521", "translation": { "en": "We define cost models for managing and mining data with a large scale subgraph mining framework over a cloud architecture.", "fr": "Nous définissons des modèles de coûts de gestion et de fouille de données avec une plateforme de fouille de sous-graphe à grande échelle sur une architecture cloud." } }, { "id": "522", "translation": { "en": "They have a sympatric lifestyle with other microorganisms within amoebae, and many lateral sequence transfers have been described that involved Acanthamoeba castellanii.", "fr": "Ils vivent en sympatrie avec d'autres micro-organismes au sein de l'amibe, et de nombreux transferts latéraux de séquences ont été décrits avec Acanthamoeba castellanii." } }, { "id": "523", "translation": { "en": "In Arabidopsis hypomethylated epigenetic mutants, we highlighted the role of the epigenome in protecting genome stability not only from TE mobility but also from genomic rearrangements and gene chimerism.", "fr": "Dans les mutants épigénétiques hypométhylés d'Arabidopsis, nous avons mis en évidence le rôle de l'épigénome dans la protection de la stabilité du génome non seulement contre la mobilité des TE mais aussi envers les réarrangements génomiques et le chimérisme des gènes." } }, { "id": "524", "translation": { "en": "As epigenetic studies may involve comparing multi-profile sequencing data, there is an imminent need for novel approaches and tools to address underlying technical variabilities.", "fr": "Puisque, dans le cadre d'études épigénétiques, il peut êtrenécessaire de comparer plusieurs profils de séquençage, il y a un besoin urgent en nouvelles approches et nouveaux outils pour pallier aux variabilités techniques sous-jacentes." } }, { "id": "525", "translation": { "en": "The results presented here—a novel, effective correction for local ancestral population LD allowing use of dense markers in MALD using the ALDsuite and the demonstration that the simpleM method provides an optimum Bonferroni correction for multiple comparisons in GWAS, reiterate the value of PCA for capturing the essential part of the complexity of high- dimensional systems.", "fr": "Les résultats présentés ici—ALDsuite, un programme en utilisant une correction nouvelle et efficace pour le déséquilibre de liaison (DL) ancestrale de la population locale, en permettant l'utilisation de marqueurs denses dans le MALD, et la démonstration que la méthode simpleM fournit une correction optimale pour les comparaisons multiples dans le GWAS—réaffirment la valeur de l'analyse en composantes principales (APC) pour capturer l'essence de la complexité des systèmes de grande dimension." } }, { "id": "526", "translation": { "en": "We have first characterized the molecular mechanism of resistance of the L74V mutant towards acyclic phosphonates using purified the RT.", "fr": "Nous nous sommes tout d'abord intéressés à la caractérisation moléculaire du mécanisme de résistance du mutant L74V et des contraintes du site actif de la RT pour les phosphonates acycliques." } }, { "id": "527", "translation": { "en": "Their methodological analysis plan and discussion have an impact on the results, interpretations and conclusions, demonstrating the importance of communication between scientific fields in current transversal research. Hepatocellular carcinoma (HCC) is a leading cause of death worldwide and the current treatments are unsatisfactory.", "fr": "Leur plan méthodologique d'analyse et leur discussion impactent les résultats, leurs interprétations et les conclusions qui en découlent, donnant raison à l'importance de la communication entre les domaines scientifiques dans la recherche transversale actuelle Le carcinome hépatocellulaire (CHC) est parmi les principales causes de mortalité dans le monde et les traitements disponibles sont insuffisants." } }, { "id": "528", "translation": { "en": "This scientific breakthrough opens new pespectives in terms of functional genomics (set of methods allowing to characterize the function of genes) and integrative biology (set of methods allowing to study the global functioning of the plant and its response to the environment).", "fr": "Cette avancée scientifique ouvre de nombreuses perspectives en termes de génomique fonctionnelle (ensemble de méthodes permettant de caractériser la fonction des gènes) et de biologie intégrative (ensemble de méthodes visant à appréhender le fonctionnement global de la plante et ses réponses à l'environnement)." } }, { "id": "529", "translation": { "en": "It also included original data generated from unique placental samples: villous cytotrophoblastic cells isolated ex vivo from chorionic villi.", "fr": "Elle a également porté sur des données originales générées par nos soins à partir d'échantillons placentaires uniques : des cellules cytotrophoblastiques isolées de villosités choriales ex vivo." } }, { "id": "530", "translation": { "en": "We account for the exponential number of dualized constraints by starting with an empty constraint pool in the first iteration to which we add cuts in each iteration, that are most violated by the convex combination of a small number of preceding Lagrangian solutions (including the current solution).", "fr": "Nous adressons le problème du nombre exponentiel d'inégalités par une approche itérative. L'ensemble des contraintes est vide au début. Après chaque itération, nous rajoutons à cet ensemble ces inégalités qui sont le plus violées par la combinaison convexe d'un petit nombre des solutions lagrangiennes précédentes (y compris la solution courante)." } }, { "id": "531", "translation": { "en": "However, prior to the 2009 H1N1 pandemic, relatively little was known regarding IAV circulating in swine around the world, compared with the knowledge base on IAV circulating in avian and human populations.", "fr": "Cependant, avant la pandémie H1N1 de 2009 on savait relativement peu de choses concernant les influenzavirus A en circulation dans les populations porcines à travers le monde, en comparaison des connaissances accumulées sur ceux qui circulaient dans les populations aviaires et les populations humaines." } }, { "id": "532", "translation": { "en": "Finally, genome-wide loss-of-function CRISPR/cas9 RAW library screen revealed that several components of the immune system response, indirectly linked to Caspase-1 are involved in the ExlA-mediated cell lysis.", "fr": "Finalement, un criblage d'une banque de macrophages dont les gènes ont été invalidés par la technologie CRISPR/cas9 a révélé que plusieurs protéines du système immunitaire, indirectement liées à l'activation de la Caspase-1 sont impliquées dans la mort cellulaire médiée par ExlA." } }, { "id": "533", "translation": { "en": "All living beings rely on chemical reactions to exist, the set of all such reactions is the metabolism.", "fr": "Tous les êtres vivants dépendent de réactions chimiques pour exister, l'ensemble de ces réactions est le métabolisme." } }, { "id": "534", "translation": { "en": "This encompasses tools like genomic, proteomic ... and flow cytometry.", "fr": "Cette approche regroupe des outils comme la génomique, la protéomique ... et lacytométrie en flux." } }, { "id": "535", "translation": { "en": "The study of the urinary proteome has emerged as an excellent way to discover biomarkers of nephropathies and thus to better understand the underlying pathophysiological mechanisms.", "fr": "L'étude du protéome urinaire s'est imposée comme un excellent moyen pour découvrir des biomarqueurs des néphropathies et ainsi mieux comprendre les mécanismes physiopathologiques." } }, { "id": "536", "translation": { "en": "My colleagues and I estimate that LUCA did not live in a very hot environment, but that its descendants the ancestors of Bacteria and of the group containing Archaea and Eukarya both lived at higher temperatures.", "fr": "Mes collègues et moi-même estimons que LUCA ne vivait pas à très haute température, mais que ses directs descendants les ancêtres des Bactéries et du groupe comprenant les Archées et les Eucaryotes vivaient dans des environnements plus chauds." } }, { "id": "537", "translation": { "en": "Regulation of the β1-adrenergic signaling pathway, pathways related to the inflammatory response (in particular the JAK/STAT pathway), and apoptosis differed between the sexes.", "fr": "La régulation des voies de signalisation β1-adrénergique, celles liées à la réponse inflammatoire (en particulier la voie JAK/STAT), et à l'apoptose, étaient différentes selon le sexe." } }, { "id": "538", "translation": { "en": "The proposed approach, named FIST for Frequent Itemset mining using Suffix-Trees, is based on a new suffix-tree data structure that enables the efficient storage of data and computation of relevant patterns in primary memory.", "fr": "L'approche proposée, nommée FIST pour Frequent Itemset mining using Suffix-Trees, utilise une nouvelle structure de données basée sur les arbres suffixés qui permet le stockage efficace des données et l'extraction de modèles de connaissance pertinents en mémoire primaire." } }, { "id": "539", "translation": { "en": "We have chosen to perform an unbiased approach using whole genomic sequencing (WGS) from XP-C and WT keratinocytes exposed or non-UV exposed.", "fr": "Nous avons choisi d'effectuer une approche non biaisée en effectuant un séquençage génomique entier de kératinocytes XP-C et WT exposés ou non aux UV." } }, { "id": "540", "translation": { "en": "In order to facilitate its use by a biologist, the tool automatically generates (in R markdown) an analysis report illustrated by figures and tables.", "fr": "Afin de faciliter son utilisation par un biologiste, l'outil génère automatiquement (en R markdown) un rapport d'analyse illustré par des figures et tableaux." } }, { "id": "541", "translation": { "en": "The alignment of the H-bonds creates a dipole moment for the helix with a resulting partial positive charge at the amino end of the helix.", "fr": "L'alignement des liaisons H crée un moment dipolaire pour l'hélice, avec une charge positive partielle résultante à l'extrémité aminée de l'hélice." } }, { "id": "542", "translation": { "en": "We proposed a method to use the structural information in order to prioritize the rearrangements scenarios.", "fr": "Notre approche a été de proposer une méthode pour utiliser l'information structurale afin de prioriser les scénarios de réarrangements." } }, { "id": "543", "translation": { "en": "In the first part, I present several new algorithms for clustering and segmentation.", "fr": "Dans la première partie, je présente de nouveaux algorithmes pour la segmentation et pour le partitionnement de données (clustering)." } }, { "id": "544", "translation": { "en": "In this PhD thesis, a filtration approach for comparing DNA sequences is proposed.", "fr": "Dans cette thèse, une approche de filtrage des séquences d'ADN est proposée." } }, { "id": "545", "translation": { "en": "Very interestingly, without UV exposure, we saw already an increase of mutation in coding sequence even though no differences in mutation burden was observed. Then performing again, a network analysis focusing only on stop mutations, we highlighted a defect in chromatin organization.", "fr": "De façon intéressante, chez les kératinocytes non exposés aux UV, nous observons une augmentation de mutation dans les séquences codantes, l'analyse des gènes portant des mutations stop a mis en évidence un défaut dans les réseaux de gènes impliqués dans l'organisation de chromatine." } }, { "id": "546", "translation": { "en": "This isoform is characterized by the alternative exons (J, A; E; F; G1129, H and G1) highly expressed in the NC and TAG.", "fr": "La combinaison d'exons alternatifs caractérisant cette isoforme (J, A, E, F, G1129, H, G1) s'est alors avérée représentative des ADNc les plus exprimés dans la CN et le DGA." } }, { "id": "547", "translation": { "en": "Advances in next generation sequencing technologies not only revolutionized the field of microbial genomics but also enabled a deeper understanding of genome plasticity, molecular evolution and diversity of closely related species and strains.", "fr": "Les progrès des technologies de séquençage de nouvelle génération ont non seulement révolutionné le domaine de la génomique microbienne, mais ont également permis de mieux comprendre la plasticité génomique, l'évolution moléculaire et la diversité d'espèces et de souches étroitement apparentées." } }, { "id": "548", "translation": { "en": "Due to high structural similarity between protein kinases, development of potent and selective kinase inhibitors is a challenging task.", "fr": "Du fait de leur grande similarité structurale des protéines kinases, il est difficile de développer des inhibiteurs qui soient à la fois efficaces et sélectifs." } }, { "id": "549", "translation": { "en": "My PhD project consists in assessing the contribution of neural stem cells (NSCs) of the dorsal subventricular zone (dSVZ, i.e. the largest germinal zone of the postnatal brain) to the spontaneous regenerative attempt observed following such injury as well as its amenability to pharmacological manipulation.", "fr": "Mon projet de thèse a d'abord consisté à étudier la contribution des cellules souche neurales de la zone sous-ventriculaire dorsale (dSVZ) à la tentative de régénération spontanée observée après la lésion. Dans un second temps, j'ai étudié la capacité de ces cellules souches à être manipulée en utilisant une approche pharmacologique." } }, { "id": "550", "translation": { "en": "This thesis addresses several problems related to whole genome alignment: the evaluation of the quality of results given by WGA tools and the improvement of the classical anchor based strategy.", "fr": "Cette thèse traite plusieurs problèmes liés à l'alignement de génomes complets dont: l'évaluation de la qualité des résultats produits par les outils d'alignement et l'amélioration de la stratégie basée sur des ancres." } }, { "id": "551", "translation": { "en": "In this thesis, three separate research projects were undertaken to gain better knowledge about the first steps of the evolution of social hybridogenesis, and about its prevalence within ants.", "fr": "Dans cette thèse, trois projets de recherche ont été menés avec pour objectifs de mieux comprendre les premières étapes de la mise en place de l'hybridogénèse sociale, et d'évaluer sa prévalence parmi les fourmis." } }, { "id": "552", "translation": { "en": "This thesis is conceived following two lines of approaches to perform drug virtual screening : data-blinded feature-based approaches (in which molecules and proteins are numerically described based on experts' knowledge), and data-driven feature-based approaches (in which compounds and proteins numerical descriptors are learned automatically from the chemical graph and the protein sequence).", "fr": "Cette thèse est conçue selon deux cadres d'approches de criblage virtuel : les approches dans lesquelles les données sont décrites numériquement sur la base des connaissances des experts, et les approches basées sur l'apprentissage automatique de la représentation numérique à partir du graphe moléculaire et de la séquence protéique." } }, { "id": "553", "translation": { "en": "Several scores are then computed for each path in the RMS network in order to assess known metabolic pathways conservation and to discover new ones.", "fr": "Plusieurs scores sont ensuite calculés pour chaque chemin dans le réseau de RMS dans le but d'évaluer la conservation des voies métaboliques connues et afin d'en découvrir des nouvelles." } }, { "id": "554", "translation": { "en": "Overall, this work relies on the theories of parameterized complexity and approximability to obtain algorithms and hardness results for the problems studied.", "fr": "De manière générale, ce travail met à profit les théories de la complexité paramétrique et de l'approximabilité pour obtenir des algorithmes et des résultats de difficulté pour les problèmes étudiés." } }, { "id": "555", "translation": { "en": "In addition, our transcriptomic-wide analysis showed a great heterogeneity between the patients with respect to both gene expression and splicing. This prevented us from identifying any characteristic profile.", "fr": "L'analyse transcriptomique montre une grande hétérogénéité entre les patients en termes d'expression et d'épissage, ce qui ne nous a pas permis de mettre en évidence de profil caractéristique." } }, { "id": "556", "translation": { "en": "Thus, we managed to detect in a studya recombinant form of HCV circulating within a patient.", "fr": "Une étude a ainsi permisde mettre en évidence la présence d'une forme recombinante du VHC chez un patient." } }, { "id": "557", "translation": { "en": "While this pre-analytical method represents an interesting alternative to classic blood sampling, its use in routine is still limited.", "fr": "Bien que cette méthode pré-analytique représente une alternative intéressante aux prélèvements sanguins classiques, son utilisation en routine est encore limitée." } }, { "id": "558", "translation": { "en": "However, these methods lack of stability, that is to say, robustness to slight variations in the input dataset. This major issue can lead to false biological interpretation.", "fr": "Cependant, ces méthodes manquent de la stabilité, c'est-à-dire de la robustesse suite à des légères variations dans le jeu de données d'entrée, ce qui peut conduire à une fausse interprétation biologique." } }, { "id": "559", "translation": { "en": "I show the potential of these two methods on experimental cryo-ET data of nucleosome conformational variability in cells.", "fr": "Je montre le potentiel de ces deux méthodes sur des données cryo-ET expérimentales de variabilité conformationnelle des nucléosomes dans les cellules." } }, { "id": "560", "translation": { "en": "Two networks, one of neurons and the other of astrocytes, thus coexist in the brain; while neuronal networks have been the subject of intense experimental and theoretical investigations, astrocyte networks have been much less investigated.", "fr": "Deux réseaux, de neuronnes et d'astrocytes, cohabitent ainsi dans le cerveau ; mais, alors que les réseaux de neuronnes ont fait l'objet de recherches expérimentales et théoriques, les réseaux d'astrocytes restent encore mal connus." } }, { "id": "561", "translation": { "en": "Other collections of databases exist such as MetaBase and the Bioinformatics Links Collection.", "fr": "Il existe d'autres collections de bases de données, telles que MetaBase ou encore 'Bioinformatics Links Collection'." } }, { "id": "562", "translation": { "en": "For example, well aligned regions from different aligners could be identified and combined into a single consensus alignment.", "fr": "Par exemple, les régions bien alignées par différents algorithmes pourraient être identifiées et regroupées en un alignement consensus unique." } }, { "id": "563", "translation": { "en": "For the first time, we show in this study the existence of a cell cycle molecular surveillance mechanism that is induced by an excess of free histones MicroRNAs are regulators of gene expression, which play a central role in multiple fundamental processes in the development of organisms.", "fr": "Pour la première fois, nous mettons en évidence dans cette étude l'existence d'un mécanisme de surveillance moléculaire du cycle cellulaire induit par l'excès d'histones non incorporées à la chromatine Les micro-ARNs sont des régulateurs de l'expression des gènes, qui jouent un rôle central dans de multiples processus fondamentaux du développement des organismes." } }, { "id": "564", "translation": { "en": "Since autism is nowadays regarded as a very complex spectrum at the clinical level, and the genetic architecture is also complex, my project aimed to identify homogeneous subgroups characterized by the relevant genetic and clinical profiles, i.e. stratification using unsupervised machine learning.", "fr": "Ce spectre étant complexe, mon projet visait à identifier des sous-groupes homogènes caractérisés par des profils génétiques et cliniques pertinents. Cette stratification des personnes avec autisme est effectuée grâce à un apprentissage non supervisé." } }, { "id": "565", "translation": { "en": "In recent years, high-throughput sequencing techniques have been developed for cancerology and many clinical trials are currently structured around biomarkers that can guide specific treatment choices.", "fr": "Les dernières années ont vu se développer les techniques de séquençage à haut débit appliquées à la cancérologie, de nombreux essais cliniques se structurent actuellement autour de biomarqueurs qui peuvent guider le choix d'un traitement spécifique." } }, { "id": "566", "translation": { "en": "Parallel implementations of these algorithms have also been studied.", "fr": "Les mises en œuvre de ces algorithmes parallèles ont également été étudiés." } }, { "id": "567", "translation": { "en": "However, MoM-based algorithms have two main disadvantages.", "fr": "Cependant, les algorithmes basés sur la MoM ont deux inconvénients principaux." } }, { "id": "568", "translation": { "en": "Extracting structured data from text currently relies on neural information extraction methods.", "fr": "L'extraction de données structurées à partir de textes repose actuellement sur des méthodes d'extraction d'information neuronales." } }, { "id": "569", "translation": { "en": "Finally, an algorithm was designed to further optimize these stage specific models to improve the consistency of their predictions with results published in previous studies.", "fr": "Enfin, un algorithme a été conçu pour optimiser encore ces modèles spécifiques afin d'améliorer la cohérence de leurs prédictions avec les résultats publiés." } }, { "id": "570", "translation": { "en": "EU1 inside I. ricinus confirmed that the developed methods were appropriate.", "fr": "EU1 chez I. ricinus a permis de valider les méthodes développées." } }, { "id": "571", "translation": { "en": "The mission of the Institute is to discover the key principles by which brains work and to implement these in artificial systems that interact intelligently with the real world.", "fr": "La mission de l'Institut est de découvrir les principes clés du cerveau et de les implémenter dans des systèmes artificiels interagissant intelligemment avec le monde réel." } }, { "id": "572", "translation": { "en": "RECOMB steering committee is chaired by Bonnie Berger.", "fr": "Le comité de pilotage de RECOMB est présidé, en 2020, par Bonnie Berger." } }, { "id": "573", "translation": { "en": "Work to be undertaken: It will initially consist in reconstructing a general metabolic network based on the integration of available individual metabolic reactions and pathways. in specialized databases (KEGG, MetaCyc, Reactome, Rhea, IntEnz, etc.).", "fr": "Travail demandé : Il consistera dans un premier temps à reconstituer un réseau métabolique général à partir de l'intégration des réactions et voies métaboliques individuelles disponibles dans les bases de données spécialisées (KEGG, MetaCyc, Reactome, Rhea, IntEnz, etc.)." } }, { "id": "574", "translation": { "en": "These bacteria are distributed in varied environments and present specific phenotypic characteristics.", "fr": "Ces bactéries proviennent d'environnements variés et présentent des caractéristiques phénotypiques intéressantes." } }, { "id": "575", "translation": { "en": "On the other hand, without prefractionation, de novo sequencing produces an undeniable gain.", "fr": "En revanche, sans préfractionnement, le séquençage de novo produit un gain indéniable." } }, { "id": "576", "translation": { "en": "It led to a prediction of some sampled conformations of AC in its unbound state.", "fr": "Elle nous a conduit à la prédiction de conformations échantillonnées de AC dans son état libre." } }, { "id": "577", "translation": { "en": "Permafrost is a reservoir of ancient organisms, including amoebas surviving up to several hundred thousand years.", "fr": "Le pergélisol est un réservoir d'organismes anciens, où des amibes survivent jusqu'à plusieurs centaines de milliers d'années." } }, { "id": "578", "translation": { "en": "However, the experience for this technique is very limited apart from the Mayo Clinic (Rochester, United States).", "fr": "Cependant, l'expérience de cette technique est à ce jour très limitée en dehors de celle de la Mayo Clinic (Rochester, États-Unis)." } }, { "id": "579", "translation": { "en": "An additional 30% of the risk is accounted for mutations in other known genes, like ATM or TP53, and by common genetic variants, called single nucleotide polymorphism (SNPs), identified in population-based GWAS.", "fr": "D'autres gènes connus, comme ATM ou TP53, ainsi que des variants génétiques fréquents (SNP) identifiés dans des études pangénomiques (GWAS) réalisées en population générale, expliqueraient 30 % supplémentaires des cas familiaux." } }, { "id": "580", "translation": { "en": "In the last decades, rarity of chromosomal rearrangements and fusion genes detected in epithelial cancers in using classical karyotyping led to consider these genomic events as specifically restricted to haematological neoplasia and mesenchymal tumors.", "fr": "La rareté de réarrangements chromosomiques et/ou de gènes de fusion dans les tumeurs épithéliales mis en évidence par caryotypage classique a conduit la communauté des oncologues à penser, pendant plusieurs décennies, que ces évènements génomiques concernaient exclusivement hémopathies et tumeurs mésenchymateuses." } }, { "id": "581", "translation": { "en": "While this model finds some empirical support at the molecular level, it fails to accurately predict cancer incidence patterns i) at old ages and ii) between species.", "fr": "Si des observations moléculaires empiriques valident partiellement ces modèles multistades, ceux-ci ne permettent pas de prédire les patrons d'incidence du cancer i) aux grands âges et ii) entre les espèces (Paradoxe de Peto)." } }, { "id": "582", "translation": { "en": "Thus, understanding of these proteins structure could allow us to better understand their role within the viral replication process and the development of new therapies targeting these domains.", "fr": "Ainsi, la compréhension de la structure de ces protéines pourrait permettent de mieux appréhender leur fonctionnement au sein du processus de réplication du CMVH et le développement de nouvelles thérapies ciblant ces domaines." } }, { "id": "583", "translation": { "en": "The physiological changes at the tissular level characterizing the progression of the disease are still poorly understood.", "fr": "Les changements physiologiques au niveau tissulaire caractérisant la progression de la maladie sont encore mal connus." } }, { "id": "584", "translation": { "en": "In a second step, we focused on the behavior of the attenuated and virulent viruses generated by reverse genetics. The viruses were tagged with fluorescent reporter genes to make easier they follow up in cell culture.", "fr": "Dans un second temps, nous nous sommes intéressés à étudier le comportement in vitro de virus atténués et virulents équipés de marqueurs fluorescents." } }, { "id": "585", "translation": { "en": "This thesis proposes an integrated approach for blockchain and IoT to support the dynamic aspects in the supply chain of dangerous goods.", "fr": "Cette thèse propose une approche intégrée pour la blockchain et l'IoT afin de prendre en charge les aspects dynamiques dans la chaîne d'approvisionnement des marchandises dangereuses." } }, { "id": "586", "translation": { "en": "We then showed that the genetic diversity of CC mice, which IFNAR was blocked by anti-IFNAR antibody, expressed phenotypes ranging from complete resistance to severe symptoms and death with large variations in the peak and rate of decrease of plasma viral load, in brain viral load, in brain histopathology and in viral replication rate in infected cells.", "fr": "La diversité génétique des souris CC, préalablement traitées par un anticorps bloquant le récepteur IFNAR, s'exprime par des phénotypes allant d'une résistance complète jusqu'à des formes sévères de la maladie. L'influence des facteurs génétiques de l'hôte s'exerce sur de nombreux paramètres tels que la virémie, la charge virale et les lésions pathologiques dans le cerveau, et enfin le taux de réplication dans les cellules infectées." } }, { "id": "587", "translation": { "en": "However, variants of uncertain clinical significance (VUS) are detected in 5% to 15% of tested patients.", "fr": "Cependant, des variants de signification clinique incertaine (VUS pour \"variants of uncertain clinical significance\") sont détectés dans 5% à 15% des cas testés." } }, { "id": "588", "translation": { "en": "Altogether, the results allow to better understand the complex relationships between each cancer and the associated immune infiltrate, and will later lead to help the development of immunotherapeutic strategies more adapted to a given tumour environment, by targeting the immune populations that could really impact the survival of patients.", "fr": "L'ensemble de ces résultats permet de mieux comprendre les relations complexes entre chaque cancer et son infiltrat cellulaire, et permettra à terme d'aider à développer des stratégies immuno-thérapeutiques plus adaptées à un environnement tumoral donné, en ciblant les populations immunitaires pouvant réellement impacter la survie des patients." } }, { "id": "589", "translation": { "en": "Weshow that PatchSearch efficiently finds known patches on protein surfaces.", "fr": "Nous montrons que PatchSearch trouve des patches qui correspondent à ceux qui sont connus sur les surfaces ciblées." } }, { "id": "590", "translation": { "en": "We use as attributes the enzymatic activities, as classes the taxonomic groups and as examples the fungi.", "fr": "Nous utilisons comme attributs les activités enzymatiques, comme classe les groupes taxonomiques et comme exemples les champignons." } }, { "id": "591", "translation": { "en": "We will use a reference-free transcriptomics method without “a-priori” that will not be restricted to the annoted RNAs.", "fr": "Nous allons utiliser une nouvelle méthode sans référence qui ne sera donc pas restreinte aux ARNs annotés." } }, { "id": "592", "translation": { "en": "Therefore, several methodologies have been developed to identify functional correlations between genes such as “phylogenetic profiles”.", "fr": "En conséquence, plusieurs méthodologies ont été développées pour mettre en évidence des corrélations fonctionnelles entre gènes. Parmi celles-ci figure la méthode des profils phylogénétiques." } }, { "id": "593", "translation": { "en": "L. lactis MG1363 genome encodes several proteins with a CXXC motif, potentially linked with a redox activity.", "fr": "Le génome de L. lactis MG1363 code plusieurs protéines possédant un motif CXXC potentiellement liées à une activité redox." } }, { "id": "594", "translation": { "en": "This has resulted in the rapid development of deep learning-based methods, such as StarDist, that demonstrated amazing performances for accurately segmenting nuclei.", "fr": "Cette situation a entraîné le développement rapide de méthodes basées sur l'apprentissage profond, telles que StarDist, qui ont démontré des performances impressionnantes pour la segmentation précise des noyaux." } }, { "id": "595", "translation": { "en": "Once the knowledge graph is complete, different machine learning algorithms will be applied to embed the graph and extract representation vectors of entities.", "fr": "Une fois le graphe de connaissances complet, des algorithmes d'apprentissage basés sur le plongement (embedding) seront appliqués au graphe afin d'extraire des vecteurs représentant les entités." } }, { "id": "596", "translation": { "en": "In this context, I did a literature review, and I developed a network embedding method based on MultiXrank.", "fr": "Dans ce cadre, j'ai réalisé une revue de littérature et développé une méthode d'embedding basée sur MultiXrank." } }, { "id": "597", "translation": { "en": "Hepatitis C virus (HCV) is a major threat to global health, with over 130 million annual infections.", "fr": "Le virus de l'hépatite C (VHC) est une menace majeure avec plus de 130 millions de personnes infectées chaque année." } }, { "id": "598", "translation": { "en": "Upstream of this research on the genus Lavandula different bioinformatic tools have been developed.", "fr": "En amont de ces recherches sur les COV du genre Lavandula, différent outils de bioinformatique ont été développés." } }, { "id": "599", "translation": { "en": "The subject of my thesis concerns the study of indexing structures and data compression methods to find a solution to the problem of indexing a collection of similar genomes.", "fr": "Le sujet de ma thèse concerne l'étude des structures d'indexation et les méthodes de compression de données pour palier au problème d'indexation d'une collection de génomes similaires." } }, { "id": "600", "translation": { "en": "More formally, a consensus ranking is a ranking that minimizes the sum of the distances between this consensus and the input rankings.", "fr": "Plus formellement, un consensus de classements est un classement qui minimise le somme des distances entre ce consensus et chacun des classements en entrés." } }, { "id": "601", "translation": { "en": "Concurrently, deep learning is the established state-of-the-art image analysis and computer vision applications.", "fr": "Parallèlement, l'état de l'art établi en matière d'applications d'analyse d'images et de vision par ordinateur est l'apprentissage profond." } }, { "id": "602", "translation": { "en": "The molecular mechanisms of psychiatric diseases are still poorly understood.", "fr": "Les mécanismes moléculaires des maladies psychiatriques sont encore mal compris." } }, { "id": "603", "translation": { "en": "LMA is an algorithm to describe a motion by using its four components: Body, Space, Shape and Effort.", "fr": "LMA est un algorithme pour décrire un mouvement en utilisant ses quatre composants: le corps, l'espace, la forme et l'effort." } }, { "id": "604", "translation": { "en": "The results showed a good correlation (70% of the adverse events in humans were detected in animal studies) and an early time to first appearance of concordant animal toxicity: 94% were first observed in studies of 1 month or less in duration.", "fr": "Les résultats montrent une bonne prédictivité (70 % des effets secondaires observés chez l'Homme étaient détectés chez l'animal) ainsi qu'une identification précoce : 94 % des organes cibles chez l'animal retrouvés dans les études cliniques sont observés dans des études d'une durée inférieure ou égale à 4 semaines." } }, { "id": "605", "translation": { "en": "To investigate bacterial adaptation in changing environments, we have tracked growth and gene expression of single cells of textit{Escherichia coli} bacteria growing in a microfluidics device in changing environments.", "fr": "Pour étudier l'adaptation des bactéries dans des environnements changeants, nous avons suivi la croissance et l'expression génétique de cellules uniques de bactéries textit{Escherichia coli} se développant dans un dispositif microfluidique dans des environnements changeants." } }, { "id": "606", "translation": { "en": "We were able to observe again that mice with a more active Tfr population had a lower level of specific IgE antibodies.", "fr": "Nous avons pu observer à nouveau que les souris présentant une population Tfr plus active présentaient un taux amoindri d'anticorps IgE spécifiques." } }, { "id": "607", "translation": { "en": "At the core of such an approach lies the problem of extracting of a subset of edges in an undirected graph under a fixed treewidh budget, a problem whose resolution and study of algorithmic properties will constitute the main objective of this PhD.", "fr": "Le problème algorithmique sous-jacent, l'extraction de sous-ensembles d'arêtes maximal sous contrainte de largeur arborescence bornée, constituera l'objectif principal de ce doctorat sur le plan algorithmique." } }, { "id": "608", "translation": { "en": "They therefore suggest that an adaptive symbology should be considered, which cannot be summarized by the change in brightness currently available to pilots.", "fr": "Ils suggèrent donc qu'il faille envisager une symbologie adaptative qui ne peux se résumer au changement de luminosité dont dispose actuellement les pilotes." } }, { "id": "609", "translation": { "en": "Proteins are involved in many biological processes.", "fr": "Les protéines sont impliquées dans de nombreux processus biologiques." } }, { "id": "610", "translation": { "en": "This study has four objectives: i) to understand the gating mechanism of the KirBac3.1, ii) to understand the impact of the mutation W46R on the channel (W68R equivalent in Kir6.2 causing hyperinsulinsm), iii) to understand the impact of the mutation S129R on the channel, iv) to resolve the structure of Kir2.1 at an atomic level.", "fr": "Cette étude a quatre objectifs: i) comprendre le mécanisme moléculaire d'ouverture et de fermeture de KirBac3.1, ii) comprendre l'impact de la mutation W46R sur le canal, iii) comprendre l'impact de la mutation S129R, une mutation conçue pour stabiliser l'état ouvert du canal, iv) résoudre la structure de Kir2.1 humain par cryo-microscopie." } }, { "id": "611", "translation": { "en": "The adoption of this kind of model could lead to an acceleration of exchanges and a better availability of data analysis workflows.", "fr": "L'adoption de ce type de modèle pourrait déboucher sur une accélération des échanges et de la mise à disposition des chaînes de traitements d'analyse de données." } }, { "id": "612", "translation": { "en": "Such tools are grounded on an a priori similarity measure between the objects to be handled, which have been named kernel in the functional anlysys literature.", "fr": "Ces outils reposent sur le choix à priori d'une fonction de similarité entre paires d'objets traités communément appelées noyau en analyse fonctionnelle." } }, { "id": "613", "translation": { "en": "In medicinal chemistry, models generated from in silico approaches are an alternative to long and costly experiments.", "fr": "En chimie médicinale, les modèles générés à partir des approches in silico constituent une alternative aux expérimentations longues et coûteuses." } }, { "id": "614", "translation": { "en": "Nonetheless, most of the environments studied through these techniques concentrated on relatively easily accessible, tractable and host-related ecosystems such as plankton (especially in marine ecosystems), soils and gut microbiomes.", "fr": "Cependant, ces efforts ont été principalement appliqués sur des environnements facilement accessibles ou liés à l'humain, comme le plancton (marin principalement) et la flore intestinale." } }, { "id": "615", "translation": { "en": "Diatom MLE expression was dependent on the thermal conditions and on the species. Our results suggest that MLE are widespread in diatom genomes and that they have an ancestral presence in the green lineage.", "fr": "L‟expression des MLE des diatomées est variable selon les conditions thermiques et selon les espèces.L‟ensemble de nos résultats suggère que les MLE sont ubiquistes dans les génomes de diatomées et qu‟ils sont présents de manière ancestrale dans la lignée végétale." } }, { "id": "616", "translation": { "en": "Altogether, the datastructure and algorithms compose SpecOMS,a software available to the community.", "fr": "L'ensemble constitue le logiciel SpecOMS diffusé à la communauté." } }, { "id": "617", "translation": { "en": "After an anonymization work of patient data many clinical information routines were made public.", "fr": "Après un travail d'anonymisation des données de patient de nombreuses informations cliniques de routines ont été rendues publiques." } }, { "id": "618", "translation": { "en": "The results suggest a frequent phenomenon (found in more than 50% of colonies), and although most intracolonial allelic variations are non-coding or silent, several diverse genes and biological functions are impacted.", "fr": "Les résultats suggèrent un phénomène fréquent (touchant plus de 50% des colonies), et bien que la plupart des variations alléliques intra-coloniales soient non codantes ou silencieuses, la diversité des gènes et des fonctions biologiques impactés n'en reste pas moins élevée." } }, { "id": "619", "translation": { "en": "The identification of all biomolecules and their interactions is required to build their interaction networks. Their structural and functional analysis with bioinformatics tools (BiNGO, DAVID) allow us to identify the key biomolecules, to predict new protein functions and to understand and model the molecular mechanisms of biological or pathological process.", "fr": "Le recensement de l'ensemble des biomolécules et leurs interactions permet de construire leurs réseaux d'interactions et de les analyser sur le plan structural et fonctionnel par des outils bioinformatiques (BiNGO, DAVID). Cela permet d'identifier les biomolécules clés, de prédire de nouvelles fonctions des protéines et de comprendre et modéliser les mécanismes moléculaires d'un processus biologique ou pathologique donné." } }, { "id": "620", "translation": { "en": "So an observer is designed based on H_/ H_inf technique aiming at maximizing the fault to residual sensitivity by using the H_ index properties, and minimizing the H_inf norm for worst-case exogenous signals attenuation.", "fr": "Ainsi, un observateur est conçu sur la base de la technique H_/H_inf visant à maximiser la sensibilité des défauts aux signaux résiduels en utilisant les propriétés de l'indice H_, et à minimiser la norme H_inf pour l'atténuation des signaux exogènes dans le pire des cas." } }, { "id": "621", "translation": { "en": "In a Hi-C experiment, DNA molecules are cross-linked with the surrounding proteins and form a large, static protein-DNA complex.", "fr": "Lors d'un protocole de Hi-C, les molécules d'ADN sont réticulées avec les protéines environnantes pour former un complexe protéine-ADN statique et volumineux." } }, { "id": "622", "translation": { "en": "miRNAs are involved in a wide range of biological processes including cell cycle, differentiation, apoptosis, and disease.", "fr": "Les miARNs sont impliqués dans un large éventail de processus biologiques, notamment le cycle cellulaire, la différenciation, l'apoptose et les maladies." } }, { "id": "623", "translation": { "en": "This thesis focuses on two intermediate alternative sequencing strategies that are more precise than metabarcoding but less expensive than shotgun metagenomics.", "fr": "Cette thèse s'intéresse à deux stratégies de séquençage intermédiaires, plus résolutives que le métabarcoding tout en étant moins coûteuses que la métagénomique shotgun." } }, { "id": "624", "translation": { "en": "These are often described as semi-structured data, and can be represented as tables, key delimited records, and XML structures.", "fr": "Elles sont souvent décrites comme des données semi-structurées, et peuvent se présenter sous la forme de tableaux, de structures XML, etc." } }, { "id": "625", "translation": { "en": "During my PhD, I have completed two genome-wide association studies (GWAS) in AIDS, comparing 275 long term non-progressors or the 85 rapid progressors from the GRIV cohort with a cohort of seronegative controls.", "fr": "Durant ma thèse, j'ai réalisé deux études d'association ‘génome entier' dans le SIDA, en comparant les 275 non-progresseurs à long terme ou les 85 progresseurs rapides de la cohorte GRIV avec une cohorte de contrôles séronégatifs." } }, { "id": "626", "translation": { "en": "To this end, a preliminary chemical and biological study was performed on these species.", "fr": "Pour ce faire, ces trois espèces ont tout d'abord été soumises à une étude chimique et biologique préliminaire." } }, { "id": "627", "translation": { "en": "We used LSTM to evaluate this descriptor.", "fr": "Nous avons utilisé LSTM pour évaluer ce descripteur." } }, { "id": "628", "translation": { "en": "The transcriptomics data obtained enabled the estimation of clonal plurality, gene expression and cell composition.", "fr": "Les données de transcriptomique obtenues ont permis d'estimer la pluralité clonale, l'expression génique et la composition cellulaire." } }, { "id": "629", "translation": { "en": "This work is based on a gene finding software (EuGène) that integrates several sources of information in a non-probabilistic graph-based gene structure model (DAG).", "fr": "Le travail réalisé dans le cadre de cette thèse se base sur un logiciel de détection de gènes (EuGène) qui intèges des informations multiples au sein d'un modèle non probabiliste représentant sous la forme d'un graphe (DAG) l'ensemble des structures géniques potentielles d'une séquence ADN." } }, { "id": "630", "translation": { "en": "To face these difficulties, recent innovative and efficient approaches have been developed.", "fr": "Face à ces difficultés, des approches plus innovantes et plus efficaces ont été développées." } }, { "id": "631", "translation": { "en": "They help to draw relevant molecular identity cards of tumors.", "fr": "Elles permettent d'établir de véritables cartes d'identité moléculaires des tumeurs." } }, { "id": "632", "translation": { "en": "Renal diseases have a high impact on the economy of any health care system worldwide.", "fr": "Les maladies rénales ont un impact important sur l'économie de tout système de santé dans le monde." } }, { "id": "633", "translation": { "en": "We introduce the notion of a structured model, develop several exact combinatorial algorithms to infer such models, and present the software, called SMILE, we made using these algorithms.", "fr": "Nous introduisons la notion de modèle structuré, et développons plusieurs algorithmes combinatoires exacts de détection de tels modèles. Nous présentons ensuite l'outil que nous avons conçu à partir de ces algorithmes, dénommé SMILE." } }, { "id": "634", "translation": { "en": "In detail, the second part of work includes 414 pseudoknots, from both the Pseudobase and the Protein Data Bank, and 15 methods including 3 exact methods and 12 heuristic ones.", "fr": "Dans le détail, la deuxième partie du travail comprend 414 pseudonoeuds de Pseudobase et de la Protein Data Bank, ainsi que 15 méthodes dont 3 méthodes exactes et 12 heuristiques." } }, { "id": "635", "translation": { "en": "In addition, the role that extracellular signals such as hormonal modulations could play on the translatome remains to be deciphered.", "fr": "De plus, l'impact que les signaux extracellulaires tels que des modulations hormonales peuvent avoir sur le traductome reste méconnu." } }, { "id": "636", "translation": { "en": "For the last ten years, many companies have been breeding and processing larvae from a circular economy perspective.", "fr": "Depuis une dizaine d'années, un nombre croissant d'entreprises élèvent et transforment des larves dans une optique d'économie circulaire." } }, { "id": "637", "translation": { "en": "Physico-chemical properties and tridimensional structure solved by NMR are the same that those of the catalytical domain of PDI. This work presents the properties of the two atypical thioredoxins, Dtrx and PsTrx. These proteins have similar functional and structural characteristics in vitro, but probably different redox functions in vivo.", "fr": "Les propriétés physico-chimiques, et la structure tridimensionnelle déterminées pour PsTrx par RMN, présentent des caractéristiques identiques à celles observées pour le domaine catalytique de PDI." } }, { "id": "638", "translation": { "en": "The actual knowledge on the conserved viral macro domains suggests that they could interact with 2'‐5‘ oligoadenylates (2‐5As), which are signalling molecules in the induction of the IFN response pathway.", "fr": "Les connaissances actuelles sur les domaines macro viraux suggèrent qu'ils pourraient interagir avec des 2'‐5' oligoadénylates (2‐5As), effecteurs de cette voie de réponse à l'IFN." } }, { "id": "639", "translation": { "en": "The developpement of a new stratgy of annotation and classification, the evolutive analysis and the ancestral state reconstruction allowed to determine the dynamics of these systems implying multiple gains and losses, and homologous recombination events within complete genomes, of a genus or a species.", "fr": "Le développement d'une nouvelle stratégie d'annotation et de classification, l'analyse évolutive et la reconstruction des états ancêtres ont permis de déterminer les dynamiques évolutives de ces systèmes impliquant des gains et pertes multiples et des évènements de recombinaison homologue au sein des génomes complets, d'un genre et d'une espèce." } }, { "id": "640", "translation": { "en": "Functional and selective impacts of these processes on genomes are poorly understood.", "fr": "L'impact fonctionnel et sélectif de ces processus sur les génomes est encore mal connu." } }, { "id": "641", "translation": { "en": "Somatic mutations affecting the Isocitrate Dehydrogenase (IDH) 1 and 2 genes are present in ~20-25% of AMLs; in these pathologies, IDH mutations correspond to early events promoting the occurrence of secondary genetic events.", "fr": "Les mutations somatiques affectant les gènes Isocitrate Déshydrogénase (IDH) 1 et 2 sont présentes dans ~20-25% des LAM; dans ces pathologies, les mutations IDH correspondent à des évènements précoces favorisant la survenue d'événements génétiques secondaires." } }, { "id": "642", "translation": { "en": "The idea is that RNA sequences can be considered as texts expressing a language with a grammar, this language corresponding to the 3D conformations of these sequences.", "fr": "L'idée est que les séquences d'ARN peuvent être considérées comme des textes exprimant un langage avec une grammaire, ce langage correspondant aux conformations 3D de ces séquences." } }, { "id": "643", "translation": { "en": "We appreciated the effect of genetic and environmental factors on expression profiles, to detect biomarkers specific to pathological subclasses of lymphoma and thyroid lesions.", "fr": "Nous avons pu mesurer l'influence de facteurs génétiques et environnementaux, détecter des biomarqueurs ou des profils d'expression spécifiques de sous-classe pathologiques dans des lymphomes et dans des maladies thyroïdiennes." } }, { "id": "644", "translation": { "en": "This computational biology project capitalises on a tight collaboration with the experimental team of Xavier Morin (IBENS).", "fr": "Ce projet de biologie computationnelle s'appuie sur une étroite collaboration avec l'équipe expérimentale de Xavier Morin (IBENS)." } }, { "id": "645", "translation": { "en": "We have also established that EAR containing proteins are preferentially localized in the cell nucleus of eukaryotes, but tend to be more secreted in prokaryotes.", "fr": "Nous avons également établi que les protéines contenant des RAEs sont préférentiellement localisées dans le noyau des cellules eucaryotes, mais ont tendance à être davantage sécrétées chez les procaryotes." } }, { "id": "646", "translation": { "en": "It combines machine learning for articles selection related to a topic of interest (e.g. gene) and text mining to gather information, in particular to populate specialized databases.", "fr": "Il combine l'apprentissage machine pour la sélection d'articles liés à un sujet d'intérêt (ex : gène) et la fouille de textes pour recueillir les informations, notamment pour peupler des bases de données spécialisées." } }, { "id": "647", "translation": { "en": "Given that in Ciliata, Nd genes and trichocysts biogenesis-related genes are similarly transcribed, we then identified genes co-regulated with the Tetrahymena Nd6 gene and conserved in Apicomplexa.", "fr": "Chez Tetrahymena, les gènes impliqués dans la biogenèse et la sécrétion des organites de défense sont exprimés au cours du cycle de façon synchronisée. Dans un criblage bio-informatique, nous avons identifié les gènes de Tetrahymena co-régulés avec le gène Nd6 conservés chez les Apicomplexes." } }, { "id": "648", "translation": { "en": "Recruitment of a cohort with a sufficient size often implies multicentric studies in which analysis of the reproducibility between centres and standardisation of pre-analytical and analytical steps are essential.", "fr": "Le recrutement d'une cohorte suffisante justifie les études multicentriques qui imposent l'analyse de la reproductibilité inter-plates-formes et la standardisation des étapes pré-analytiques et analytiques." } }, { "id": "649", "translation": { "en": "Those two effects can be corrected with specific coefficients.", "fr": "Ces deux effets peuvent être corrigés à l'aide de coefficients spécifiques." } }, { "id": "650", "translation": { "en": "One of the ultimate goals in life science research is the elucidation of the diversity of the phenome (i.e., the set of observable phenotypes) by identifying the internal and environmental factors and their interactions associated with each phenotype.", "fr": "Un des objectifs ultimes de la recherche en sciences de la vie est l'élucidation de la diversité du phénome (c'est-à-dire de l'ensemble des phénotypes observables) par l'identification des facteurs internes, environnementaux et de leurs interactions, associés à chaque phénotype." } }, { "id": "651", "translation": { "en": "This work sheds light on the key importance of non-negative cycles in the interaction graph for the emergence of minimal sequences of control of size greater than or equal to two.", "fr": "L'étude sur la topologie met en lumière l'importance de la présence de cycles non-négatifs dans le graphe d'interaction pour l'émergence de séquences minimales de contrôle de taille supérieure ou égale à deux." } }, { "id": "652", "translation": { "en": "Totoro is a constraint-based approach that takes the stoichiometry of the network into account.", "fr": "Totoro est une approche basée sur les contraintes qui prend en compte la stœchiométrie du réseau." } }, { "id": "653", "translation": { "en": "This tool is applied to phylogenetic trees on which evolutionary events (mutations, gain / loss of biological functions) are placed.", "fr": "Cet outil s'applique sur des arbres phylogénétiques sur lesquels des évènements évolutifs (mutations, gains/pertes de fonctions biologiques) sont placés." } }, { "id": "654", "translation": { "en": "Using bioinformatic approaches, I dedicated my thesis on the study of the genomic diversity and evolutionnary history of the chlorovirus at the genus level, and the transcriptomic of the viral infection.", "fr": "A l'aide d'approches bioinformatiques, j'ai consacré mon travail de thèse à l'étude de la diversité génomique des chlorovirus et de leur histoire évolutive, ainsi qu'à l'étude transcriptomique de l'infection virale chez son hôte." } }, { "id": "655", "translation": { "en": "Despite these filters, the number of errors remains significant, showing the limit of conventional approaches and indicating that some sequencing errors are not random.", "fr": "Malgré ces filtres, le nombre d'artefacts reste important, montrant la limite des approches conventionnelles et indiquant que certains artefacts de séquençage ne sont pas aléatoires." } }, { "id": "656", "translation": { "en": "This study have permit to understand the evolution of helitron family.", "fr": "Cette étude a permis de comprendre l'évolution d'une famille d'hélitrons." } }, { "id": "657", "translation": { "en": "During embryogenesis, cardiogenesis is mediated by a gene regulatory network which includes conserved signaling pathways and transcription factors, and leads to the formation of a linear cardiac tube.", "fr": "Au cours de l'embryogenèse, la cardiogenèse est réalisée grâce à un réseau de régulation génique (GRN) qui conduit à la formation d'un simple tube cardiaque linéaire." } }, { "id": "658", "translation": { "en": "I participated to the functional validation of this mutation.", "fr": "J'ai participé à la validation fonctionnelle de cette mutation." } }, { "id": "659", "translation": { "en": "However, the exact molecular mechanisms underlying anthocyanin cardioprotective effects are not fully understood.", "fr": "Cependant, les mécanismes moléculaires sous-jacents aux effets cardio-protecteurs de l'anthocyanine ne sont pas entièrement compris." } }, { "id": "660", "translation": { "en": "This thesis proposes to define personalized mechanistic models of cancer.", "fr": "Cette thèse propose en premier lieu de définir des modèles mécanistiques personnalisés de cancer." } }, { "id": "661", "translation": { "en": "This meta-system, based on the concept of metaheuristic, tries to optimize the behavior of the system, according to precise problems, by evaluating the impact of preset factors on the evolution of the AOS.", "fr": "Ce méta-système, basé sur le concept de métaheuristique, cherche à optimiser le comportement du système en fonction d'une problématique précise en évaluant l'impact de facteurs prédéfinis sur l'évolution de la SOA." } }, { "id": "662", "translation": { "en": "Currently, 22 compounds are being tested on a human cell line expressing the enzymes of steroidogenesis (NCI-H295R) to evaluate their potential endocrine disrupting effects.", "fr": "22 composés sont en cours de test sur une lignée cellulaire humaine exprimant les enzymes de la stéroïdogenèse (NCI-H295R) pour évaluer leur potentiel effet perturbateur endocrinien." } }, { "id": "663", "translation": { "en": "However, the immune response at the root level remains very little studied.", "fr": "Cependant, la réponse immunitaire au niveau de la racine reste très peu étudiée." } }, { "id": "664", "translation": { "en": "In a second study, we constructed and described the bovine proteomes of both tissues at 140 dpc.", "fr": "Dans une seconde étude, nous avons décrit les protéomes des deux tissus à 140 jpc." } }, { "id": "665", "translation": { "en": "During my PhD, I confirmed that in UM cells, PRL-3 expression modify the phosphorylation state of CRMP2 in particular on T514 and S522 residues.", "fr": "Au cours de ma thèse, j'ai pu confirmer que dans les cellules de MU, PRL-3 modifie l'état de phosphorylation de CRMP2 en particulier sur les résidus T514 et S522." } }, { "id": "666", "translation": { "en": "As a result, vas! amounts of data have been generated and researchers are now confronted to both bioinformatic and biostatistic challenges to make sense of such data in the context of obesity and its complications.", "fr": "En conséquence, de vastes quantités de données ont été générées et les chercheurs sont maintenant confrontés à des défis bioinformatiques et biostatistiques pour extraire de ces données de l'information en lien avec l'obésité et ses complications." } }, { "id": "667", "translation": { "en": "Indeed, beyond the financial benefits and the technology transfer opportunities, these non-monetary benefits are essentials in order to perpetuate the original goals which are battered by techonological developments.", "fr": "En effet, au-delà des avantages monétaires et du transfert de technologie, ces avantages non monétaires sont essentiels afin de perpétuer les objectifs initiaux de la Convention sur la diversité biologique, malmenés par l'évolution des techniques." } }, { "id": "668", "translation": { "en": "The tedious process of cloning those DNA fragments for sequencing got fastened up by the steady improvement of sequencing technologies.", "fr": "Le processus autrefois fastidieux de clonage de ces fragments d'ADN pour le séquençage a été accéléré par l'amélioration constante des technologies de séquençage." } }, { "id": "669", "translation": { "en": "Finally, proper expression and regulation of chromatin remodelers seem to be critical for male fertility, as revealed by both the transcriptomic and the epigenetic data.", "fr": "Enfin, nos données transcriptomiques et épigénétiques tendent à indiquer qu'une expression et une régulation adéquates des gènes impliqués dans le remodelage de la chromatine constituent un facteur clé pour la fertilité masculine." } }, { "id": "670", "translation": { "en": "Developing efficient algorithms to learn appropriate representations of structured data, including sequences or graphs, is a major and central challenge in machine learning.", "fr": "Le développement d'algorithmes efficaces pour apprendre des représentations appropriées des données structurées, telles des sequences ou des graphes, est un défi majeur et central de l'apprentissage automatique." } }, { "id": "671", "translation": { "en": "These algorithms have been implemented in order to provide biologists with tools that detect efficiently these repeats in real large sequences, such as human chromosomes.", "fr": "Ces algorithmes ont été implantés afin de mettre à disposition des biologistes des outils qui détectent efficacement ces répétitions dans de très grandes séquences génomiques, telles les chromosomes humains." } }, { "id": "672", "translation": { "en": "This work is situated in the heart of a recent domain: (bio)molecular computing, which is a domain where biology and computer science meet.", "fr": "Ce travail se situe au c?ur d'un domaine récent: les calculs (bio)moléculaires qui se place à la rencontre de la biologie et de l'informatique." } }, { "id": "673", "translation": { "en": "This habilitation thesis gathers several works in the field of formal methods for biology.", "fr": "Cette synthèse pour l'HDR est un recueil de plusieurs travaux dans le domaine des méthodes formelles pour la biologie." } }, { "id": "674", "translation": { "en": "We selected 9 patients, 3 untreated, 3 stable on therapy and 3 responders.", "fr": "Nous avons alors sélectionné 9 patients, 3 non traités, 3 stables sous traitement sans réponse objective, et 3 répondeurs." } }, { "id": "675", "translation": { "en": "We show that these structures entail a family of particular stability properties which can be characterized by a fragment of CTL over infinite state structures.", "fr": "Nous montrons que ces structures définissent une famille de propriétés qui peuvent être caractérisés par un fragment de CTL sur les structures infinies." } }, { "id": "676", "translation": { "en": "During my PhD, I first evaluated OMS strategies with theoretical spectra playing the role of experimental spectra, which enabled the development of new criteria to evaluate PSMs.", "fr": "Dans le cadre de cette thèse, j'ai d'abord évalué des stratégies OMS à l'aide de spectres théoriques jouant le rôle de spectres expérimentaux, ce qui a permis de développer de nouveaux critères pour évaluer les PSM." } }, { "id": "677", "translation": { "en": "Finally, we have analyzed the preferences of MADS box transcription factors, known to bind the same DNA sequences and whose role is to determine the identity of floral organs.", "fr": "Enfin, nous avons analysé les préférences des facteurs de transcription à boîte MADS, connus pour lier les mêmes séquences d'ADN et dont le rôle est de déterminer l'identité des organes floraux." } }, { "id": "678", "translation": { "en": "Further research using these and similar models could be useful for both developing new treatments and predicting effects for each patient.", "fr": "Des recherches futures utilisant ces modèles pourraient être utiles à la fois pour développer de nouveaux traitements et pour prévoir les effets potentiels pour chaque patient." } }, { "id": "679", "translation": { "en": "Preponderant genera in both states are highlighted.", "fr": "Les genres prépondérants lors des deux états sont mis en évidence." } }, { "id": "680", "translation": { "en": "This work has been conducted in close collaboration with biologists, epidemiologists and IT specialists.", "fr": "Ce travail a été réalisé en étroite collaboration avec des biologistes, épidémiologistes et informaticiens." } }, { "id": "681", "translation": { "en": "Integrative bioinformatics is one field attempting to tackle this problem by providing unified access.", "fr": "La bioinformatique intégrative a pour objectif de résoudre ce problème en proposant un accès unifié." } }, { "id": "682", "translation": { "en": "These observations benefited greatly from the development of the second generation of RNA-sequencing (RNA-seq).", "fr": "Ces observations sont largement tributaires du développement de la seconde génération de séquençage haut-débit de l'ARN (RNA-seq)." } }, { "id": "683", "translation": { "en": "SNK algorithm has been modified to be well adapted to biological needs expressed by our biologist collaborators. SNK has been successfully used to study a protein family.", "fr": "Pour répondre à un besoin de nos collaborateurs, nous avons étendu l'algorithme SNK en lui donnant une spécification plus adaptée à la biologie, puis nous avons utilisé avec succès SNK pour l'étude d'une famille protéique." } }, { "id": "684", "translation": { "en": "In the context of Bioinformatics, many problems are proven to be NP-hard, but nevertheless admit efficient solutions under the assumption of restricted values by selected parameters of the instance (Fixed-Parameter Tractable).", "fr": "Dans le contexte de la bioinformatique, de nombreux problèmes algorithmiques s'avèrent NP-difficiles, mais admettent néanmoins des solutions efficaces en supposant une restriction de certains paramètres sur les données en entrées (FPT)." } }, { "id": "685", "translation": { "en": "The interactions are complex between cytotoxic agents and the tumor and / or its microenvironment.", "fr": "Les interactions sont complexes entre les agents cytotoxiques et la tumeur et/ou son microenvironnement." } }, { "id": "686", "translation": { "en": "The modeling method was applied to rare diseases to predict their causes from the genetic to the cellular, physiological, and whole organism levels.", "fr": "La méthode de modélisation a été appliquée aux maladies rares pour prédire leurs causes, depuis les niveaux génétique, cellulaire et physiologique jusqu'au niveau de l'organisme entier." } }, { "id": "687", "translation": { "en": "In both the coding and non coding sequences, alterations were observed to be mainly transitions.", "fr": "Dans l'exome, comme dans le reste du génome, les altérations principales sont des transitions." } }, { "id": "688", "translation": { "en": "For instance, thousands of long non-coding RNAs (lncRNAs) are transcribed by mammalian genomes, presumably expanding their regulatory capacity.", "fr": "Par exemple, les mammifères transcrivent des milliers d'ARN longs non codants (ARNlnc), accroissant ainsi la capacité régulatrice de leurs cellules." } }, { "id": "689", "translation": { "en": "We developed an approach to characterize such motifs in A. thaliana.", "fr": "Chez A. thaliana, nous avons mis au point une approche pour caractériser de tels motifs." } }, { "id": "690", "translation": { "en": "In average, 3 out of the 14 mutations identified in each patient affected recurrently mutated genes.", "fr": "En moyenne, 3 des 14 mutations affectent des gènes touchés de façon récurrente." } }, { "id": "691", "translation": { "en": "Dogs spontaneously develop genetic diseases, rare in humans, but frequent in some dog breeds, which simplifies the genetic analyzes.", "fr": "Le chien développe spontanément des maladies génétiques, rares chez l'Homme, mais fréquentes dans certaines races de chiens, ce qui simplifie les analyses génétiques." } }, { "id": "692", "translation": { "en": "The biocidal activity was also studied against Staphylococcus aureus and Vibrio strains.", "fr": "L'activité biocide a été également étudiée contre les souches Staphylococcus aureus et Vibrio." } }, { "id": "693", "translation": { "en": "The pace of new genes discovery has been dramatically accelerated by the availability of the human genome sequence in the 2000s, and the next-generation sequencing technologies in the 2010s.", "fr": "Le séquençage du génome humain dans les années 2000, et l'arrivée du séquençage haut débit dans les années 2010 ont permis une progression phénoménale du rythme de ces découvertes génétiques." } }, { "id": "694", "translation": { "en": "The aim of my thesis was first to develop neolectins with controlled valency and topology to understand the effect of multivalency on the endocytosis mechanism, and second to design lectins with tuned specificity for the recognition of tumor cells.", "fr": "Le but de ma thèse est d'une part de concevoir des néo-lectines de valence et topologie contrôlées pour comprendre l'effet de la multivalence sur le mécanisme d'endocytose, et d'autre part de concevoir des lectines de spécificité modulable afin de les utiliser dans la reconnaissance spécifique des cellules tumorales." } }, { "id": "695", "translation": { "en": "We have also been able to uncover some alternative transcripts associated with the presence of these mutations.", "fr": "Nous avons pu, en outre, identifier quelques transcrits alternatifs associés à la présence de ces mutations." } }, { "id": "696", "translation": { "en": "CBMs have been successfully applied to a wide range of problems for the last 20 years to several aspects of microbial physiology. Main objective of present thesis is to use CBMs as a modeling technique in Microbial Ecology context.", "fr": "Pendent les 20 dernières années, CBMs ont été appliqués avec succès à un large éventail de problèmes dans plusieurs aspects de la physiologie microbienne.L'objectif principal de la présente thèse est d'utiliser les CBM comme une technique de modélisation dans le contexte de l'écologie microbienne." } }, { "id": "697", "translation": { "en": "It is thus freely accessible and available to anyone.", "fr": "La base de données est ainsi librement accessible à toute personne souhaitant la consulter." } }, { "id": "698", "translation": { "en": "On the one hand, the problem of programmability: the programming should be simple, as close as possible to the conventional sequential programming and independent of the target architecture.", "fr": "D'une part, le problème de programmabilité: la programmation doit rester simple, la plus proche possible de la programmation séquentielle classique et indépendante de l'architecture cible." } }, { "id": "699", "translation": { "en": "However, the development of new clustering methods and their evaluation is essential to answer to new biological questions.", "fr": "Cependant, le développement de nouvelles méthodes de classification et leur évaluation est indispensable pour répondre aux nouvelles questions biologiques posées." } }, { "id": "700", "translation": { "en": "mRNA reference values and validated tools are now available to advance researches on retinoid signalling in the lung.", "fr": "Des valeurs ARNm de référence ainsi que des outils validés sont maintenant disponibles pour faire progresser la recherche sur le signal rétinoïde dans les cellules bronchiques." } }, { "id": "701", "translation": { "en": "In the final section, the basic associative rules between sequence, mutation, structural impact and clinical phenotypes are discussed, illustrated by the analysis of two well-studied proteins for which the genotype/phenotype correlations are partially elucidated.", "fr": "Les règles d'association de base entre séquence, mutations, impacts structuraux et phénotypes cliniques associés sont finalement discutées, en se basant sur l'étude de deux protéines dont la relation génotype/phénotype est en partie élucidée." } }, { "id": "702", "translation": { "en": "In particular, it has been problem-focused and makes expedient use of approximations, simulations, etc.", "fr": "En particulier, il a été axé sur les problèmes rencontrés et fait un usage judicieux des approximations, des simulations, etc." } }, { "id": "703", "translation": { "en": "I have selected 96 targets, based on their structural and/or functional signifiance, cloned into a His-tag vector.", "fr": "J'ai sélectionné 96 cibles parmi ces modules, en fonction de leur intérêt structural et/ou fonctionnel, et les ait inséré dans un vecteur avec une étiquette poly-His." } }, { "id": "704", "translation": { "en": "We suggest four ways of thinking about the design of their corporate strategies.", "fr": "Nous leur suggérons quatre pistes de réflexion pour concevoir la stratégie de leur entreprise." } }, { "id": "705", "translation": { "en": "PCA is already standard for correcting for population substructure in GWAS; my results point to it's broader applicability as a general strategy for dealing with the high dimensionality of genomic association data.", "fr": "L'APC est déjà la norme pour corriger la structure de la population dans le GWAS; mes résultats indiquent qu'elle est aussi une stratégie générale pour faire face à la forte dimensionnalité des données génomiques d'association." } }, { "id": "706", "translation": { "en": "Thus, text mining and automated information extraction are becoming key elements of the biocuration process.", "fr": "Ainsi, l'exploration de textes et l'automatisation de l'extraction d'informations deviennent des éléments clés du processus de bio curation." } }, { "id": "707", "translation": { "en": "The work that will be carried out during this thesis will support the vanilla breeding program. program conducted by the UMR PVBMT in La Réunion, through the production of an improved version of the complete and annotated genome sequence of V. planifolia, which will serve as the molecular molecular basis for the whole work.", "fr": "Les travaux qui seront menés au cours de cette thèse serviront d'appui au programme de sélection et d'amélioration variétale des vanilliers mené par l'UMR PVBMT à La Réunion, grâce à la production d'une version améliorée de la séquence complète et annotée du génome de V. planifolia, qui servira de base moléculaire à l'ensemble des travaux." } }, { "id": "708", "translation": { "en": "In a second step, we studied the impact of insertions of these transposable elements on certain agronomic traits (TE-GWAS).", "fr": "Dans un second temps, nous avons étudié l'impact des insertions de ces éléments transposables sur certains caractères agronomiques (TE-GWAS)." } }, { "id": "709", "translation": { "en": "To facilitate the research and composition of SW, several approaches emanating from the semantic web community propose to describe the functional and / or non-functional properties based on domain ontologies.", "fr": "Pour faciliter la recherche et la composition de SW, plusieurs approches émanant de la communauté Web sémantique proposent de décrire les propriétés fonctionnelles et/ou non fonctionnelles en se basant sur des ontologies du domaine." } }, { "id": "710", "translation": { "en": "A complete reorganisation of the structure of the existing database and its interface has been achieved.", "fr": "La refonte complète de la structure de la base de données préexistantes et de son interface a été ainsi réalisée." } }, { "id": "711", "translation": { "en": "The objective of my thesis is to elucidate the genetic mechanisms underlying HPE and to propose novel bioinformatic strategies of pathogenic variant interpretation in complex genetic disorders.", "fr": "L'objectif de ma thèse est de préciser les mécanismes génétiques impliqués dans l'HPE et de proposer des nouvelles approches bio-informatiques pour améliorer le diagnostic des maladies génétiques complexes." } }, { "id": "712", "translation": { "en": "Bacterial multi-drug resistance is of major concern in the case of clinic.", "fr": "La multi-résistance aux drogues des bactéries est un problème majeur en clinique." } }, { "id": "713", "translation": { "en": "Statistically, each organism has a specific frequency of nucleotide use in its genome.", "fr": "Statistiquement, chaque organisme a une fréquence d'utilisation des nucléotides dans son génome qui lui est propre." } }, { "id": "714", "translation": { "en": "We did this through global sampling using the CO1 gene and assembling about 60 complete mitochondrial genomes.", "fr": "Nous l'avons fait au moyen d'un échantillonnage mondial en utilisant à la fois le gène CO1 et l'assemblage d'une soixantaine de génomes mitochondriaux complets." } }, { "id": "715", "translation": { "en": "This second component is now widely accepted as a major evolutionary force that constantly reshaped genomes throughout evolution.", "fr": "Cette deuxième composante est maintenant reconnue comme une force évolutive majeure ayant remodelé les génomes tout au long de l'évolution." } }, { "id": "716", "translation": { "en": "This allows determining the hyper-functionalization of 5AQ and the subfunctionalization of 5Dq and more interestingly the subfunctionalization of the pseudogene 5Bq. All three homoeologs were shown to contribute to the domestication traits and regulate each others.", "fr": "J'ai pu ainsi caractériser l'hyper-fonctionalisation de l'homéologue 5AQ, et la sous-fonctionalisation des homéologues 5Dq et plus étonnamment 5Bq, pseudogénéisé ; les trois homéologues contribuent aux caractères de domestication et se régulent entre eux." } }, { "id": "717", "translation": { "en": "Therefore, a better comprehension of UM metastatic process and identification of the genes involved are major issues for the development of new therapies.", "fr": "Ainsi, une meilleure compréhension du processus métastatique et l'identification des gènes impliqués dans celui-ci sont des enjeux importants pour permettre le développement de nouvelles thérapies." } }, { "id": "718", "translation": { "en": "Thus, we first focused on TNF polymorphisms.", "fr": "Ainsi, nous nous sommes tout d'abord intéressés aux polymorphismes du TNF." } }, { "id": "719", "translation": { "en": "Indeed, analytical methods and bioinformatics processing can introduce biases in the composition of viromes.", "fr": "En effet, les méthodes analytiques et de traitements bioinformatiques peuvent introduire des biais dans la composition des viromes." } }, { "id": "720", "translation": { "en": "The bioinformatic analysis of these systems includes the identification of partners, the assembly, the reconstruction of incomplete systems, the classification in sub-families, and the identification of the carried substrate.", "fr": "L'analyse bioinformatique du répertoire de ces systèmes comprend l'identification des partenaires, l'assemblage, la reconstruction des systèmes incomplets, la classification en sous-familles, et l'identification du substrat transporté." } }, { "id": "721", "translation": { "en": "Machine learning models based on multivariate analysis contribute to advance research in GWAS.", "fr": "Les modèles d'apprentissage automatique basés sur l'analyse multivariée contribue à avancer la recherche en GWAS." } }, { "id": "722", "translation": { "en": "Guo et al. 2015 have developed three online services to predict essential genes in bacterial genomes.", "fr": "Les serveurs de prédiction des gènes essentiels En 2015, Guo et ses collaborateurs ont développé trois services en ligne afin de prédire des gènes essentiels au sein de génomes bactériens." } }, { "id": "723", "translation": { "en": "Gene expression regulatory networks make up, for the most part, the basis of physiological cell processes.", "fr": "Les réseaux de contrôle de l'expression génique sont, pour une large part, à la base des processus cellulaires physiologiques ou pathologiques." } }, { "id": "724", "translation": { "en": "The results and experiences, conducted on bioinformatics services and datatypes, show the relevance of our approaches.", "fr": "Les résultats et les expériences, effectués sur des services et des types de données en bioinformatique, montrent la pertinence de nos approches." } }, { "id": "725", "translation": { "en": "Specific control of the 'lac' genes depends on the availability of the substrate lactose to the bacterium.", "fr": "Le contrôle spécifique des gènes 'lac' dépend de la disponibilité en lactose du substrat de la bactérie." } }, { "id": "726", "translation": { "en": "This synthesis was then transferred to a continuous process to increase the productivity of obtaining nanoparticles.", "fr": "Cette synthèse a ensuite été transférée en procédé continu pour augmenter la productivité d'obtention des nanoparticules." } }, { "id": "727", "translation": { "en": "Enhancers close to a list of genes known to be altered in LAL-T and enhancers whose presence is correlated with the overexpression of close oncogenes (NKX3-1, NKX3-2, TAL1, MYC, LMO2, or JDP2) are among them.", "fr": "Parmi eux se trouvent des enhancers proches d'une liste de gènes connus pour être altérés dans la LAL-T et des enhancers dont la présence est corrélée avec la surexpression d'oncogènes proches (NKX3-1, NKX3-2, TAL1, MYC, LMO2, ou JDP2)." } }, { "id": "728", "translation": { "en": "Instead, the description provided by the UCSC Genome Browser has been widely used as a reference.", "fr": "Cependant, la description fournie par l'Explorateur de Génomes de l'UCSC est largement utilisée." } }, { "id": "729", "translation": { "en": "In the three independent experiments conducted for this screen, we see a number of complexes stand out, notably MRX, which is involved in DNA repair pathways, replicative stress management and participates in DNA damage checkpoint activation.", "fr": "Dans les trois expériences indépendantes menées pour ce crible, nous voyons ressortir un certain nombre de complexes, notamment MRX, qui est impliqué dans les voies de réparation de l'ADN, la gestion du stress réplicatif et qui participe à l'activation du checkpoint de dommages à l'ADN." } }, { "id": "730", "translation": { "en": "Curiously however, mapping of Mtr4 binding sites highlighted that Mtr4 binds to sites that are distant from PROMPTs.", "fr": "Curieusement, la cartographie des sites de liaison de MTR4 a mis en évidence que cette hélicase se lie sur des sites distants des PROMPTs." } }, { "id": "731", "translation": { "en": "The thesis project therefore aims to characterise in vivo the virulence of different Bt/Bc strains in the oral poisoning model Drosophila melanogaster.", "fr": "Le projet de thèse vise donc à caractériser in vivo la virulence de différentes souches de Bt/Bc chez le modèle d'intoxication orale Drosophila melanogaster." } }, { "id": "732", "translation": { "en": "This sometimes makes it difficult to ensure the 'consistency' of information, e.g. when different names are used for the same species or different data formats.", "fr": "De ce fait, il est parfois difficile de s'assurer de la consistance des informations." } }, { "id": "733", "translation": { "en": "Each of these strains has two prophages in its genome, Lagaffe and Mushu for F. prausnitzii, Jekyll and Shimadzu for R. intestinalis.", "fr": "Chacune de ces souches possède deux prophages dans son génome, Lagaffe et Mushu pour F. prausnitzii, Jekyll et Shimadzu pour R. intestinalis." } }, { "id": "734", "translation": { "en": "A second straightforward application of the classification is the deorphanization of receptors, i. E. The discovery of a fisrt ligand for an orphan receptor.", "fr": "Une deuxième application immédiate de notre classification est la désorphanisation de récepteurs, c'est-à-dire la découverte d'un premier ligand pour un récepteur orphelin." } }, { "id": "735", "translation": { "en": "In a second step, the importance of candidate functional sites will be tested through genetic approaches directly in P. falciparum parasites using transfection and gene editing techniques.", "fr": "Dans un second temps, des approches génétiques directement chez le parasite, par des techniques de transfection et d'édition de gènes, seront mises en place pour tester l'importance des sites fonctionnels candidats." } }, { "id": "736", "translation": { "en": "This tool will enable to cluster cells based on their multimodal similarities, to extract markers from the different modalities and to transfer annotations from one dataset to another.", "fr": "Cet outil permettra de partitionner les cellules grâce à leurs similarités multimodales, d'extraire des variables charactéristiques de chaque partition à partir des différentes modalités et de transférer des informations d'une modalité à une autre." } }, { "id": "737", "translation": { "en": "In this thesis, we tackle the problem of reconstruction of ancestral DNAsequences by focusing on the nucleotide chains of intermediate size, and have experienced relatively little recombinationover time: chloroplast genomes.", "fr": "Dans cette thèse, nous nous attaquons au problème de reconstruction des séquences ADN ancestrales en nousfocalisant sur des chaînes nucléotidiques de taille intermédiaire, et ayant connu assez peu de recombinaison au coursdu temps : les génomes de chloroplastes." } }, { "id": "738", "translation": { "en": "The thesis presented here, entitled “Genomics and Bioinformatics in the emergence and spread of resistant Plasmodium in Cambodia” aimed to develop new molecular and biological tools for:1) improving our understanding of the collateral impact of the strategies implemented to fight against falciparum malaria on the other Plasmodium species; 2) defining the molecular epidemiology of antimalarial resistant parasites, especially resistance to quinine and artemisinin derivatives;3) studying and defining the structure of P. falciparum parasite populations circulating in Cambodia to estimate areas at risk of spread of artemisinin resistance, using genomic approaches and bioinformatics.", "fr": "Le travail de thèse intitulé \" Approche génomique et bio-informatique de l'émergence et de la diffusion des résistances chez Plasmodium au Cambodge \" avait pour objectif de développer de nouveaux outils moléculaires et biologiques pour 1) une meilleure compréhension de l'impact des stratégies mises en place pour lutter contre le paludisme à P. falciparum sur les autres espèces de Plasmodium, 2) la mise en place d'outils biologique et moléculaire, permettant de mieux définir l'épidémiologie des parasites résistants, en particulier la résistance à la quinine et aux dérivés de l'artémisinine, 3) l'étude et la définition des sous-populations parasitaires circulant au Cambodge afin d'estimer les risques associés à la diffusion de la résistance à l'artémisinine." } }, { "id": "739", "translation": { "en": "All new species emerge of an existing species.", "fr": "Toutes les nouvelles espèces émergent d'une espèce existante." } }, { "id": "740", "translation": { "en": "This format was developed during the Human Genome Project and then adopted by other sequencing projects.", "fr": "Ce format fut développé au cours du Projet Génome Humain puis adopté par d'autres projets de séquençage." } }, { "id": "741", "translation": { "en": "This work presents the development of a new method enabling the design of protein ligands based on the transfer of a set of aminoacids of a known ligand, contributing to the binding of a choosen target on an host protein, containing less than 100 residues (mini-proteins).", "fr": "Ce travail présente le développement d'une nouvelle méthode de conception de ligands protéiques, laquelle repose sur le transfert d'un groupe de résidus, appartenant à un ligand connu et contribuant de façon importante à la liaison avec une cible d'intérêt, sur une protéine hôte, de moins de 100 résidus (mini-protéines)." } }, { "id": "742", "translation": { "en": "Within the frame of this PhD, the first objective will be the understanding of molecular recognition of Ubi enzymes to form an active supramolecular complex using molecular modelling techniques combined with evolutionary information of enzymes.", "fr": "Dans le cadre de cette thèse, le premier objectif sera de mieux comprendre la reconnaissance moléculaire des enzymes Ubi pour former un complexe supramoléculaire actif en utilisant des techniques de modélisation moléculaire combinées à de l'information évolutionnaire de ces enzymes." } }, { "id": "743", "translation": { "en": "I will be modelling the gut microbiota with metabolic networks, and studying their structure through graph theory, machine learning, and statistical inferences to pinpoint metabolic properties that may be involved in the clinical phenotypes of the diseases.", "fr": "Je modélise le microbiote intestinal avec des réseaux métaboliques et j'étudie leur structure par la théorie des graphes, l'apprentissage automatique et l'inférence statistique, pour identifier les propriétés métaboliques associées aux phénotypes cliniques des maladies." } }, { "id": "744", "translation": { "en": "The identification of the interactions occurring at the molecular level is crucial to understand the life process.", "fr": "L'identification des interactions survenant au niveau moléculaire joue un rôle crucial pour la compréhension du vivant." } }, { "id": "745", "translation": { "en": "This occurs because selective constraints are particularly stringent in the case of gene sharing.", "fr": "Cela a lieu car les contraintes sélectives sont particulièrement rigoureuses dans le cas du partage génique." } }, { "id": "746", "translation": { "en": "These proteins belong to a family conserved during evolution, MAP65s.", "fr": "Ces protéines appartiennent à une famille conservée au cours de l'évolution, les MAP65s." } }, { "id": "747", "translation": { "en": "Three types of hydrophilic, hydrophobic and fluorophilic nanoparticles have been obtained.", "fr": "Trois types de nanoparticules hydrophiles, hydrophobes et fluorophiles ont été obtenues après l'échange de ligand." } }, { "id": "748", "translation": { "en": "Tc1-mariner elements are ubiquist ; when they are active, they produce a transposase which cuts and inserts the element into another locus.", "fr": "Les éléments de la famille mariner sont ubiquistes ; lorsqu'ils sont actifs, ilsproduisent une transposase qui coupe l'élément et l'insère dans un autre locus." } }, { "id": "749", "translation": { "en": "As such, this tissue offers a unique system to decipher the genetic and self-organizing processes driving tissue shaping movements and divisions.", "fr": "En tant que tel, ce tissu offre un système unique pour déchiffrer les processus génétiques et d'auto-organisation conduisant les mouvements et divisions de formation des tissus." } }, { "id": "750", "translation": { "en": "An in silico study based on the structure of the MetRS:β-Met complex was conducted in collaboration with the laboratory's bioinformatics team in order to search for mutant enzymes more efficient in the use of β-amino acids.", "fr": "Une étude in silico basée sur la structure du complexe MetRS:β-Met a été menée en collaboration avec l'équipe de Bio-informatique du laboratoire afin de rechercher des enzymes mutantes plus efficaces vis à vis des acides aminés β." } }, { "id": "751", "translation": { "en": "Other members of the Mimiviridae, closer to CeV, also infect unicellular algae.", "fr": "D'autres membres des Mimiviridae, plus proches de CeV, infectent aussi des espèces d'algues unicellulaires." } }, { "id": "752", "translation": { "en": "Several regions of the metastasis are described independently.", "fr": "Afin d'étudier ces divers éléments, plusieurs régions de la métastase sont décrites indépendamment." } }, { "id": "753", "translation": { "en": "Several criteria are considered in order to evaluate the quality of clusters.", "fr": "Nous considérons plusieurs critères pour évaluer la qualité de la parcellisation à une échelle donnée." } }, { "id": "754", "translation": { "en": "The first type of system we adress consist in toral autormorphisms and translations.", "fr": "Les premiers systèmes considérés sont des automorphismes et des translations sur un tore." } }, { "id": "755", "translation": { "en": "We are interested in a bioinformatic method taking advantage of high throughput sequencing technologies for the characterization of compositions of pooled samples of wheat varieties for quality control of flour.", "fr": "Nous nous intéressons à une méthode bioinformatique tirant profit des technologies de séquençage haut débit pour la caractérisation de compositions de mélanges de variétés de blé pour le contrôle qualité de farines." } }, { "id": "756", "translation": { "en": "The method is based on a decomposition of the tree into seeds and the detection of shared seeds between these structures.", "fr": "La méthode se base sur un découpage de l'arborescence en graines et sur une recherche de graines communes entre les structures." } }, { "id": "757", "translation": { "en": "A model combining these different factors will be produced to assess and predict the response to antidepressants.", "fr": "Un modèle combinant ces différents facteurs de variabilité sera réalisé pour évaluer et prédire la réponse aux antidépresseurs." } }, { "id": "758", "translation": { "en": "Hence; this discovery shows for the first time the existence of an ancestral duplication event of the Nav gene in insects.", "fr": "Cette découverte montre alors pour la première fois l'existence d''un événement de duplication du gène des canaux Nav chez les insectes." } }, { "id": "759", "translation": { "en": "Language delay and school disruption were noticed in 18/20 patients.", "fr": "Un retard de langage et une rupture scolaire étaient notés chez 18/20 patients." } }, { "id": "760", "translation": { "en": "MatrixDB allows the construction and the visualization of the entire extracellular network and other types of interaction networks specific of a molecule, a tissue, a disease or a biological process.", "fr": "MatrixDB permet la construction et la visualisation de l'interactome extracellulaire entier et de plusieurs types de réseaux d'interactions, spécifiques d'une molécule, d'un tissu, d'une pathologie ou d'un processus biologique." } }, { "id": "761", "translation": { "en": "However, the relationships of the orders within Dromopoda are not yet sufficiently resolved.", "fr": "Cependant, les relations entre les ordres au sein de Dromopoda ne sont pas encore suffisamment définies." } }, { "id": "762", "translation": { "en": "Moreover, each of these populations is heterogeneous and presents very significant plasticity and differentiation states.", "fr": "En outre, chacune de ces populations est hétérogène et présente des degrés de plasticité et des états de différenciation très variables." } }, { "id": "763", "translation": { "en": "During my PhD, I have created a new tool, HLA-Check, that allows to rate the plausibility of HLA alleles from the genotypes obtained from genotyping chips. I also assesses its performances and showed that it was able to point out individuals with a wrong HLA typing, in order to retype them or remove them from the study.", "fr": "J'ai durant ma thèse créé un nouvel outil, HLA-Check, permettant d'évaluer, à partir des génotypes obtenus par puce de génotypage, la plausibilité de données d'allèles HLA d'un même individu, et démontré que cette technique permettait d'identifier plus précisément les individus dont les allèles HLA avaient été mal caractérisés afin de les retyper ou de les écarter de l'étude." } }, { "id": "764", "translation": { "en": "During this PhD, using a functional validation approach, we have first demonstrated that the nine predicted VapBC systems are Toxin/Antitoxin modules.", "fr": "Au cours de cette thèse, nous avons tout d'abord démontré, par une approche de validation fonctionnelle, que les neuf systèmes VapBC prédits sont des modules Toxine/Antitoxine." } }, { "id": "765", "translation": { "en": "High-throughput screening (HTS) technology has largely improved the efficiency of hazard identification in the in-vitro platform.", "fr": "La technologie de criblage à haut débit (`High-throughput screening'ou HTS) a largement amélioré l'identification de molécules potentiellement dangereuses." } }, { "id": "766", "translation": { "en": "Similarly ER and mitochondrial UPR in neurons are relayed to intestinal cells .", "fr": "De même, les ERP et UPR mitochondriales dans les neurones sont relayés aux cellules intestinales." } }, { "id": "767", "translation": { "en": "Second, a radical change in biodiversity data gathering practices is happening: primary biodiversity data are now mostly observation-based and not specimen-based.", "fr": "Deuxièmement, un changement radical dans la production de ces données: de plus en plus de données primaires de biodiversité sont de simples observations et non plus des spécimens récoltés et mis en collection." } }, { "id": "768", "translation": { "en": "And it is commonly believed that the structures of the RNA molecules hold the key to the discovery of their functions.", "fr": "Et il est accepté généralement que les structures des molécules d'ARN sont la clé de la découverte de leurs fonctions." } }, { "id": "769", "translation": { "en": "Moreover, half of them are up-regulated while the other half are down-regulated.", "fr": "De plus, la moitié d'entre eux est sur-exprimée tandis que l'autre est sous-exprimée." } }, { "id": "770", "translation": { "en": "Each user is given a sum of virtual currency that he will use for running his tasks.", "fr": "Chaque utilisateur se voit attribué un montant de monnaie virtuelle qu'il utilisera pour exécuter ses tâches." } }, { "id": "771", "translation": { "en": "Structural repeats were broadly divided into five classes mainly based on repeat length; Class I – crystalline aggregates; Class II – fibrous structures such as collagen; Class III – elongated structures where the repetitive units require each other for structural stability such as solenoid proteins; Class IV – closed repetitive structures, such as TIM-barrels and Class V – bead on a string structures such as tandems of Ig-fold domains.", "fr": "Les structures répétitives ont été réparties en cinq classes, principalement fondées sur la longueur des TRs: Classe I - agrégats cristallins; Classe II - structures fibreuses; Classe III - structures allongées, dont la stabilité dépend des interactions qui s'établissent entre les motifs répétés. Classe IV - structures répétitives fermées ; Classe V - structures en collier de perles." } }, { "id": "772", "translation": { "en": "In 1796, Pierre André Latreille erected the family Phalangida for the then known harvestmen, but included the genus 'Galeodes' Solifugae.", "fr": "En 1796, Pierre André Latreille a érigé la famille 'Phalangida' comme le groupe maintenant appelé Opilions, mais en incluant également le genre 'Galeodes' Solifugae." } }, { "id": "773", "translation": { "en": "These multiple intercontinental invasions imply a potential risk for this species to invade Europe.", "fr": "Ces multiples invasions intercontinentales impliquent un risque potentiel d'invasion de l'Europe par cette espèce." } }, { "id": "774", "translation": { "en": "The strategy is based on the construction and analysis of multi-layer differential co-expression networks, each layer representing a set of dysregulations of gene pairwise co-expression observed in a given experimental context.", "fr": "Elle repose sur la construction et l'analyse de réseaux multi-couches de co-expression différentielle, chaque couche représentant l'ensemble des dérégulations de la co-expression génique observée pour un contexte expérimental donné." } }, { "id": "775", "translation": { "en": "In addition to the use of OpenSource and powerful tools, we have produced a second similar workflow using proprietary computer resources (Proteome Discoverer software) in order to optimize the extraction of experimental intensities from isotopic clusters.", "fr": "En complément de l'usage d'outils OpenSource et performants, nous avons produit un deuxième workflow similaire dont l'utilisation de ressources informatiques propriétaires (logiciel Proteome Discoverer) a été mis en œuvre dans le but d'optimiser l'extraction des intensités expérimentales des isotopologues dans les clusters isotopiques." } }, { "id": "776", "translation": { "en": "In a single query, this tool synthesizes the biological information stored in public databases or provided by functional annotations from gene ontology.", "fr": "En une seule requête, il synthétise l'information biologique stockée dans les bases de données publiques ou fournie par les annotations fonctionnelles issues de l'ontologie des gènes." } }, { "id": "777", "translation": { "en": "Bioinformatic tools have become essential for microarray processing.", "fr": "Les outils bio-informatiques sont devenus indispensables aux traitements et à l'analyse desdonnées de puces à ADN." } }, { "id": "778", "translation": { "en": "Our collaborators have shown their necessity to the kinase activity of PI4KA and the HCV replication.", "fr": "Nos collaborateurs ont montré qu'ils sont essentiels à l'activité kinase de la protéine ainsi qu'à la replication du VHC." } }, { "id": "779", "translation": { "en": "The quantitative analysis was used to understand eventual links between different pathways.", "fr": "Cette analyse quantitative a également été utilisée pour comprendre les liens éventuels entre les différentes voies." } }, { "id": "780", "translation": { "en": "Some tools of the literature can also determine other types of ncRNAs by comparison with sequences listed in various databases dedicated to ncRNAs (homology-based approach).", "fr": "Certains outils de la littérature peuvent également déterminer d'autres types d'ARNncs par comparaison avec des séquences figurant dans diverses bases de données dédiées aux ARNncs (approche par homologie)." } }, { "id": "781", "translation": { "en": "Building on this work, my thesis takes two approaches to investigate the crosstalk between genome duplication and meiotic recombination, using the fission yeast Schizosaccharomyces pombe as a model system.", "fr": "Basés sur ces résultats, mes travaux de thèse visent à comprendre le lien existant entre la replication du génome et la recombinaison méiotique, via deux approches." } }, { "id": "782", "translation": { "en": "We use in this case a weighted directed hypergraph.", "fr": "Les réseaux métaboliques sont modélisés en utilisant des hypergraphes dirigés et pondérés." } }, { "id": "783", "translation": { "en": "In this thesis, a reconsideration of the processes underlying the differentiation of free-living bacterial populations from the environment was carried out using co-occurring subpopulations of the Prochlorococcus HLII ecotype as models.", "fr": "Au cours de cette thèse, une reconsidération des processus à l'origine de la différenciation de populations bactériennes libres environnementales a été réalisée en prenant comme modèle des sous-populations cooccurrentes de l'écotype HLII de Prochlorococcus." } }, { "id": "784", "translation": { "en": "To understand molecular mechanisms underlying these gene expression modifications, we integrated gradually other genomic data.", "fr": "Afin de comprendre des mécanismes moléculaires sous-jacents de ces modifications d'expression, nous avons progressivement intégré d'autres données génomiques." } }, { "id": "785", "translation": { "en": "Our primary objective is structure learning and thus the graph structure is our parameter of interest.", "fr": "Notre principal objectif est l'apprentissage statistique de la structure de réseaux complexes représentée par un graphe et par conséquent notre objet d'intérêt est cette structure graphique." } }, { "id": "786", "translation": { "en": "The explosion of genomic sequence data has prompted the development of a wide variety of methods, at the interface between bioinformatics, machine learning, and physics, which aim at gaining a deeper understanding of biological systems from such data.", "fr": "L'explosion de données de séquences génomiques a conduit au développement d'une grande variété de méthodes, à l'interface entre la bioinformatique, l'apprentissage automatique et la physique, qui visent à approfondir la compréhension des systèmes biologiques à partir de telles données." } }, { "id": "787", "translation": { "en": "We show that our architecture correctly learns atomic, amino acid, and also higher-level molecular descriptors.", "fr": "Nous montrons que notre architecture apprend effectivement des propriétés des atomes, des acides aminés et des structures moléculaires de niveau supérieur." } }, { "id": "788", "translation": { "en": "By systematically comparing all available gene expression patterns from ANISEED and ZFIN (for zebrafish) I observed a generalized divergence in the gene expression programs of both species, with some similarity noticeable in the locomotory system; 2) what are the gene regulatory networks underlying ascidian development?", "fr": "En comparant les données d'expression de gènes de Ciona et poisson zèbre, j'ai remarqué une divergence généralisé des patrons d'expression des deux espèces, avec plus de similarité dans des tissues liés à la locomotion; 2) quels sont les réseaux de régulation de gènes responsables pour le développement de l'ascidie?" } }, { "id": "789", "translation": { "en": "These software platforms could rally and unite not only the current stakeholders, who are service consumers, but also the service producers, around a disciplinary theme.", "fr": "Elles pourraient capter et fédérer autour d'une thématique disciplinaire non seulement le public actuel des consommateurs de services mais aussi celui des producteurs de services." } }, { "id": "790", "translation": { "en": "Then this population rose back to its original level thanks to the emergence of bacterial mutants resistant to the viral infection.", "fr": "La population bactérienne remonte ensuite à son niveau initial grâce à l'émergence de mutants bactériens résistants à l'infection." } }, { "id": "791", "translation": { "en": "To demonstrate the feasibility of the approach, we formalize the discrete networks of R. Thomas and relevant biological properties, offer a tool based on constraint logic programming in cooperation with a SAT solver, and validate it on significant biological applications. Les récepteurs couplés aux protéines G (RCPG) représentent la plus large famille de récepteurs transmembranaires.", "fr": "Pour montrer la faisabilité de l'approche, nous formalisons les réseaux discrets de R. Thomas et les propriétés biologiques pertinentes, proposons un outil reposant sur la programmation logique par contraintes en coopération avec un solveur SAT, et la validons sur des applications biologiques significatives G protein–coupled receptors represent the largest family of eukaryotic transmembrane signal transduction proteins." } }, { "id": "792", "translation": { "en": "The second chapter describes my first pangenome visualization, published in the journal Bioinformatics under the name ‘Panache: a Web Browser-Based Viewer for Linearized Pangenomes'.", "fr": "Le second chapitre, décrit mon premier outil de visualisation de pangénome, publié dans le journal Bioinformatics sous le titre \" Panache : a Web Browser-Based Viewer for Linearized Pangenomes \"." } }, { "id": "793", "translation": { "en": "Hypomethylation affects genes that are crucial for the differentiation of the germline, spermatic functions, and also on satellite sequences.", "fr": "L'hypométhylation affecte des gènes importants pour la différenciation de la lignée germinale, les fonctions spermatiques, ainsi que des séquences satellites." } }, { "id": "794", "translation": { "en": "Gene expression was also studied all along these parasites life cycle.", "fr": "L'expression des gènes d'Amoebophrya a été étudiée durant tout le cycle de vie du parasite." } }, { "id": "795", "translation": { "en": "Numerous experimental and biblio- graphical data now available on lipid metabolism ; however both the hierarchy of importance of metabolic pathways and the key regulators remain unhnown under various conditions.", "fr": "De nombreuses données expérimentales et bibliographiques sont actuellement disponibles sur le métabolisme des lipides dans différentes espèces. Néamoins, la hiérarchie d'importance des voies métaboliques et les régulateurs clefs de ce métabolisme dans différentes conditions expérimentales restent mal connus." } }, { "id": "796", "translation": { "en": "However, the methods and protocols used so far in metaproteomics are not suitable for large-scale studies.", "fr": "Cependant, les méthodes et protocoles utilisés jusqu'à ce jour en métaprotéomique ne sont pas adaptés à des études de grande ampleur." } }, { "id": "797", "translation": { "en": "A better understanding of the molecular characteristics associated with differentiation blockade and linked to the presence of IDH mutations may eventually lead to the optimization of therapeutic combinations; similarly, a better understanding of the mechanisms associated with response and the identification of somatic variants associated with relapse are essential to understand the efficacy of these new inhibitors.", "fr": "Une meilleure compréhension des caractéristiques moléculaires associés au blocage de la différenciation et lié à la présence des mutations IDH pourra permettre à terme d'optimiser certaines combinaisons thérapeutiques envisagées avec ces inhibiteurs ; de même, une meilleure compréhension des mécanismes associés à la réponse et l'identification de variants somatiques associés à la rechute sont essentiels pour comprendre l'efficacité de ces nouveaux inhibiteurs et pour le suivi des patients engagés dans ces thérapies." } }, { "id": "798", "translation": { "en": "In addition, an early and exacerbated cell death was observed in the CDC48-TAP line, suggesting a role for CDC48 in the hypersensitive response.", "fr": "De plus, une mort cellulaire précoce a été observée chez les cellules CDC48-TAP, suggérant un rôle de cette dernière dans la régulation de la réponse hypersensible." } }, { "id": "799", "translation": { "en": "This review is aiming to give an overview to the reader of the relevance of epigenetic mechanisms for the understanding and treatment of cancer.", "fr": "Cette revue a pour objectif de sensibiliser le lecteur à l'enjeu que représentent les mécanismes épigénétiques dans la compréhension et le traitement du cancer." } }, { "id": "800", "translation": { "en": "The ahpF gene deletion causes a strong sensitivity to the cumene hydroperoxide, but no sensibility for hydrogen peroxide.", "fr": "La délétion du gène ahpF entraîne une forte sensibilité du mutant au cumène hydroperoxyde, mais aucune au peroxyde d'hydrogène." } }, { "id": "801", "translation": { "en": "The proteinprotein interaction and subcellular localization data from HPRD have been used to develop a human protein interaction network.", "fr": "La data d'interaction protéine-protéine et de la localisation subcellulaire de l'HPRD a été utilisées pour développer un réseau d'interaction des protéines humaines." } }, { "id": "802", "translation": { "en": "In this thesis we develop a higher-order calculus rewriting for describing molecules, reaction patterns, and biochemical network generation.", "fr": "Dans cette thèse nous développons un calcul de réécriture d'ordre supérieur pour décrire des molécules, des règles de réaction, et la génération des réseaux biochimiques." } }, { "id": "803", "translation": { "en": "Afterward, a thresholding-based approach is proposed to get the segmentation mask.", "fr": "Ensuite, une approche basée sur le seuillage est proposée pour obtenir le masque de segmentation des noyaux." } }, { "id": "804", "translation": { "en": "These databases are nevertheless not adapted to the study of lichens, since they produce unique metabolites.", "fr": "Ces bases de données ne sont cependant pas adaptées à l'étude des lichens, qui produisent principalement des molécules qui leur sont uniques." } }, { "id": "805", "translation": { "en": "While it is difficult to define species within prokaryotic organisms, 16S marker can be used for determining individual operational taxonomic units OTUs.", "fr": "Il est difficile de définir les espèces au sein des procaryotes, mais le marqueur 16S peut être utilisé pour déterminer des unités taxonomiques opérationnelles OTU." } }, { "id": "806", "translation": { "en": "Network controllability is a major challenge in network medicine. It consists in finding a way to rewire molecular networks to reprogram the cell fate.", "fr": "Un enjeu majeur de la médecine des réseaux est l'identification des perturbations moléculaires induites par les maladies complexes et les thérapies afin de réaliser une reprogrammation cellulaire." } }, { "id": "807", "translation": { "en": "In this context, I realized a very large scale phylogenomic analysis of proteins involved in cell cycle and its regulation in Firmicutes.", "fr": "Dans ce contexte, j'ai réalisé une analyse phylogénomique à très large échelle des protéines impliquées dans le cycle cellulaire et sa régulation chez les Firmicutes." } }, { "id": "808", "translation": { "en": "Ln order to better understand how a biological system works, it is necessary to study the interactions between the different entities that compose it.", "fr": "Afin de mieux comprendre le fonctionnement d'un système biologique, il est nécessaire d'étudier les différentes entités qui le composent." } }, { "id": "809", "translation": { "en": "I perform simulations and study prokaryotes species to confirm its parametrization.", "fr": "Je valide sa paramétrisation par des simulations numériques et une étude sur des espèces bactériennes ou archées." } }, { "id": "810", "translation": { "en": "As a result, whole-genotype analysis, although suffering its own set of limitations, has improved the ability to look beyond the limitations of a priori variants.15 On the other hand, it has also been criticized for spawning diffuse and non-hypothesis-driven fishing expeditions.", "fr": "Par conséquent, l'analyse du génotype complet, quoique présentant ses propres limites, a amélioré notre capacité de voir au delà des limites des variantes a priori.15 Mais cette technique a également été décriée comme favorisant des recherches empiriques diffuses et sans hypothèse de base." } }, { "id": "811", "translation": { "en": "Both the model and the crystal structures of RSL complexed with sialyl Lewis X and Lewis X oligosaccharides indicate a very unusual conformational change of the glycan during the interaction. These studies pave the way for the design of mutants with higher specificity.", "fr": "La modélisation et la structure cristallographique des complexes entre RSL et les oligosaccharides Lewis X et Sialyl Lewis X indiquent un changement conformationnel du glycanne très inhabituel lors de l'interaction, donnant ainsi des pistes pour la conception de mutants de plus haute spécificité." } }, { "id": "812", "translation": { "en": "Alternatively, the Pentanychidae, which reside in Travunioidea, could be the sister group to all other Laniatores.", "fr": "Au sein de Travunioidea, la famille des Briggsidae anciennement connus sous le nom Pentanychidae pourrait être un groupe frère de tous les autres Laniatores." } }, { "id": "813", "translation": { "en": "Since its discovery in 1882 by Robert Koch many studies have been focusing on the characteristics of this bacterium and of the most closely related strains known as the Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC).", "fr": "Depuis sa découverte en 1882 par Robert Koch, de nombreuses études se sont penchées sur les caractéristiques de cette bactérie et des souches proches, connues sous le nom de complexe Mycobacterium tuberculosis (MTBC)." } }, { "id": "814", "translation": { "en": "A recent study reporting a thousand potential sites within the promoters of genes and proteins of which 400 were validated experimentally suggests that the number of sites across the genome may be even higher, forcing them to develop other characterization methods to question the whole genome and high volumes of data.", "fr": "Une étude récente faisant état d'un millier de sites potentiels au sein des promoteurs de gènes protéiques et dont 400 furent validés expérimentalement laisse supposer que le nombre de sites à l'échelle du génome soit encore plus nombreux, forçant à développer d'autres méthodes de caractérisation à même de questionner le génome entier et de forts volumes de données." } }, { "id": "815", "translation": { "en": "This concept names the parallelism which can be defined as the state of what develops in the same direction or at the same time.", "fr": "Cette notion se nomme le parallélisme qui peut se définir comme l'état de ce qui se développe dans la même direction ou en même temps." } }, { "id": "816", "translation": { "en": "This tool will thus contribute significantly to the acceleration of the race for the development of new drugs.", "fr": "Cet outil va ainsi contribuer significativement à l'accélération de la course au développement de nouveaux médicaments." } }, { "id": "817", "translation": { "en": "The advent of new sequencing technologies has opened up new research perspectives in evolutionary biology.", "fr": "L'avènement des nouvelles technologies de séquençage a ouvert de nouvelles perspectives de recherche en biologie évolutive." } }, { "id": "818", "translation": { "en": "Mass spectrometry-based quantitative proteomics strategies are ideally adapted to the detection of global protein changes between different biological samples.", "fr": "Les approches de protéomique quantitative basées sur la spectrométrie de masse sont parfaitement adaptées à la détection de changements au niveau protéique entre échantillons biologiques." } }, { "id": "819", "translation": { "en": "At last, we present two applications using the suffix vector. The first one compute the number of repeated substrings in a sequence, the second one is a linear method to detect maximal repeats.", "fr": "Enfin, nous présentons deux applications utilisant les vecteurs de suffixes : une méthode de calcul du nombre de facteurs répétés dans une séquence et une méthode linéaire de détection des répétitions maximales." } }, { "id": "820", "translation": { "en": "In vivo, these AtMAP65s are localized with subsets of microtubule bundles as they are suggested to play a role in establishing and maintaining these networks.", "fr": "La distribution des AtMAP65s in vivo est très régulée, celle-ci sont localisées avec des réseaux des microtubules bien définis. Ainsi, leur rôle supposé est de mettre en place ces réseaux puis de participer à leur maintient." } }, { "id": "821", "translation": { "en": "We further chose to validate experimentaly these rules with studying protein-protein interactions of yeasts Saccharomyces cerevisiae and Yarrowia lipolytica, using blue native and SDS polyacrylamide gel electrophoresis (BN/SDS PAGE).", "fr": "Nous avons choisi de valider expérimentalement l'application de ces règles en étudiant les interactions protéine-protéine chez les levures Saccharomyces cerevisiae et Yarrowia lipolytica par la technique de l'électrophorèse en gel de polyacrylamide en bleu natif et SDS (BN/SDS PAGE)." } }, { "id": "822", "translation": { "en": "We showed the transcriptional importance of these elements.", "fr": "Nous avons montré l'importance de ces éléments dans la transcription." } }, { "id": "823", "translation": { "en": "In this study we have shownthat H3K4 methylation influences the transcription of only a very limited number of genes.", "fr": "Dans cette étude nous démontrons que la méthylation de H3K4 n'influence la transcription que d'un nombre très limité de gènes." } }, { "id": "824", "translation": { "en": "We have used a nutritional model of adult rats deficient in methyl donors (vitamin B12, folate and choline) before pregnancy.", "fr": "Nous avons mis en oeuvre un modèle nutritionnel de rates adultes carencées en donneurs de groupements méthyles (vitamines B12, folates et choline) avant la gestation." } }, { "id": "825", "translation": { "en": "Recent advances of experimental techniques in biology have led to the production of enormous amounts of data on the dynamics of genetic regulatory networks (GRN).", "fr": "Les progrès récents des techniques expérimentales biologiques ont conduit à la production d'une énorme quantité de données sur le comportement dynamique des réseaux de régulation génique (RRG)." } }, { "id": "826", "translation": { "en": "Molecular logic gates and a device for detecting glucose have been designed, modeled and then validated experimentally.", "fr": "Des portes logiques moléculaires et un dispositif de détection du glucose ont ainsi été conçus, modélisés et validés expérimentalement." } }, { "id": "827", "translation": { "en": "In plants RNA interference (RNAi) plays an important role in this control through small RNAs that guide the expression regulation of endogenous or exogenous sequences by two types of mechanisms.", "fr": "Chez les plantes l'interférence ARN (ARNi) joue un rôle important dans ces contrôles via des petits ARN d'environ 20nt qui guident la régulation de l'expression de séquences endogènes ou exogènes par deux types de mécanismes." } }, { "id": "828", "translation": { "en": "Thus, in collaboration with Airbus Safran Lauchers (ASL), a research program was set up to obtain optimized tools for predicting the potential toxicity of HEM and to design new non-toxic and regulatory molecules.", "fr": "Ainsi, en collaboration avec Airbus Safran Lauchers (ASL), un programme de recherche a été mis en place, afin d'obtenir des outils optimisés pour la prédiction de la toxicité des HEMs et concevoir de nouvelles molécules HEMS non toxiques et réglementaires." } }, { "id": "829", "translation": { "en": "Analyses stratified on groups built according to their reproduction factors exposures did not highlighted specific variants. However, analyses stratified on groups reflecting the chest X—ray exposures showed potential specific SNPs for women who had never been exposed to chest X—ray, in genes XRCC4 and MAGI1, and for women highly exposed to X-ray exposures, in gene FGFR2, already known in the general population.", "fr": "Alors que l'analyse stratifiée sur les groupes construits à partir des expositions aux facteurs gynéco-obstétriques ne nous permet pas de mettre en évidence de potentiels SNPs spécifiques, l'analyse stratifiée sur les groupes construits à partir des expositions aux radiations a permis de mettre en évidence des SNPs spécifiques potentiels aux femmes non exposées, dans les gènes XRCC4 et MAGI1, et à celle fortement exposées aux radiations, dans le gène FGFR2, déjà trouvés en population générale." } }, { "id": "830", "translation": { "en": "The main objective is to attempt high performance of computer-aided diagnosis (CAD), by selectingfew genes with high predictive power and high sensibility to variations in real clinical tests.", "fr": "L'objectif principalest d'atteindre de hautes performances de diagnostic assisté par ordinateur, en sélectionnantquelques gènes avec une forte puissance prédictive et une grande sensibilité aux variations dansles tests cliniques réels." } }, { "id": "831", "translation": { "en": "To this end, we implemented large-scale standardized methods of sampling, DNA extraction, and bioinformatic processing to recover environmental DNA data.", "fr": "Dans ce but, nous avons mis en place des méthodes standardisées d'échantillonnage, d'extraction d'ADN et d'analyse bioinformatique." } }, { "id": "832", "translation": { "en": "The first part of the thesis concerns classical identification techniques to estimate physical parameters of PTWV. The second part deals with model-based observers implemented to estimate the dynamic states of the PTWV.", "fr": "La première partie de thèse est consacrée aux algorithmes d'identification classiques. Ces techniques sont conçues pour estimer les paramètres physiques inconnus des modèles paramétriques des V2RM. La deuxième partie concerne des observateurs basés modèles." } }, { "id": "833", "translation": { "en": "Through an extensive study on both artificial and biological data, we provide a better interpretation of the central inferred parameters, up to now poorly understood, especially in the limited sampling regime.", "fr": "À travers une étude approfondie sur des donnéesartificielles et biologiques, nous proposons une meilleure interpretation des paramètres centraux de ces méthodes d'inférence, jusqu'ici mal compris, notamment dans le cas d'un échantillonnage limité." } }, { "id": "834", "translation": { "en": "We thus also have developed DACMLang, a language dedicated to gene annotation based on DACMs.", "fr": "Nous avons donc également développé DACMLan, un langage dédié à l'annotation de gènes fondé sur les DACMs." } }, { "id": "835", "translation": { "en": "However, it poses a major problem of therapeutic adherence.", "fr": "Cependant, elle pose un problème majeur qui est celui de l'adhésion thérapeutique." } }, { "id": "836", "translation": { "en": "We further studied the NDST1 gene, which is located within chromosome 5q31-q33, and which encodes the bifunctional enzyme N-deacetylase/ N-sulfotransferase 1, and also participates in the heparan sulfate synthesis .", "fr": "Nous avons étudié en outre le gène NDST1, situé dans la région chromosomique 5q31-q33, et qui code également pour une enzyme impliquée dans la voie héparane sulfate." } }, { "id": "837", "translation": { "en": "In recent years, targeted drugs for the treatment of cancer have been introduced.", "fr": "Ces dernières années, les thérapies ciblées pour le traitement du cancer, ont été introduites." } }, { "id": "838", "translation": { "en": "Both objectives will be served by joint approaches involving machine-learning and chemogenomics and experimental cell biology (Clara Nahmias'team).", "fr": "Ces deux objectifs seront servis par des approches conjointes impliquant l'apprentissage automatique et la chimiogénomique et la biologie cellulaire expérimentale." } }, { "id": "839", "translation": { "en": "The results showed that Vvrd22 is constitutively expressed at a low level in all analyzed tissues.", "fr": "Les résultats ont révélé que Vvrd22 est exprimé de manière constitutive dans tous les tissus analysés, mais à un niveau très faible." } }, { "id": "840", "translation": { "en": "The identification of the altered cellular functions will provide a rationale for mechanistic studies of new determinants of MM resistance to MAPKi.", "fr": "L'identification des fonctions cellulaires altérées procurera un rationnel pour l'étude mécanistique de nouveaux déterminants de la résistance du MM aux iMAPK." } }, { "id": "841", "translation": { "en": "This thesis deals with the integration and the analysis of high throughput data : each type of data can be thought of as measuring a certain aspect of a biological process, so how to combine these heterogeneous data in order to deduce relevant conclusions ?", "fr": "La question abordée dans cette thèse porte sur l'intégration et l'exploitation des données haut-débit : chaque source de données mesurant un aspect du fonctionnement cellulaire, comment les combiner dans un modèle et en tirer des conclusions pertinentes sur le plan biologique ?" } }, { "id": "842", "translation": { "en": "Our results showed that Candidatus Pelagibacter ubique has probably originated from an ancestor facultative intracellular with Rickettsiales species.", "fr": "Nos résultats montrent que CPu provient probablement d'un ancêtre intracellulaire facultatif en commun avec les espèces de Rickettsiales." } }, { "id": "843", "translation": { "en": "Characterized by a set of descriptors (sequence, epigenetic, phylogenetic) the emerging context is used to quickly and reliably replace any genomic questioning inside its overall environment.", "fr": "Caractérisé par un ensemble de descripteurs (séquence, épigénétique, phylogénétique), le contexte qui en émerge est utilisé pour replacer tout questionnement génomique dans son environnement global, de manière rapide et fiable." } }, { "id": "844", "translation": { "en": "Today, Big Data also exists in the health sector.", "fr": "Aujourd'hui, le Big Data existe également dans le domaine de la santé." } }, { "id": "845", "translation": { "en": "The NFA models, presented here under the name of Protomata, are discreet graphical models of strong expressiveness, which distinguishes them from statistical models such as HMM profiles or pattern models like Prosite patterns.", "fr": "Les modèles NFA, présentés ici sous le nom de Protomates, sont des modèles graphiques discrets de forte expressivité, ce qui les distingue des modèles statistiques de type profils HMM ou des motifs de type Prosite." } }, { "id": "846", "translation": { "en": "However, fiber flax cultivation is often compromised by verticillium wilt, a disease caused by the fungal pathogen Verticillium dahliae Kleb.", "fr": "Cependant, cette culture est fréquemment menacée par la verticilliose, une maladie causée par le champignon pathogène Verticillium dahliae Kleb." } }, { "id": "847", "translation": { "en": "In particular we chose Sesquin as antifungal for food preservation, BLP-3 and K11 as drugs in the fight of antibacterial resistance, Cecropins XJ, A and D as agents against esophageal cancer.", "fr": "Plus spécifiquement, nous avons choisi la Sesquin comme candidat antifongique utilisable pour la conservation des aliments, les peptides BLP-3 et K11 comme médicaments dans la lutte contre la résistance antibactérienne, et les Cecropins XJ, A et D comme agents contre le cancer de l'œsophage." } }, { "id": "848", "translation": { "en": "In terms of the problem, the construction of pangenomes is considered NP-hard, so different statisticaland algorithmic methods have been developed to solve it.", "fr": "En termes de problèmatique, la construction de pangénomes est considérée comme particulièrement complexe etdifférentes méthodes statistiques et algorithmiques ont été développées pour tenter de le résoudre." } }, { "id": "849", "translation": { "en": "In biology, mass spectrometry has become an indispensable tool for protein identification.", "fr": "En biologie, la spectrométrie de masse est devenue l'outil incontournable pour l'identification des protéines." } }, { "id": "850", "translation": { "en": "An output kernel is assumed to encode the proximities of nodes in the target graph and the goal is to approximate this kernel by using appropriate input features.", "fr": "Un noyau de sortie est supposé coder les proximités existantes entres les nœuds du graphe et l'objectif est d'approcher ce noyau à partir de descriptions appropriées en entrée." } }, { "id": "851", "translation": { "en": "The second goal will be the use of this knowledge to further identify key molecular and dynamical determinants responsible for enzyme regioselectivity and more particularly to understand the role of molecular assemblies in the cascade of catalytic reactions.", "fr": "Le second objectif sera l'utilisation de cette connaissance pour identifier des déterminants moléculaires et dynamiques clés responsables pour la régio-sélectivité et plus particulièrement la comprehension du role des assemblages moléculaires dans la cascade des reactions catalytiques." } }, { "id": "852", "translation": { "en": "Our methods successfully apply to a practical benchmark composed of the 404 models from the biomodels.", "fr": "Nos méthodes s'appliquent avec succès à un banc d'essai pratique composé de 404 modèles du dépôt biomodels." } }, { "id": "853", "translation": { "en": "Exists as a heterodimer with another polymerase subunit, POLR2J forming a core subassembly.", "fr": "Elle existe sous forme d'un hétérodimère avec une autre sous-unité de la polymérase, formant un sous-assemblage avec la chaîne POLR2J." } }, { "id": "854", "translation": { "en": "I have shown that the number of really independent markers become stable as soon as the population is homogeneous and large enough (N > 60) and as soon as the window size is large enough (size > 100 SNPs).", "fr": "Il a été montré que ce nombre de marqueurs indépendants devient constant dès que la population est homogène avec une taille suffisante (N > 60 individus) et que l'on utilise une fenêtre assez grande (taille > 100 SNPs)." } }, { "id": "855", "translation": { "en": "However, their high error rate and truncation events constitute inescapable impediments.", "fr": "Cependant, leur taux d'erreur élevé et la troncation des séquences sont des obstacles incontournables." } }, { "id": "856", "translation": { "en": "These results allow us to better understand the genetic control of humoral response against malaria.I also characterized non- infectious inflammation in a mouse model to test the influence of the inflammatory condition during infection by Plasmodium .", "fr": "Ces résultats nous permettent de mieux comprendre le contrôle génétique de la réponse humorale contre la malaria.J'ai aussi caractérisé l'inflammation non infectieuse dans un modèle murin afin de tester l'influence de l'état inflammatoire lors de l'infection par le plasmodium." } }, { "id": "857", "translation": { "en": "These graphs thus provide the prediction of the metabolism of xenobiotics in humans, as well as the genotoxicity of the molecules and atoms that make up xenobiotics.", "fr": "Ces graphes fournissent ainsi la prédiction du métabolisme de xénobiotiques chez l'homme, ainsi que la génotoxicité des molécules et atomes qui le composent." } }, { "id": "858", "translation": { "en": "During my PhD, we have studied the variability (or stochasticity) of gene expression assuming that the stochastic signal it produces carries information about the process of gene expression itself.", "fr": "Dans ce travail de thèse, nous avons étudié la variabilité (ou stochasticité) de l'expression des gènes en considérant que le signal stochastique que produit cette expression est porteur d'information quant au processus d'expression lui-même." } }, { "id": "859", "translation": { "en": "To this end, we studied transcriptomes from four tissues (adipose tissue, blood, hypothalamus and liver) using the possibilities offered by RNA-seq, an RNA sequencing technology.", "fr": "Nous avons étudié pour cela les transcriptomes de quatre tissus (tissu adipeux, sang, hypothalamus et foie) à l'aide des possibilités offertes par le RNA-seq, technologie de séquençage des ARN." } }, { "id": "860", "translation": { "en": "Results are het erogeneous, with good correlation in patients with wide QRS activation patterns.", "fr": "Les résultats sont hétérogènes, avec une bonne corrélation sur les rythmes avec QRS larges." } }, { "id": "861", "translation": { "en": "Three series of triarylmethanes have been developed: triazole TAMs, macrocyclic TAMs and hybrid TAMs.", "fr": "Trois séries des triarylméthanes ont été développées : TAMs triazoliques, TAMs macrocycliques et TAMs hybrides." } }, { "id": "862", "translation": { "en": "Although they focused on the so-called mapping problem, the abstraction to sequencing is much the same.", "fr": "Bien qu'ils se soient concentrés sur le dénommé problème de cartographie génétique, l'abstraction du séquençage est à peu près la même." } }, { "id": "863", "translation": { "en": "These clusters, that are cooler than the system, generate a percolation line, characterized by the universal exponents of random percolation in three dimensions.", "fr": "Ces amas qui sont plus froids que le fluide, engendrent une ligne de percolation, caractérisée par les exposants de la percolation aléatoire à trois dimensions." } }, { "id": "864", "translation": { "en": "Understanding why a phenotype has been predicted is necessary to ensure that the prediction is based on reliable representations of the patients rather than on irrelevant artifacts present in the training data.", "fr": "D'une part, pour s'assurer que le modèle se base sur des représentations fiables des patients et ne se concentre pas sur des artefacts non pertinents présents dans les données d'apprentissage." } }, { "id": "865", "translation": { "en": "In this project we will discover unknown pathogens that could explain BSF colony collapse.", "fr": "Dans ce projet, nous découvrirons des agents pathogènes inconnus qui pourraient expliquer l'effondrement des colonies BSF." } }, { "id": "866", "translation": { "en": "The resolution of the complex at the atomic scale by cryo-electron microscopy will open the way towards the design of new therapeutic molecules.", "fr": "La résolution du complexe à l'échelle atomique par cryo-microscopie électronique permettra d'ouvrir la voie vers la conception de nouvelles molécules thérapeutiques." } }, { "id": "867", "translation": { "en": "The LPV UIO is able to estimate state variables and the unknown disturbances and the estimated values converge to the true values of the state variables and the unknown disturbances asymptotically.", "fr": "Le LPV UIO est capable d'estimer les variables d'état et les perturbations inconnues et les valeurs estimées convergent vers les vraies valeurs des variables d'état et les perturbations inconnues de manière asymptotique." } }, { "id": "868", "translation": { "en": "When we applied this method to the asp gene, it showed that there is a selection pressure induced by the ASP protein.", "fr": "L'application de cette méthode au gène asp montre qu'il existe bien une pression de sélection induite par la protéine ASP." } }, { "id": "869", "translation": { "en": "Our idea is to automatically extract the arguments from ML models and combine them using argumentation.", "fr": "Notre idée est d'extraire automatiquement les arguments des modèles ML et de les combiner à l'aide de l'argumentation." } }, { "id": "870", "translation": { "en": "They are designed towards training SVMs for binary classification.", "fr": "Ils servent à apprendre des SVMs destinés à traiter des problèmes de classification binaire (décision entre deux classes)." } }, { "id": "871", "translation": { "en": "This thesis introduces an approach for haplotype phasing based on the search of connected components in a read similarity graph to identify haplotypes.", "fr": "Cette thèse propose une méthode de phasage d'haplotype basée sur la recherchede composantes connexes dans un graph de similarité des lectures pour identifier les haplotypes." } }, { "id": "872", "translation": { "en": "The vast majority of them are genetic and for most of them there is no cure.", "fr": "La grande majorité d'entre elles correspond à des maladies génétiques, pour lesquelles il n'existe pas de traitement curatif." } }, { "id": "873", "translation": { "en": "The cophylogeny reconciliation model formulates the coevolution question as an optimization problem.", "fr": "La réconciliation cophylogénétique est un modèle qui traduit la reconstruction de l'histoire coévolutive en un problème d'optimisation combinatoire." } }, { "id": "874", "translation": { "en": "Comparative analysis of the MITE sequences identified in the two genomes led to the identification of 18 families classified into three superfamilies (PIF/harbinger, Tc1/mariner and CACTA), comprising 140 MITEs members in H. armigera and 161 MITEs members in H. zea.", "fr": "L'analyse comparative des séquences MITE identifiées dans les deux génomes a conduit à l'identification de 18 familles classées en trois superfamilles (PIF/harbinger, Tc1/mariner et CACTA), comprenant 140 membres MITEs chez H. armigera et 161 membres MITEs chez H. zea." } }, { "id": "875", "translation": { "en": "These cellular events are taking place at the early steps of fetal period in cattle, as the total number of muscle cells is fixed at 180 days post-conception (dpc) in the fetus.", "fr": "Ces propriétés sont sous le contrôle d'événements cellulaires se mettant en place précocement chez le bovin puisque le nombre de cellules musculaires est fixé dès l'âge 180 jours post-conception (jpc) chez le fœtus." } }, { "id": "876", "translation": { "en": "The proposed annotation strategy consists in identifying all genes, even those whose structure contain nonsense mutations.", "fr": "La stratégie d'annotation proposée consiste à identifier tous les gènes, même ceux dont la structure est impactée par des mutations non-sens." } }, { "id": "877", "translation": { "en": "Moreover, it is likely that genes and processes regulating epigenetic modifications are also implicated in the individual response to the environment.", "fr": "En outre, il est probable que des spécificités au niveau des gènes et des processus régulant l'épigénome soient également impliquées dans cette réponse individuelle à l'environnement." } }, { "id": "878", "translation": { "en": "We first demonstrated the localization of these proteins in M. abscessus, EsxU and EsxT are associated with the bacterial membrane and are also secreted.", "fr": "Nous avons d'abord démontré la localisation de ces protéines chez M. abscessus. EsxU et EsxT sont associées avec la membrane bactérienne et secrétées dans le milieu extérieur." } }, { "id": "879", "translation": { "en": "The employment of diverse methodologies for the investigation of common chronic diseases risk factors and pathways provided new diagnostic markers and generated results, which could help to improve the diseases risk prediction based on the individual genetic “make-up”. New insights into associations between different biomarkers might help in understanding the pathophysiological pathways common between CVDs and other chronic diseases.", "fr": "L'utilisation de diverses méthodologies pour étudier les facteurs de risque et les voies impliquées dans des maladies chroniques courantes a permis d'identifier de nouveaux marqueurs diagnostiques qui pourraient améliorer la prédiction du risque de maladie basée sur le profil génétique de chaque individu." } }, { "id": "880", "translation": { "en": "CTCF binds to an average of about 55,000 DNA sites in 19 diverse cell types 12 normal and 7 immortal and in total 77,811 distinct binding sites across all 19 cell types.", "fr": "CTCF se lie en moyenne à 55 000 sites dans 19 types cellulaires divers 12 normaux et 7 immortels et au total 77 811 sites distincts dans les 19 types cellulaires." } }, { "id": "881", "translation": { "en": "BioNetCAD also facilitates spatiotemporal simulation of the designed system with a link to the HSim software.", "fr": "BioNetCAD facilite également la simulation spatio-temporelle du système conçu grâce à un lien vers le logiciel HSim." } }, { "id": "882", "translation": { "en": "Finally, the LINC complex is proposed to contribute at the proper chromatin organisation and positioning since its alteration is associated with the release of transcriptional silencing as well as decompaction of heterochromatic sequences.", "fr": "Ce complexe LINC est proposé pour contribuer l'organisation de la chromatine et à son positionnement, de plus la mutation de ce complexe est associée une dérégulation l'inactivation de la transcription, ainsi qu'a une décompaction des séquences hétérochromatiques." } }, { "id": "883", "translation": { "en": "The impact of transfers on phylogenetic classification was evaluated and placed within the tree of life.", "fr": "L'impact des transferts sur la classification phylogénétique a été évalué et replacé au sein de l'arbre de la vie." } }, { "id": "884", "translation": { "en": "GPCRs are known to form homo- and heterodimers, but the physiological relevance of these complexes remains a matter of debate.", "fr": "Les RCPG sont connus pour former des homo- et hétérodimères mais la pertinence physiologique de ces complexes reste à démontrer." } }, { "id": "885", "translation": { "en": "Our results suggest the role of PPR protein flexibility, both at the protein and motif level, in binding to its RNA target and its relevance to the affinity and specificity of nucleotide recognition.", "fr": "Nos résultats suggèrent le rôle de la flexibilité des protéines PPR, tant au niveau de la protéine que du motif dans la liaison à sa cible ARN et sa pertinence pour l'affinité et la spécificité de la reconnaissance des nucléotides." } }, { "id": "886", "translation": { "en": "In all these works, the proposed algorithms are simple 'greedy' algorithms where the mesh is modified step by step to converge towards a final solution Ef: At each step Ei, one makes the hypothesis that the 'best' solution Ef will be obtained by making the 'optimal' choice for Ei.", "fr": "Dans tous ces travaux, les algorithmes proposés sont des algorithmes simples de type \" glouton \" où le maillage est modifié pas à pas pour converger vers une solution finale Ef : A chaque étape Ei, on fait l'hypothèse que la \" meilleure \" solution Ef sera obtenue en faisant le choix \" optimal \" pour Ei." } }, { "id": "887", "translation": { "en": "In a first step, a partial volume effect correction methodology integrating, within the reconstruction process, the Lucy-Richardson deconvolution algorithm associated with a wavelet-based denoising method has been introduced.", "fr": "Dans un premier temps, une méthodologie de correction des effets de volume partiel intégrant, dans le processus de reconstruction, une déconvolution de Lucy-Richardson associée à un débruitage dans le domaine des ondelettes, a été proposée." } }, { "id": "888", "translation": { "en": "This NP-Hard problem has been widely studied for applications like Data Compression, Structure Discovery and Algorithmic Information Theory.", "fr": "Ce probléme NP-dur a été largement étudié pour des applications comme la compression de données, la découverte de structure et la théorie algorithmique de l'information." } }, { "id": "889", "translation": { "en": "This work may establish a new relationship between the 3D structure of genomes and the regulation of ncRNAs.", "fr": "Ces travaux pourraient établir une nouvelle relation entre la structure 3D des génomes et la régulation des ARNs non codants." } }, { "id": "890", "translation": { "en": "The technique was developed in the laboratory of Jason D. Lieb at the University of North Carolina, Chapel Hill.", "fr": "Cette technique fut développée dans le laboratoire de Jason D. Lieb à l'Université de Caroline du Nord, Chapel Hill." } }, { "id": "891", "translation": { "en": "In particular, predictive and prognostic models were derived based on microarray and/or clinical data and compared with genetic and clinical based approaches.", "fr": "En particulier, des modèles prédictifs et pronostiques ont été extraits à partir des données de puces à ADN et/ou des données cliniques, et leurs performances comparées avec celles d'approches génétiques et cliniques existantes." } }, { "id": "892", "translation": { "en": "These studies have allowed us to highlight the importance of internal metabolites in the production of target compounds.", "fr": "Ces études nous ont permis de mette en avant l'importance de métabolites internes dans la production de composés cibles." } }, { "id": "893", "translation": { "en": "My goal was to improve the predictive power of methods which model the structures of macromolecular assemblies (docking) and to tackle real-life problems faced by biologists.", "fr": "Mon objectif était d'améliorer le pouvoir prédictif des méthodes permettant de prédire les structures d'assemblages macromoléculaires (docking) et d'aborder les problèmes rencontrés par les biologistes sur des cas réels d'interactions." } }, { "id": "894", "translation": { "en": "The KBDOCK database contains 2,721 non-redundant hetero DDIs corresponding to 1,439 DFBSs located in 947 distinct domain families.", "fr": "Le système KBDOCK couvre plus de 2,700 hetero DDIs non-redondantes correspondant à 1,439 DFBSs localisés sur 947 domaines Pfam distincts." } }, { "id": "895", "translation": { "en": "We then analyzed in detail the diversity of TAL effector sequences in African strains of Xanthomonas oryzae pv.", "fr": "Nous avons ensuite analysé plus en détail la diversité des séquences TAL de souches africaines de Xanthomonas oryzae pv." } }, { "id": "896", "translation": { "en": "A simulation study was conducted and it showed negligible bias for the proposed estimator and a nonparametric one based on inverse probability censoring weighting, while a semiparametric estimator, ignoring the clustering, is markedly biased.", "fr": "Une étude de simulation a été réalisée et a montré un biais négligeable pour l'estimateur proposé et pour un estimateur non paramétrique fondé sur la pondération par la probabilité inverse d'être censuré (IPCW), tandis qu'un estimateur semi-paramétrique, ignorant la structure en grappe est nettement biaisé." } }, { "id": "897", "translation": { "en": "Transposable elements are DNA sequences that have the ability to move in the genome.", "fr": "Les éléments transposables sont des séquences d'ADN qui ont la capacité de se déplacer dans le génome." } }, { "id": "898", "translation": { "en": "We have tested this hypothesis using phylogenetic methods, and we have reconstructed a consensus phylogeny of bacteria using complete genomes data.", "fr": "Nous avons testé cette hypothèse au moyen de méthodes phylogénétiques et tenté de reconstruire une phylogénie des procaryotes en utilisant les génomes complets." } }, { "id": "899", "translation": { "en": "Genes within ohnologous pairs do not appear to be subject to different selection pressures.", "fr": "Les gènes au sein des paires ohnologues ne semblent pas soumis à des pressions de sélection différentes." } }, { "id": "900", "translation": { "en": "The genome study of A. Baumannii AYE, a nosocomial infection agent, revealed the presence of catabolic islands which were previously described in strain ADP1.", "fr": "L'étude du génome de A. Baumannii AYE, un agent responsable d'infections nosocomiales, a révélé la présence d'îlots cataboliques initialement caractérisés dans la souche ADP1." } }, { "id": "901", "translation": { "en": "For now, we have had to use two different methods in order to accurately detect both CNVs and point mutations.", "fr": "Il est donc pour l'instant nécessaire d'avoir recours à deux techniques différentes pour couvrir ces deux types d'évènements génétiques." } }, { "id": "902", "translation": { "en": "According to the hypothesis which says that the closer the genes conserved in the neighborhood of a transporter are, the stronger their functionnal link with the transporter is, we try to identify the carried substrate or associations between genes.", "fr": "D'après l'hypothèse selon laquelle plus les gènes conservés dans le voisinage d'un transporteur sont proches, plus leur lien fonctionnel avec le transporteur est fort, on essaye d'identifier le substrat transporté ou des associations de gènes." } }, { "id": "903", "translation": { "en": "The ileal lesions of MC patients are abnormally colonized by pathogenic strains of Escherichia coli belonging to the AIEC (\"Adherent-invasive E. coli\") pathovar.", "fr": "Les lésions iléales des patients atteints de MC sont anormalement colonisées par des souches pathogènes de Escherichia coli appartenant au pathovar AIEC (\"Adherent-Invasive E. coli\")." } }, { "id": "904", "translation": { "en": "TimeNexus is the first method to extract subnetworks from tMLNs.", "fr": "TimeNexus est la première méthode d'extraction de sous-réseaux à partir de tMLNs." } }, { "id": "905", "translation": { "en": "During plant infection, pathogens deploy molecular weapons known as effectors that target cellular processes of the host to promote infection.", "fr": "Pendant l'infection du végétal, les agents pathogènes déploient des armes moléculaires connues sous le nom d'effecteurs qui ciblent les processus cellulaires de l'hôte pour favoriser l'infection." } }, { "id": "906", "translation": { "en": "The aim of my PhD was to address the following questions: i) What is the expression level of dcm transcripts and their corresponding proteins compared to other genes and proteins whose abundance is modulated in response to growth with DCM?", "fr": "Les objectifs de ma thèse étaient de répondre à plusieurs questions : i) quel est le niveau d'expression des transcrits dcm et des protéines correspondantes par rapport à d'autres gènes et protéines dont l'abondance est modifiée en réponse à la croissance sur le DCM ?" } }, { "id": "907", "translation": { "en": "We first showed by bioinformatics that TgREMIND has a N-terminus F-BAR domain known to bind membranes by inducing vesicle formation and a novel C-terminus domain that we named REMIND for Regulator of Membrane Interacting Domain.", "fr": "Nous avons dans un premier temps montré par bio-informatique que TgREMIND possède un premier domaine F-BAR connu pour fixer les membranes en induisant la formation de vésicules et un second domaine original de fonctions inconnues que nous avons appelé REMIND (Regulator of Membrane Interacting Domain)." } }, { "id": "908", "translation": { "en": "In-depth bioinformatic analysis of this interactome has revealed the associated partners to be related to mitochondria and mRNA splicing, highlighting the potential involvement of Aurora A in these mechanisms.", "fr": "L'analyse bioinformatique approfondie de cet interactome a permis de révéler les partenaires associés à des mécanismes liés à la mitochondrie et l'épissage des ARN messagers mettant en évidence une implication potentielle d'Aurora A dans ces mécanismes." } }, { "id": "909", "translation": { "en": "Finally, we show how confronting experimental data of various nature can reveal the structure of the underlying system.", "fr": "Nous montrons enfin comment la confrontation de diverses mesures expérimentales peut renseigner sur la structure du système sous-jacent." } }, { "id": "910", "translation": { "en": "Gaps are allowed during matching and a gap penalty is included in this case as a negative score when no amino acid is matched.", "fr": "Les écarts sont autorisés pendant l'appariement et une pénalité d'écart est incluse dans ce cas comme score négatif quand aucun acide aminé n'est apparié." } }, { "id": "911", "translation": { "en": "Comparative genomics approaches in microbiology now use thousands of genomes to analyze the diversity of a species.", "fr": "Les approches de génomique comparée en microbiologie utilisent maintenant des milliers de génomes pour analyser la diversité d'une espèce." } }, { "id": "912", "translation": { "en": "It can handle datasets having a low number of biological replicates. Since the first sequencing of the human genome in the early 2000s, large endeavours have set out to map the genetic variability among individuals, or DNA alterations in cancer cells.", "fr": "Depuis le premier séquençage du génome humain au début des années 2000, de grandes initiatives se sont lancé le défi de construire la carte des variabilités génétiques inter-individuelles, ou bien encore celle des altérations de l'ADN tumoral." } }, { "id": "913", "translation": { "en": "The other part of this thesis work consisted in applying this methodology on several study systems: homomeric complexes, cytosolic proteins from S. cerevisiae, families of interologs.", "fr": "L'autre partie a consisté à appliquer cette méthode sur plusieurs systèmes : complexes homomériques, protéines du cytosol de S. cerevisiae, familles d'interologues." } }, { "id": "914", "translation": { "en": "Several drivers genes were detected, including CDK1, NCK1 and PDGFB, some not previously linked to breast cancer relapse.", "fr": "Plusieurs gènes directeurs ont été détectés, dont CDK1, NCK1 et PDGFB, certains n'étant pas déjà relié à la rechute métastatique dans le cancer du sein." } }, { "id": "915", "translation": { "en": "First, the skeleton of drimentines, hybrid alkaloids containing a sesquiterpenic unit, has been obtained by mimicking the main event of their postulated biosynthesis.", "fr": "Le squelette des drimentines, alcaloïdes hybrides possédant une partie sesquiterpénique, a été obtenu grâce à une séquence de désaromatisation-cyclisation qui mime l'étape-clé de la biogenèse de ces métabolites spécialisés." } }, { "id": "916", "translation": { "en": "Corynebacterium diphtheriae, which causes diphtheria, remains largely susceptible to first-line antibiotics, including penicillin, and can be controlled through vaccination, but re-emerges when vaccination coverage is insufficient.", "fr": "Corynebacterium diphtheriae, responsable de la diphtérie, reste largement sensible aux antibiotiques de première intention dont la pénicilline et peut être contrôlée par les vaccins, mais ré-émerge lorsque la couverture vaccinale est insuffisante." } }, { "id": "917", "translation": { "en": "However, proteomics is only emerging in the evolutionary biology field.", "fr": "En revanche, la protéomique est un outil émergent en biologie évolutive." } }, { "id": "918", "translation": { "en": "However, it is noteworthy that an appropriate organization of the laboratory and a strategy of antimicrobial stewardship in the hospital are necessary.", "fr": "Cependant, cette réduction de délai nécessite une organisation adéquate du laboratoire de bactériologie et l'existence d'une politique de maîtrise de l'antibiothérapie dans l'établissement." } }, { "id": "919", "translation": { "en": "This application goes beyond the classical use of protein docking as a, because our strategy provides a systemic point of view of protein interactions at an atomic resolution.", "fr": "Cela va donc au-delà de l'utilisation classique du docking \"binaire\" puisque notre stratégie fournit une vision systémique des interactions protéiques à l'échelle des \"résidus\"." } }, { "id": "920", "translation": { "en": "These integrative approaches reflect the evolution of our concepts and allow, with the use of biological pathways, the transition between the genetics of mental retardation to the genomics of mental retardation.", "fr": "Ces approches intégratives reflètent l'évolution de nos concepts de recherche passant de la génétique du retard mental à la génomique du retard mental en tenant compte de la multiplicité des réseaux d'interactions et de régulations." } }, { "id": "921", "translation": { "en": "Chromosomal rearrangements are large scale mutations that alter the structure and organisation of genomes.", "fr": "Les réarrangements chromosomiques sont des mutations qui modifient la structure et l'organisation des génomes." } }, { "id": "922", "translation": { "en": "Variations in genetic make-up have been described by the concept of single nucleotide polymorphisms (SNPs), where individual nucleotides (i.e., base pairs) differ within specific genes, thus producing various alleles.", "fr": "Les variations dans la constitution génétique ont été décrites avec le concept de polymorphismes nucléotidiques (SNP), selon lequel les nucléotides (c.-à-d. les paires de bases) sont différents au sein de gènes spécifiques, ce qui produit des allèles différents." } }, { "id": "923", "translation": { "en": "They can be used as biomarkers for the monitoring of genotoxic agents such as ionizing radiations.", "fr": "Ils peuvent être utilisés comme biomarqueurs d'exposition à des agents potentiellement mutagènes tels que les radiations ionisantes." } }, { "id": "924", "translation": { "en": "A metabolic network is modelled by a coloured graph and a motif is defined as a multiset of colours (a colour corresponds to a reaction mechanism).", "fr": "Un réseau métabolique est modélisé par un graphe coloré et un motif est défini comme un multiensemble de couleurs (une couleur correspond ici `a un mécanisme réactionnel)." } }, { "id": "925", "translation": { "en": "For each step, clinical and genetic analyses (e.g. genetic burden and biological pathways) are systematically applied to investigate intersections between clinical and genetic subgroups.", "fr": "À chaque étape, les analyses cliniques et génétiques (e.g. enrichissement de mutations délétères dans certaines voies biologiques) sont appliqués systématiquement afin d'étudier les intersections entre ces sous-groupes cliniques et génétiques." } }, { "id": "926", "translation": { "en": "The first part - giant viruses and horizontal transfers - compiles the work on the detection of horizontal gene transfer events in the genomes of giant viroses.", "fr": "La première partie - virus géants et transferts horizontaux - rassemble les travaux menés sur les transferts horizontaux de gènes au niveau des génomes de virus géants." } }, { "id": "927", "translation": { "en": "Moreover, the activity of AtMAP65-4 could be regulated in vivo by post-translational modifications.", "fr": "Par ailleurs, l'activité d'AtMAP65-4 pourrait être régulée in vivo par des modifications post traductionnelles." } }, { "id": "928", "translation": { "en": "This could make it possible to consolidate the existing bridge between fine grained models and coarse grained models.", "fr": "Ceci pourrait permettre de consolider le pont existant entre modèles à grains fins et modèles à gros grains." } }, { "id": "929", "translation": { "en": "These sites are therefore more conserved than the rest of the protein.", "fr": "Ces sites sont donc plus conservés que le reste de la protéine." } }, { "id": "930", "translation": { "en": "But all newly discovered genomes and encoded proteins are only partially annotated with biological function assessed by similarities to reference organisms.", "fr": "Mais tous les génomes nouvellement découverts et les protéines encodées ne sont que partiellement annotés d'une fonction biologique, récupérée par similarité à partir des organismes de référence." } }, { "id": "931", "translation": { "en": "The second chapter refers to the development of analytical methods for the identification of acetophenones (chemotaxonomic markers of the genus) and to the dereplication strategies for the chemical characterisation of extracts by UHPLC-HRMSn.", "fr": "Le deuxième chapitre vise au développement de méthodes analytiques pour l'identification des dimères d'acétophénones (marqueurs chimiotaxonomiques du genre) et aux stratégies utilisées pour la déréplication de ces différents extraits et la caractérisation chimique des composés par UHPLC-HRMSn." } }, { "id": "932", "translation": { "en": "They are also activated in human brain, particularly during fetal development.", "fr": "Ils sont également activés dans le cerveau humain, en particulier pendant le développement fœtal." } }, { "id": "933", "translation": { "en": "Finally the similarity measure IntelliGO is generalized to another structured vocabulary organized as GO as a rooted directed acyclic graph, with an application concerning the semantic reduction of attributes before mining.", "fr": "Finalement, la mesure de similarité IntelliGO est généralisée à d'autres vocabulaires structurés en graphe acyclique dirigé et enraciné (rDAG) comme l'est l'ontologie GO, avec un exemple d'application concernant la réduction sémantique d'attributs avant la fouille." } }, { "id": "934", "translation": { "en": "It is possible to use network analyses to infer how selection acts on metabolic pathways.", "fr": "Il est possible d'utiliser des analyses de réseau pour déduire comment la sélection agit sur les voies métaboliques." } }, { "id": "935", "translation": { "en": "We propose mixed models for data normalization and representation of subjects by the empirical cumulative distribution function.", "fr": "Nous proposons les modèles mixtes pour la normalisation des données et la représentation des sujets par la fonction de répartition empirique." } }, { "id": "936", "translation": { "en": "That is why it is necessary to make a standardized functional annotation of this proteomes. The annotation of protein sequences can be realized by the transfer of annotations between orthologs sequences.", "fr": "C'est pourquoi il est nécessaire d'effectuer une ré-annotation fonctionnelle standardisée des protéomes des organismes que nous souhaitons comparer.L'annotation de séquences protéiques peut être réalisée par le transfert d'annotations entre séquences orthologues." } }, { "id": "937", "translation": { "en": "Based on simplification of three-dimensional space onto one-dimensional space in the form of sequences of PBs. A PB substitution matrix was devised and a new structure comparison and alignment method called PB-ALIGN, has been developed.", "fr": "La représentation dans une seule dimension sous la forme de séquences de BPs des structures des proteines nous a permis de construire une matrice de substitution et de développer une nouvelle méthode appelée PB-ALIGN pour l'alignement et la comparaison des structures." } }, { "id": "938", "translation": { "en": "Comparison of transcriptomic profiles showed separate expression profiles, suggesting that the molecular mechanisms responsible for resistance to VMF, DBF or TMT were different.", "fr": "La comparaison des profils transcriptomiques n'a pas permis de regrouper les lignées résistantes entre elles, suggérant que les mécanismes de résistance au VMF, au DBF ou au TMT sont différents." } }, { "id": "939", "translation": { "en": "A potential genetic interaction between the LT iTFs Ap (a Lhx2 orthologue) and Mid (a Tbx20 orthologue) as well as Ap and the conserved Ssdp partner Chi (an LDB1 orthologue) was unveiled.", "fr": "Une interaction génétique potentielle entre les iTFs des muscles LT, Ap (un orthologue de Lhx2) et Mid (un orthologue de Tbx20) ainsi qu'entre Ap et le partenaire Ssdp conservé, Chi (un orthologue de LDB1) a été dévoilée." } }, { "id": "940", "translation": { "en": "Functional Gene Arrays (FGA), by profiling environmental communities in a flexible and easy-to-use manner, are well adapted for an application in bioremediation.", "fr": "Les biopuces ADN fonctionnelles (FGA, Functional Gene Array), outils moléculaires haut débit, sont particulièrement bien adaptées pour des applications en bioremédiation." } }, { "id": "941", "translation": { "en": "In a first research axis, using a cellular system to modulate DNA methylation levels, we revealed that different repressive chromatin modifications ensure the silencing of transposable elements when DNA methylation is lost.", "fr": "Dans un premier axe, en utilisant un système cellulaire modulant le niveau de méthylation, nous avons révélé que différentes modifications chromatiniennes répressives assurent la mise sous silence des éléments transposables lorsque la méthylation de l'ADN est perdue." } }, { "id": "942", "translation": { "en": "Which allows to visualize the level of conservation of metabolic pathways. During the analysis of the KEGG pathways, 1 tried to understand how the fungal metabolism evolved during the Evolution.", "fr": "En analysant la conservation des différentes voies métaboliques de KEGG, j'ai essayé de comprendre comment le métabolisme fongique a pu évoluer et se diversifier au cours de l'évolution." } }, { "id": "943", "translation": { "en": "In order to fit with current memory capacities and to be time efficient, we used a modified Bloom filter data structure.", "fr": "Afin d'être rapide et économe en mémoire, l'implémentation de notre méthode a nécessité la conception d'une nouvelle structure d'indexation, basée sur le filtre de bloom." } }, { "id": "944", "translation": { "en": "The undergoing WHO Malaria elimination program is threatened by the emergenceand potential spread of the Plasmodium falciparum artemisinin resistant parasite.", "fr": "Le programme d'élimination du paludisme de l'OMS est menacé par l'émergence etla propagation potentielle de parasites de l'espèce Plasmodium falciparum résistants à l'artémisinine." } }, { "id": "945", "translation": { "en": "Having a large amount of data to answer a biological question is often not the main challenge.", "fr": "Disposer d'une grande quantité de données pour répondre à un questionnement biologique n'est souvent pas le défi principal." } }, { "id": "946", "translation": { "en": "To cope with this complexity, organisms have evolved a plethora of regulatory mechanisms.", "fr": "Pour faire face à cette complexité, les organismes ont développé une pléthore de mécanismes régulateurs." } }, { "id": "947", "translation": { "en": "The dcmR gene was detected and quantified in similar amounts as dcmA in DCM-contaminated environmental samples, despite the fact that bioinformatics analysis of sequence databases suggests that dcmR-like genes are not necessary associated with the catabolic dcm transposon.", "fr": "Alors que le gène dcmR a été détecté en quantité similaire à celle du gène dcmA par qPCR dans des échantillons de sites contaminés par le DCM, une analyse bioinformatique à partir des données de séquences indique que des gènes dcmR-like sont trouvés dans d'autres contextes génétiques que celui du transposon catabolique dcm." } }, { "id": "948", "translation": { "en": "These predictions, associated with experimental data, allowed us to determine interactions able to be established simultaneously by endostatin.", "fr": "Ces prédictions, associées aux données expérimentales, ont permis de déterminer des interactions susceptibles d'être établies simultanément par l'endostatine." } }, { "id": "949", "translation": { "en": "In particular, an insulator mutant that prevents loop formation significantly reduces the establishment of micro-domains.", "fr": "En particulier, un mutant d'insulateur qui empêche la formation de boucle diminue significativement l'établissement des micro-domaines." } }, { "id": "950", "translation": { "en": "The SH2 domains of the STAT5 proteins are once again used for this dimerization.", "fr": "Les domaines SH2 des protéines STAT5 sont à nouveau utilisés pour cette dimérisation." } }, { "id": "951", "translation": { "en": "Finally, the MSPs open the way to strain-level analyses.", "fr": "Enfin, les MSPs ouvrent la voie à des analyses au niveau souche." } }, { "id": "952", "translation": { "en": "Here, we describe the contribution and challenges of Big Data in oncology.", "fr": "Dans cet article, nous décrivons l'apport et les défis représentés par les Big Data en cancérologie." } }, { "id": "953", "translation": { "en": "DPC is based on a division test to decide if a group must be divided into two groups or not. This test compares the density of points inside the two groups and between them. If the first is significatively superior to the second then the group is divided.", "fr": "DPC est basé sur un test de découpage de classe qui fait l'hypothèse qu'une classe doit être découpée en deux si la densité à l'intérieur de ces deux classes est significativement supérieure à celle observée entre les deux." } }, { "id": "954", "translation": { "en": "Thus, we revealed these prediction tools are able to prioritize variants for RNA studies in these hitherto poorly studied regions.", "fr": "Nous avons ainsi révélé que ces outils de prédictions sont aptes à prioriser les variants pour des études ARN dans ces régions jusque-là peu étudiées." } }, { "id": "955", "translation": { "en": "Moreover with a large number of tunable parameters it allows us to control the properties of primers.", "fr": "En plus, avec un grand nombre de paramètres réglables il nous permet de contrôler les propriétés des amorces." } }, { "id": "956", "translation": { "en": "Results showed that disease-associated variants were scored higher than control SNPs with the SNP model and lower than control SNPs with the SOM model, supporting our hypothesis that purifying selection as measured by fraction of rare SNPs and mutation density is informative for the evaluation of the functional impact of cancer mutations in the non-coding genome.", "fr": "Les résultats ont montré que les variants associés à des maladies ont des scores plus élevés que les SNP-contrôle avec le modèle SNP et inférieures avec le modèle SOM, confortant notre hypothèse selon laquelle la sélection négative, telle que mesurée par fraction de SNP rares et de densité de mutation somatiques, nous informe sur l'impact fonctionnel des mutations tumorales dans le génome non-codant." } }, { "id": "957", "translation": { "en": "We also conducted field studies and organized design workshops. Participatory design enables the user to actively participate in the design of software.", "fr": "Parallèlement à cette réflexion, nous avons mené des études de terrains et organisé des ateliers de conception avec des biologistes permettant à l'utilisateur de participer activement à la conception d'un logiciel." } }, { "id": "958", "translation": { "en": "This thesis fits into the context of designing ARAS for PTWV that can alert riders upstream of dangerous driving situations.", "fr": "L'objectif principal de la thèse est de concevoir des systèmes d'assistance à la conduite, ARAS (Advanced Rider Assistance Systems), pour les V2RM pouvant alerter ces conducteurs en amont des situations de conduite dangereuses." } }, { "id": "959", "translation": { "en": "State of art. Friedreich's ataxia (FRDA) is clearly the most frequent ARCA and several rarer entities have been described during the past fifteen years such as ataxia with oculomotor apraxia type 1 (AOA1) and type 2 (AOA2), ataxia with vitamin E deficiency (AVED) and autosomal recessive spastic ataxia of Charlevoix-Saguenay (ARSACS).", "fr": "État des connaissances La maladie de Friedreich (FRDA) est de loin la plus fréquente des ACAR et plusieurs entités plus rares ont été décrites au cours des quinze dernières années telles que les ataxies avec apraxie oculomotrice de type 1 (AOA1) et 2 (AOA2), l'ataxie avec déficit en vitamine E (AVED) et l'ataxie spastique autosomique récessive de Charlevoix-Saguenay (ARSACS)." } }, { "id": "960", "translation": { "en": "However, despite the economical importance of citrus, a little is known about the coumarins and furanocoumarins pathway in these plants.", "fr": "En revanche, malgré l'importance économique des agrumes, nous en savons très peu sur la voie de biosynthèse des coumarines et furocoumarines chez ces plantes." } }, { "id": "961", "translation": { "en": "In this thesis, we focus on the problem of link prediction in binary tensors of order three and four containing positive observations only.", "fr": "Dans cette thèse, nous abordons le problème de prédiction de liens dans des tenseurs binaires d'ordre trois et quatre contenant des observations positives uniquement." } }, { "id": "962", "translation": { "en": "Such modular evolution is inadequately modeled by trees, since composite objects are not merely the result of divergence from a common ancestor only.", "fr": "Cette évolution modulaire se modélise mal par des arbres, puisque les objets composites ne sont pas seulement le résultat d'une divergence depuis un ancêtre." } }, { "id": "963", "translation": { "en": "Subtype determination in daily practice remains a major challenge as most technologies used to build these classifications are very expensive, requires dedicated bio-informatics analysis pipelines and are not adapted to routine samples that are mostly formal in fixed paraffin embedded biopsies, in which tumor cells are highly contaminated by the cell from the microenvironment and the clot.", "fr": "La détermination des sous-types en pratique courante reste un challenge majeur car la majorité des technologies ayant permis de définir ces sous-types sont coûteuses, complexes et non adaptés aux prélèvements de routine qui sont pour la majorité des biopsies fixées en formol et incluses en paraffine au sein desquelles les cellules tumorales sont fortement contaminées par les cellules du micro-environnement et du caillot." } }, { "id": "964", "translation": { "en": "Considered in a wider framework, this SB model was then evaluated and compared to two other computational models (i.e., an empirical dose-response statistical model and a dynamic Bayesian model) for the quantification of a ‘chronic kidney disease' AOP.", "fr": "Ce modèle de SB a été ensuite utilisé pour la quantification d'un AOP de l'insuffisance rénale chronique et comparé à deux autres approches: l'utilisation de modèles statistiques empiriques et celle d'un réseau Bayésien dynamique." } }, { "id": "965", "translation": { "en": "To further understand the activation mechanism of ADGRV1, I started its structural characterization in complex with its associated G protein by cryo electron microscopy.", "fr": "Afin de mieux comprendre les mécanismes d'activation d'ADGRV1, j'ai entamé l'étude structurale du complexe RCPG/protéine G par cryo-microscopie électronique." } }, { "id": "966", "translation": { "en": "Patch-seq experiment is a combination of patch experiment and single-cell RNA-seq with SMART-seq3 allowing a morphological, electrophysiological, and single-cell transcriptional profiling characterization of a given cell.", "fr": "L'expérience Patch-seq est une combinaison d'expérience de patch et d'ARN-seq unicellulaire avec SMART-seq3 permettant une caractérisation de profil transcriptionnel morphologique, électrophysiologique et unicellulaire d'une cellule donnée." } }, { "id": "967", "translation": { "en": "When an optimal point, or a set of points is found, these can be projected back to the original representation.", "fr": "Lorsqu'un point optimal ou un ensemble de points est trouvé, ceux-ci peuvent être projetés vers la représentation d'origine." } }, { "id": "968", "translation": { "en": "Finally, this catalogue was used in the development of a new method to differentiate between direct and indirect protein binding events in ChIP-seq results.", "fr": "Enfin, ce catalogue a été utilisé dans le développement d'une nouvelle méthode permettant de différencier les événements de fixations directes et indirectes par les protéines dans les résultats de ChIP-seq." } }, { "id": "969", "translation": { "en": "The interest and limitations of our different methods are discussed and some perspectives are proposed.", "fr": "L'intérêt et les limites de nos différentes approches sont discutés et plusieurs perspectives d'évolution sont proposées." } }, { "id": "970", "translation": { "en": "We validate the performance of GrAPFI using six reference proteomes from UniprotKB/SwissProt and compare GrAPFI results with state-of-the-art EC prediction approaches.", "fr": "Nous validons les performances de GrAPFI en utilisant six protéomes de référence dans UniprotKB/SwissProt, et nous comparons les résultats de GrAPFI avec des outils de référence." } }, { "id": "971", "translation": { "en": "A growing demand for tools to build and decrypt genetic networks that control cellular processes is felt in biology.", "fr": "Une demande croissante d'outils pour construire et décrypter des réseaux génétiques contrôlant des processus cellulaires est ressentie en biologie." } }, { "id": "972", "translation": { "en": "The uncontrolled variability of beef tenderness is a major problem for industry. This quality is very important for consumers.", "fr": "La variabilité non maîtrisée de la tendreté de la viande bovine est un problème majeur pour la filière industrielle, cette qualité étant très recherchée par les consommateurs." } }, { "id": "973", "translation": { "en": "To adapt to this complex environment, the virus must necessarily acquire new mutations on the sites targeted by CRISPR.", "fr": "Pour s'adapter à cet environnement complexe le virus doit nécessairement acquérir de nouvelles mutations sur les sites ciblés par CRISPR." } }, { "id": "974", "translation": { "en": "We propose an approximate method for labeled weighted graph matching, based on a convex-concave programming approach which can be applied to the matching of large sized graphs.", "fr": "Nous proposons une méthode approximative pour l'alignement de graphes étiquetés et pondérés, basée sur la programmation convexe concave." } }, { "id": "975", "translation": { "en": "Results indicate mitochondrial peptides produced by regular delRNA translation and translation of regular mRNAs by expanded anticodons.", "fr": "Les résultats indiquent que des peptides mitochondriaux sont produits à partir de traduction normale de delRNAs et de traduction de mRNAs normaux par des anticodons rallongés." } }, { "id": "976", "translation": { "en": "Further studies revealed that most cases show non-random chromosomal aberrations of chromosomes 1, 3, 6 and 8 and that the loss of chromosome 3 and gain of 8q were significantly associated with overall survival and the development of metastases.", "fr": "Plusieurs études montrent dans beaucoup de cas des aberrations chromosomiques non aléatoires sur les chromosomes 1, 3, 6 et 8 et que la perte du chromosome 3 et le gain du 8q sont associés significativement à une survie réduite et au développement de métastase." } }, { "id": "977", "translation": { "en": "Recent advances in cancer research have led to the development of very expensive new drugs for cancer treatment: the targeted therapies.", "fr": "Les avancées récentes de la biologie moléculaire ont conduit à la mise à disposition de nouvelles molécules très coûteuses en cancérologie : les thérapies moléculaires ciblées." } }, { "id": "978", "translation": { "en": "As far as we know, no local alignment method using pairwise parameters exists.", "fr": "À notre connaissance, il n'existe pas de méthode d'alignement local utilisant des paramètres pairés." } }, { "id": "979", "translation": { "en": "In addition to its relevance in fundamental research, this work may allow a better understanding of the solubility of supercritical fluids used in many industrial processes.", "fr": "Outre son intéret sur le plan fondamental, ce travail pourrait permettre une meilleure compréhension des propriétés de solubilité des fluides supercritiques, utilisés dans de nombreuses applications industrielles." } }, { "id": "980", "translation": { "en": "The study of imputation quality to sequence level is a necessary first step before using imputed sequences in association analysis and genomic evaluations.", "fr": "L'étude de la qualité d'imputation vers la séquence dans la filière caprine est un préalable nécessaire à l'utilisation de cette dernière dans les analyses d'association pour la détection de QTL ainsi que dans les évaluations génomiques." } }, { "id": "981", "translation": { "en": "A good knowledge of each resource is required to find relevant information. The search for data is time consuming, the comparison and the transfer of data between species is tedious.", "fr": "Trouver l'information requiert une bonne connaissance des différentes ressources bioinformatiques et la recherche d'informations est coûteuse en temps, rendant la comparaison et le transfert d'informations entre espèces complexe." } }, { "id": "982", "translation": { "en": "This, among other things, can be partially attributed to the adopted statistical methodology, which does not often take into account interaction between genetic variants, or epistasis.", "fr": "Cela peut être partiellement attribué à la méthodologie statistique adoptée, qui ne prend pas souvent en compte l'interaction entre les variants génétiques, ou l'épistasie." } }, { "id": "983", "translation": { "en": "A new chaining method, which is able to produce an optimal set of chains that satisfies specific consistency constraints that aim at easier interpretation is described, using minimum cost flow theory.", "fr": "Une nouvelle méthode de chaînage, capable de produire un ensemble de chaînes de score optimal et satisfaisant des contraintes de cohérences assurant une interprétation aisée des résultats est formulée, en exploitant la théorie des flots de coût minimum." } }, { "id": "984", "translation": { "en": "Consequently, I have developed a bioinformatics pipeline to generate estimates of diversity using molecular taxonomic units (MOTUs) by fish family.", "fr": "En conséquence, j'ai développé un pipeline bio-informatique pour générer des estimations de la diversité en unités taxonomiques moléculaires (MOTUs) par famille de poissons." } }, { "id": "985", "translation": { "en": "We estimate the relevance of the results using a predictive scheme (we predict new games usingthe skills estimated in the past).", "fr": "Nous évaluons la qualitéde nos résultats via un schéma prédictif (nous prédisons le résultat de nouveaux matchs `a l'aide des valeursprécédemment calculées)." } }, { "id": "986", "translation": { "en": "The process also includes bulls from 4 other breeds in order to obtain an estimate of the genetic variability linked to the breed.", "fr": "Le dispositif inclus également des taureaux de 4 autres races pour obtenir une estimation de la variabilité épigénétique liée à la race." } }, { "id": "987", "translation": { "en": "The analysis of biological networks with respect to diseases has led to the development of the field of network medicine.", "fr": "L'analyse des réseaux biologiques par rapport aux maladies humaines a conduit au domaine de la médecine des réseaux." } }, { "id": "988", "translation": { "en": "The purpose of SV genotyping is to assess for each variant of a given input set which alleles are present in a newly sequenced sample.", "fr": "L'objectif du génotypage de SVs vise pour un ensemble de SVs donné à évaluer les allèles présents dans un nouvel échantillon séquencé." } }, { "id": "989", "translation": { "en": "In the omics era, the study of genotype-phenotype relations requires the integration of a wide variety of data to describe diverse aspects of biological systems.", "fr": "A l'ère des omiques, l'étude des relations génotype-phénotype repose sur l'intégration de données diverses décrivant des aspects complémentaires des systèmes biologiques." } }, { "id": "990", "translation": { "en": "In this context, we study the repertoires of lymphocyte antigen receptors, whose diversity is essential for effective host protection.", "fr": "Dans ce cadre, nous nous intéressons aux répertoires de récepteurs à l'antigène des lymphocytes dont la diversité est indispensable pour assurer une protection efficace de l'hôte." } }, { "id": "991", "translation": { "en": "To highlight relevant information within these data, MS2 spectra were organized as molecular networks.", "fr": "Pour exploiter au mieux la quantité d'information générée par ces analyses, les spectres MS2 ont ensuite été organisés sous forme de réseaux moléculaires." } }, { "id": "992", "translation": { "en": "A notable innovation of my approach is to take into account data of associations between non-coding regions and target genes.", "fr": "Une innovation notable de mon approche est de prendre en compte des données d'associations entre régions non-codantes et gènes cibles." } }, { "id": "993", "translation": { "en": "A precise model could be constructed in an LPV framework where the nonlinear terms are considered as linearly time-varying within the given parameter limits.", "fr": "Un modèle précis pourrait être construit dans un cadre LPV où les termes non linéaires sont considérés comme variant linéairement dans le temps dans les limites des paramètres donnés." } }, { "id": "994", "translation": { "en": "Gene co-expression networks can be perceived as association networks between variables that measure transcript abundances.", "fr": "Les réseaux de coexpression de gènes peuvent être interprétés comme des réseaux d'association entre des variables qui mesurent les abondances de transcrits." } }, { "id": "995", "translation": { "en": "FIST is an integrated approach based on the Galois closure framework, combining the searches for generators, frequent closed itemsets, association rules, conceptual bi-clusters and classification patterns, and extending the generated patterns for conceptual analysis.", "fr": "FIST est une approche intégrée qui combine l'extraction de générateurs, motifs fermés fréquents, règles d'association, de classification, et bi-clusters conceptuels, étendant ainsi les modèles classiques de connaissance pour une analyse conceptuelle." } }, { "id": "996", "translation": { "en": "Wrong route medication errors due to tubing misconnections can lead to serious adverse events, especially when they concern the neuraxial and perineural routes.", "fr": "Les erreurs de voie d'administration de médicaments peuvent entraîner des événements indésirables potentiellement graves, notamment lorsqu'elles concernent les voies neuraxiales et périneurales." } }, { "id": "997", "translation": { "en": "A penetrating keratoplasty was performed at the same time for eight eyes.", "fr": "Une kératoplastie transfixiante a été réalisée dans le même temps opératoire pour huit yeux." } }, { "id": "998", "translation": { "en": "Their characterization at the molecular level is therefore crucial in drug discovery.", "fr": "Les caractériser au niveau moléculaire est un donc enjeu crucial pour la recherche de nouveaux candidat-médicaments." } }, { "id": "999", "translation": { "en": "In the context of my PhD thesis, I have first developed a new software allowing to measure with a good precision the number of really independent genetic markers present in a set of markers genotyped in a given population.", "fr": "Dans le cadre de cette thèse, un nouvel outil logiciel a été développé qui permet de mesurer avec une bonne précision le nombre de marqueurs génétiques effectivement indépendants correspondant à un ensemble de marqueurs génotypés dans une population donnée." } }, { "id": "1000", "translation": { "en": "In this regard, we studied the functional organization of a set of 37 genes encoding classical and newly discovered RAAS participants, including substrate, enzymes and receptors.", "fr": "À cet égard, nous avons étudié l'organisation fonctionnelle d'un ensemble de 37 gènes codant pour les composants classiques et nouvellement découverts du RAAS, y compris les substrats, les enzymes et les récepteurs." } }, { "id": "1001", "translation": { "en": "Oncology, infectious diseases or human genomics, many applications have been developed in recent years.", "fr": "Cancérologie, infectiologie ou génomique humaine, de nombreuses applications ont vu le jour ces dernières années." } }, { "id": "1002", "translation": { "en": "The results are divided into three parts.", "fr": "Les résultats de la thèse se divisent en trois parties." } }, { "id": "1003", "translation": { "en": "Insulator Binding Proteins (IBPs) could be involved in the three-dimensional folding of genomes into topological domains (or \"TADs\").", "fr": "Les protéines se liants aux insulateurs (IBPs) seraient impliquées dans la structuration tri-dimensionnelle des génomes en domaines topologiques (ou \" TADs)." } }, { "id": "1004", "translation": { "en": "Unexpectedly, our simulations demonstrated that large conformational changes of the PAPS-bound SULT1A1 could occur.", "fr": "De manière inattendue, nos simulations ont montré que de grands changements conformationnels de SULT1A1 contenant le PAPS peuvent se produire." } }, { "id": "1005", "translation": { "en": "Encompassing both a translational approach in research and a vision of future medical practice, genomic medicine may have important impact on the way healthcare professionals diagnostics, treat and prevent diseases.", "fr": "Englobant à la fois une démarche de recherche et une vision de la médecine du futur, elle pourrait avoir des conséquences importantes sur la manière de diagnostiquer, traiter et prévenir la maladie." } }, { "id": "1006", "translation": { "en": "Further analyses showed that the initial muscle identity program proceeds normally for the most part in the absence of zygotic Ssdp, but muscles fail to establish their final identity due to the deregulation of identity processes such as specific muscle morphology, innervation and attachment.", "fr": "J'ai pu montrer qu'en absence de Ssdp zygotique le programme initial d'identité musculaire se déroule normalement pour la plupart. Pourtant les muscles ne parviennent pas à acquérir leur identité finale à cause de la dérégulation des processus d'identité tels que la morphologie musculaire spécifique, l'innervation et l'attachement." } }, { "id": "1007", "translation": { "en": "The markers and a classification method are applied to four SHD groups: arrhythmogenic right ventricular dysplasia, cardiomyopathy, Brugada syndrome and idiopathic VF, and a control group for comparison.", "fr": "Ces marqueurs sont mis en œuvre dans une méthodologie de classification et appliqués à quatre populations de patients malades: les dysplasies arythmogènes du ventricule droit, les cardiomyopathies, les syndromes de Brugada et les FVI micro-structurelles, et un groupe contrôle pour la comparaison." } }, { "id": "1008", "translation": { "en": "This thesis manuscript provides us with the tools necessary for a complete characterization of the virus genome.", "fr": "Dans ce manuscrit de thèse nous apportant les outils nécessaire à la caractérisation complète du génome du virus." } }, { "id": "1009", "translation": { "en": "The present thesis explores the folding of biomolecules with interactive molecular dynamics (IMD) simulations using the OPEP and HiRE-RNA models, respectively for amino acids and nucleic acids.", "fr": "Ce travail de thèse explore le repliement des biomolécules au moyen de simulations de dynamique moléculaire interactives avec les modèles gros-grains OPEP et HiRE-RNA, respectivement dédiés aux acides aminés et nucléiques." } }, { "id": "1010", "translation": { "en": "The structure and dynamics of the model was investigated through molecular modelling and all-atom molecular dynamics simulation in a fully hydrated lipid bilayer environment.", "fr": "Sa structure et sa dynamique ont été étudiées par modélisation et simulations de dynamiques moléculaires tout-atome dans une bicouche lipidique solvatée." } }, { "id": "1011", "translation": { "en": "This database is available online at the following address: http://www.pasteur-guadeloupe.fr:8081/SITVIT2/.", "fr": "Cette base de données est consultable en ligne à l'adresse suivante : http://www.pasteur-guadeloupe.fr:8081/SITVIT2/." } }, { "id": "1012", "translation": { "en": "We benchmark our completion methods on knowledge bases which represent a variety of relationnal data and scales.", "fr": "Ces dernières nous permettent d'évaluer nos méthodes de complétion à grande échelle et sur des types de graphes relationnels variés." } }, { "id": "1013", "translation": { "en": "I hypothesized that there might be a decorrelation between function and phenotype and I decided to extend my study to all T cells, since the lineage paradigm is also questionable here.", "fr": "En partant de l'hypothèse qu'il y a potentiellement décorrélation entre le phénotype et la fonction, j'ai ensuite élargi mon cadre d'étude à l'ensemble des cellules T en questionnant le paradigme de lignée actuel." } }, { "id": "1014", "translation": { "en": "This thesis introduces such unattended approaches in the fields of metabonomics and structural biology.", "fr": "Les travaux réalisés ici représentent des nouvelles approches dans le domaine de la métabolomique et de la biologie structurelle." } }, { "id": "1015", "translation": { "en": "We frame them through multitask machine learning frameworks, which combine all data available for related problems in order to solve them at the same time.", "fr": "Pour ce faire, nous nous plaçons dans le cadre de l'apprentissage statistique multitâche, qui consiste à combiner les données disponibles pour plusieurs problèmes liés afin de les résoudre simultanément." } }, { "id": "1016", "translation": { "en": "After parameter estimation, the model reproduces much of experimental data, including the dependence of STDP on the number of paired stimuli of pre- and postsynaptic neurons and intensive pharmacological exploration (where signaling molecules are perturbed by chemicals).", "fr": "Après estimation des paramètres, le modèle reproduit la quasi-totalité des données expérimentales, y compris la dépendance de la STDP envers le nombre stimulations pré- et post-synaptiques appariées et son exploration pharmacologique intensive (perturbation des voies de signalisation par des produits chimiques)." } }, { "id": "1017", "translation": { "en": "More recently, we have also developed approaches that allow to model more complex interactions thanks to kernel methods.", "fr": "Plus récemment, nous avons aussi développé des approches permettant la modélisation d'interactions plus complexes grâce à des méthodes à noyaux." } }, { "id": "1018", "translation": { "en": "Some of these new hypotheses (e.g., direct action of potassium bromate on DCF, bleaching of DCF with time, etc.)", "fr": "Ces nouvelles hypothèses (par exemple : action directe du bromate de potassium sur le DCF, atténuation de la fluorescence du DCF avec le temps, etc.)" } }, { "id": "1019", "translation": { "en": "The fact that many plant genomes are large, complex (containing many repeats) and often polyploid makes this approach particularly difficult.", "fr": "Le fait que de nombreux génomes de plantes soient grands, complexes (contenant de nombreuses répétitions) et souvent polyploïdes rend l'approche particulièrement difficile." } }, { "id": "1020", "translation": { "en": "Very recently, few studies have shown how mutations that spontaneously arise in the body during development (somatic mutations) can be used to reconstruct cell phylogenies. This shed light for the first time on how cells segregate to form different parts of the human body during development.", "fr": "Très récemment, quelques études ont montré de manière indépendante qu'un arbre généalogique des cellules d'un même individu (phylogénie cellulaire) peut être reconstruit à partir des mutations qui apparaissent spontanément dans le corps au cours du développement (mutations somatiques), permettant ainsi pour la première fois d'étudier comment les cellules ségréguent pour former les différentes parties du corps humain au cours du développement." } }, { "id": "1021", "translation": { "en": "Data extracted from DNA microarrays is considered an important source of knowledge about obesity and cancer like complex diseases. Few obe studies exist to predict the outcomes of different therapies.", "fr": "L'obésité et le cancer sont des maladies complexes multifactorielles. Les données de puces à ADN représentent une source importante de connaissances pour étudier ces maladies." } }, { "id": "1022", "translation": { "en": "This point is the main drive of this thesis.", "fr": "C'est sur ce dernier point que s'inscrivent les travaux exposés dans cette thèse." } }, { "id": "1023", "translation": { "en": "There are automated solutions to facilitate composing workflows but they are generally limited in the guidance and the data adaptation between services they offer.", "fr": "Il existe des solutions automatisées pour faciliter la composition de workflows mais elles sont généralement limitées dans le guidage et l'adaptation des données entre services." } }, { "id": "1024", "translation": { "en": "Lactic acid bacteria, particularly Lactococcus lactis are used in dairy industry.", "fr": "Les bactéries lactiques, en particulier Lactococcus lactis sont utilisées en industrie agroalimentaire." } }, { "id": "1025", "translation": { "en": "In this Ph.D. work, we proposed models and algorithms to study the common evolutionary history of hosts and symbionts.", "fr": "Lors de cette thèse, je me suis intéressée aux modèles et aux algorithmes pour étudier l'histoire évolutive commune des hôtes et des symbiotes." } }, { "id": "1026", "translation": { "en": "It automatically avoids inconsistency in case of contradiction between different hypotheses.", "fr": "Cet outil permet d'éviter automatiquement l'incohérence en cas de contradiction entre différentes hypothèses sur le système." } }, { "id": "1027", "translation": { "en": "But even for these cases, all receptors show a transmembrane cavity on which we will concentrate during this work.", "fr": "Mais même dans ces cas, les récepteurs possèdent une cavité transmembranaire et c'est sur elle que nous focalisons notre travail." } }, { "id": "1028", "translation": { "en": "The latest sequencing protocols have made it possible to obtain genomic data with new characteristics.", "fr": "Les derniers protocoles de séquençage ont permis d'obtenir de nouvelles données génomiques." } }, { "id": "1029", "translation": { "en": "The identification of the position of these origins in the genome, as well as the description of their sequence features and chromatin structure, have been the center of many studies over the last years. A handful of sophisticated methods has been developed to capture replication initiation events, to detect replication factors binding sites onto the chromatin and to computationally analyze these data at the genome scale.", "fr": "Ces dernières années ont vu l'émergence de technologies sophistiquées à même d'identifier les sites d'initiation et les sites de liaison des facteurs de la réplication à l'échelle du génome. Malgré ces avancées, le mystère demeure quant aux facteurs (génétiques et chromatiniens) capables de recruter la machinerie de réplication au niveau des origines, notamment chez les mammifères." } }, { "id": "1030", "translation": { "en": "The patients included in this study are children, followed for 5 years, from different centers in France with the support of the French Society of Childhood Cancers.", "fr": "Les patients inclus dans cette étude sont les enfants suivis depuis 5 ans dans différents centres en France sous l'égide de la Société Française des Cancers de l'Enfant." } }, { "id": "1031", "translation": { "en": "Finally the performance of the system is evaluated using an annotated corpus of specialized full-text publications.", "fr": "Finalement, les performances du système sont évaluées à l'aide d'un corpus annoté de pubIications complètes de biologie moléculaire." } }, { "id": "1032", "translation": { "en": "This last objective requires the implementation of a bioinformatic tool based on the use of R (R Development Core Team) software.", "fr": "Ce dernier objectif à nécessité la mise en place d'un outil bioinformatique basée sur l'utilisation du logiciel R (R Development Core Team)." } }, { "id": "1033", "translation": { "en": "This method exploits structural information encoded in a database of three-residue fragments (tripeptides) extracted from high-resolution experimentally-solved protein structures.", "fr": "Cette méthode exploite les informations structurales codées dans une base de données de fragments de trois résidus (tripeptides) extraites de structures protéiques à haute résolution." } }, { "id": "1034", "translation": { "en": "Next, we focused on Sars-CoV-2 data.", "fr": "Ensuite, nous nous sommes concentrés sur les données du Sars-Cov-2." } }, { "id": "1035", "translation": { "en": "It is based on the detection of B-arches with the help of the improved version of ArchCandy 2.0.", "fr": "Il est basé sur la détection des B-arches à l'aide de la version améliorée d'ArchCandy 2.0." } }, { "id": "1036", "translation": { "en": "However the major limitation of proteomic investigations, more generally of post-genomic approaches, remains the molecular and cellular complexity of the mammary gland that is still a major challenge.", "fr": "Néanmoins la protéomique, comme l'ensemble des approches de post-génomique, doit faire face à la complexité cellulaire et moléculaire de la glande mammaire qui reste un défi majeur." } }, { "id": "1037", "translation": { "en": "These variants were observed in the progenies of different plant, indicating that FIGL1 is essential to ensure genome stability of B. napus.", "fr": "Ces variants ont été observés dans les descendances de plantes différentes, ce qui indique que FIGL1 est essentiel pour assurer la stabilité du génome du colza." } }, { "id": "1038", "translation": { "en": "The objective of this thesis is to study, using DNA microarrays, transcriptional modulations associated with the pathogenesis and therapeutic response in the case of two diseases: infection with Hepatitis C Virus (HCV) and Rheumatoid Arthritis (RA).", "fr": "L'objectif de cette thèse est d'étudier, à l'aide de puces à ADN, les modulations transcriptionnelles associées à la pathogénèse et à la réponse thérapeutique dans le cas de deux pathologies: l'infection par le Virus de l'Hépatite C (VHC) et la Polyarthrite Rhumatoïde (PR)." } }, { "id": "1039", "translation": { "en": "Then, we present an application example by focusing onthe prediction of piRNAs.", "fr": "Par la suite, nous présentons un exemple d'application en se concentrantsur la prédiction d'ARNpi." } }, { "id": "1040", "translation": { "en": "Motivated by these questions, this thesis presents a SLA-Aware application consolidation solution for cloud federation.", "fr": "À partir de ces questions, la présente thèse propose une solution de consolidation d'applications pour la fédération de clouds qui garantit le respect des normes de qualité de service." } }, { "id": "1041", "translation": { "en": "We develop our approach based on the assumption that event-based cameras provide edge-like information about the objects in the scene and apply a line detection algorithm for data reduction.", "fr": "Nous développons notre approche basée sur l'hypothèse que ces caméras fournissent des informations des contours des objets de la scène et appliquons un algorithme de détection de ligne pour la réduction des données." } }, { "id": "1042", "translation": { "en": "In particular, we do not have a universally accepted biological or clinical marker to measure the effect of a treatment.", "fr": "En particulier, nous ne disposons pas de marqueur biologique ou clinique qui fasse consensus pour mesurer l'effet d'un traitement." } }, { "id": "1043", "translation": { "en": "These data will be useful for the improvement and/or development of countermeasures to limit the impact of these stresses on astronauts and the general population.", "fr": "Ces données seront utiles pour l'amélioration et/ou le développement de contremesures permettant de limiter l'impact de ces stress chez les spationautes mais aussi la population en général." } }, { "id": "1044", "translation": { "en": "Quantitative assessment of surrounding brain regions, including the dorsal SVZ, revealed a transient response of defined progenitor populations.", "fr": "Une analyse quantitative des régions adjacentes, incluant la région dorsale de la SVZ, a révélé une réponse transitoire de progéniteurs définis." } }, { "id": "1045", "translation": { "en": "Treatment is sometimes adapted to the pathogenic variant.", "fr": "Les avancées de la médecine permettent aussi dorénavant d'adapter parfois les traitements au résultat." } }, { "id": "1046", "translation": { "en": "This software was used to build PhylOPDb: a comprehensive 16S rRNA oligonucleotide probe database for prokaryotic identification.", "fr": "Ce logiciel a alors été utilisé pour construire PhylOPDb: une base de données complète de sondes oligonucléotidiques pour l'étude des communautés procaryotiques." } }, { "id": "1047", "translation": { "en": "In addition, we show how systolic solutions can be derived in CGM algorithms.", "fr": "D'autre part, nous montrons comment des solutions systoliques peuvent être dérivées en algorithmes CGM." } }, { "id": "1048", "translation": { "en": "Finally, the approaches and methods implemented in this thesis are validated using a virtual prototype in the SimMechanics environment, where a graphical user interface GUI is designed to manipulate and visualize the system during programmed scenarios, thus demonstrating the interest of the main thesis contributions.", "fr": "Finalement, les approches et méthodes mises en œuvre sont validées à l'aide d'un prototype virtuel dans l'environnement SimMechanics où une interface utilisateur graphique GUI est conçue pour manipuler et visualiser le système lors de scénarios programmés, montrant ainsi l'apport des contributions principales de la thèse." } }, { "id": "1049", "translation": { "en": "Genomes evolve through processes that modify their content and organization at different scales, ranging from the substitution, insertion or deletion of a single nucleotide to the duplication, loss or transfer of a gene and to large scale chromosomal rearrangements.", "fr": "L'évolution des génomes peut être observée à plusieurs échelles, chaque échelle révélant des processus évolutifs différents. A l'échelle de séquences ADN, il s'agit d'insertions, délétions et substitutions de nucléotides. Si l'on s'intéresse aux gènes composant les génomes, il s'agit de duplications, pertes et transferts horizontaux de gènes. Et à plus large échelle, on observe des réarrangements chromosomiques modifiant l'agencement des gènes sur les chromosomes." } }, { "id": "1050", "translation": { "en": "It is against this backdrop that France announced its cooperation with Great Britain, one of the global leaders in genomics.", "fr": "C'est dans ce contexte que la France a annoncé sa coopération avec la Grande-Bretagne, l'un des plus grands leaders mondiaux de la médecine génomique." } }, { "id": "1051", "translation": { "en": "The late isolates displayed independent genomic signatures of chronic adaptation in patients (altered LPS and porin OprD, and extinction of MexAB-oprM efflux pump overproduction).", "fr": "Les isolats tardifs présentaient des signatures génomiques d'adaptation à l'infection chronique (altération du lipopolysaccharide et de la porine OprD – objectivées phénotypiquement, et extinction de la surproduction de la pompe d'efflux MexAB-OprM – contrôlée par RT-qPCR) suite à des mutations indépendantes." } }, { "id": "1052", "translation": { "en": "The development of a specific analysis tool allowed us to finely characterize the nature of movements.", "fr": "Le développement d'un outil d'analyse spécifique a permis de caractériser finement la nature des mouvements." } }, { "id": "1053", "translation": { "en": "So, it becomes possible to deduct if the creation of a particular taxonomic group can give some explanation by (or led to) the appearance of specificities at the level of its metabolism.", "fr": "Ainsi, il devient possible de déduire si la création d'un groupe taxonomique particulier peut s'expliquer par (ou a induit) l'apparition de certaines spécificités au niveau de son métabolisme." } }, { "id": "1054", "translation": { "en": "We propose here a new method to estimate an efficient value of the gamma shape parameter, i.e., the value that is best suited for tree topology estimation.", "fr": "Nous proposons ici une méthode visant à déterminer la valeur efficace de ce paramètre, c'est-à-dire la valeur la plus adaptée à l'estimation de topologies d'arbres." } }, { "id": "1055", "translation": { "en": "The main objective is first to characterize this phenomenon in V. planifolia and then to evaluate it as a model for other vanilla/orchid species by comparative genomics approaches, using genomic approaches, based on genomic data of other species of the genus Vanilla that will be generated in the team or from representative species of classical endoreplication such as Phalaenopsis equestris for which the genomic sequence is already available.", "fr": "L'objectif principal est dans un premier temps de caractériser ce phénomène chez V. planifolia puis de l'évaluer en tant que modèle pour d'autres vanilliers/orchidées par des approches de génomique comparative, à partir de données génomiques d'autres espèces du genre Vanilla qui seront générées dans l'équipe ou d'espèces représentatives de l'endoréplication classique comme Phalaenopsis equestris dont la séquence génomique est déjà disponible." } }, { "id": "1056", "translation": { "en": "These networks evolve with the components of the environment and the enzymes that they contain thus leading to the emergence of new pathways capable of developing new products or use new substrates.", "fr": "Ces réseaux évoluent avec les composants du milieu et les enzymes qui les composent, pouvant ainsi mener à l'émergence de nouvelles voies capables d'élaborer de nouveaux produits ou d'utiliser de nouveaux substrats." } }, { "id": "1057", "translation": { "en": "A)Open state Structural analysis of GLIC, a bacterial pLGIC, revealed sites for solvent molecules within the transmembrane pore of the open channel.", "fr": "A) Etat ouvert L'analyse structurale de GLIC, RCP bactérien, a révélé la présence de sites préférentiels pour le solvant le long du pore transmembranaire." } }, { "id": "1058", "translation": { "en": "The rapid development of sequencing technologies and bioinformatics methods makes possible the integration of large amounts of data to study regulatory elements.", "fr": "Le développement des techniques de séquençage et des méthodes d'analyse bioinformatiques permettent d'intégrer de grandes quantités de données pour étudier le fonctionnement des éléments régulateurs." } }, { "id": "1059", "translation": { "en": "However, little is yet known about what they can do.", "fr": "Cependant, on sait encore peu de choses sur ce qu'elles peuvent y faire." } }, { "id": "1060", "translation": { "en": "I discuss the following contributions, with a focus on applications to cancer data from bioinformatics.", "fr": "Je présente les contributions suivantes, en soulignant les applications à la bioinformatique." } }, { "id": "1061", "translation": { "en": "Knowing that the life expectancy increases, it is certain that the prevalence of these age-related diseases will rise in the years to come.", "fr": "Sachant que l'espérance de vie augmente, il est certain que la prévalence de ces maladies liées à l'âge augmentera dans les années à venir." } }, { "id": "1062", "translation": { "en": "The second contribution aims at increasing the effectiveness and efficiency of geneticists in their task of analyzing exomes.", "fr": "La seconde contribution vise à augmenter l'efficacité et l'efficience des généticiens dans leur tâche d'analyse des exomes." } }, { "id": "1063", "translation": { "en": "A list of candidates regulating transcripts (small RNA) has been mapped from new transcripts located in intergenic regions (IGR) and transcripts oriented in antisense of annotated coding sequences.", "fr": "Une cartographie de candidats ARN régulateurs non-codant a été édifiée à partir de nouveaux transcrits localisés en régions intergéniques (IGR) et de transcrits orientés en antisens de séquences codantes." } }, { "id": "1064", "translation": { "en": "Then, I present my own contribution to the investigation of the production of NRPs from genomic or protein sequences by participating to the design of bioinformatics protocols and to genome annotation.", "fr": "Ensuite, je présente ma contribution à l'exploration du potentiel de synthèse de PNR à partir de séquences génomiques ou protéiques à travers ma participation à la mise au point d'un protocole d'analyses bio-informatiques et à l'annotation de plusieurs génomes." } }, { "id": "1065", "translation": { "en": "A fruitful assumption based on this paradigm is that proteins sharing close three dimensional structures may derive from the same ancestor and thus, may share similar functions.", "fr": "Ce paradigme permet de supposer que deux protéines possédant des structures tridimensionnelles similaires peuvent partager un ancêtre commun et donc posséder des fonctions similaires." } }, { "id": "1066", "translation": { "en": "Retinoblastoma is a rare pediatric cancer of the developing retina.", "fr": "Le rétinoblastome est un cancer pédiatrique rare de la rétine en cours de développement." } }, { "id": "1067", "translation": { "en": "Gene sharing is a fairly common occurrence and is most often seen in enzymes taking on a various subfunctions such as signal transduction and transcriptional regulation.", "fr": "Ce partage est un phénomène assez courant, le plus souvent observé chez les enzymes réalisant plusieurs sous-fonctions telles que la transduction du signal et la régulation transcriptionnelle." } }, { "id": "1068", "translation": { "en": "Together with Ciliata and Dinoflagellata, apicomplexan parasites belong to the Alveolata superphylum.", "fr": "Les Apicomplexes font partie, avec les Ciliés et les Dinoflagellés, du phylum des Alveolés." } }, { "id": "1069", "translation": { "en": "The analysis of these proteins shows that some of them could effectively replace homodimers.", "fr": "L'analyse de ces protéines indique que certaines pourraient effectivement remplacer des dimères." } }, { "id": "1070", "translation": { "en": "Taken together, our data show that severe malaria associated genetic variants alters the activity of a promoter with enhancer function.", "fr": "Ensemble, nos données montrent les variantes génétiques associées au paludisme grave modifient l'activité d'un promoteur avec une fonction d'activateur." } }, { "id": "1071", "translation": { "en": "Context RNAs, and more precisely non-coding RNAs (ncRNAs, RNA untranslated into proteins), have aroused growing interest in the international scientific community in recent years, due to their proven involvement in many biological processes and the important role they can play in pathological processes such as cancer.", "fr": "Contexte Les ARN, et plus précisément les ARN non-codants (ARNncs, ARN non traduits en protéines), suscitent depuis quelques années un intérêt croissant auprès de la communauté scientifique internationale, de par leur implication avérée dans de nombreux processus biologiques et le rôle important qu'ils peuvent jouer dans des processus pathologiques comme le cancer." } }, { "id": "1072", "translation": { "en": "A better understanding of the impact of antibiotics on the intestinal microbiota and the development of resistance is essential.", "fr": "Mieux comprendre l'impact des antibiotiques sur le microbiote intestinal et l'acquisition de résistances est essentiel." } }, { "id": "1073", "translation": { "en": "Single-cell technologies are becoming essential in many research projects to analyze complex biological systems.", "fr": "Les technologies single-cell deviennent essentielles dans de nombreux projets de recherche visant à analyser des systèmes biologiques complexes." } }, { "id": "1074", "translation": { "en": "Inter-individual genetic variation might account for diverse efficacy and toxicity of calcineurin inhibitors (cyclosporin and tacrolimus). In particular, some variants located within genes coding for proteins of the calcineurin pathway can explain part of this variability.", "fr": "Ce travail de thèse reposait sur l'hypothèse que la variabilité génétique des protéines \" cibles \" des médicaments immunosuppresseurs de la famille des inhibiteurs de la calcineurine (ICN ; ciclosporine et tacrolimus) pourrait expliquer une partie de la variabilité observée dans leur efficacité et toxicité." } }, { "id": "1075", "translation": { "en": "Personalised medicine offers sophisticated approaches for management of the morbidities of the ageing population.", "fr": "La médecine personnalisée représente une approche sophistiquée pour réussir la prise en charge des morbidités de populations vieillissantes." } }, { "id": "1076", "translation": { "en": "Initially, a hierarchical study by normal modes analysis of the central domain of the alpha-actinin was performed to evaluate the effect of the 3D organization of the repeats on the mechanics of the system.", "fr": "Dans un premier temps, une étude hiérarchique par analyse de modes normaux du domaine central de l'alpha-actinine a été réalisée afin d'évaluer l'effet de l'organisation 3D des répétitions sur la mécanique du système." } }, { "id": "1077", "translation": { "en": "For this purpose, an original dereplication workflow combining LC/HRMS and 13C NMR, associated with the use of databases and molecular networks is proposed.", "fr": "Pour cela, un workflow de déréplication original combinant LC/HRMS et RMN du 13C, associé à l'utilisation de base de données et aux tracés de réseaux moléculaires est proposé." } }, { "id": "1078", "translation": { "en": "In bacteria it can be used to introduce genetic modifications, or specifically kill bacteria carrying target sequences such as antibiotic resistance genes. The catalytically dead variant of Cas9 (dCas9) can be used to control gene expression and has proven especially useful in high-throughput screens.", "fr": "Chez les bactéries, il peut être utilisé pour introduire des modifications génétiques ou tuer spécifiquement des bactéries pathogènes, tandis que le mutant catalytique de Cas9 (dCas9) peut être utilisé pour contrôler l'expression des gènes." } }, { "id": "1079", "translation": { "en": "Confocal microscopy, videomicroscopy together with a new generation of fluorochromes (especially those derived from green fluorescent protein, GFP) and image analysis software allow to visualize life in all its dimensions (space and time).", "fr": "Le developpement de la microscopie confocale, de la videomicroscopie, de nouveaux fluorochromes, notamment des derives de la GFP (green fluorescent protein), et de nouveaux logiciels permettent d'acceder a la visualisation tridimensionnelle des processus biologiques." } }, { "id": "1080", "translation": { "en": "During development of this pathology, the cell acquires many genetic abnormalities.", "fr": "Lors du développement de cette pathologie, la cellule fait l'acquisition de nombreuses anomalies génétiques." } }, { "id": "1081", "translation": { "en": "Fzo1p, a large GTPase of the Dynamin-Related Proteins superfamily, is a key component in mitochondrial outer membrane fusion in yeast. During this PhD project I built a model of the protein Fzo1p.", "fr": "Cette thèse porte sur la protéine Fzo1p, une grande GTPase de la superfamille des Dynamin-related-Protein. C'est un élément clé impliqué dans la fusion mitochondriale de la membrane externe de la levure." } }, { "id": "1082", "translation": { "en": "Our work point out where the bioinformatic improvment are still needed.", "fr": "Notre travail souligne les points qui nécessitent encore l'amélioration des méthodes bioinformatiques." } }, { "id": "1083", "translation": { "en": "The generated results can be accessed by several dedicated Web querying and visualisation interfaces designed during this thesis.", "fr": "Les résultats générés sont accessibles via plusieurs interfaces originales de recherche et de visualisation conçues au cours de cette thèse." } }, { "id": "1084", "translation": { "en": "Similarly, the study of the contributions of preestablishedgroups of tumors based on clinical or molecular criteria showed different levels of stromacontamination between FGFR3 non-mutated and mutated tumors.", "fr": "De façon similaire, l'étude des contributions de groupes de tumeurs basés sur des annotations cliniques ou moléculaires a montré différents niveaux de contamination par le stroma entre les tumeurs mutées et nonmutées pour FGFR3." } }, { "id": "1085", "translation": { "en": "Our team develops an original alternative strategy: anti-cytokine peptide-based active immunization.", "fr": "Notre équipe développe une stratégie alternative originale, l'immunisation active à base de peptides de cytokines." } }, { "id": "1086", "translation": { "en": "A third study (Zhang et al., 2017) contradicted these previous findings.", "fr": "Une troisième étude (Zhang et al., 2017) basée sur des patients chinois était en contradiction avec ces résultats précédents." } }, { "id": "1087", "translation": { "en": "Immune checkpoint inhibitors (ICI) are one of the most successful immunotherapy treatments for cancer.", "fr": "Les inhibiteurs de points de contrôle immunitaire (ICI, de l'anglais Immune Checkpoint Inhibitors) sont l'un des traitements d'immunothérapie les plus efficaces contre le cancer." } }, { "id": "1088", "translation": { "en": "The work carried out for this purpose shows that a deletion of the 5' region of the XACT major isoform is not sufficient to modulate X chromosome activity. In a second step, I was interested in the dynamics of X chromosome activity in somatic cells, in particular, in the hematopoietic lineage where an atypical inactivation status was identified.", "fr": "Les travaux réalisés dans ce but montrent qu'une délétion de la région 5' de l'isoforme majeur de XACT n'est pas suffisante pour moduler l'activité du chromosome X. Dans un second temps, je me suis intéressé à la dynamique de l'activité du chromosome X dans des cellules somatiques, en particulier, dans le lignage hématopoïétique où un statut atypique de l'inactivation a été identifié." } }, { "id": "1089", "translation": { "en": "The weighting process is mainly based on the definition of a membership margin for each sample.", "fr": "Le processus de pondération repose essentiellement sur la définition d'une marge d'appartenance pour chaque échantillon." } }, { "id": "1090", "translation": { "en": "Furthermore, Ets1 colocalizes with permissive chromatin marks in inter-and intra-genic regions, characterized byincreased GC content, TF binding motifs (TFBS) density as well as inter-species conservation \"Omics\" data are massive and heterogeneous data types, obtained from the measurement of different biological objects.", "fr": "De plus, ETS1 co-localise avec des marques chromatines permissives aux régions inter- et intragéniques,caractérisées par un contenu GC, densité de motifs de fixation de FT (SFFT) et conservation inter-espèces accrus. Les données dites \"omiques\", sont des données massives et hétérogènes, issues de la mesure de différents objets biologiques." } }, { "id": "1091", "translation": { "en": "A Strong Module is a module that does not overlap with another module.", "fr": "Un module fort est un module qui ne chevauche pas un autre module." } }, { "id": "1092", "translation": { "en": "Furthermore, a bioinformatics approach by generation of molecular networking from LC-MS2 analyses of these two species fractions involved that 28 others compounds such as falcarinol and labdanolic acid were present in these species and most of them are known to be bioactive.", "fr": "Par ailleurs, une approche bio-informatique par génération de réseaux moléculaires à partir des analyses CLUHP-SM2 des fractions issues des deux espèces a permis de supposer la présence de 28 autres composés tels que le falcarinol et l'acide labdanolique, connus pour être bioactifs." } }, { "id": "1093", "translation": { "en": "We finally addressed a problem related to motifs, that is to patterns, that may be composed of one or more parts, that appear conserved in a set of sequences and may correspond to functional elements. Over time, life has evolved to produce remarkably complex organisms.", "fr": "Nous avons finalement abordé un problème lié à la recherche de motifs conservés dans un ensemble de séquences et pouvant ainsi correspondre à des éléments fonctionnels Au fil du temps, la vie a évolué pour produire des organismes remarquablement complexes." } }, { "id": "1094", "translation": { "en": "We first developed a method to precisely localise these regions on a genome by comparison with the genome of another species.", "fr": "Dans un premier temps, nous avons développé une méthode permettant d'identifier précisément ces régions sur un génome par comparaison avec un génome d'espèce différente." } }, { "id": "1095", "translation": { "en": "The second level is the organism metabolism which contains hundreds of metabolic pathways.", "fr": "Un second niveau du métabolisme rassemble l'ensemble des centaines de voies métaboliques contenu dans le métabolisme d'un organisme." } }, { "id": "1096", "translation": { "en": "These methods require: a protein model, a function of energy and varions algorithms.", "fr": "Ces méthodes requièrent la mise au point: d'un modèle protéique, d'une fonction d'énergies et de divers algorithmes." } }, { "id": "1097", "translation": { "en": "The first one was to detect if any resistance system exists in flax.", "fr": "La première vise à détecter si un système de résistance existe chez le lin." } }, { "id": "1098", "translation": { "en": "The kinase Aurora A is an essential mitotic cell cycle protein.", "fr": "La kinase Aurora A est une protéine essentielle au cycle cellulaire et plus particulièrement lors de la mitose." } }, { "id": "1099", "translation": { "en": "The transcriptional factor DcmR regulates the expression of dcmA and its own gene, two genes which are divergently oriented.", "fr": "Son activité est modulée par DcmR, un facteur de transcription qui régule l'expression de dcmA ainsi que son propre gène, orienté de manière divergente par rapport à dcmA." } }, { "id": "1100", "translation": { "en": "We build a corpus of proteins as sentences composed of respective domains and learn fixed dimensional vector representation for proteins.", "fr": "Nous construisons un corpus de protéines sous forme de phrases composées de leurs domaines respectifs et nous apprenons une représentation vectorielle à dimension fixe." } }, { "id": "1101", "translation": { "en": "In first part of this thesis I have analysed small RNA-seq transcriptome data.", "fr": "Dans la première partie j'ai analysé des jeux de données de RNA-seq de transcriptome de petits ARNs disponibles dans les bases de données publiques." } }, { "id": "1102", "translation": { "en": "The Aevol model is an in silico experimental evolution model that was specifically developped by Carole Knibbe to study the evolution of the structure of the genome.", "fr": "Le modèle Aevol est un modèle d'évolution expérimentale in silico développé par Carole Knibbe et Guillaume Beslon pour étudier l'évolution de la structure des génomes." } }, { "id": "1103", "translation": { "en": "Diverse proteomics strategies thus allow identification and quantification of hundreds/thousands of proteins in complex samples, which classically allows physiopathological states to be characterized.", "fr": "Diverses stratégies protéomiques permettent ainsi, aujourd'hui, d'identifier et quantifier plusieurs centaines/milliers de protéines dans un échantillon complexe, ce qui permet classiquement de caractériser les états physiopathologiques." } }, { "id": "1104", "translation": { "en": "First, I tackled the reinterpretation challenge of previous sequencing analysis that remained unsolved.", "fr": "Premièrement, je me suis attaqué au problème de la réinterprétation des données de séquençage de patients restés sans diagnostic." } }, { "id": "1105", "translation": { "en": "The stability of DNA hypomethylation has been studied in relation to high-throughput sequencing of small RNAs data from WT, ddm1 and 4 epiRIL lines. It provides a temporal view of the TE control by siRNA.", "fr": "La stabilité de l'hypométhylation de l'ADN a été étudiée, au regard de données de séquençage à haut débit de banques de petits ARN de lignées WT, ddm1 ainsi que pour 4 lignées epiRIL, afin d'apporter une notion temporelle à l'étude du contrôle des ET par les siARN." } }, { "id": "1106", "translation": { "en": "After validation of the models, these predictions may be used in real-time to guide the personalized treatment of patients in clinical settings, as an alternative to phenotypic characterization of antibiotic resistance.", "fr": "Après la validation des modèles, ces prédictions pourraient être utilisées en temps réel pour le traitement personnalisé des patients, comme alternative à la caractérisation phénotypique." } }, { "id": "1107", "translation": { "en": "My work during this thesis is was to better understand the success and the maintaining of these peculiar repeated sequences, with the study of horizontal transfers (HTs) of TEs enabling them to escape host regulation mechanisms, and the study of this regulation.", "fr": "J'ai cherché au cours de cette thèse à mieux comprendre le succès et le maintien de ces séquences répétées, avec d'une part l'étude des transferts horizontaux (TH) d'ET, un moyen d'échapper aux mécanismes de régulation , et d'autre part l'étude de leur régulation." } }, { "id": "1108", "translation": { "en": "2 / On the other hand, the lack of dedicated methods to detect convergence at the genomic scale.", "fr": "2/ D'autre part, le manque de méthodes dédiées à la détection de la convergence à l'échelle génomique." } }, { "id": "1109", "translation": { "en": "I will also evaluated the prediction performance of the reviewed tools based on an independent validation data set, containing experimentally verified ligands across HLA-I allotypes.", "fr": "J'évaluerai également les performances de prédiction des outils examinés sur la base d'un ensemble de données de validation indépendant, contenant des ligands vérifiés expérimentalement à travers les allotypes HLA-I." } }, { "id": "1110", "translation": { "en": "A mid-throughput PCR-LDR-FMA approach based on LUMINEXtechnology was used to screen for SNPs in 537 blood samples (2010 - 2011) from 16health centres in Cambodia.", "fr": "Une approche moléculaire de PCR-LDR-FMA multiplexée et basée sur la technologie LUMINEX a été mise au point pour identifier les SNP dans 537 échantillons de sang (2010 - 2011) provenant de 16centres de santé au Cambodge." } }, { "id": "1111", "translation": { "en": "A second structure, namely the major repetition, is defined, retrieved and evaluated regarding expert annotations, and as an alternative indexing method for cover song identification.", "fr": "Une deuxième structure, la répétition majeure, est définie, analysée et évaluée par rapport à un ensemble d'annotations d'experts, puis en tant qu'alternative d'indexation pour l'identification de reprises." } }, { "id": "1112", "translation": { "en": "The interpretation of biological data becomes meaningful in light of evolution.", "fr": "L'interprétation des données biologiques prend tout son sens à la lumière de l'évolution." } }, { "id": "1113", "translation": { "en": "We have chosen to develop a dedicated method O'Browser, that use specificity of biological ontologies by using (i) a matcher based on homology relationships between proteins annotated with the ontologies the alignement of two functional hierachies.", "fr": "Nous avons choisi de développer une méthode de mapping, O'Browser, prenant en compte les spécificités des ontologies biologiques, en introduisant un matcher utilisant les relations d'homologie entre les protéines annotées par ces ontologies et la notion de pondération adaptative des ces matchers. Cette méthode a été utilisée pour l'alignement de deux hiérarchies fonctionnelles." } }, { "id": "1114", "translation": { "en": "Methods My work will focus on the implementation or development of bioinformatic software, which will aim to: - the implementation of a cryptic splicing variations detection tool; - the spatial clustering of gene variations identified in our cohort of patients with rare developmental diseases, to identify new regions subject to functional constraints (mutational hot spots for instance) involved in these diseases; - the implementation of new algorithms for detecting triplets repeats number variations, implicated for example in fragile X syndrome; - the design of graphical user interfaces facilitating data interpretation or the development of integrated bioinformatics tools for the combined exploitation of omics data.", "fr": "Méthodes Le travail de thèse portera sur la mise en place ou le développement de solutions bioinformatiques, qui auront pour objet : - l'implémentation d'un outil de recherche de variations d'épissage potentiellement cryptiques ; - le clustering spatial de variations géniques identifiées dans notre cohorte de patients atteints de maladies rares du développement, de façon à identifier de nouvelles régions soumises à des contraintes fonctionnelles (hot spots mutationnels par exemple) impliqués dans ces maladies ; - l'implémentation de nouveaux algorithmes de détection de variations de nombre de répétitions de triplets, impliquées par exemple dans le syndrome de l'X fragile ; - la conception d'interfaces graphiques facilitant le travail d'interprétation des données et la mise au point d'outils bioinformatiques intégrés permettant l'exploitation conjointe de données \" omics \"." } }, { "id": "1115", "translation": { "en": "However, current methods dedicated to identifying members of this large family within bacterial proteomes are either not suitable for large-scale approach or are of relatively limited performance when no 3D structural template is available.", "fr": "Cependant, les méthodes actuelles dédiées à l'identification des membres de cette grande famille dans les protéomes bactériens sont soit inadaptées pour des approches à grande échelle, soit présentent des performances relativement limitées en l'absence d'une structure tridimensionnelle résolue." } }, { "id": "1116", "translation": { "en": "These effects can be negative, leading to withdrawal from the market, or positive, leading to reuse of this drug for another pathology.", "fr": "Ces effets peuvent être de nature négative, menant à un retrait du marché, ou positive, menant à une réutilisation de ce médicament pour une autre pathologie." } }, { "id": "1117", "translation": { "en": "This thesis tackles methodologies to identify the genetic causes of complex diseases.", "fr": "Cette thèse s'intéresse à un ensemble de méthodes utilisées pour identifier les causes génétiques de maladies complexes." } }, { "id": "1118", "translation": { "en": "To do so, we prove that the corresponding problem is difficult.", "fr": "Pour ce faire, nous démontrons que le problème en question est algorithmiquement difficile." } }, { "id": "1119", "translation": { "en": "In the first part of the thesis I introduce hidden Markov models (HMM)-based algorithms that allow for the modelling of those PH precursor sequences.", "fr": "Dans la première partie de la thèse, l'on introduit des algorithmes, basés sur les chaînes de Markov cachées (HMM), qui vont nous permettent de modéliser les séquences protéiques des précurseurs à hormones peptidiques." } }, { "id": "1120", "translation": { "en": "The tool C-RCPred is a new version of RCPred, taking into account user constraints and structural data (SHAPE, PARS, DMS).", "fr": "L'outil C-RCPred est une nouvelle version de RCPred, prenant en compte des contraintes utilisateurs et des données biologiques structurales (SHAPE, PARS et DMS)." } }, { "id": "1121", "translation": { "en": "Besides, the structure of Rv2543 from Mtb shows the coherence of its annotation as a lipoprotein, and gives clues suggesting a possible redox function linked to host-pathogen interactions.", "fr": "D'autre part, la structure de Rv2543 de Mtb montre la cohérence de son annotation comme lipoprotéine, et fournit des pistes suggérant une possible fonction de type redox liée à l'interaction hôte—pathogène." } }, { "id": "1122", "translation": { "en": "More generally, the extent of combinatorial processes, by unravelling other evolutionary bonds than homology bonds in the strictest sense, legitimates a pluralistic study of similarity relationships between sequences.", "fr": "Plus généralement, l'étendue des processus combinatoires, en révélant des liens évolutionnaires autres que les liens d'homologie au sens fort, justifie une étude pluraliste des relations de similarité entre séquences." } }, { "id": "1123", "translation": { "en": "This article analyses this concept and the associated promises.", "fr": "Cet article propose une analyse de ce concept, ainsi que des promesses qui lui sont associées." } }, { "id": "1124", "translation": { "en": "Furthermore, the identifi cation of PAVs and SVs from several accessions is the key to understanding the diversity and theintra-species genomic variation currently known as species pan-genome.", "fr": "De plus, l'identifi cation des PAV et des SV de plusieursaccessions est la clé pour comprendre la diversité et la variation génomique intra-espèce, actuellement connue sous le nomde pangénome d'espèce." } }, { "id": "1125", "translation": { "en": "We can eventually propose these new receptors as putative targets for the ligands we started with.", "fr": "On peut proposer ces nouveaux récepteurs comme cibles potentielles pour les ligands de départ." } }, { "id": "1126", "translation": { "en": "Currently, the thermophilic version (tHDA) uses Thermoanaerobacter tengcongensis UvrD helicase (TteUvrD) and Bacillus stearothermophilus DNA polymerase I Large Fragment (Bstpol) for the amplification of a DNA fragment of less than 200 bp in 90 min at 65oC.", "fr": "La version thermophile utilisée actuellement (tHDA) nécessite l'hélicase UvrD de Thermoanaerobacter tengcongensis (TteUvrD) et le grand fragment de la polymérase I de Bacillus stearothermophilus (Bstpol) pour l'amplification d'un fragment d ADN de moins de 200 pb en 90 min à 65oC." } }, { "id": "1127", "translation": { "en": "Finally, the 'Geloc' website (https://rice-genome-hub.southgreen.fr/content/geloc) has been developed to allow visualization, exploration and comparison of these LRR annotations in rice.", "fr": "Enfin, le site web ‘Geloc' (https://rice-genome-hub.southgreen.fr/content/geloc) a été développé pour permettre la visualisation, l'exploration et la comparaison des annotations des récepteurs LRR chez le riz." } }, { "id": "1128", "translation": { "en": "These observations can have a major impact on patients' prognosis and follow-up.", "fr": "Cette découverte peut avoir un impact capital sur le pronostic et le suivi des patients." } }, { "id": "1129", "translation": { "en": "Indeed, by simulations of the expansion of a liquid droplet, we have showed that self-bound clusters are the precursors of the observed fragments at the end of the fragmentation process.", "fr": "En effet, par la simulation de l'expansion d'une gouttelette de fluide, nous avons montré que les amas stables étaient les précurseurs des fragments observés lors d'un processus de fragmentation." } }, { "id": "1130", "translation": { "en": "To this day, near 70% of patients suffering from Mendelian diseases remain without any diagnosis after their DNA sequencing.", "fr": "À ce jour, près de 70% des patients atteints de maladies mendéliennes demeurent sans diagnostic après séquençage de leur ADN." } }, { "id": "1131", "translation": { "en": "Microbial networks, provided improved reconstruction methods, could therefore be used to capture signals of biotic interactions in the pathobiome.", "fr": "Les réseaux microbiens, sous réserve d'amélioration des méthodes de reconstruction, pourraient donc être utilisés pour capturer les signaux des interactions biotiques dans le pathobiome." } }, { "id": "1132", "translation": { "en": "We will first analyze novel spatial transcriptomics data recently generated by our collaborator with 10X Visium technology from human glioma samples with a special focus on (i) the core of the tumor with dense tumor cells content, and (ii) areas of perineuronal satellitosis where clusters of glioma cells surround neurons cell bodies, to reveal the gliomas' subtype spatial organization.", "fr": "Nous analyserons d'abord de nouvelles données de transcriptomique spatiale récemment générées par nos collaborateurs avec la technologie 10X Visium à partir d'échantillons de gliomes humains avec un accent particulier sur (i) le noyau de la tumeur avec un contenu dense en cellules tumorales, et (ii) les zones de satellitose périneurale où des clusters de cellules tumorales entourent les corps cellulaires des neurones, pour révéler l'organisation spatiale des différents sous-type des gliomes." } }, { "id": "1133", "translation": { "en": "In contrast, chronic infections are characterized by a sessile lifestyle into a biofilm, the production of the type VI secretion system Hsi1 involve in bacterial dueling and a high concentration of RsmY and RsmZ.", "fr": "Au contraire, l'infection chronique est caractérisée par un mode de vie sessile au sein d'un biofilm, la producion du système de sécrétion de type VI Hsi1 impliqué dans la compétition bactérienne et une forte expression de RsmY et RsmZ." } }, { "id": "1134", "translation": { "en": "This result confirms the presence of a phylogenetic signal in the spatial structure of the genomes.", "fr": "Ces résultats confirment la présence d'un signal phylogénétique dans la structure spatiale des génomes." } }, { "id": "1135", "translation": { "en": "We show that, compared to classical collinear chaining, chaining with overlaps improves on real bacterial data, while remaining almost as efficient in practice.", "fr": "Nous avons montré que cet algorithme, comparé au chainage colinéaire classique, améliore les résultats sur des génomes bactériens, tout en restant aussi efficace en pratique." } }, { "id": "1136", "translation": { "en": "Life Sciences are built on observations.", "fr": "Les sciences de la vie se sont construites sur l'observation." } }, { "id": "1137", "translation": { "en": "One approach, the structure-sequence alignment of RNA, addresses these two issues.", "fr": "L'une des approches: l'alignement structure-séquence d'ARN, répond à ces deux problématiques." } }, { "id": "1138", "translation": { "en": "Background: Interaction between immuno-genetic background and environmental risk factors promotes low-grade inflammation associated with Schizophrenia (SCZ), Bipolar Disorder (BD) or autism spectrum disorders (ASD).", "fr": "L'interaction des facteurs immunogénétiques et environnementaux conduit à de l'inflammation et des perturbations immunitaires qui ont été associées aux maladies psychiatriques comme la schizophrénie (SCZ), les troubles bipolaires (TB) ou les troubles du spectre autistique (TSA)." } }, { "id": "1139", "translation": { "en": "However, since both the ligand and the protein are flexible, a 'hand-in-glove' analogy is more appropriate than 'lock-and-key'.", "fr": "Néanmoins, si le liant et la protéine sont tous les deux flexibles, il est plus adapté de comparer cette situation à celle où une 'main' rentre dans un 'gant'." } }, { "id": "1140", "translation": { "en": "We describe an efficient algorithm that solves the EPA problem repetitively to determine near-optimal Lagrangian multipliers via subgradient optimization.", "fr": "Nous introduisons un algorithme efficace permettant de résoudre ce problème de manière répétitive, afin de trouver une bonne approximation des multiplicateurs de Lagrange via optimization du sous-gradient." } }, { "id": "1141", "translation": { "en": "These results also highlight the value of applying omics approaches at the organ level of sentinel species to identify and assess possible differences in contaminant MoA depending on the target organ.", "fr": "Ces résultats soulignent également l'intérêt de l'application d'approches omiques au niveau des organes des espèces sentinelles pour identifier et évaluer les possibles différences de MoA de contaminants en fonction de l'organe cible." } }, { "id": "1142", "translation": { "en": "AtMAP65-4 is a microtubule-associated protein belonging to the AtMAP65s family that comprises 9 members identified in Arabidopsis thaliana.", "fr": "AtMAP65-4 est une protéine associée aux microtubules appartenant à la famille des AtMAP65s qui compte 9 membres identifiés chez Arabidopsis thaliana." } }, { "id": "1143", "translation": { "en": "The constant presence of these products preserve the cell in spite of it having become cancerous, causing the cell to eventually become malignant.", "fr": "La présence constante de ces produits préserve la cellule malgré le fait qu'elle soit devenue cancéreuse, ce qui la rend finalement maligne." } }, { "id": "1144", "translation": { "en": "Osteoarthritis is the most common joint disease.", "fr": "L'arthrose est la plus commune des maladies articulaires." } }, { "id": "1145", "translation": { "en": "Algorithmics of motion is a fundamental part of robotics.", "fr": "Algorithmics de mouvement est une partie fondamentale de la robotique." } }, { "id": "1146", "translation": { "en": "Further identification of the signaling pathways and a better understanding of their role will certainly open new avenues in the treatment of cardiomyopathies.", "fr": "Poursuivre l'identification des voies de signalisation et mieux comprendre leur rôle ouvrira certainement de nouvelles perspectives dans le traitement des cardiomyopathies." } }, { "id": "1147", "translation": { "en": "Thanks to next-generation sequencing, the number of sequenced genomes grows rapidly, providing in particular ample examples for the sequence variability between homologous proteins.", "fr": "Grâce au séquençage de nouvelle génération, le nombre de génomes séquencés augmente rapidement, fournissant notamment de nombreux exemples de la variabilité des séquences de protéines homologues." } }, { "id": "1148", "translation": { "en": "We give a formulation for this novel problem and provide the first algorithm for it.", "fr": "Nous avons donné une formulation de ce nouveau problème et réalisé un premier algorithme." } }, { "id": "1149", "translation": { "en": "Glioblastoma is the most commun and agressive cerebral tumor.", "fr": "Le glioblastome est la tumeur cérébrale de mauvais pronostic la plus fréquente et la plus agressive." } }, { "id": "1150", "translation": { "en": "The mechanisms of action, bioavailability, synergy and methods to determine the level of anti-oxidants are very sensitive topics, and it is crucial to study them if we want to obtain reliable clinical studies.", "fr": "Les mécanismes d'action, la biodisponibilité, la synergie et les méthodes de dosage des anti-oxydants sont des thèmes très sensibles, et il est primordial de les étudier en profondeur si l'on veut aboutir à des études cliniques fiables." } }, { "id": "1151", "translation": { "en": "Network analyses and statistical computations led to the identification of deregulated MAPK network regions, and to the delineation of optimal intervention points aimed at blocking the proliferative signals transduced from such regions. This approach was used to study five different tumour stages and four different subtypes of T-cell lymphoma. Altogether, these results led to the formulation of novel hypotheses concerning the functioning of MAPK network in different pathological conditions, and to the selection of target components that might be considered for the development of novel treatments. The β-lactam antibiotics are one of the oldest and widely used antimicrobial drugs.", "fr": "Des analyses du réseaux et des calculs statistiques ont conduit à l'identification de régions dérégulées dans le réseau des MAPKs, et à la délinéation de points d'intervention optimales dans cinq stades du cancer de la vessie et dans quatre sous-types de lymphome TL'ensemble de ces résultats a conduit à la formulation de nouvelles hypothèses concernant le fonctionnement du réseau des MAPKs dans différents états pathologiques, et à la sélection de composants cibles qui pourraient être envisagées pour le développement de nouveaux traitements Les antibiotiques β-lactamines sont parmi les médicaments antimicrobiens les plus anciens et les plus utilisés." } }, { "id": "1152", "translation": { "en": "Single-cell RNA sequencing revealed a dysregulation of transcriptional programs, which correlates with the gradual decline in cortical neurogenesis observed in vivo.", "fr": "Le séquençage d'ARN sur cellule unique a révélé une dérégulation transcriptionnelle qui corrèle avec le déclin progressif observé in vivo de la neurogénèse corticale." } }, { "id": "1153", "translation": { "en": "To do this, new principles of generalization and new classes have been introduced based on substitutability.", "fr": "Pour ce faire, de nouveaux principes de généralisation et de nouvelles classes de langages ont été introduites sur la base de la substituabilité locale." } }, { "id": "1154", "translation": { "en": "In particular, TADs would help to separate the inactive/heterochromatin and active/euchromatin compartments.", "fr": "Les TADs contribueraient notamment à séparer les compartiments inactifs/hétérochromatine et actifs/euchromatine." } }, { "id": "1155", "translation": { "en": "The failure rate was 24.37%, the average duration before discharge was 34.7 months.", "fr": "Le taux d'échec était de 24,37 %, la durée moyenne avant échappement était de 34,7 mois." } }, { "id": "1156", "translation": { "en": "The applications that publish and exchange potentially sensitive RDF data are increasing in many areas: bioinformatics, e-government, open data movement.", "fr": "Les applications qui publient et échangent des données RDF potentiellement sensibles augmentent dans de nombreux domaines : bio-informatique, e-gouvernement, mouvements open-data." } }, { "id": "1157", "translation": { "en": "This observation suggests that Tankyrase inhibits the inhibitory protein Arpin in the cell.", "fr": "Ces résultats suggèrent Tankyrase inhibe la protéine inhibitrice Arpin." } }, { "id": "1158", "translation": { "en": "The thesis proposes several solutions tailored for manycore processors such as today's GPUs. Such processors are making massively parallel computing more and more popular.", "fr": "La thèse explore différentes solutions adaptées aux processeurs massivement multicoeurs: aujourd'hui, les GPUs sont en train de démocratiser le calcul parallèle et préparent les processeurs de demain." } }, { "id": "1159", "translation": { "en": "This PhD work is focused on the development of analytical and bioinformatics strategies in quantitative proteomics for the identification and quantification of trace-level proteins.", "fr": "Ce travail de thèse est articulé sur le développement de stratégies analytiques et bioinformatiques en protéomique quantitative pour l'identification et la quantification d'impuretés protéiques à l'état de traces." } }, { "id": "1160", "translation": { "en": "The second (Chapter 4, paper [11]), shows that annotating alternative splicing events with a single approach leads to missing out a large number of candidates, many of which are significant.", "fr": "Le second (Chapitre 4, article [11]) montre que l'annotation d'événements d'épissage alternatifs avec une seule approche conduit à rater un grand nombre de candidats, dont beaucoup sont importants." } }, { "id": "1161", "translation": { "en": "It is therefore surprising that mechanisms of genome duplication and cell cycle regulation manifest a high level of diversity across the tree of life.", "fr": "Il est donc surprenant que les mécanismes de duplication du génome et de régulation du cycle cellulaire manifestent un niveau élevé de diversité dans l'arbre de vie." } }, { "id": "1162", "translation": { "en": "Regulating these bacterial systems is essential for developing antivirulence therapeutics to respond against antibiotic-resistant pathogens.", "fr": "La modulation de ces systèmes bactériens est essentielle pour le développement de thérapies antivirulences ciblant les pathogènes antibiorésistants." } }, { "id": "1163", "translation": { "en": "Alzheimer's disease (AD) is a widespread pathogenic condition causing memory and behavior impairment mostly in elderlies because of the accumulation of amyloid beta peptide and tau protein in human brain.", "fr": "La maladie d'Alzheimer est une pathologie neurodégénérative qui amène à une perte progressive de la mémoire et cause des changements comportementaux. Selon plusieurs théories, le développement de cette maladie est associé à l'accumulation du peptide amyloïde beta et de la protéine tau dans des zones précises du cerveau humain." } }, { "id": "1164", "translation": { "en": "Therefrom, we developed a pipeline for the DGE annotation.", "fr": "À partir de cette analyse, nous avons développé un pipeline d'annotation pour la DGE." } }, { "id": "1165", "translation": { "en": "The work in this thesis started by a participation in the experimental and bioinformatic analysis of dual miRNA-seq and mRNA-seq data obtained by profiling the host-pathogen interaction of Sus scrofa with the bacterium Mycoplasma hyopneumoniae.", "fr": "Les travaux de cette thèse ont débuté par une participation à l'analyse expérimentale et bioinformatique de données dual miARN-seq et mARN-seq obtenues en profilant l'interaction hôte-pathogène de Sus scrofa avec la bactérie Mycoplasma hyopneumoniae." } }, { "id": "1166", "translation": { "en": "It is based on the study of some residues of the transmembrane cavity supposed to be critical and to interact with the ligand.", "fr": "Elle est basée sur l'étude de résidus supposés critiques de la cavité trans- membranaire, qu'on pense interagir avec des ligands." } }, { "id": "1167", "translation": { "en": "This work therefore indicates that cell cycle dynamics modulates the replication program through determining the profile of replication complex assembly along the chromosomes.", "fr": "Ce travail indique donc que la dynamique du cycle cellulaire module le programme de réplication en déterminant la distribution du complexe de réplication le long des chromosomes." } }, { "id": "1168", "translation": { "en": "One of the fundamental challenges of modern biology is to better understand the mechanisms regulating gene expression, on which the functioning and differentiation of cells depend.", "fr": "Un des défis fondamentaux de la biologie moderne est une meilleure compréhension des mécanismes de régulation de l'expression des gènes, dont dépendent notamment le fonctionnement et la différentiation des cellules." } }, { "id": "1169", "translation": { "en": "In this thesis, we explore the use of such models to expand the knowledge of reactions with a specific type of high-level data: gene essentiality data, assessed using growth phenotypes of deletion mutants.", "fr": "Dans cette thèse, nous explorerons l'utilisation de ces modèles pour compléter la connaissance des réactions à l'aide d'une catégorie particulière de données d'échelle globale : les essentialités de gènes déterminées à partir des phénotypes de croissance de mutants de délétion." } }, { "id": "1170", "translation": { "en": "These techniques provide accurate gene expression, but a little information about the isoforms expressed in each cell.", "fr": "Ces techniques permettent d'obtenir une expression génique précise, mais peu d'informations sur les isoformes exprimées dans chaque cellule." } }, { "id": "1171", "translation": { "en": "When in clouds, microbes can be redeposited on the local surface with precipitation, ending their atmospheric cycle and potentially impacting surface ecosystems.", "fr": "Lorsqu'ils sont dans les nuages, les microbes peuvent être redéposés à la surface avec les précipitations, ayant un impact potentiel sur les écosystèmes locaux." } }, { "id": "1172", "translation": { "en": "Copia and gypsy elements appear to contribute more significantly to genome size differences in Mediterranean lupines than in African lupines, suggesting different mechanisms involved in the genus.", "fr": "Les analyses de rétrotransposons révèlent que les éléments copia et gypsy contribuent de façon plus significative aux différences de taille de génome chez les lupins méditerranéens que chez les lupins africains et suggèrent différents modes et mécanismes d'évolution de la taille des génomes au sein du genre." } }, { "id": "1173", "translation": { "en": "My thesis work focused on the bioinformatical analysis of genomic data from the GRIV AIDS cohort and from the IHAC (International HIV Acquisition Consortium) project.I first laid the foundation for imputation work by developing the SUBHAP software.", "fr": "Ma thèse a porté sur l'exploitation bioinformatique des données génomiques issues de la cohorte GRIV du SIDA et du projet international IHAC (International HIV Acquisition Consortium). Posant les prémices de l'imputation, j'ai d'abord développé le logiciel SUBHAP." } }, { "id": "1174", "translation": { "en": "Associated with separation techniques, it can also be used to measure the variation of protein abundance between different samples.", "fr": "Associée à des techniques de séparation, elle est aussi utilisée pour mesurer la variation d'abondance des protéines entre plusieurs échantillons." } }, { "id": "1175", "translation": { "en": "The role of CTDH was unknown.", "fr": "Le rôle de CTDH était inconnu." } }, { "id": "1176", "translation": { "en": "The mechanisms that drive calcium signaling in astrocytes are, at both subcellular and intercellular levels, still not completely understood.", "fr": "En effet, autant au niveau subcellulaire qu'inter-cellulaire, les mécanismes gouvernant l'activité calcique des astrocytes restent mals connus." } }, { "id": "1177", "translation": { "en": "While it is not possible to designate at the time being which among these approaches will be robust and cost-efficient enough to help routinely the clinical embryologist in assisted reproductive techniques (ART), one can predict that our ability to select the “right” embryo will combine morphological criteria already available with validated biomarkers.", "fr": "Sans pouvoir dire aujourd'hui laquelle ou lesquelles de ces approches se révélera suffisamment robuste et rentable pour devenir un outil d'aide à la décision en routine, il est vraisemblable que la capacité de sélectionner un embryon à fort potentiel de viabilité intégrera le cumul des critères morphologiques déjà utilisés et de biomarqueurs validés." } }, { "id": "1178", "translation": { "en": "For modularity and reusability reasons, we decided to design libraries of enzymatic logic gates that implement basic boolean operators, and then to assemble these building blocks to get the complete logic enzymatic network.", "fr": "Pour des raisons de modularité et de réutilisabilité, nous avons décidé de concevoir des bibliothèques de portes logiques enzymatiques implémentant les opérateurs booléens de base, puis d'assembler ces briques de base pour obtenir le réseau enzymatique complet." } }, { "id": "1179", "translation": { "en": "This reference system allows the integration of purely genetic mutations at one of its ends, thus paving the way to a new, gradual vision that encompasses the genome and the epigenome.", "fr": "Ce référentiel permet d'intégrer les mutations purement génétiques à l'une de ses extrémités, autorisant ainsi une nouvelle vision graduelle allant du génome à l'épigénome au lieu de les opposer." } }, { "id": "1180", "translation": { "en": "Our results are consistent with population studies by Barker and colleagues, who suggest that maternal nutrition during early stages of life is correlated with the risk of cardiovascular disease in adult, independent of other risk factors The process of developing a drug is long and costly as it lasts for several decades.", "fr": "Nos résultats sont en accord avec les études de population de Barker et al, qui suggèrent que la nutrition maternelle pendant les étapes précoces de la vie est corrélée avec le risque de maladies cardio-vasculaires dans la vie adulte indépendamment des autres facteurs de risque Le processus de développement d'un médicament est long et coûteux puisqu'il dure plusieurs dizaine d'années." } }, { "id": "1181", "translation": { "en": "The results show that YOC improves on divergent cases by detecting more distant similarities and by avoiding misaligned regions.", "fr": "Les résultats montrent que YOC améliore les cas divergents en détectant des similarités plus distantes et en évitant les régions mal alignées." } }, { "id": "1182", "translation": { "en": "The multiple alignment is one common mathematical abstraction of the comparison of multiple biological sequences, like DNA, RNA, or protein sequences.", "fr": "Le problème de l'alignement de séquences est une abstraction mathématique courante du problème de comparaison de séquences biologiques, comme l'ADN, l'ARN ou les séquences de protéines." } }, { "id": "1183", "translation": { "en": "The aim of this thesis is to study TEs and their positions in insecticide resistance genes.", "fr": "L'objectif de cette thèse est d'étudier les ETs et leurs positions dans les gènes de résistance aux insecticides." } }, { "id": "1184", "translation": { "en": "First, the dynamic of accumulation CDC48 together with intracellular events inherent to the immune response were analyzed in both wild-type and CDC48 overexpressing tobacco cells (CDC48-TAP line).", "fr": "Premièrement, la dynamique d'accumulation de la protéine CDC48 ainsi que les événements intracellulaires sous-jacents à la réponse immunitaire ont été étudiés à la fois dans des cellules de tabac sauvages et des cellules sur-exprimant la protéine CDC48 (lignée CDC48-TAP)." } }, { "id": "1185", "translation": { "en": "This doctoral thesis consisted in the analysis of the miRNA mediated coregulation through a network approach based on target sharing.", "fr": "La thèse a consisté en l'analyse de la corégulation médiée par les miARN grâce à l'inférence de réseau basée sur le partage de gènes cibles." } }, { "id": "1186", "translation": { "en": "Alignment-free methods for phylogenetic placement are a novel group of methods designed to eliminate the need to align query sequences within reference sequences --- a current limit to the applicability of phylogenetic placement methods in the next-generation sequencing (NGS) era.", "fr": "Les méthodes algorithmiques dites og sans alignementfg proposent une nouvelle approche capable d'éviter d'aligner la séquence requête avec les séquences de référence, une étape qui limite fortement le passage à l'échelle du placement phylogénétique à l'ère des technologies de séquençage à haut-débit (SHD)." } }, { "id": "1187", "translation": { "en": "We found a specific gene clusters, for those the effect of ABA and inhibitors was similar; SA-dependent genes, regulated via the balance of phosphoinositides, and SA-dependent genes, regulated via PLD-mediated pathway.", "fr": "Nous avons trouvé des groupes de gènes, pour qui l'effet d'ABA et des inhibiteurs était semblable; des gènes dependants du SA via l'équilibre des phosphoinositides et des gènes dependants du SA via l'activité de PLD." } }, { "id": "1188", "translation": { "en": "We suggest that some genetic controls of these regions are related to the axillary meristem initiation and that some genetic controls of the epicormic branching are probably involved also in the control of the tree growth.", "fr": "Nous faisons également l'hypothèse qu'une partie des contrôles génétiques que ces régions assurent sont liés à l'initiation du méristème axillaire et par ailleurs que certains contrôles génétiques de la ramification épicormique pourraient être impliqués dans le contrôle de la croissance." } }, { "id": "1189", "translation": { "en": "To do so, we first annotated the ETs in B. tabaci genome by combining different bioinformatics approaches.", "fr": "Pour ce faire, nous avons tout d'abord annoté le génome de B.tabaci en ETs en combinant différentes approches bio-informatique." } }, { "id": "1190", "translation": { "en": "Support for this hypothesis often comes from computational simulations.", "fr": "Le soutien de cette hypothèse provient souvent de simulations informatiques." } }, { "id": "1191", "translation": { "en": "The principal aim of this doctoral thesis was to understand the genetic basis for the diversification of the extra-ocular pigmentation in Gerromorpha embryos.", "fr": "Le but de ce doctorat était de comprendre les bases génétiques de la diversification de la pigmentation extra-oculaire chez les embryons des Gerromorphes." } }, { "id": "1192", "translation": { "en": "The hypergraph formalism has been introduced in the 1970s for modeling complex problems where relationshipsare no longer binary, which is when they involve more than two individuals.", "fr": "Au cours des années 1970, la notion d'hypergraphe a ́et ́e introduite afin de modéliser des relations plus complexes,impliquant potentiellement plus de deux individus." } }, { "id": "1193", "translation": { "en": "The object is to compute equilibria corresponding to cellular phenotypes.", "fr": "L'objet est de calculer les équilibres correspondant à des phénotypes cellulaires." } }, { "id": "1194", "translation": { "en": "In conclusion, YOC should be easier to apply automatically and systematically to in- coming genomes, for it does not require a post-filtering step to detect misalignment and is less complex to calibrate.", "fr": "En conclusion, YOC semble être plus facile à appliquer de manière automatique et systématique, parce qu'il nécessite pas un post-traitement des régions mal alignées, ni un paramétrage complexe." } }, { "id": "1195", "translation": { "en": "This work contributes to the characterization of the molecular landscape of myeloproliferative neoplasms.", "fr": "Ce travail de thèse contribue à la caractérisation du profil moléculaire des syndromes myéloprolifératifs." } }, { "id": "1196", "translation": { "en": "Their diagnosis is now made thanks to new generation sequencing which generates a lot of data difficult to analyze without the help of bioinformatics.", "fr": "Leur diagnostic est maintenant réalisé grâce au séquençage de nouvelle génération qui génère de nombreuses de données difficiles à analyser sans l'aide de la bioinformatique." } }, { "id": "1197", "translation": { "en": "In order to betterunderstand current crop diseases and prevent future epidemics, it is essential to appreciate the factorsunderlying the emergence, adaptation and spread of pathogens.", "fr": "Afinde mieux comprendre les maladies actuelles de cultures et prévenir les épidémies futures, il estindispensable de comprendre les facteurs sous-jacents à l'émergence, l'adaptation et la diffusion desagents pathogènes." } }, { "id": "1198", "translation": { "en": "The second method, DE-Kupl, is a new strategy to perform differential analysis, without a priori knowledge about the transcriptome. DE-kupl is designed to help the discovery of new biomarkers as well as the characterization of new mechanisms of the transcriptome.", "fr": "La seconde méthode, DE-kupl, propose une analyse différentielle - sans apriori - des données RNA-Seq pour l'identification de nouveaux biomarqueurs et la caractérisation de nouveaux mécanismes du transcriptome." } }, { "id": "1199", "translation": { "en": "The grammar that we present is a modelization of regulatory mechanisms for gene expression that considers two types of objects: DNA transcriptional units and the proteins synthesized, and other regulatory molecules and ligands.", "fr": "La grammaire que nous présentons est une modélisation des mécanismes de régulation de l'expression des gènes qui considère deux types d'objets : les unités transcriptionnelles sur l'ADN et les protéines synthétisées et autres molécules régulatrices et ligands." } }, { "id": "1200", "translation": { "en": "This data has the potential to help the discovery of gene targets for new antibiotics and tackle bacterial resistance.", "fr": "Ce système a le potentiel d'aider à la découverte de gènes cibles pour le développement de nouveaux antibiotiques, et de répondre à la résistance croissante des bactéries." } }, { "id": "1201", "translation": { "en": "We collected and compared intestinal microbiota and microbiomes from several Podarcis sicula lizards, which live in Croatian continental and insular populations.", "fr": "Nous avons collecté et comparé les microbiotes et les microbiomes intestinaux de plusieurs dizaines de lézards de l'espèce Podarcis sicula, vivant dans des populations continentales et insulaires croates." } }, { "id": "1202", "translation": { "en": "The database also includes several molecular markers such as MIRU-VNTRs (mycobacterial interspersed repetitive units- variable number of tandem repeats) and Spoligotype43 allowing a better description and identification of the families of genotypic profiles of Mycobacterium tuberculosis complex.", "fr": "Cette base intègre aussi plusieurs marqueurs moléculaires tels que les MIRU-VNTRs (\" mycobacterial interspersed repetitive units-variable number of tandem repeats \") et le Spoligotype43 servant à mieux décrire et identifier les familles de profils génotypiques du MTBC." } }, { "id": "1203", "translation": { "en": "The main objectives of this thesis were (i) to search for the selection pressure exerted on plant orthologous genes and (ii) to describe the structural and functional features they share in particular in their promoters, in order to (iii) define a novel phylogenetic footprinting approach.", "fr": "Les objectifs de la thèse étaient (i) de mettre en évidence les pressions de sélection qui s'exercent sur les gènes orthologues chez les végétaux et (ii) de cerner les caractéristiques structurales et fonctionnelles qu'ils partagent, notamment au niveau de leurs promoteurs, pour (iii) définir une nouvelle démarche d'empreinte phylogénétique." } }, { "id": "1204", "translation": { "en": "Following the example of regular expressions, the Automata theory offer tools to define a recognition principle for the different properties of this patterns.", "fr": "Comme pour les expressions régulières, la théorie des automates offre des formalismes de reconnaissance pour les différents types de propriétés caractérisant les motifs." } }, { "id": "1205", "translation": { "en": "Hence TP53INP family is involved in at least two major cellular functions, apoptosis and autophagy.", "fr": "Ainsi, la famille TP53INP est impliquée dans les fonctions cellulaires majeures que sont l'apoptose et l'autophagie." } }, { "id": "1206", "translation": { "en": "Currently, there is no efficient method to control the pathogen.", "fr": "Aujourd'hui, aucune méthode de lutte ne parvient à lutter efficacement contre la pathogène." } }, { "id": "1207", "translation": { "en": "The objective is to underline the importance of the choice of iteration mode for the dynamics of these networks especially for the observed limit cycles.", "fr": "L'objectif est de mettre en évidence l'importance du choix du mode d'itération pour la dynamique de ces réseaux, et en particulier pour les cycles limites atteints." } }, { "id": "1208", "translation": { "en": "These approaches consistin identifying a biologically significant structure in D, whose vertices induce in G a structure that is alsobiologically significant.", "fr": "Ces approches consistent à identifier unestructure biologiquement significative dans D, dont les sommets induisent dans G une structure qui soitaussi biologiquement significative." } }, { "id": "1209", "translation": { "en": "In the last part, we will model the proteins, peptides and glycoproteins degradation potential at a microbial community scale, by completing an existing model created by two INRA teams using a Non-negative Matrix factorisation approach. This approach is built on a priori information and knowledge about the metabolism and the structure of bacterial genomes.", "fr": "En dernière partie, nous modéliserons le potentiel de dégradation des protéines, peptides et des glycoprotéines à l'échelle de la communauté microbienne en complétant le modèle existant construit par les deux équipes INRA grâce à une approche de Non-negative Matrix Factorisation adaptée pour prendre en compte des informations a priori sur le métabolisme et la structure des génomes bactériens." } }, { "id": "1210", "translation": { "en": "Assets and liabilities of this shift are discussed, while the role of voucher specimens is reiterated and, for observations, the need for ancillary data is underlined.", "fr": "Les dangers et avantages liés à ce changement de pratique sont discutés, le rôle de spécimens vouchers est rappelé et la nécessité d'acquérir des données supplémentaires est soulignée." } }, { "id": "1211", "translation": { "en": "Durandal exploits the propagation of geometric constraints to accelerate the exact clustering algorithm for protein models.", "fr": "Durandal exploite la propagation de contraintes géométriques afin d'accélérer l'algorithme de partitionnement exact pour des modèles de protéines." } }, { "id": "1212", "translation": { "en": "), and represent vast morphological and genetic diversity. Not surprisingly given their numerical dominance, viruses significantly impact ecosystems through regulating microbial populations, driving major biogeochemical cycles, and shaping the evolution of hosts genomes. However, our understanding of viruses in nature is primitive, especially because the majority of environmental viral genomes remains uncharacterized.", "fr": "Au sein des écosystèmes, ils ont ainsi un impact sur la diversité des populations microbiennes, l'évolution des génomes de ces populations, et directement ou indirectement sur les cycles biogéochimiques majeurs. Leur caractère protéiforme et l'absence de marqueur unique (tant génétique que physique) font toutefois de l'exploration de la diversité virale une tâche complexe, de telle sorte que nos connaissances sur ces communautés virales environnementales sont encore très limitées." } }, { "id": "1213", "translation": { "en": "Genomic medicine is often presented as a new paradigm for personalized healthcare.", "fr": "La médecine génomique est souvent présentée comme un nouveau paradigme permettant une prise en charge personnalisée du patient." } }, { "id": "1214", "translation": { "en": "Where are the ecological niches?", "fr": "Où sont les niches écologiques ?" } }, { "id": "1215", "translation": { "en": "First, there is no consensus on the most reliable bioinformatics approach to determine the identity and abundance of microorganisms present in plant samples.", "fr": "Tout d'abord, il n'existe pas de consensus concernant l'approche bioinformatique la plus fiable pour déterminer l'identité et l'abondance des micro-organismes présents dans les échantillons végétaux." } }, { "id": "1216", "translation": { "en": "The last contribution of this thesis is related to the development of GEPeTTO, a prototype of the prioritization of genes.", "fr": "Enfin, l'ultime contribution de cette thèse est liée au développement de GEPeTTO, un prototype de priorisation de gènes. Une application biologique a été réalisée." } }, { "id": "1217", "translation": { "en": "Our results demonstrated that this induced local changes in origin efficiency near the endpoints of the rearranged region during both mitotic and pre-meiotic S phase.", "fr": "Nos résultats ont montré que ces réarrangements induisaient des changements de l'efficacité des origines localisées spécifiquement de part et d'autre des extrémités des régions réarrangées, et ce durant les phases S mitotique et méiotique." } }, { "id": "1218", "translation": { "en": "In planta subcellular localization of a set of MiSSPs belonging to a core-regulon showed that three of them are able to target different plant subcellular compartments.", "fr": "Un jeu de MiSSPs de L. bicolor ont été localisées in planta. Trois d'entre eux ciblent spécifiquement des compartiments subcellulaires de la cellule végétale." } }, { "id": "1219", "translation": { "en": "A theoretical version of this problem is the problem of the shortest superstring: given a set of words (own set of reads), we try to find the shortest string that contains all others as substring (the genome of origin).", "fr": "Une version théorique de cette problématique est le problème de la plus courte superchaîne: étant donné un ensemble de mots (notre ensemble de lectures), on cherche à trouver le plus petit mot qui contient tous les autres comme sous-chaîne (le génome d'origine)." } }, { "id": "1220", "translation": { "en": "All techniques show that the presence of 5% DMSO does not significantly modify the affinity of ADA for gamma-CD, while the affinity is dramatically reduced for beta-CD.", "fr": "Toutes les techniques ont montré que le DMSO n'a pas d'effet sur l'affinité de l'ADA pour la gamma-CD alors qu'il diminue fortement l'affinité de l'ADA pour la beta-CD." } }, { "id": "1221", "translation": { "en": "The theoretical complexity of this problem has been studied and a practical algorithm to solve it is presented. The second part presents a formalization of a problem concerning graphs comparison.", "fr": "La complexité de ce problème a été étudiée et un algorithme le résolvant est présenté. La seconde partie présente la formalisation d'un problème de comparaison de graphes." } }, { "id": "1222", "translation": { "en": "The study of informative families included in this research project on cranio-facial and oro-dental anomalies, by using genetic strategies such as candidate gene mutational analysis,homozygosity mapping and next generation sequencing, allowed the discovery of novel genes and mutations in AI.", "fr": "L'étude de familles informatives dans le cadre de ce projet de recherche sur le massif crânio-facial et bucco-dentaire, associée à des stratégies d'identification génétique telles que la sélection de gènes candidats, les zones d'homozygotie, le séquençage haut débit, ont permis d'obtenir des résultats probants." } }, { "id": "1223", "translation": { "en": "More than 200,000 campylobacteriosis cases are reported in the European Union each year.", "fr": "Plus de 200 000 cas de campylobacterioses sont recensés dans l'Union Européenne chaque année, avec comme principale espèce Campylobacter jejuni." } }, { "id": "1224", "translation": { "en": "From divergent abdominal fat weight chicken lines, I lastly identified new lncRNAs that potentially regulate this lipid metabolism.", "fr": "Enfin, à partir de lignées divergentes pour le poids de gras abdominal, j'ai également mis en évidence de nouveaux ARNlnc potentiellement régulateurs de ce métabolisme lipidique." } }, { "id": "1225", "translation": { "en": "All kinds of species interactions such as mutualism, commensalism, and competition, are omnipresent in nature and occur often at the metabolic level.", "fr": "Tous les types d'interactions entre espèces tels que le mutualisme, le commensalisme, et la compétition, sont omniprésents dans la nature et impliquent souvent le métabolisme." } }, { "id": "1226", "translation": { "en": "Horizontal transfers are events that allow the exchange of genetic material between two species, without reproduction.", "fr": "Les transferts horizontaux sont définis par la transmission de matériel génétique entre deux espèces, sans reproduction sexuée." } }, { "id": "1227", "translation": { "en": "Modulation of chromatin structure via histone modification is a major epigenetic mechanism and key regulator of gene expression, however, the contribution of chromatin heterogeneity to tumor evolution remains unknown, mostly due to the lack of methods to study it in tumors.", "fr": "La modulation de la structure de la chromatine via modifications d'histones est un mechanisme majeur epigenetique et un regulateur cle de la regulation des genes. Cependant la contribution de l'heterogeneity de la chromatine envers l'evolution tumorale reste inconnue, principalement a cause du manque de methodes pour l'evaluer dans les tumeurs." } }, { "id": "1228", "translation": { "en": "Given the clinical and genetic overlap of EOS with other neurodevelopmental disorders, including Autism Spectrum Disorder (ASD) and Attention Deficit Hyperactivity Disorder (ADHD), we paid particular attention to the genes involved in neurodevelopment.", "fr": "Compte tenu du chevauchement clinique et génétique de la SP avec les autres troubles neurodéveloppementaux, dont le Trouble du Spectre de l'Autisme (TSA) et le Trouble Déficit de l'Attention Hyperactivité (TDAH), nous avons porté une attention particulière aux gènes impliqués dans le neurodéveloppement." } }, { "id": "1229", "translation": { "en": "We will evaluate methods for reprogramming TME to bypass immunosuppression and improve the efficacy of cancer immunotherapy in patient-derived xenograft mice.", "fr": "Nous évaluerons également des méthodes de reprogrammation des TME pour contourner l'immunosuppression et améliorer l'efficacité de l'immunothérapie anticancéreuse dans des souris PDX avec xénogreffe dérivée de la tumeur des patients." } }, { "id": "1230", "translation": { "en": "For instance, ambient occlusion or sphere raycasting with dynamic shadows can augment a physical object taking the real illumination of the scene for a better insertion in an Augmented Reality context.", "fr": "Par exemple, l'occultation ambiante ou le raycasting de sphères avec des ombres portées dynamiques permettent d'augmenter un modèle physique en tenant compte de l'illumination réelle pour une meilleure intégration en réalité augmentée." } }, { "id": "1231", "translation": { "en": "The structure, inhibition, and evolution of these two systems were studied by combining sequence analysis and molecular modeling methods.", "fr": "La structure, l'inhibition et l'évolution de ces deux systèmes ont été étudiées en combinant des méthodes d'analyse de séquences et de modélisation moléculaire." } }, { "id": "1232", "translation": { "en": "Taken together, these exploratory studies allow a more reasoned choice of methodology for the study of plant-associated viromes and expand our knowledge of plant virus diversity especially in neglected wild plant populations, providing important references for the further viral ecology and evolution studies.", "fr": "Pris dans leur ensemble, ces travaux exploratoires permettent de mieux raisonner les choix méthodologiques pour l'étude des viromes associés aux plantes et étendent notre connaissance de la diversité des phytovirus, en particulier dans des espèces végétales sauvages largement négligées, apportant des points de référence importants pour de nouveaux travaux en écologie et en évolution virale." } }, { "id": "1233", "translation": { "en": "Then, they were applied to The Cancer Genome Atlas datasets in order to identify genes with a differential expression variance when comparing normal and tumor samples.", "fr": "Par la suite, elles ont été appliquées aux jeux de données The Cancer Genome Atlas dans le but d'identifier des gènes ayant une différence de variance d'expression entre échantillons sains et tumoraux." } }, { "id": "1234", "translation": { "en": "We reproduced and further extended our observations using subcutaneous injection of CT26 colorectal cancer cells in syngeneic immunocompetent BALB/c mice and B16 melanoma in C57BL/6 mice.", "fr": "Nous avons reproduit et étendu nos observations en utilisant des lignées modèles de cancéreuses colorectaux (CT26) et de mélanome (B16) injectée dans des souris syngéniques, immunocompétente." } }, { "id": "1235", "translation": { "en": "These transcripts are responsible for the regulatory mechanisms of the organism, some of them are translated into protein.", "fr": "Ces transcrits sont responsables des mécanismes de régulation de l'organisme, certains sont traduits en protéine." } }, { "id": "1236", "translation": { "en": "Some authors have thus distinguished between genes 'essential for survival' and 'essential for fitness'.", "fr": "Certains auteurs ont ainsi fait la distinction entre des gènes 'essentiels pour la survie' et des gènes 'essentiels pour la fitness'." } }, { "id": "1237", "translation": { "en": "Other particular traits were explored, such as the reversible obesity of the grey mouse lemur or the interactions between sociality and longevity in the ant.", "fr": "D'autres traits particuliers ont été explorés, tels que l'obésité réversible du microcèbe, ou encore les interactions entre socialité et longévité chez la fourmi." } }, { "id": "1238", "translation": { "en": "This resulted in the identification of 477 potential interacting partners, of which, 180 were determined to have a high probability of interacting directly with the kinase.", "fr": "J'ai identifié 477 partenaires potentiels dont 180 présentant une forte probabilité d'être des partenaires directs de la kinase." } }, { "id": "1239", "translation": { "en": "As more genomes are sequenced, the exact localisation of protein-coding genes in genomic DNA sequences is a major challenge in bioinformatics and modern biology.", "fr": "L'exploitation des données issues des projets de séquençage des génomes représente un enjeu majeur de la biologie moderne et de la bioinformatique. Une étape déterminante du processus d'annotation est la localisation dans les séquences d'ADN des gènes codant pour des protéines." } }, { "id": "1240", "translation": { "en": "The first axis of this work will concern researching associations between certain TSPAN5 and ERICH3 variants found in two metabolomic and genetic studies (GWAS) analyzing plasma concentrations of kynurenine and serotonin.", "fr": "Le premier axe concernera la recherche d'associations entre certains variants de TSPAN et ERICH3 retrouvés dans deux études de métabolomiques et génétiques (GWAS) analysant des concentrations plasmatiques de kynurenine et serotonine." } }, { "id": "1241", "translation": { "en": "During the first part of this project we constructed a bladder-cancer-specific gene regulatory network using a data mining algorithm (H-LICORN) as well as transcriptomic data coming from: (1) bladder cancer cell lines and bladder tumors expressing a mutated FGFR3 and (2) different preclinical models where the expression or activity of FGFR3 was modulated.", "fr": "Dans la première partie de mon projet, nous avons construit un réseau de régulation de gènes via un algorithme bioinformatique (H-LICORN) et des données transcriptomiques issues de : (1) lignées de cancer de la vessie exprimant un FGFR3 muté et (2) deux modèles précliniques dans lesquels l'expression de FGFR3 a été altérée." } }, { "id": "1242", "translation": { "en": "The set of bounded n-compositions of an interval simultaneously generalizes product set and compositions of an integer, and so < puts under a single roof all theseGray codes.", "fr": "L'ensemble des n compositions bornées d'un intervalle généralise simultanément l'ensemble produit et l'ensemble des compositions d'un entier et donc la relation < définit de façon unifiée tous ces codes de Gray." } }, { "id": "1243", "translation": { "en": "The characterization of their surface, chemical and colloidal stability as well as their cytotoxicity were studied in order to consider their use in biological environments.", "fr": "La caractérisation de leur surface, leur stabilité chimique et colloïdale ainsi que leur cytotoxicité ont été étudiées afin d'envisager leur utilisation en milieu biologique." } }, { "id": "1244", "translation": { "en": "For instance, the cells that are supposed to fight a disease can be silenced.", "fr": "Par exemple, les cellules qui sont supposées combattre l'infection peuvent être rendues silencieuses." } }, { "id": "1245", "translation": { "en": "In this project we intend to perform a change of perspective as, in order to face the diversity and the heterogeneity of omic data and that of machine learning strategies, we intend to make profit from all these available pieces of evidence thanks to a consensus based approach.", "fr": "Dans ce projet, nous entendons opérer un changement de perspective car, pour faire face à la diversité et à l'hétérogénéité des données omiques et à celle des stratégies d'apprentissage machine, nous souhaitons développer une nouvelle approche consensus." } }, { "id": "1246", "translation": { "en": "In order to provide information on the mechanisms of action and potential toxic effects of PhAC, data lacking in the literature, -omic approaches such as metabolomics and proteomics were applied.", "fr": "Afin de renseigner les mécanismes d'action et les potentiels effets toxiques des PP, données manquantes dans la littérature, les approches –omiques telles que la métabolomique et la protéomique ont été favorisées." } }, { "id": "1247", "translation": { "en": "The object of the simulation is the observation of the cell in a given state, and for a given process which implicates a cascade of genes; the examples of biological algorithms tested combines several types of regulation: the lactose operon, regulation of metallothionein, catabolism of galactose in yeast, the tryptophan operon and passage from the lysogenic to the lytic phase in phage.", "fr": "L'objet de la simulation est l'observation de la cellule dans un état donné, et pour un processus donné qui implique une cascade de gènes, les exemples d'algorithmes biologiques testés combinent plusieurs types de régulation : opéron lactose, régulation de la méthallothionéine, catabolisme du galactose chez la levure, opéron tryptophane, passage de la phase lysogénique à la phase lytique chez le phage." } }, { "id": "1248", "translation": { "en": "In this project, we will implement state-of-the-art, multi-level omics approaches to identify how reactive glial cells can help neurons clear toxic mHtt.", "fr": "Dans ce projet, nous utiliserons des approches \" multi-omics \" de pointe pour identifier comment les cellules gliales réactives aident les neurones à éliminer la mHtt toxique." } }, { "id": "1249", "translation": { "en": "This work highlights the utility of the zebrafish model organism as an informative experimental tool for variant interpretation in genomic medicine, especially in neurodevelopmental disorders.", "fr": "Confirmant la haute valeur ajoutée du poisson zèbre pour modéliser les variations génétiques chez des patients atteints de pathologies neurodéveloppementales, ce travail souligne la particulière informativité de cette stratégie en médecine génomique." } }, { "id": "1250", "translation": { "en": "The parameters of these two models are conditional probabilities of domain transmission from a parental node to its children in the taxonomy tree.", "fr": "Les paramètres de ces deux modèles sont les probabilités conditionnelles de transmission du domaine d'un nœud parental vers les nœuds fils dans l'arbre de la taxonomie." } }, { "id": "1251", "translation": { "en": "In addition, this strategy allowed us to identify key proteins involved in physiological and contaminant-associated pathways that had not been revealed by the differential analysis used.", "fr": "De plus, cette stratégie nous a permis d'identifier des protéines clés impliquées dans des voies physiologiques et associées aux contaminants, que l'analyse différentielle utilisée n'avait pas permis de révéler." } }, { "id": "1252", "translation": { "en": "Our bioinformatics analyzes identified the existence of de novo post-zygotic mutations of genes involved in neural crest development or cancer, in 5 cases.", "fr": "Nos analyses bio-informatiques ont montré l'existence de mutations de novo post-zygotiques de gènes impliqués dans le développement de la crête neurale ou le cancer, dans 5 cas." } }, { "id": "1253", "translation": { "en": "Applying it to the Tara Oceans dataset allowed me to describe for the first time their distribution in the global ocean and revealed that type IV chromatic acclimation, a process by which cells can match their absorption properties to the ambient light colour, is widespread and constitutes the dominant pigmentation in Synechococcus populations. It also showed that natural chromatic acclimation mutants prevail in wide oligotrophic areas of the southern Pacific Ocean.", "fr": "Appliquée aux données de Tara Oceans, cela m'a permis de décrire leur répartition à l'échelle mondiale, révélant que l'acclimatation chromatique de type IV, qui permet aux cellules de modifier leur spectre d'absorption en fonction de la couleur de la lumière, domine les populations naturelles de Synechococcus, et que des mutants naturels de l'acclimatation chromatique prévalent dans les étendues oligotrophes de l'océan Pacifique sud." } }, { "id": "1254", "translation": { "en": "The three tools have been rapidly adopted by all the scientists of the research centre and are now daily used for the tracking of all the laboratory's activities but also more globally for the research centre's other scientific activities.", "fr": "Les trois outils ont été rapidement adoptés par l'ensemble des scientifiques du centre de recherche et sont désormais utilisés au quotidien pour le suivi de toutes les activités de laboratoire mais aussi plus globalement pour les autres activités scientifiques du centre de recherche." } }, { "id": "1255", "translation": { "en": "Given a combination of features at a given genome positions, the SNP model predicts the expected fraction of rare SNPs (a measure of negative selection), and the SOM model predicts the expected mutation density at this position.", "fr": "Compte tenu de la combinaison de caractéristiques fonctionnelles à une position donnée du génome, le modèle SNP prédit la fraction de SNP rares (une mesure de la sélection négative), et le modèle SOM prédit la densité de mutations somatiques attendue à cette position." } }, { "id": "1256", "translation": { "en": "This would enable powerful deep learning-based prediction of hidden links between drugs and targets.", "fr": "Cela permettra d'obtenir des prédictions de liens manquants entre les médicaments et les cibles via des méthodes d'apprentissage profond." } }, { "id": "1257", "translation": { "en": "Our data indicated that the activation of the immune response is accompanied by an induction of the accumulation of both CDC48 transcript and protein.", "fr": "Les principaux résultats obtenus ont montré que l'activation de la réponse immunitaire s'accompagne de l'induction d'une accumulation des transcrits et la protéine CDC48." } }, { "id": "1258", "translation": { "en": "The laboratory has at its disposal a mutant strain of the haptophyte microalga Tisochrysis lutea producing twice more storage lipids than the wild type strain when exposed to nitrogen deprivation.", "fr": "Le laboratoire dispose d'une souche mutante de la microalgue haptophyte Tisochrysis lutea produisant deux fois plus de lipides de réserve que la souche sauvage en condition de privation azotée." } }, { "id": "1259", "translation": { "en": "Large scale Monte-Carlo and molecular dynamics calculations suggest that self-bound clusters are present in the supercritical phase, that is for temperatures above the critical one.", "fr": "Les calculs de dynamiques moléculaire et Monte-Carlo que nous avons réalisés sur des systèmes de grandes tailles suggèrent que des amas énergétiquement stables existent dans la phase supercritique, c'est à dire pour des températures supérieures à la température critique." } }, { "id": "1260", "translation": { "en": "The proposed algorithm has then been assessed on clinical datasets of several patients with non small cell lung carcinoma.", "fr": "L'algorithme proposé a ensuite été testé sur des données cliniques de patients présentant un cancer bronchique non à petites cellules." } }, { "id": "1261", "translation": { "en": "OA is characterized by articular cartilage degeneration, together with synovitis and abnormal subchondral bone remodeling, leading to progressive loss of mobility and pain.", "fr": "Elle se caractérise par une dégénérescence du cartilage articulaire associée à une inflammation synoviale et un remodelage anormal de l'os sous-chondral, qui résultent en une perte progressive de mobilité et des douleurs très handicapantes." } }, { "id": "1262", "translation": { "en": "The selectivity of kinase inhibitors may lead to side effects potentially harmful.", "fr": "L'absence de sélectivité conduit le plus souvent à des effets secondaires particulièrement néfastes pour l'organisme." } }, { "id": "1263", "translation": { "en": "This work opens up several potential leads for future work on the interactions between amoebae and giant viruses.", "fr": "Ces travaux ouvrent plusieurs pistes potentielles pour des travaux futurs portant sur les interactions entre les amibes et les virus géants." } }, { "id": "1264", "translation": { "en": "Following the rise of epigenetic, studies on DNA methylation, the most well understood epigenetic mark, showed that the loci of CGB genes and INSL4 are hypomethylated in cancer and placental cells, which may reflect a global hypomethylation also characteristic of these cells.", "fr": "Avec l'émergence de l'épigénétique, des études de la méthylation de l'ADN, la caractéristique épigénétique la mieux comprise, ont montré que les loci de gènes CGB et INSL4 sont hypométhylés dans les cellules cancéreuses et placentaires ; ce qui pourrait refléter l'hypométhylation globale caractéristique de ces deux types cellulaires." } }, { "id": "1265", "translation": { "en": "This work required many software developments in the aim to grid enabled bioinformatic applications and transparenlty give access to the Decrypthon grid, but also into DIET middleware and tools around : DIET_Webboard, VizDIET, GoDIET, LogService, MA_DAG, etc.", "fr": "Ces travaux ont nécessité un développement logiciel important, d'une part sur les applications du Décrypthon elles-mêmes et sur leur portage afin de rendre transparente leur utilisation sur la grille Décrypthon, mais aussi au niveau de l'intergiciel DIET et son écosystème : DIET_Webboard, VizDIET, GoDIET, LogService, MA_DAG, etc." } }, { "id": "1266", "translation": { "en": "The OCP is composed of two domains connected by a flexible linker, the C-terminal domain (CTD) and the N-terminal domain (NTD).", "fr": "L'OCP est composé de deux domaines), le domaine C-terminal (CTD) et le domaine N-terminal (NTD), reliés par un domaine de liason flexible (linker)." } }, { "id": "1267", "translation": { "en": "Radiotherapy is the main modality in cancer treatment but is associated with radiation damages on healthy tissues.", "fr": "La radiothérapie constitue l'une des principales modalités de traitement des cancers, mais elle est associée à des atteintes radio-induites aux tissus sains." } }, { "id": "1268", "translation": { "en": "We have shown for the first timethat Hox genes contribute to cardiogenesis. Moreover, genetically labeled cells analysis reveals a common origin of the arterial and venous poles in the cardiac field.", "fr": "Pour la première fois, nous montrons l'implication des gènes Hox dans la cardiogenèse précoce.L'analyse du lignage des cellules exprimant Hoxa1, Hoxa3 et Hoxb1 nous a permis demontrer que les pôles artériels et veineux ont la même origine au niveau du territoire cardiaque." } }, { "id": "1269", "translation": { "en": "We have shown that there is a model of a photosynthetic system which differs from that of supercomplexes and that the heterogeneity of LH2 is important in the process of adapting.", "fr": "Nous montrons qu'il existe un modèle de système photosynthétique qui diffère de celui des supercomplexes, et que l'hétérogénéité des LH2 est importante dans le processus d'adaptation aux variations de lumière." } }, { "id": "1270", "translation": { "en": "Further investigation in the mdx mouse revealed dysregulation of transcription factors of fatty acid (SREBP1) and cholesterol metabolism (SREBP2), perturbation of the mevalonate pathway, and accumulation of cholesterol in skeletal muscles.", "fr": "Des investigations chez la souris mdx ont montré une dérégulation des facteurs de transcription lié aux acides gras (SREBP1) ou au métabolisme du cholestérol (SREBP2), une perturbation de la voie de mévalonate, et une accumulation du cholestérol dans les muscles squelettiques." } }, { "id": "1271", "translation": { "en": "The goal of our work has been to explore cancer cell mRNA heterogeneity.", "fr": "Le but de notre travail a été d'explorer l'hétérogénéité des cellules cancéreuses du point de vue de la séquence d'ARN messager." } }, { "id": "1272", "translation": { "en": "NR5A1 is a crucial factor for gonadotrope cell fate determination since it initiates the transcription of key gonadotrope genes such as the GnRH receptor and LH and FSH specific subunits.", "fr": "NR5A1 est crucial pour l'émergence du lignage gonadotrope puisqu'il permet d'initier l'expression des gènes codant le récepteur de la GnRH et les sous-unités des hormones gonadotropes, LH et FSH." } }, { "id": "1273", "translation": { "en": "The final objective of the project will be to implement generic methods and tools for the prediction of lncRNAs.", "fr": "L'objectif final du projet sera de mettre en œuvre des méthodes et des outils génériques pour la prédiction des ARNlncs." } }, { "id": "1274", "translation": { "en": "However, applied to divergent proteins, this strategy may miss several domains.", "fr": "Cependant, appliquée aux protéines d'organismes divergents, cette méthode manque de sensibilité." } }, { "id": "1275", "translation": { "en": "As bioinformatics was an important part of my work to analyse barcoding/metabarcoding data, a part of my thesis is dedicated to explain these analyses as a tutorial for all future users.", "fr": "La bioinformatique ayant une part importante dans l'analyse des données de barcoding/metabarcoding, une partie du manuscrit lui est dédiée pour \" désacraliser \" ce type d'analyse." } }, { "id": "1276", "translation": { "en": "Following a presentation of the key steps and developments that have been required to reconstruct a global metabolic model of A. baylyi, we will show that confronting observed and predicted phenotypes highlight inconsistencies between the two scales.", "fr": "Après avoir présenté les développements effectués pour reconstruire un modèle global du métabolisme d'A. baylyi, nous montrerons que la confrontation entre phénotypes observés et phénotypes prédits permet de mettre en évidence des incohérences entre les deux échelles d'observations." } }, { "id": "1277", "translation": { "en": "Our pipeline RNA-unchained greatly improves computation time of LocARNA and is comparable to the one of ExpLocP, while improving the overall accuracy of the final alignments.", "fr": "Notre méthode RNA-unchained permet d'améliorer significativement les temps de calcul de LocARNA et présente des temps de calcul similaires à ExpLocP, tout en améliorant l'exactitude des alignements finaux." } }, { "id": "1278", "translation": { "en": "From the theoretical point of view, our contributions to this problem is a new formalisation of the Smallest Grammar Problem based on two complementary optimisation problems: the choice of constituents of the final grammar and the choice of how to parse the sequence with these constituents.", "fr": "Nous proposons de décomposer ce probléme en deux problémes d'optimisation complémentaires. Le premier consiste á choisir les chaînes de la séquence qui seront les constituants de la grammaire finale alors que le second, que nous appelons ''analyse grammaticale minimale'', consiste á trouver une grammaire de taille minimale permettant l'analyse syntaxique de ces constituants." } }, { "id": "1279", "translation": { "en": "We use a model of a “common denominator” for cardiovascular disease (CVD) and other chronic diseases to identify biomarkers linked with common diseases risk factors and molecular pathways.", "fr": "Nous avons utilisé un modèle de \"dénominateur commun\" pour les maladies chroniques afin d'identifier des biomarqueurs associés aux facteurs de risque et aux voies biologiques de maladies courantes." } }, { "id": "1280", "translation": { "en": "In parallel, a bioinformatic work on public banks of genomic DNA from citrus, allowed to identify seven genes with high sequence homologies with those involved in the synthesis of furanocoumarins in Pastinaca sativa (CYP71) and in Arabidopsis thaliana (CYP82).", "fr": "En parallèle, un travail de bioinformatique sur des banques publiques d'ADN génomique d'agrumes, a permis d'identifier sept gènes présentant de fortes homologies de séquences avec ceux intervenant dans la synthèse des furocoumarines chez Pastinaca sativa (CYP71) et chez Arabidopsis thaliana (CYP82)." } }, { "id": "1281", "translation": { "en": "Psychiatric comorbidities (DSM-5) were ADHD (15/20 patients), anxiety disorders (14/20) and ASD (13/20).", "fr": "Les comorbidités psychiatriques étaient le TDAH (15/20 patients), les troubles anxieux (14/20) et le TSA (13/20)." } }, { "id": "1282", "translation": { "en": "Second, we provide an analysis of the interface properties of Ig-Ag complexes. In particular, we design a classifier using two descriptors, which is able todistinguish ligand types.", "fr": "Deuxièmement, nous proposons de nouvelles analyses de complexes Ig-Ag.D'une part nous concevons un classificateur distinguant les types de ligand desIg." } }, { "id": "1283", "translation": { "en": "Such heterogeneity has so far only been observed in neurodegenerative diseases, particularly in Alzheimer's disease, in which some subsets are proposed to be beneficial or detrimental.", "fr": "Plusieurs de ces études ont établi une association entre l'hétérogénéité microgliale et les maladies neurodégénératives, en particulier la maladie d'Alzheimer." } }, { "id": "1284", "translation": { "en": "Each algorithm introduced in this thesis achieves state-of-the-art performances, especially in terms of training speed.", "fr": "Tous les algorithmes introduits dans cette thèse atteignent les performances de l'état-de-l'art, en particulier en ce qui concerne les vitesses d'entraînement." } }, { "id": "1285", "translation": { "en": "The resulting model is used to study how the constant surface cells renewal impacts the microbiome kinetics.", "fr": "Le modèle ainsi obtenu est utilisé pour étudier l'impact du renouvellement constant des cellules de surface sur la dynamique du microbiome." } }, { "id": "1286", "translation": { "en": "The thesis is completed by a machine learning method to infer deleterious effects after a genetic variation called INDEL.", "fr": "La thèse est complétée par une méthode d'apprentissage automatique pour inférer des effets délétères après une variation génétique appelée INDEL." } }, { "id": "1287", "translation": { "en": "Constituent amino-acids can be analyzed to predict secondary, tertiary and quaternary protein structure.", "fr": "La chaîne d'acides aminés peut être analysée pour prédire les structures secondaire, tertiaire et quaternaires d'une protéine." } }, { "id": "1288", "translation": { "en": "This doctoral thesis describes the main aspects of the LASTec C++ package, which is the core of the SDView project.", "fr": "Cette thèse décrit les points essentiels du package LASTec, premier ensemble de bibliothèques C++ constituant le coeur du projet SDView." } }, { "id": "1289", "translation": { "en": "We found, that the recruitment of repair components and the phosphorylation of H2AX is governed by pre-existing Topologically Associating Domain (TADs).", "fr": "Nous avons découvert que le recrutement des composants de réparation et la phosphorylation de H2AX sont régis par des domaines topologiques associatifs (TAD) préexistants." } }, { "id": "1290", "translation": { "en": "Over the course of approximately 100 years, from 1908 till 2000, 10 strains of Phaeodactylum tricornutum (referred to asecotypes) have been collected and stored axenically as cryopreserved stocks at various stock centers.", "fr": "Au cours d'une centaine d'années environ, de 1908 à 2000, 10 souches de Phaeodactylum tricornutum (appelées écotypes) ont été collectées et stockées soit de manière axénique ou en l'état avec leur populations naturelles de bactéries dans les centres des ressources génétiques pour algues, cryo-préservées quand cela est possible." } }, { "id": "1291", "translation": { "en": "The aim of this thesis is the study of the transcriptome of the bacterium Buchnera aphidicola, the primary endosymbiont of the pea aphid, Acyrthosiphon pi-sum, by microarray technology.", "fr": "L'objectif de cette thèse est l'étude par la technologie des puces à ADN, du transcriptome de la bactérie Buchnera aphidicola, qui vit en symbiose avec le puceron du pois Acyrthosiphon pisum." } }, { "id": "1292", "translation": { "en": "Genetic analyses ruled out single gene deficiencies but rather suggested combined effects of multiple factors in the type I IFN induction signaling pathway.", "fr": "Des analyses génétique et transcriptomique ont exclus des déficiences causées par des gènes uniques et ont favorisé l'hypothèse d'une combinatoire de gènes exerçant des effets faibles dans la voie d'induction de la réponse IFN." } }, { "id": "1293", "translation": { "en": "I have characterized two atypical thioredoxin proteins, one from the anaerobe Desulfovibrio vulgaris Hildenborough, Dtrx, and one from the pathogenic Pseudomonas aeruginosa PAO1, PsTrx.", "fr": "J'ai caractérisées deux thiorédoxines atypiques, l'une provenant de l'organisme anaérobie Desulfovibrio vulgaris Hildenborough, Dtrx, et l'autre provenant de la bactérie pathogène Pseudomonas aeruginosa PAO1, PsTrx." } }, { "id": "1294", "translation": { "en": "A major objective of this thesis was to apply Transposon-Directed Insertion Sequencing (TraDIS) to detect mutants with reduced intracellular survival and virulence in zebrafish embryos.", "fr": "Le premier objectif de cette thèse est d'utiliser la technique de TraDIS (transposon-directed insertion sequencing) pour détecter des mutants atténués en virulence dans les embryons de poisson zèbre." } }, { "id": "1295", "translation": { "en": "Within this dissertation, I introduce the state of the art of pangenome visualization: I distinguish pan-gene from pangenomes, the latter often being represented by pangenome graphs where each sequence is a node and each observed sequence succession forms an edge; I also identify unspecific, qualifying, positioned, structural and composite visualization tools.", "fr": "Dans ce manuscrit de thèse, je présente l'état de l'art de la pangénomique : j'y fais la distinction entre la notion de pan-gene atlas et de pangénome, le second étant souvent représenté sous la forme d'un graphe où chaque séquence forme un nœud et chaque succession observée de séquence forme des liens entre ces nœuds ; j'identifie également des outils de visualisation non spécifiques, qualitatifs, positionnés, structuraux, et enfin composites." } }, { "id": "1296", "translation": { "en": "I have characterized in vitro some of these terminators, particularly in 5'UTRs, with the hope that they will be involved in conditional regulatory mechanisms.", "fr": "J'ai caractérisé in vitro certains de ces terminateurs, en particulier dans les régions 5'UTR, avec l'espoir qu'ils soient impliqués dans des mécanismes de régulation conditionnelle." } }, { "id": "1297", "translation": { "en": "Our work revealed that direct developmental exposure to CD leads to impairment of meiosis in male and female mice, causes a reduction in viable reproductive cells, i.e., both spermatogonia and spermatozoid, and oocytes in females.", "fr": "Les travaux réalisés dans le cadre de cette thèse ont révélé qu'une exposition développementale au CD conduit à une altération de la méiose chez les souris mâles et femelles, entraîne une réduction des cellules reproductrices viables, à la fois la spermatogonie et les spermatozoïdes chez les mâles, et les ovocytes chez les femelles." } }, { "id": "1298", "translation": { "en": "The manuscript describes how we applied the 2P2I approach to several research projects to design antiviral drugs as well as the modeling tools and strategies we developed.", "fr": "Le manuscrit décrit l'application de l'approche 2P2I à plusieurs projets de recherche pour la conception d'antiviraux ainsi que les outils et stratégies de modélisation que nous avons développé." } }, { "id": "1299", "translation": { "en": "Their corresponding genes form an operon temporarily induces in early growth phase.", "fr": "Leurs gènes forment un opéron induit temporairement en début de croissance." } }, { "id": "1300", "translation": { "en": "During a viral infection the cell is able of generate an antiviral response, the Interferon (IFN) response pathway, which occurs via oligoadenylate synthetase (OAS) /Ribonuclease L (RNase L) involvement.", "fr": "Lors d'une infection virale, la cellule est capable de mettre en place des réponses antivirales, dont la voie de réponse à l'interféron (IFN) via l'oligoadénylate synthétase (OAS)/Ribonucléase L(RNase L)." } }, { "id": "1301", "translation": { "en": "This work has shown the importance to consider the combined effect of several mutations in molecular diagnosis of complex genetic disorders.", "fr": "Ces travaux ont démontré l'importance de considérer l'effet combiné de plusieurs mutations lors du diagnostic des patients." } }, { "id": "1302", "translation": { "en": "On the application side, we concentrate on premature aging diseases, a group of rare genetic disorders that resemble some aspects of physiological aging at an early age.", "fr": "Du côté des applications, nous nous concentrons sur les maladies liées au vieillissement prématuré, un groupe de maladies génétiques ressemblant à certains aspects du vieillissement physiologique à un âge précoce." } }, { "id": "1303", "translation": { "en": "Bioinformatics analyses of gene expression data allowed the identification of potential transcription factors involved in the observed nutrigenomic effects and cell signalling proteins regulating their activity.", "fr": "Les analyses bioinformatiques de ces données ont permis d'identifier les facteurs de transcription potentiellement impliqués dans les effets nutrigénomiques observés ainsi que les protéines de signalisation cellulaire régulant leur activité." } }, { "id": "1304", "translation": { "en": "From these studies, we demonstrated the interesting antiproliferative potential of some compounds on colorectal cancer cells and the absence of cytotoxicity of these compounds on normal cells.", "fr": "A partir de ces études, nous avons démontré le potentiel antiprolifératif intéressant de certains composés sur des cellules de cancer colorectal et l'absence de cytotoxicité de ces composés sur des cellules saines." } }, { "id": "1305", "translation": { "en": "We introduce several biologically motivated equivalence relations, each one splitting the solution space into equivalence classes. We propose polynomial-delay algorithms that enumerate the equivalence classes, and the representative solutions, i.e., the solutions taken from each equivalence class.", "fr": "D'abord, je définis des relations d'équivalence et propose des algorithmes d'énumération qui produisent la liste des solutions représentatives, c'est-à-dire des solutions appartenant à chacune des classes d'équivalence." } }, { "id": "1306", "translation": { "en": "Finally, we developed a robust computational protocol to rationalize the design of peptidic interaction inhibitors.", "fr": "Enfin, nous avons développé un protocole bio-informatique robuste pour le design d'inhibiteurs peptidiques d'une interaction protéine-protéine." } }, { "id": "1307", "translation": { "en": "Although dominated by Bacteria, deep samples from Yukechi were found to be very rich in sequences close to the Pithoviridae.", "fr": "Des échantillons profonds de Yukechi, pourtant dominés par les bactéries, se sont avérés très riches en séquences proches des Pithoviridae." } }, { "id": "1308", "translation": { "en": "Concomitantly, this work showed that, although being operational protein, components of these EMS carry a phylogenetic signal usable for inferring phylogenetic relationships among eukaryotic lineages.", "fr": "En parallèle, ce travail a montré que, bien qu'étant des protéines opérationnelles, lescomposants de ces SME portent un signal phylogénétique exploitable pour inférer les relations de parentés entre lignées eucaryotes." } }, { "id": "1309", "translation": { "en": "Because of this, 'rpoB' mutations were used to study transcription mechanisms before interest shifted to their ability to impart antibiotic resistance.", "fr": "C'est pourquoi les mutations 'rpoB' ont été utilisées pour étudier les mécanismes de transcription avant que l'intérêt ne se porte sur leur capacité à conférer une résistance aux antibiotiques." } }, { "id": "1310", "translation": { "en": "3D data of biomolecules produced using cryo-ET are noisy, suffer from spacial anisotropies, and are difficult to analyze individually.", "fr": "Les données 3D de biomolécules produites à l'aide de cryo-ET sont bruitées, souffrent d'anisotropies spatiales et sont difficiles à analyser individuellement." } }, { "id": "1311", "translation": { "en": "Because of similar infection routes (blood-related), co-infection with those two viruses are frequent, and the infection by HIV enhances HCV activity and increases liver fibrosis leading to cirrhosis and death of co-infected patients.", "fr": "La coinfection par ces deux maladies est fréquente en raison de modes d'infection similaires, et l'infection par le VIH stimule l'activité du VHC et accélère la fibrose du foie puis sa cirrhose, causant la mort des patients co-infectés." } }, { "id": "1312", "translation": { "en": "For instance, in a microarray experiment the expression values of thousands of genes are measured for several samples.", "fr": "Par exemple, dans une expérience de microréseau, les valeurs d'expression de milliers de gènes sont mesurées pour plusieurs échantillons." } }, { "id": "1313", "translation": { "en": "This thesis aimed at developing tools for the classification and identification of new enzymes involved in biomass degradation.", "fr": "Mon sujet de recherche s'inscrit dans un objectif de développement d'outils pour la classification et l'identification de nouvelles enzymes impliqués dans la conversion de la biomasse." } }, { "id": "1314", "translation": { "en": "However, for deeper phylogenetic analysis, less closely related taxa can be used.", "fr": "Cependant, pour une analyse phylogénétique plus approfondie, des taxons moins étroitement apparentés peuvent être utilisés." } }, { "id": "1315", "translation": { "en": "Results: From 2013 to 2019, 101 patients were included.", "fr": "Résultats : De 2013 à 2019, 101 patients ont été inclus." } }, { "id": "1316", "translation": { "en": "We present a modelisation of the folding process as a game, a cost function associated to that game, and several heuristics to search for Nash equilibrium.", "fr": "Nous présentons une modélisation du repliement comme un jeu, une fonction de coût associée, et plusieurs heuristiques de recherche d'équilibre de Nash." } }, { "id": "1317", "translation": { "en": "Despite phylogenetic and taxonomic advances enabled by morphological and molecular studies in the last two decades, uncertainties still remain.", "fr": "Malgré les avancées phylogénétiques et taxonomiques permises par des études morphologiques et moléculaires des deux dernières décennies, des incertitudes demeurent." } }, { "id": "1318", "translation": { "en": "The path of invasion from the American continent to the African continent and potentially associated adaptation processes were studied in this thesis based on population genomics approaches.", "fr": "Le chemin d'invasion du continent américain vers le continent africain et les processus d'adaptation potentiellement associés ont été étudiés dans cette thèse en se basant sur des approches de génomique des populations." } }, { "id": "1319", "translation": { "en": "However, this type of identification is approximative and difficult for micro-organisms.", "fr": "Cependant, ce type d'identification est imprécis et difficile pour des micro-organismes." } }, { "id": "1320", "translation": { "en": "The predictive criteria were subsequently used to search for potentially polymorphic coding mini satellites in the human genome.", "fr": "Les critères prédictifs ont également été appliqués à l'identification de minisatellites codants potentiellement polymorphes dans le génome humain." } }, { "id": "1321", "translation": { "en": "In order to better understand this mode of action, pan-genomics analysis integrating chromatin accessibility data, transcriptio factor binding, histones modifications and conformation data combined with single cell analysis have been performed.", "fr": "Pour mieux comprendre ce mode d'action, des analyses pangénomiques intégrant des données d'accessibilité à la chromatine, de fixation de facteur de transcription, de modification d'histones ainsi que des données de conformation de la chromatine couplées à des analyses en cellule unique ont été réalisées." } }, { "id": "1322", "translation": { "en": "On the contrary, at low rearrangement rates organisms have most of their genes transcribed on monocistronic RNAs, they own a huge number of coding RNAs and present very complex and intricate regulation networks.", "fr": "Au contraire, chez les organismes ayant évolué avec de faibles taux de réarrangement, la plupart des gènes sont transcrits sur des ARNs monocistroniques. Ces organismes possèdent un grand nombre d'ARNs non-codants et présentent des réseaux de régulation très complexes." } }, { "id": "1323", "translation": { "en": "Finally, the full-length human PI4KA was expressed in insect cells, purified and a first interaction experiment with membranes have been initiated.", "fr": "Enfin, la PI4KA humaine dans son entier a été exprimée en cellules d'insecte puis purifiée, et un premier test d'interaction avec les membranes a été initié." } }, { "id": "1324", "translation": { "en": "After validating the structural annotation, I show that the different structural elements that constitute these proteins display marked composition biases that probably derive from the environment's influence.", "fr": "Après avoir valider l'approche d'annotation des différents éléments structurels, j'ai pu montrer que chacun de ces éléments ont des biais de composition caractéristiques qui découlent vraisemblablement de l'environnement." } }, { "id": "1325", "translation": { "en": "This work is based on the development of two clustering methods, which are methodologically and biologically evaluated, the evaluation methods themselves being finally questioned.", "fr": "Ce travail est basé sur le développement de deux méthodes de classification, qui sont évaluées au niveau méthodologique et biologique, les méthodes d'évaluation elles-mêmes étant finalement questionnées." } }, { "id": "1326", "translation": { "en": "However, while they require a quite straightforward instrumentation, they need heavy computation, limiting their use in routine.", "fr": "Néanmoins, même si ces techniques nécessitent une instrumentation relativement simple, elles requièrent des traitements informatiques conséquents, limitant leur utilisation en routine." } }, { "id": "1327", "translation": { "en": "Transport of solutes across biological membranes is crucial to eukaryotic cell physiology.", "fr": "Le transport de composés à travers les membranes biologiques est crucial pour la physiologie des cellules eucaryotes." } }, { "id": "1328", "translation": { "en": "We also suggested the use of association rules to determine the correlations between domains and used these informations in the certification process.", "fr": "Nous proposons également une autre stratégie basée sur l'utilisation de règles d'association pour la détermination des co-occurrences de domaines utilisées dans le processus de certification." } }, { "id": "1329", "translation": { "en": "Introduction: travellers to endemic areas must know malaria, its risk factors and prophylactic measures.", "fr": "Introduction: la connaissance du paludisme, de ses facteurs de risque et de sa prophylaxie par les voyageurs se rendant en zones d'endémie est fondamentale." } }, { "id": "1330", "translation": { "en": "Distance vision averaged 1 ± 0.25 line better and near vision 2.2 ± 0.32 lines better when visual acuity was quantifiable before surgery.", "fr": "Le gain moyen d'acuité visuelle était d'1 ± 0,25 ligne en vision de loin et de 2,2 ± 0,32 lignes en vision de près lorsque l'acuité visuelle préopératoire était chiffrable." } }, { "id": "1331", "translation": { "en": "This is particularly the case of tools that we developed previously (and available on our software platform EvryRNA (http://EvryRNA.ibisc.univ-evry.fr)).", "fr": "C'est notamment le cas des outils que nous avons développés précédemment (et disponibles sur notre plate-forme logicielle EvryRNA (http://EvryRNA.ibisc.univ-evry.fr))." } }, { "id": "1332", "translation": { "en": "However, being 'essential' is highly dependent on the circumstances in which an organism lives.", "fr": "Cependant, le fait d'être 'essentiel' est largement dépendant des conditions dans lesquelles ledit organisme vit." } }, { "id": "1333", "translation": { "en": "According to the current knowledge, cancer develops as a result of themutational process of the genomic DNA.", "fr": "Il est admis actuellement que le cancer se développe à la suite d'unprocessus de mutations sur l'ADN d'un génome." } }, { "id": "1334", "translation": { "en": "These results make this domain a suitable target for antiviral research specifically directed against these viruses.", "fr": "Ces résultats font alors de ce domaine une cible majeure pour la recherche d'antiviraux dirigée spécifiquement contre ces virus." } }, { "id": "1335", "translation": { "en": "Their roles as immune toxicants, pro-oxidants, endocrine disruptors and epigenetic modulators are discussed.", "fr": "Leurs rôles comme toxines immunitaires, pro-oxydants, perturbateurs endocriniens et modulateurs épigénétiques y sont discutés." } }, { "id": "1336", "translation": { "en": "In a SAM file, a read may occupy multiple alignment lines, when its alignment is chimeric or when multiple mappings are given.", "fr": "Dans un fichier SAM, un 'read' peut occuper plusieurs lignes d'alignement, lorsque son alignement est chimérique ou lorsque plusieurs mappages sont donnés." } }, { "id": "1337", "translation": { "en": "We establish representer theorems in the supervised and semi-supervised cases and use them to define new regression models for different cost functions.", "fr": "Nous établissons en particulier des théorèmes de représentation, qui permettent de définir de nouveaux modèles de régression." } }, { "id": "1338", "translation": { "en": "The aim of this work was to develop methods to model and to predict these interactions for the metabolism and the regulation of transcription.", "fr": "L'objectif de ce travail a consisté à développer des méthodes permettant de modéliser et de prédire ces interactions pour le métabolisme et la régulation de la transcription." } }, { "id": "1339", "translation": { "en": "However, it is an overly complex task because of both clinical and genetic heterogeneity, the complexity of the genetic architecture of such diseases and the statistical challenges they bring.", "fr": "Cependant, le diagnostic et l'élaboration de stratégie thérapeutiques demeurent extrêmement compliqués du fait de l'hétérogénéité clinique et génétique, des défis statistiques associés et de la complexité de l'architecture génétique des maladies." } }, { "id": "1340", "translation": { "en": "Finally, we propose MULTIPUS, a method to infer microbial communities and metabolic roads to produce specific target compounds from a set of defined substrates.", "fr": "Enfin, nous proposons MULTIPUS, une méthode d'extraction d'(hyper)-arbres de Steiner dirigés qui permet de sélectionner les voies métaboliques pour la production de composés au sein d'une communauté bactérienne." } }, { "id": "1341", "translation": { "en": "COMPARE allows data retrieval, integration, comparison and transfer of heterogeneous, publicly available, data for a number of species.", "fr": "COMPARE permet la collecte, l'intégration, la comparaison ainsi que le transfert d'informations hétérogènes, provenant de différentes ressources publiques, entre plusieurs espèces." } }, { "id": "1342", "translation": { "en": "We created a prototype (GenSCor, Genetic Score Creator) to test the effectiveness of the approach, which we validated with genetic users.", "fr": "Nous avons créé un prototype (GenSCor) permettant de tester l'efficacité de l'approche, que nous avons validé avec des utilisateurs généticiens." } }, { "id": "1343", "translation": { "en": "This assessment revealed the need of a formal evaluation method of analytical pipelines used for targeted metagenomics analyses. This method has been developed with simulated and real datasets, and adequate evaluation metrics.", "fr": "Cette évaluation a révélé la nécessité de mettre en place une méthode d'évaluation formelle de pipelines d'analyses de données de métagénomique ciblée, qui a été développée sur la base de données simulées et réelles, et de métriques d'évaluation adaptées." } }, { "id": "1344", "translation": { "en": "A first approach will consist in proposing a map of conservation and variations during the evolution of the global metabolic network using metabolic profile data available for a large number of organisms (several hundred of organisms).", "fr": "Une première approche consistera à proposer une carte de conservation et de variations au cours de l'évolution du réseau métabolique global en utilisant les données de profil métaboliques disponibles chez un grand nombre d'organismes (plusieurs centaines d'organismes)." } }, { "id": "1345", "translation": { "en": "The joint analysis of energetic influences and hydrogen bonds revealed a network of interactions between AC and calmodulin, in which three key residues, that may play an allosteric role on the catalytic activity of the adenyl-cyclase, were modified by site-directed mutagenesis.", "fr": "L'analyse conjointe des influences énergétiques et des liaisons hydrogène a révélé un réseau d'interactions entre AC et la calmoduline, dans lequel trois résidus clés, susceptibles de jouer un rôle allostérique sur l'activité de l'adénylcyclase ont été modifiés par mutagenèse dirigée." } }, { "id": "1346", "translation": { "en": "However, existing models of regulation of the translation by uORFs are still limited to a few set of genes, and the mechanisms remain cryptic for most RNAs.", "fr": "Néanmoins, les modèles existants de régulation de la traduction par les uORFs sont limités à un nombre restreint de gènes et ces mécanismes demeurent cryptiques pour la majorité des ARNs." } }, { "id": "1347", "translation": { "en": "The purpose of my PhD was to annotate and process in a uniform way the raw data from sequencing experiments whose objective is to identify the binding regions of regulatory proteins for humans and then for Arabidopsis Thaliana.", "fr": "Le but de mon doctorat a été d'annoter et traiter de façon uniforme les données brutes issues d'expériences de séquençage dont l'objectif est d'identifier les régions de fixation des protéines régulatrices pour l'Homme puis chez Arabidopsis Thaliana." } }, { "id": "1348", "translation": { "en": "It will then become possible to map and study sites of transcriptomic variation on a large collection of chloroplastic RNA-Seq data before adding them to the flagDB++ public database [2].", "fr": "Cela permettra de cartographier et étudier des sites de variation transcriptomique sur une large collection de données RNA-Seq chloroplastiques avant de les répertorier dans la base de données publique flagDB++ [2]." } }, { "id": "1349", "translation": { "en": "Moreover, it has been discovered that proteins with high degrees of connectedness are more likely to be essential for survival than proteins with lesser degrees.", "fr": "De plus, il a été découvert que les protéines à haut degré de connectivité sont plus susceptibles d'être essentielles à la survie que les protéines à moindre degré." } }, { "id": "1350", "translation": { "en": "Defoliation does not affect the sugar and tartaric acid contents, hardly affects amino acids, but it increases flavonol content and decreases malic acid content.", "fr": "L'effeuillage n'affecte pas la teneur en sucres ou en acide tartrique des baies, il affecte peu les acides aminés, mais il augmente la teneur en flavonols et diminue la teneur en acide malique." } }, { "id": "1351", "translation": { "en": "This technological revolution has led to the development of numerous bioinformatics methods.", "fr": "Cette révolution technologique a entraîné le développement de nombreuses méthodes bioinformatiques." } }, { "id": "1352", "translation": { "en": "AGORA can handle different gene content between species (duplications, gains, and loss) by using accurate gene phylogenies as input.", "fr": "AGORA est capable de gérer les duplications de gènes, les délétions, et les gains, et interprète de manière réaliste des phylogénies complexes de gènes." } }, { "id": "1353", "translation": { "en": "Using RNA-Seq technology and bioinformatics tools, we identified 167 transcription factors that are co-expressed in eyes, antennas and legs of embryos in Limnogonus franciscanus.", "fr": "En utilisant la technologie de transcriptomique du RNA-seq, nous avons identifié 167 facteurs de transcription co-exprimés dans les yeux, les antennes et les pattes des embryons de Limnogonus franciscanus." } }, { "id": "1354", "translation": { "en": "A discovery algorithm of sequential itemsets searchs for sequence of hierarchical patterns previously extracted and based on an alphabet including the amino acid set and their own physicochemical properties.", "fr": "Les signatures sont définies par des séquences de motifs hiérarchiques préalablement extraits et basés sur une classification hiérarchique des acides aminés en fonction de leurs propriétés physico-chimiques." } }, { "id": "1355", "translation": { "en": "This remodeling is due to a dysfunction of pulmonary vascular endothelial cells leading to the proliferation of smooth muscle cells whose phenotype shares characteristics with cancer cells: genetic mutations, proliferation, inflammation, resistance to apoptosis.", "fr": "Ce remodelage est dû à une dysfonction des cellules endothéliales vasculaires pulmonaires entrainant la prolifération des cellules musculaires lisses dont le phénotype partage des caractéristiques de cellules cancéreuses : mutations génétiques, prolifération, rôle de l'inflammation, résistance à l'apoptose." } }, { "id": "1356", "translation": { "en": "Cryogenic electron tomography (cryo-ET) allows visualizing biomolecular complexes in situ.", "fr": "La tomographie électronique cryogénique (cryo-TE) permet de visualiser des complexes biomoléculaires in situ." } }, { "id": "1357", "translation": { "en": "RNA-seq, or high throughput transcript sequencing, enables the fast digitization of a transcriptome in the form of million of short DNA sequences.", "fr": "Le RNA-Seq ou séquençage à haut-débit des transcrits, permet la numérisation rapide d'un transcriptome sous forme de millions de courtes séquences d'ADN." } }, { "id": "1358", "translation": { "en": "A further contribution in this study, when a new classification of aerial manipulation systems based on a symbolic formula is introduced, capable of specifying the type and number of multirotors and manipulators used within the mechanical structure.", "fr": "Une contribution complémentaire a permis de présenter une nouvelle classification des systèmes de manipulation aérienne basée sur une formule symbolique, capable de définir le type et le nombre de multirotors et de manipulateurs utilisés au sein de la structure mécanique." } }, { "id": "1359", "translation": { "en": "The persistence of these sequences within the human genome highlights a potential positive selection of particular forms of soluble HERV-Env, which we coined as endoRBDs, in the human genome and other metazoans. We postulate a direct relationship between selection of endoRBDs in the human genome and their interaction with SLC receptors.", "fr": "La persistance de ces séquences au sein du génome humain incite à privilégier l'existence d'une sélection positive de formes particulières de HERV-Env, les endoRBD solubles, dans le génome humain et des autres métazoaires ainsi qu'une relation directe entre leur sélection dans les génomes humains et leur interaction avec des récepteurs." } }, { "id": "1360", "translation": { "en": "In fact, this program is not able to detect new repeats and in consequence produced annotations with a quality that depends on the sequences of transposable elements used.", "fr": "De fait, ce programme n'est pas en mesure de détecter de nouvelles séquences répétées, et la qualité de l'annotation sera donc dépendante de la banque de séquences d'éléments transposables utilisée." } }, { "id": "1361", "translation": { "en": "While they have been mainly applied to a number of single exemplary proteins, it is now time for a broader application at the level of the whole genome.", "fr": "Bien qu'elles aient été principalement appliquées à un certain nombre de protéines exemplaires, il est maintenant temps de les appliquer au niveau du génome entier." } }, { "id": "1362", "translation": { "en": "Concerning uni-dimensional signal analysis, we first propose a method to enhance the signal to noise ratio of ECG recordings.", "fr": "Concernant les signaux unidimensionnels, nous proposons tout d'abord une méthodologie d'amélioration du rapport signal sur bruit des enregistrements ECG par des méthodes de moyennage et de gating respiratoire." } }, { "id": "1363", "translation": { "en": "The application of the approach to a phylogenomic dataset with a similarity matrix of a thousand genes for 31 bacteria allowed the separation of genes related to specific bacterial lineages.", "fr": "L'application de la Décomposition Bayésienne sur une matrice de similarité contenant environ un millier de gènes pour 31 bactéries a permis d'isoler les gènes spécifiques à certaines lignées de bactéries." } }, { "id": "1364", "translation": { "en": "The aim of this thesis topic is to advance methods that estimate these confidence levels for data extracted from text.", "fr": "Il s'agira de faire avancer les méthodes d'estimation de ces différents niveaux de confiance pour les données obtenues à partir de textes." } }, { "id": "1365", "translation": { "en": "The ability to obtain reliable and consistent results from small cohorts remains an important challange.", "fr": "La capacité de retirer des résultats fiables et cohérents à partir de petites cohortes reste donc primordiale." } }, { "id": "1366", "translation": { "en": "Some of them are already used in the community, for example, by the PDBe database and CASP assessors.", "fr": "Certains sont déjà utilisés dans la communauté, par les évaluateurs de CASP par example." } }, { "id": "1367", "translation": { "en": "The mutated JAK2 protein has a constitutive tyrosine kinase activity, implicated in the physiopathology of MPN.", "fr": "La protéine JAK2 mutée a une activité tyrosine kinase constitutive, impliquée dans le développement de la maladie." } }, { "id": "1368", "translation": { "en": "Median follow-up was 26.5 months.", "fr": "Le suivi médian était de 26,5 mois." } }, { "id": "1369", "translation": { "en": "Some regions named ‘'constitutive heterochromatin'' are nonetheless known to remain highly condensed, regardless of conditions.", "fr": "Certaines régions qualifiées d' ‘'heterochromatine constitutive'' sont toutefois connues pour être maintenues à l'état condensé." } }, { "id": "1370", "translation": { "en": "Finally, we introduce two new qualitative semantics for the computation of the dynamics of SBGN-PD reaction networks. These semantics are expressed using automata networks.", "fr": "Enfin, nous proposons deux nouvelles sémantiques qualitatives pour le calcul de la dynamique des réseaux de réactions SBGN-PD, exprimées à l'aide de réseaux d'automates." } }, { "id": "1371", "translation": { "en": "DomainOrganizer detects first domains' borders from a multiple alignment and provides the list of domains.", "fr": "DomainOrganizer détecte les frontières entre domaines à partir d'un alignement multiple et crée la liste des domaines." } }, { "id": "1372", "translation": { "en": "In this work, with biomolecular and bioinformatic methods, we have searched for and characterized full length MLE, and precised their activity under thermal and metal (copper and zinc) stresses.", "fr": "Dans le présent travail, par des méthodes de biologie moléculaire et de bioinformatique, nous avons recherché et caractérisé des MLE complets, et précisé leur activité en conditions de chocs thermiques et métalliques (cuivre et zinc)." } }, { "id": "1373", "translation": { "en": "I have shown that the HPO used to generate groups of similar patients suffering from heterogeneous diseases such as developmental disorders are not reliable to prioritize exome variants and that a case-only burden statistical test can be used in a clinical setting to identify causal variants in a heterogeneous cohort without a priori.", "fr": "J'ai montré que les termes HPO utilisés pour grouper des patients souffrant de des maladies hétérogènes telles que les maladies du développement sont aujourd'hui trop peu fiables à elles seules pour prioriser les variants exoniques et qu'une stratégie de type \"burden\" peut fonctionner dans un cadre clinique et identifier des variants causaux sans a priori dans une cohorte hétérogène." } }, { "id": "1374", "translation": { "en": "In regard to the scarcity of quantitative data, we chose the logical formalism to study the cell cycle from a theoretical point of view.", "fr": "Les données qualitatives étant les plus nombreuses, nous avons choisi le formalisme logique pour étudier le cycle cellulaire d'un point de vue théorique." } }, { "id": "1375", "translation": { "en": "Each independent component (IC) is characterized by a list of gene projections on the one hand and weightedcontributions of tumor samples on the other hand.", "fr": "Chaque composante indépendante est caractérisée par une liste de projections de gènes et de contributions pondérées d'échantillons tumoraux ." } }, { "id": "1376", "translation": { "en": "As part of this work, we were particularly interested in the design of series of analogous molecules of bisacodyl, a laxative drug with antibacterial activity.", "fr": "Dans le cadre de ces travaux nous nous sommes intéressés particulièrement à la conception d'une série de molécules analogues du bisacodyl, un médicament laxatif possédant une activité antibactérienne." } }, { "id": "1377", "translation": { "en": "The hitch is that selecting a set of relevant features in this context is an extremely difficult task given, among other reasons, the so-called curse of dimensionality (the number of variables or features to examine being extremely high compared to the number of studied samples) .", "fr": "La sélection d'un ensemble de caractéristiques pertinentes dans ce contexte est une tâche extrêmement difficile compte tenu, entre autres, du nombre de variables ou de caractéristiques à examiner, lequel est extrêmement élevé par rapport au nombre d'échantillons étudiés." } }, { "id": "1378", "translation": { "en": "However, new approaches have emerged, with for example the more and more spread use of “liquid biopsies”.", "fr": "Cependant, de nouvelles approches voient le jour, comme la pratique maintenant de plus en plus répandue des \" biopsies liquides \"." } }, { "id": "1379", "translation": { "en": "Essential genes in bacteria'.", "fr": "Gènes essentiels chez les bactéries." } }, { "id": "1380", "translation": { "en": "Nowadays, the amount of cazymes' sequences is so large that it has became impossible to experimentally characterize all.", "fr": "Aujourd'hui, la quantité de séquences de cazymes rendue disponible est cependant tellement grande qu'il est devenu impossible de toutes les caractériser expérimentalement." } }, { "id": "1381", "translation": { "en": "We present the development of a standardized quantitative metagenomics and metabolic analysis framework based on a unified reference.", "fr": "Nous présentons le développement d'un framework standardisé de métagénomique quantitative et d'analyse métabolique basé sur une référence unifiée." } }, { "id": "1382", "translation": { "en": "This thesis describes three bioinformatics tools available freely on the web (http://crispr.", "fr": "Cette thèse décrira trois outils bioinformatiques accessibles à l'adresse (http://crispr." } }, { "id": "1383", "translation": { "en": "Acute Myeloid Leukemia (AML) is a malignant hemopathy characterized by an uncontrolled proliferation of myeloid progenitors arrested in their maturation process.", "fr": "La Leucémie Aiguë Myéloïde (LAM) est une hémopathie maligne qui se caractérise par une prolifération incontrôlée des progéniteurs myéloïdes médullaires arrêtés dans leur processus de maturation." } }, { "id": "1384", "translation": { "en": "However, the mechanisms controlling the morphogenesis of proliferative tissues remain poorly understood.", "fr": "Cependant, les mécanismes contrôlant la morphogenèse des tissus prolifératifs restent mal compris." } }, { "id": "1385", "translation": { "en": "Moreover, the accuracy of protocols based on eDNA in deep sea sediments still needs to be assessed, as results may be biased by ancient DNA, resulting in biodiversity assessments not targeting live organisms.", "fr": "De plus, la précision des protocoles basés sur l'ADNe dans les sédiments profonds reste à évaluer, car les résultats pourraient être biaisés par de l'ADN ancien archivé dans le sédiment, ce qui conduirait à des estimations de biodiversité passée plutôt que présente." } }, { "id": "1386", "translation": { "en": "The proteomic databases thus produced enabled the inter-population analysis of 40 individual Gammarus pulex proteomes from two sampling sites (polluted vs reference).", "fr": "Les bases de données protéomiques ainsi produites ont permis l'analyse inter-population de 40 protéomes individuels de Gammarus pulex répartis sur deux sites de prélèvement (pollué vs référence)." } }, { "id": "1387", "translation": { "en": "Transmission electron microscopic images show a particule like endospore with variable size (from 400 nm to 1 μm), a multilayered outer wall (~60 nm) and an apical pore.", "fr": "Des observations au microscope électronique à transmission indiquent une forme ressemblant à une endospore, de taille très variable (de 400 nm jusqu'à 1 μm), avec une paroi multicouche épaisse (~60 nm) et un pore apical." } }, { "id": "1388", "translation": { "en": "In this doctoral thesis, we explored associations between the human blood methylome and obesity-associated gene variants as well as dietary fat quality and quantity.", "fr": "Dans cette thèse de doctorat, nous avons exploré des associations entre le méthylome sanguin humain et des polymorphismes nucléotidiques (SNPs) liés à l'obésité, ainsi que des mesures qualitatives et quantitatives de l'apport journalier en acides gras." } }, { "id": "1389", "translation": { "en": "A large scale culturomics effort to contrast the phytovirome with the mycovirome of fungal cultures obtained from the same plant samples revealed an extremely low number of shared OTUs, further deepening the debate about the phytovirus or mycovirus nature of the dsRNA viruses identified in plant viromes.", "fr": "Un effort important en culturomique visant à comparer le phytovirome avec le mycovirome de cultures fongiques obtenues à partir des mêmes échantillons végétaux a révélé un nombre remarquablement faible d'OTUs partagés, renforçant le questionnement sur la nature, phytovirus ou mycovirus, des virus dsRNA identifiés dans les viromes des plantes." } }, { "id": "1390", "translation": { "en": "They are thus increasingly considered as potential therapeutic targets or biomarkers (diagnostic and prognostic markers).", "fr": "Ils sont ainsi de plus en plus considérés comme de potentiels cibles thérapeutiques ou biomarqueurs (marqueurs diagnostiques et pronostiques)." } }, { "id": "1391", "translation": { "en": "The candidate will construct the flagellogenesis biological network, and perform an integrative bioinformatics analysis of this network in order to identify new and less obvious MMAF candidate genes, and to improve our understanding of flagellogenesis.", "fr": "Le candidat construira le réseau biologique de la flagellogénèse, et développera une méthode d'analyse bioinformatique intégrative de ce réseau afin d'identifier de nouveaux gènes candidats pour la pathologie d'infertilité MMAF et contribuer à une meilleure compréhension de la flagellogénèse." } }, { "id": "1392", "translation": { "en": "Therefore, we tested the reduction in specific macronutrient without decrease in general calorie intake on tumor development. We used two diets: reduced in carbohydrates (Low CHO, -25% carbohydrates) and diet reduced in protein (Low PROT, -25% proteins) on the Eμ-Myc transgenic mouse model of B-cell lymphoma.", "fr": "A partir d'un modèle murin de lymphomes B (modèle transgénique Eμ-Myc) nous avons testé l'impact de deux régimes alimentaires : l'un pauvre en glucides (Low CHO, 25% de réduction en glucides) et l'autre pauvre en protéines (Low PROT, 25% de réduction en protéines)." } }, { "id": "1393", "translation": { "en": "We have shown the relationship between autonomous and nonautonomous helitrons and discovered new families.", "fr": "Nous avons ensuite démontré la relation autonome-nonautonome des hélitrons et découvert de nouvelles familles." } }, { "id": "1394", "translation": { "en": "Our analysis also showed that essential proteins have less EARs in comparison to non-essential ones.", "fr": "Notre analyse a également montré que les protéines essentielles ont moins de RAEs par rapport aux protéines non essentielles." } }, { "id": "1395", "translation": { "en": "Exploring and analysing the bubbles in the generator is feasible in practice and can be complementary to state-of-the-art algorithms that analyse a subset of the bubble space.", "fr": "L'exploration et l'analyse des bulles dans le générateur sont réalisables dans la pratique et peuvent être complémentaires aux algorithmes de l'état de l'art qui analysent un sous-ensemble de l'espace des bulles." } }, { "id": "1396", "translation": { "en": "The obtained sequences also provides a wide range of qualitative information such as splicing junction, genomic or post-transcriptional variants, as well as new forms of less conventional transcription such as circular RNA, fusion genes or long non coding RNA.", "fr": "Les séquences obtenues contiennent également une multitude d'informations qualitatives comme les jonctions d'épissage, les variants génomiques ou post-transcriptionnels, ainsi que de nouvelles formes de transcriptions moins conventionnelles comme les ARN circulaires, les gènes de fusions ou les longs ARN non-codants." } }, { "id": "1397", "translation": { "en": "This disease is caused by Plasmodium, a protozoan parasite.", "fr": "Cette maladie est causée par le Plasmodium, parasite protozoaire appartenant à la famille des Apicomplexes." } }, { "id": "1398", "translation": { "en": "To address these issues, we have used up–to-date bioinformatics, analytical and biological approaches to: (1) map, annotate and compare G4-L1 motifs in the human genome, using the hg38 reference and the 1000 Genomes project variation information to assess common polymorphism, as well as examine their maintenance across over 500 species; (2) characterize, using various human cell lines and Next Generation Sequencing (NGS) approaches, the potential of these sequences to mutate or induce perturbations upon treatments with G4 ligands; and (3) to improve our understanding of the roles of stable G4s in transcription, we have associated gene expression with the frequency of canonical G4 motifs near gene by combined G4 ligand/genomic analyses in fibrosarcoma cells.", "fr": "Pour aborder ces questions, nous avons mis au point et employé des approches expérimentales et bio-informatiques pour : (1) localiser, annoter et comparer les motifs G4-L1 dans le génome humain, en utilisant le génome de référence hg38 et les données du projet 1000 Génomes pour évaluer leur polymorphisme, ainsi qu'examiner leur maintien dans plus de 500 espèces ; (2) caractériser le potentiel mutagène des G-quadruplex par une approche de capture-NGS (séquençage à très haute profondeur), en utilisant diverses lignées cellulaires humaines traitées par des ligands de G4 (notamment, les ligands de la famille de PhenDC produits à l'Institut Curie) ; et (3) améliorer notre compréhension des rôles des G4 stables dans la transcription, en associant l'expression génique à la fréquence de motifs G4 canoniques présents autour des TSS, par des analyses combinées de génomique/traitements avec des ligands dans des cellules de fibrosarcome." } }, { "id": "1399", "translation": { "en": "This pathology mainly kills people who are already vulnerable.", "fr": "Cette pathologie tue principalement des personnes déjà fragilisées." } }, { "id": "1400", "translation": { "en": "We analyse why these programs perform so well on even very large biological rnodels although the decision problem is NP-complete.", "fr": "Nous analysons pourquoi ces programmes performent aussi bien sur même de très grands modèles biologiques, bien que le problème de décision relatif soit NP-complet." } }, { "id": "1401", "translation": { "en": "Saccharides and glycoconjugates constitute the main component of the biomass produced on earth, therefore they represent a plentiful source of renewable energy.", "fr": "Sous forme de saccharides et de glycoconjugués, ils constituent une partie substantielle de la biomasse produite sur terre et représentent une source potentielle d'énergie renouvelable de première importance." } }, { "id": "1402", "translation": { "en": "This Xcp secreton is a macromolecular complex involving 12 proteinscalled XcpA0 and XcpPC to XcpZM. This machinery is organized in 3 complexes, the assemblyplatform anchored in the inner membrane (implicating XcpPC,RE,SF,YL and ZM), the pore localizedin the outer membrane and formed by multimerization of the secretin XcpQD, and the periplasmicpseudopilus involving XcpTG-XK matured by the prepilin peptidase XcpAO.", "fr": "Ce sécréton Xcp est un complexe macromoléculaire de 12 protéines, nommées XcpAO et XcpPC-ZM, organisé en trois sous-complexes : une plateforme d'assemblage ancrée dans la membrane interne (XcpPC-SF etXcpYL-ZM), un pore localisé dans la membrane externe et formé par multimérisation de la sécrétine XcpQD, et un pseudopilus périplasmique impliquant les pseudopilines XcpTG-XK." } }, { "id": "1403", "translation": { "en": "In conclusion, the proposed potential biomarkers need to be tested in a variety of different combinations with a panel of significant number of patients and using the most appropriate substrate defined during this study.", "fr": "En conclusion, les biomarqueurs potentiels proposés dans cette étude doivent être testés en différentes combinaisons avec un panel en nb significatif de patients et en utilisant le substrat antigénique le plus approprié comme défini au cours de cette étude." } }, { "id": "1404", "translation": { "en": "In a second step we analyzed different transcriptomes of H. armigera available in databases and we could highlight 13 superfamilies of transcribed ETs.", "fr": "Dans une deuxième étape nous avons analysés différents transcriptomes de H. armigera disponibles dans les bases de données et nous avons pu mettre en évidence 13 superfamilles de ETs transcrites." } }, { "id": "1405", "translation": { "en": "In humans, some tandem repeats mutate at a very high rate: hypermutable minisatellites are the most unstable elements in the human genome.", "fr": "Par ailleurs, certaines répétitions en tandem humaines ont la propriété de muter à des fréquences élevées : les minisatellites hypermutables sont les éléments les plus instables du génome humain." } }, { "id": "1406", "translation": { "en": "Although many selective inhibitors selective of COX-2 have been developed and marketed, they have displayed diverse side effects leading, in some cases, to their with drawal from the market.", "fr": "Bien que de nombreux inhibiteurs sélectifs de la COX-2 aient été développés et commercialisés, ceux-ci présentent des effets secondaires dont la gravité a entraîné, dans certains cas, l'arrêt de leur commercialisation." } }, { "id": "1407", "translation": { "en": "We present a mixed-integer linear programming formulation of our model, and propose a branch-and-cut algorithm to solve to provable optimality in reasonable run time.", "fr": "Nous présentons une formulation de notre modèle sous forme de programmation linéaire en nombres entiers, et proposons un algorithme branch-and-cut qui résout le modèle à l'optimalité en temps raisonnable." } }, { "id": "1408", "translation": { "en": "These irregularities suggest a heterogeneity of chromosome structures in wild bananas involved in hybrids.", "fr": "Ces irrégularités suggèrent une hétérogénéité des structures chromosomiques chez les bananiers sauvages impliqués dans les hybrides." } }, { "id": "1409", "translation": { "en": "The transformation of lignocellulosic biomass is a pathway to consider in order to meet the challenges of the energy sector.", "fr": "La transformation de la biomasse lignocellulosique est une voie à considérer pour répondre aux défis du domaine de l'énergie." } }, { "id": "1410", "translation": { "en": "Indeed, a mutation at the mRNA level can disrupt the splicing machinery by two main means: damaging wild-type splice sites, or creating exonic de novo splice sites.", "fr": "Pourtant, une mutation au niveau de l'ARNm peut perturber la mécanique de l'épissage, par deux moyens principaux: endommagement des sites sauvages d'épissage, ou la création de sites exoniques d'épissage de novo." } }, { "id": "1411", "translation": { "en": "The aims of this thesis are two-fold, and centered on synthetic metabolic circuits, which perform sensing and computation using enzymes.", "fr": "Les buts de cette thèse sont doubles, et concernent les circuits métaboliques synthétiques, qui permettent de détecter des composants chimiques par transmission de signal et de faire du calcul en utilisant des enzymes." } }, { "id": "1412", "translation": { "en": "The gap between the number of structures and protein sequences available in databases has steadily increased since the advent of high throughput sequencing technologies.", "fr": "L'écart entre le nombre de structures et de séquences protéiques disponibles dans les bases de données ne cesse en effet de croître depuis l'arrivée des technologies de séquençage à haut débit." } }, { "id": "1413", "translation": { "en": "This algorithm, combined with data-derived reaction rules and varying levels of enzyme promiscuity, allows to focus exploration on the most promising compounds and pathways for bio-retrosynthesis.", "fr": "Cet algorithme, combiné à des règles de réaction apprises sur des données et des niveaux différents de promiscuité enzymatique, permet de focaliser l'exploration sur les composés et les chemins les plus prometteurs en bio-rétrosynthèse." } }, { "id": "1414", "translation": { "en": "The objective of this thesis is in first work to extend this methodology with right-censored data and to determine at different prediction horizons the optimal threshold of the biomarker beyond which treatment will be attributed or avoided.", "fr": "L'objectif dans cette thèse est dans un premier travail d'étendre cette méthodologie avec un critère de jugement censuré et de déterminer à différent horizons de prédiction le seuil optimal du biomarqueur au-delà duquel le traitement sera attribué ou évité." } }, { "id": "1415", "translation": { "en": "The two main approaches of this thesis (namely, SPFlow and DistillFlow) are based on a provenance model that we have introduced to represent the provenance structure of the workflow executions.", "fr": "Les deux principales approches de cette thèse (à savoir, SPFlow et DistillFlow) sont basées sur un modèle de provenance que nous avons introduit pour représenter la structure de la provenance des exécutions du workflowl." } }, { "id": "1416", "translation": { "en": "This variant is present only on a portion of the 508del haplotypes and could therefore have a modifying effect on deletion expression.", "fr": "Ce variant n'est présent que sur une partie des haplotypes 508del et pourrait donc avoir un effet modificateur de l'expression de la délétion." } }, { "id": "1417", "translation": { "en": "It enables to choose the most favourable orientation of the database.", "fr": "Ce cadre permet de choisir l'orientation de la base de données qui est la plus favorable pour les algorithmes d'extraction." } }, { "id": "1418", "translation": { "en": "WAVE which is in an inactive state, then exposes its WCA domain (WH2-Connector-Acidic) that can bind to the Arp2/3 complex and activate it to trigger the formation of a new daughter actin filament.", "fr": "En réponse à une cascade d'activation moléculaire, une des sous-unités du complexe WAVE expose son domaine WCA (WH2-Connecteur-Acide) qui peut alors se lier au complexe Arp2/3 et l'activer afin d'initier la formation d'un nouveau filament d'actine." } }, { "id": "1419", "translation": { "en": "The considerations of this thesis manuscript focus on the impact of these elements on the resolution of the tree eukaryotes, with the objectif of getting a better understanding of the history of the hosts photosynthetic and their endosymbiont.", "fr": "Les considérations de ce manuscrit de thèse se focalise sur l'impact de ces éléments sur la résolution de l'arbre des eucaryotes, avec pour objectif une meilleure compréhension de l'histoire des hôtes photosynthétiques et de leur endosymbionte." } }, { "id": "1420", "translation": { "en": "These issues are governed by strict regulations: REACh (Registration, Evaluation, Authorization and Restriction of Chemicals) to ensure a high level of health and environmental protection.", "fr": "Ces enjeux sont encadrés par une réglementation stricte : REACh (Registration, Evaluation, Authorization and Restriction of Chemicals) permettant d'assurer un haut niveau de protection sanitaire et environnementale." } }, { "id": "1421", "translation": { "en": "It allows in particular to observe the impactof communications between vehicles on their behavior.", "fr": "Il permet notamment d'observerl'impact des communications entre véhiculessur leur comportement." } }, { "id": "1422", "translation": { "en": "Firstly, I present experimental and bioinformatic analyses of dual miRNA-seq and mRNA-seq data obtained by profiling the interaction of Sus scrofa and its host-pathogen bacteria Mycoplasma hyopneumoniae.", "fr": "D'abord, je présente des analyses expérimentales et bioinformatiques de données doubles sRNA-seq et mRNA-seq obtenues en profilant l'interaction hôte-pathogène de Sus scrofa et de la bactérie Mycoplasma hyopneumoniae." } }, { "id": "1423", "translation": { "en": "The protein CyaA is an important virulence factor of Bordetella pertussis involved in the whooping cough disease.", "fr": "La protéine CyaA est un facteur de virulence majeur de Bordetella pertussis, impliqué dans la maladie de la coqueluche." } }, { "id": "1424", "translation": { "en": "Rules enable decomposition and composition as well as specialization and generalization of types.", "fr": "Les règles permettent la décomposition et la composition ainsi que la spécialisation et la généralisation de types." } }, { "id": "1425", "translation": { "en": "Discrete parameters were used to sample the cone of admissible fluxes, whereas the continuous Michaelis and maximum rates constants were obtained by local minimization of an objective function.", "fr": "Des paramètres discrets ont été utilisés pour échantillonner le cône des flux admissibles, alors que les constantes des Michaelis et les taux maximaux ont été obtenus par la minimisation locale d'une fonction objective." } }, { "id": "1426", "translation": { "en": "Analysis of gene expression in males and females at different stages of the life cycle then allowed the identification of differentially expressed genes. The functions and molecular evolution of these sex-biased genes was then studied.", "fr": "Par la suite, l'analyse de l'expression des gènes entre individus mâles et femelles à différents stades du cycle de vie a permis d'identifier les gènes différentiellement exprimés, de caractériser leurs fonctions et d'analyser leur évolution moléculaire." } }, { "id": "1427", "translation": { "en": "In contrast to proteins, there are relatively few experimental and computational studies on RNAs.", "fr": "JContrairement aux protéines, il y a relativement peu d'études expérimentales et computationelles concernant les ARN." } }, { "id": "1428", "translation": { "en": "The SAFlex web server represents the concrete contribution of this PhD while the SAFlex-PDB parser represents an important contribution to the proper function of the proposed website.", "fr": "Ce site web représente la contribution concrète de cette thèse alors que le parser SAFlex-PDB représente une contribution importante pour le fonctionnement du site web proposé." } }, { "id": "1429", "translation": { "en": "A new technique for quantify proteins in bovine muscle samples have been developed, the Dot-Blot, and allow to have prototypes of the future tenderness tests.", "fr": "Une nouvelle technique pour quantifier les protéines d'un échantillon de muscle bovin a été développée, le Dot-Blot, et permet de disposer de prototype pour de futurs tests de phénotypage de la tendreté." } }, { "id": "1430", "translation": { "en": "Deep learning methods show great promise to automate classification or dimensionality reduction.", "fr": "Les méthodes d'apprentissage approfondi sont très prometteuses pour automatiser la classification ou la réduction de la dimensionnalité." } }, { "id": "1431", "translation": { "en": "This thesis aims to use bioinformatics for developing new in silico tools for the study of lectins.", "fr": "Cette thèse vise à utiliser la bioinformatique pour développer de nouveaux outils in-silico pour l'étude des lectines." } }, { "id": "1432", "translation": { "en": "Currently, few structural prediction methods are specific to peptides.", "fr": "À l'heure actuelle, peu de méthodes de prédiction structurale sont spécifiques des peptides." } }, { "id": "1433", "translation": { "en": "Newly developed bioinformatics approaches revealed new non-coding regulatory RNAs and allowed us to identify putative targets.", "fr": "Le développement de nouvelles approches bioinformatiques a permis de découvrir de nouveaux ARN régulateurs non-codant (ARNrnc), de les caractériser notamment évolutivement et d'identifier leurs cibles putatives." } }, { "id": "1434", "translation": { "en": "Thanks to advances in instrumentation and bioinformatics, automated interpretation of MS/MS spectra can now identify thousands of proteins in a cell type.", "fr": "Grâce aux progrès de l'instrumentation et de la bioinformatique, l'interprétation automatisée des spectres MS/MS permet aujourd'hui d'identifier des milliers de protéines dans un type cellulaire." } }, { "id": "1435", "translation": { "en": "INPP5A is expressed in the brain (human, mouse and Drosophila), is highly conserved between species and encodes a InsP3 5-phosphatase whose hydrolysis products mobilize intracellular calcium, essential for the morphogenesis of dendritic spines in neurons.", "fr": "INPP5A est un gène exprimé dans le cerveau (humain, souris et drosophile), très conservé entre espèces et qui code une InsP3 5-phosphatase dont les produits d'hydrolyse mobilisent le calcium intracellulaire, essentiel pour la morphogenèse des épines dendritiques dans les neurones." } }, { "id": "1436", "translation": { "en": "The tool RCPred, based on the MFE model, proposes several sub-optimal structures.", "fr": "L'outil RCPred, basé sur le modèle MFE, propose plusieurs structures sous-optimales." } }, { "id": "1437", "translation": { "en": "Bioinformatic analysis complements this characterization and provides a clear picture of the evolution of the OCP to respond efficiently to stress conditions.", "fr": "L'analyse bioinformatique complète cette caractérisation et fournit une image claire de l'évolution de l'OCP pour répondre efficacement aux conditions de stress." } }, { "id": "1438", "translation": { "en": "Finally, the two approaches will be confronted to propose a model for the evolution of the metabolic network.", "fr": "Enfin, les deux approches seront confrontées pour proposer un modèle d'évolution du réseau métabolique." } }, { "id": "1439", "translation": { "en": "In 2014 tuberculosis (TB) surpassed HIV as the leading cause of death by an infectious disease worldwide emphasizing the urgent need to develop a more effective vaccine against this airborne disease.", "fr": "En 2014 la Tuberculose (TB) à dépassé le VIH comme la principale cause de décès par maladie infectieuse dans le monde soulignant le besoin urgent de développer un vaccin plus efficace contre cette maladie." } }, { "id": "1440", "translation": { "en": "We also evaluate the polymorphism of presence of HERV loci on more than two thousands individuals, grouped into human populations.", "fr": "Nous évaluons également le polymorphisme de présence des HERV dans le génome de plus de deux mille individus répartis dans les populations humaines." } }, { "id": "1441", "translation": { "en": "Furthermore, they can functionally complementeach other, supporting the hypothesis of their common origin (Garrido et al. 2020).", "fr": "De plus, ils peuvent se complémenter fonctionnellement in vivo, confortant l'hypothèse de leur origine commune (Garrido et al. 2020)." } }, { "id": "1442", "translation": { "en": "This work was completed by a literature review which led to a selection of candidates.", "fr": "Ce travail a été complété par une analyse bibliographique qui a amené une sélection de candidats." } }, { "id": "1443", "translation": { "en": "The high heterogeneity of clinical, histological, biological and genetic features in breast cancer is due in part to the extreme molecular complexity of these tumors.", "fr": "La grande hétérogénéité clinique, histologique, biologique et génétique du cancer du sein est due en partie à l'extrême complexité moléculaire de ces tumeurs." } }, { "id": "1444", "translation": { "en": "Functional annotation of somatic mutations have been a consistent hotspot of cancer genomics studies.", "fr": "L'annotation fonctionnelle de mutations somatiques est un point focal des études de génomique du cancer." } }, { "id": "1445", "translation": { "en": "Then, we developed an efficient dedicated algorithm to solve local alignments.", "fr": "Nous avons ensuite développé un algorithme dédié permettant de résoudre un de ces modèles." } }, { "id": "1446", "translation": { "en": "This NR is said to be orphan because it does not have a natural ligand known to date.", "fr": "Ce RN est dit orphelin car il ne possède pas de ligand naturel connu à ce jour." } }, { "id": "1447", "translation": { "en": "However, only small number of lectins are currently available, limiting their use in biotechnology and research.", "fr": "Toutefois, un nombre réduit de lectines sont actuellement disponibles, limitant leur utilisation dans les biotechnologies et la recherche." } }, { "id": "1448", "translation": { "en": "Matrix values give the likelihood of each amino acid at the corresponding position in the alignment.", "fr": "Les valeurs de la matrice donnent la probabilité de chaque acide aminé à la position correspondante dans l'alignement." } }, { "id": "1449", "translation": { "en": "Functional analysis comparing phenotype, domestication traits, expression and interaction between different Q/q homoeologs was rendered possible using series of “deletion lines”, where one or several homoeologs were deleted.", "fr": "L'analyse fonctionnelle comparant les caractères de domestication ainsi que l'expression et les interactions entre les différents homéologues du gène Q/q dans le blé hexaploïde a été rendue possible par la caractérisation des \" lignées de délétion \", où une ou plusieurs copies homéologues ont été perdues ou substituées." } } ]